MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti AK83 plasmid pSINME01

Total Repeats: 398

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015597	AAAG	2	8	1284	1291	75 %	0 %	25 %	0 %	334321235
2	NC_015597	CGTG	2	8	1320	1327	0 %	25 %	50 %	25 %	334321235
3	NC_015597	ACCG	2	8	1695	1702	25 %	0 %	25 %	50 %	334321236
4	NC_015597	GATC	2	8	1855	1862	25 %	25 %	25 %	25 %	334321236
5	NC_015597	CGGC	2	8	1958	1965	0 %	0 %	50 %	50 %	334321236
6	NC_015597	GACA	2	8	1971	1978	50 %	0 %	25 %	25 %	334321236
7	NC_015597	GATG	2	8	2019	2026	25 %	25 %	50 %	0 %	334321236
8	NC_015597	CGGC	2	8	2453	2460	0 %	0 %	50 %	50 %	334321236
9	NC_015597	GACG	2	8	5448	5455	25 %	0 %	50 %	25 %	334321237
10	NC_015597	CGAT	2	8	5976	5983	25 %	25 %	25 %	25 %	334321238
11	NC_015597	TTCC	2	8	6057	6064	0 %	50 %	0 %	50 %	334321238
12	NC_015597	CGGA	2	8	6337	6344	25 %	0 %	50 %	25 %	334321238
13	NC_015597	GACA	2	8	8977	8984	50 %	0 %	25 %	25 %	334321239
14	NC_015597	TCGA	2	8	12462	12469	25 %	25 %	25 %	25 %	334321240
15	NC_015597	CGGC	2	8	13625	13632	0 %	0 %	50 %	50 %	334321241
16	NC_015597	TCTA	2	8	13789	13796	25 %	50 %	0 %	25 %	334321241
17	NC_015597	AGAT	2	8	15983	15990	50 %	25 %	25 %	0 %	334321243
18	NC_015597	TCCG	2	8	16079	16086	0 %	25 %	25 %	50 %	334321243
19	NC_015597	CTGA	2	8	16848	16855	25 %	25 %	25 %	25 %	334321243
20	NC_015597	CGGA	2	8	17840	17847	25 %	0 %	50 %	25 %	334321244
21	NC_015597	GCTG	2	8	17987	17994	0 %	25 %	50 %	25 %	334321244
22	NC_015597	GGAT	2	8	18088	18095	25 %	25 %	50 %	0 %	334321244
23	NC_015597	CATC	2	8	18212	18219	25 %	25 %	0 %	50 %	334321244
24	NC_015597	GGCC	3	12	18697	18708	0 %	0 %	50 %	50 %	334321244
25	NC_015597	GCGT	2	8	19877	19884	0 %	25 %	50 %	25 %	334321245
26	NC_015597	AAAC	2	8	21310	21317	75 %	0 %	0 %	25 %	334321246
27	NC_015597	CATT	2	8	21352	21359	25 %	50 %	0 %	25 %	334321246
28	NC_015597	TCGC	2	8	21508	21515	0 %	25 %	25 %	50 %	334321246
29	NC_015597	AGCG	2	8	21610	21617	25 %	0 %	50 %	25 %	334321246
30	NC_015597	TGCG	2	8	23936	23943	0 %	25 %	50 %	25 %	334321247
31	NC_015597	GTCT	2	8	24127	24134	0 %	50 %	25 %	25 %	334321247
32	NC_015597	ATCG	2	8	24409	24416	25 %	25 %	25 %	25 %	334321247
33	NC_015597	CGTG	2	8	24757	24764	0 %	25 %	50 %	25 %	334321247
34	NC_015597	TGCG	2	8	25826	25833	0 %	25 %	50 %	25 %	334321248
35	NC_015597	GCTT	2	8	26273	26280	0 %	50 %	25 %	25 %	334321248
36	NC_015597	GTTG	2	8	27911	27918	0 %	50 %	50 %	0 %	334321249
37	NC_015597	GCGA	2	8	30616	30623	25 %	0 %	50 %	25 %	334321250
38	NC_015597	GCCG	2	8	30739	30746	0 %	0 %	50 %	50 %	334321250
39	NC_015597	TGGT	2	8	30863	30870	0 %	50 %	50 %	0 %	334321250
40	NC_015597	GAGC	2	8	31169	31176	25 %	0 %	50 %	25 %	334321250
41	NC_015597	TCAA	2	8	31505	31512	50 %	25 %	0 %	25 %	334321250
42	NC_015597	TCGG	2	8	31960	31967	0 %	25 %	50 %	25 %	334321250
43	NC_015597	CGGA	2	8	31999	32006	25 %	0 %	50 %	25 %	334321250
44	NC_015597	CGAT	2	8	32270	32277	25 %	25 %	25 %	25 %	334321250
45	NC_015597	CAGA	2	8	32830	32837	50 %	0 %	25 %	25 %	334321250
