MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti AK83 plasmid pSINME01

Total Repeats: 3391

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015597	GC	3	6	230685	230690	0 %	0 %	50 %	50 %	334321411
3002	NC_015597	GC	3	6	230700	230705	0 %	0 %	50 %	50 %	334321411
3003	NC_015597	TCG	2	6	230757	230762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321411
3004	NC_015597	AGC	2	6	230775	230780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321411
3005	NC_015597	TCG	2	6	230802	230807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321411
3006	NC_015597	CGG	2	6	230821	230826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321411
3007	NC_015597	GGCACG	2	12	230945	230956	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	334321411
3008	NC_015597	CGA	2	6	230965	230970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321411
3009	NC_015597	ACT	2	6	230988	230993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334321411
3010	NC_015597	CGA	2	6	231001	231006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321411
3011	NC_015597	AT	3	6	231049	231054	50 %	50 %	0 %	0 %	334321411
3012	NC_015597	GCT	2	6	231070	231075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321411
3013	NC_015597	CGG	2	6	231079	231084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321411
3014	NC_015597	CGG	2	6	231091	231096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321411
3015	NC_015597	CGA	3	9	231199	231207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321411
3016	NC_015597	GCC	2	6	231222	231227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321411
3017	NC_015597	TCG	2	6	231267	231272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321411
3018	NC_015597	GCCG	2	8	231310	231317	0 %	0 %	50 %	50 %	334321412
3019	NC_015597	AGC	2	6	231347	231352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321412
3020	NC_015597	GGGC	2	8	231407	231414	0 %	0 %	75 %	25 %	334321412
3021	NC_015597	CCGG	2	8	231465	231472	0 %	0 %	50 %	50 %	334321412
3022	NC_015597	GTG	3	9	231517	231525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334321412
3023	NC_015597	CGGC	2	8	231547	231554	0 %	0 %	50 %	50 %	334321412
3024	NC_015597	CCT	2	6	231555	231560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334321412
3025	NC_015597	CG	3	6	231645	231650	0 %	0 %	50 %	50 %	334321412
3026	NC_015597	GCG	2	6	231746	231751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321412
3027	NC_015597	TCG	2	6	231780	231785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321412
3028	NC_015597	GCC	2	6	231802	231807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321412
3029	NC_015597	CGG	2	6	231908	231913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321412
3030	NC_015597	CGA	2	6	231963	231968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321412
3031	NC_015597	CTG	2	6	231975	231980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321412
3032	NC_015597	GCT	2	6	232011	232016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321412
3033	NC_015597	CGG	2	6	232048	232053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321412
3034	NC_015597	GAC	2	6	232141	232146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321412
3035	NC_015597	ATCG	2	8	232237	232244	25 %	25 %	25 %	25 %	334321412
3036	NC_015597	GCT	2	6	232287	232292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321412
3037	NC_015597	CGA	2	6	232328	232333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321412
3038	NC_015597	GC	3	6	232354	232359	0 %	0 %	50 %	50 %	334321412
3039	NC_015597	CGG	2	6	232380	232385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321412
3040	NC_015597	ATG	2	6	232425	232430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334321412
3041	NC_015597	GA	3	6	232434	232439	50 %	0 %	50 %	0 %	334321413
3042	NC_015597	CTT	2	6	232441	232446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334321413
3043	NC_015597	CGA	2	6	232469	232474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321413
3044	NC_015597	CG	3	6	232476	232481	0 %	0 %	50 %	50 %	334321413
3045	NC_015597	GCC	2	6	232582	232587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321413
3046	NC_015597	TGC	2	6	232621	232626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321413
3047	NC_015597	CCGG	2	8	232650	232657	0 %	0 %	50 %	50 %	334321413
3048	NC_015597	GGT	2	6	232701	232706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334321413
3049	NC_015597	TGA	2	6	232735	232740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334321413
3050	NC_015597	CCCT	2	8	232752	232759	0 %	25 %	0 %	75 %	334321413
3051	NC_015597	CAA	2	6	232808	232813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334321413
3052	NC_015597	CGCC	2	8	232835	232842	0 %	0 %	25 %	75 %	334321413
3053	NC_015597	CAG	2	6	232875	232880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321413
3054	NC_015597	GGC	2	6	232943	232948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321413
3055	NC_015597	GGA	2	6	233027	233032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334321413
3056	NC_015597	TCCCC	2	10	233228	233237	0 %	20 %	0 %	80 %	334321413
3057	NC_015597	TGC	2	6	233359	233364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321413
3058	NC_015597	GAT	2	6	233505	233510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334321413
3059	NC_015597	GAG	2	6	233538	233543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334321413
3060	NC_015597	CGA	2	6	233576	233581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321413
3061	NC_015597	GGT	2	6	233603	233608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334321413
3062	NC_015597	TGC	2	6	233647	233652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321413
3063	NC_015597	CTG	2	6	233670	233675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321413
3064	NC_015597	CGG	2	6	233729	233734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321413
3065	NC_015597	GGC	2	6	233744	233749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321413
3066	NC_015597	TTC	2	6	233760	233765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334321413
3067	NC_015597	GTC	2	6	233784	233789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321413
3068	NC_015597	TCT	2	6	233810	233815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334321413
3069	NC_015597	CAG	2	6	233841	233846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321413
3070	NC_015597	CGA	2	6	233864	233869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321413
3071	NC_015597	TGA	2	6	233890	233895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334321413
3072	NC_015597	TGG	2	6	234094	234099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334321413
3073	NC_015597	GCG	2	6	234138	234143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321413
3074	NC_015597	GAG	2	6	234189	234194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334321413
3075	NC_015597	TGC	2	6	234235	234240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321413
3076	NC_015597	GCT	2	6	234358	234363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321414
3077	NC_015597	TATG	2	8	234482	234489	25 %	50 %	25 %	0 %	334321414
3078	NC_015597	TGA	2	6	234558	234563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334321414
3079	NC_015597	GGCC	2	8	234577	234584	0 %	0 %	50 %	50 %	334321414
3080	NC_015597	TCG	2	6	234603	234608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321414
3081	NC_015597	CGG	2	6	234709	234714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321414
3082	NC_015597	CT	3	6	234766	234771	0 %	50 %	0 %	50 %	334321414
3083	NC_015597	CGG	2	6	234787	234792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321414
3084	NC_015597	CGC	2	6	234817	234822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321414
3085	NC_015597	CCG	2	6	234834	234839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321414
3086	NC_015597	CCG	2	6	234890	234895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321414
3087	NC_015597	GCG	2	6	234923	234928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321414
3088	NC_015597	TGC	2	6	235011	235016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321414
3089	NC_015597	CT	3	6	235029	235034	0 %	50 %	0 %	50 %	334321414
3090	NC_015597	GCT	2	6	235087	235092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321414
3091	NC_015597	TCG	2	6	235104	235109