46	NC_015597	CGCC	2	8	35324	35331	0 %	0 %	25 %	75 %	334321251
47	NC_015597	CAGC	2	8	35360	35367	25 %	0 %	25 %	50 %	334321251
48	NC_015597	GGTT	2	8	39622	39629	0 %	50 %	50 %	0 %	334321252
49	NC_015597	GAAG	2	8	42396	42403	50 %	0 %	50 %	0 %	334321253
50	NC_015597	TCAA	2	8	42474	42481	50 %	25 %	0 %	25 %	334321254
51	NC_015597	CAAT	2	8	42542	42549	50 %	25 %	0 %	25 %	334321254
52	NC_015597	CAAT	2	8	43053	43060	50 %	25 %	0 %	25 %	334321254
53	NC_015597	CTAT	2	8	43407	43414	25 %	50 %	0 %	25 %	334321255
54	NC_015597	CCTG	2	8	43559	43566	0 %	25 %	25 %	50 %	334321255
55	NC_015597	GGGC	2	8	46024	46031	0 %	0 %	75 %	25 %	334321257
56	NC_015597	CGTC	2	8	46852	46859	0 %	25 %	25 %	50 %	334321258
57	NC_015597	AATC	2	8	47913	47920	50 %	25 %	0 %	25 %	334321258
58	NC_015597	GAAC	2	8	48315	48322	50 %	0 %	25 %	25 %	334321259
59	NC_015597	CGAA	2	8	48536	48543	50 %	0 %	25 %	25 %	334321259
60	NC_015597	AAGC	2	8	49434	49441	50 %	0 %	25 %	25 %	334321259
61	NC_015597	CTGG	3	12	49732	49743	0 %	25 %	50 %	25 %	334321260
62	NC_015597	TCGC	2	8	50029	50036	0 %	25 %	25 %	50 %	334321260
63	NC_015597	CCTT	2	8	50702	50709	0 %	50 %	0 %	50 %	334321261
64	NC_015597	GTCG	2	8	50928	50935	0 %	25 %	50 %	25 %	334321261
65	NC_015597	TCCT	2	8	51110	51117	0 %	50 %	0 %	50 %	334321261
66	NC_015597	TCCT	2	8	51178	51185	0 %	50 %	0 %	50 %	334321261
67	NC_015597	TGGC	2	8	51436	51443	0 %	25 %	50 %	25 %	334321262
68	NC_015597	GCCG	2	8	51894	51901	0 %	0 %	50 %	50 %	334321262
69	NC_015597	ATCG	2	8	52598	52605	25 %	25 %	25 %	25 %	334321262
70	NC_015597	TCGC	2	8	52646	52653	0 %	25 %	25 %	50 %	334321262
71	NC_015597	AAAC	2	8	52764	52771	75 %	0 %	0 %	25 %	334321262
72	NC_015597	CCGC	2	8	52968	52975	0 %	0 %	25 %	75 %	334321262
73	NC_015597	TCTG	2	8	55134	55141	0 %	50 %	25 %	25 %	334321263
74	NC_015597	CGGG	2	8	55317	55324	0 %	0 %	75 %	25 %	334321263
75	NC_015597	CTGT	2	8	55600	55607	0 %	50 %	25 %	25 %	334321263
76	NC_015597	CAGG	2	8	55639	55646	25 %	0 %	50 %	25 %	334321263
77	NC_015597	GCAT	2	8	57725	57732	25 %	25 %	25 %	25 %	334321265
78	NC_015597	CAAA	2	8	61586	61593	75 %	0 %	0 %	25 %	334321266
79	NC_015597	GGTC	2	8	61839	61846	0 %	25 %	50 %	25 %	334321266
80	NC_015597	GCGG	2	8	65542	65549	0 %	0 %	75 %	25 %	334321268
81	NC_015597	GGGC	2	8	66332	66339	0 %	0 %	75 %	25 %	334321269
82	NC_015597	GCTC	2	8	68013	68020	0 %	25 %	25 %	50 %	334321270
83	NC_015597	GGTC	2	8	68893	68900	0 %	25 %	50 %	25 %	334321271
84	NC_015597	TGCG	2	8	69487	69494	0 %	25 %	50 %	25 %	334321271
85	NC_015597	GCAT	2	8	69634	69641	25 %	25 %	25 %	25 %	334321271
86	NC_015597	ACCT	2	8	70603	70610	25 %	25 %	0 %	50 %	334321272
87	NC_015597	GGCC	2	8	70644	70651	0 %	0 %	50 %	50 %	334321272
88	NC_015597	GAGC	2	8	71949	71956	25 %	0 %	50 %	25 %	334321273
89	NC_015597	CCCA	2	8	72331	72338	25 %	0 %	0 %	75 %	334321273
90	NC_015597	GGCC	2	8	72712	72719	0 %	0 %	50 %	50 %	334321274
91	NC_015597	ACCC	2	8	72902	72909	25 %	0 %	0 %	75 %	334321274
92	NC_015597	GTCG	2	8	73139	73146	0 %	25 %	50 %	25 %	334321274
93	NC_015597	CGGC	2	8	73259	73266	0 %	0 %	50 %	50 %	334321274
94	NC_015597	AGGT	2	8	73282	73289	25 %	25 %	50 %	0 %	334321274
95	NC_015597	CCGG	2	8	73345	73352	0 %	0 %	50 %	50 %	334321274
96	NC_015597	GCCA	2	8	73711	73718	25 %	0 %	25 %	50 %	334321274
97	NC_015597	GCCG	2	8	73772	73779	0 %	0 %	50 %	50 %	334321274
98	NC_015597	AGCG	2	8	74553	74560	25 %	0 %	50 %	25 %	334321275
99	NC_015597	GCCG	2	8	74856	74863	0 %	0 %	50 %	50 %	334321275
100	NC_015597	TTTG	2	8	75408	75415	0 %	75 %	25 %	0 %	334321276
101	NC_015597	AGCA	2	8	75528	75535	50 %	0 %	25 %	25 %	334321277
102	NC_015597	ATCC	2	8	76139	76146	25 %	25 %	0 %	50 %	334321277
103	NC_015597	GACA	2	8	76190	76197	50 %	0 %	25 %	25 %	334321277
104	NC_015597	TGCT	2	8	76501	76508	0 %	50 %	25 %	25 %	334321277
105	NC_015597	CCAG	2	8	76851	76858	25 %	0 %	25 %	50 %	334321278
106	NC_015597	GCTG	2	8	77215	77222	0 %	25 %	50 %	25 %	334321278
107	NC_015597	CTTC	2	8	78214	78221	0 %	50 %	0 %	50 %	334321279
108	NC_015597	CGTG	2	8	78256	78263	0 %	25 %	50 %	25 %	334321279
109	NC_015597	CGAT	2	8	79888	79895	25 %	25 %	25 %	25 %	334321280
110	NC_015597	AAGC	2	8	79933	79940	50 %	0 %	25 %	25 %	334321280
111	NC_015597	AGGC	2	8	82756	82763	25 %	0 %	50 %	25 %	334321281
112	NC_015597	CCCT	2	8	82893	82900	0 %	25 %	0 %	75 %	334321281
113	NC_015597	GTGG	2	8	83652	83659	0 %	25 %	75 %	0 %	334321282
114	NC_015597	GAAC	2	8	84134	84141	50 %	0 %	25 %	25 %	334321282
115	NC_015597	GGCT	2	8	85754	85761	0 %	25 %	50 %	25 %	334321283
116	NC_015597	CGAA	2	8	86130	86137	50 %	0 %	25 %	25 %	334321283
117	NC_015597	AGCT	2	8	86718	86725	25 %	25 %	25 %	25 %	334321283
118	NC_015597	CCGT	2	8	87071	87078	0 %	25 %	25 %	50 %	334321284
119	NC_015597	GCAT	2	8	87547	87554	25 %	25 %	25 %	25 %	334321285
120	NC_015597	AGCA	2	8	87702	87709	50 %	0 %	25 %	25 %	334321285
121	NC_015597	GGCG	2	8	88261	88268	0 %	0 %	75 %	25 %	334321286
122	NC_015597	GCCC	2	8	89019	89026	0 %	0 %	25 %	75 %	334321286
123	NC_015597	CATC	2	8	90468	90475	25 %	25 %	0 %	50 %	334321288
124	NC_015597	TTGA	2	8	90839	90846	25 %	50 %	25 %	0 %	334321288
125	NC_015597	GGCC	2	8	92228	92235	0 %	0 %	50 %	50 %	334321289
126	NC_015597	CCGA	2	8	92549	92556	25 %	0 %	25 %	50 %	334321289
127	NC_015597	CTTC	2	8	93244	93251	0 %	50 %	0 %	50 %	334321289
128	NC_015597	GATC	2	8	93914	93921	25 %	25 %	25 %	25 %	334321290
129	NC_015597	TATT	2	8	94387	94394	25 %	75 %	0 %	0 %	334321290
130	NC_015597	TCGC	2	8	95139	95146	0 %	25 %	25 %	50 %	334321291
131	NC_015597	CCAG	2	8	95606	95613	25 %	0 %	25 %	50 %	334321292
132	NC_015597	GCCT	2	8	96630	96637	0 %	25 %	25 %	50 %	334321293
133	NC_015597	TGCC	2	8	96808	96815	0 %	25 %	25 %	50 %	334321293
134	NC_015597	TCGG	2	8	97146	97153	0 %	25 %	50 %	25 %	334321294
135	NC_015597	GCTG	2	8	97312	97319	0 %	25 %	50 %	25 %	334321294
136	NC_015597	GAAG	2	8	97461	97468	50 %	0 %	50 %	0 %	334321295
137	NC_015597	AAAC	2	8	98430	98437	75 %	0 %	0 %	25 %	334321295
138	NC_015597	CCTG	2	8	100767	100774	0 %	25 %	25 %	50 %	334321297
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.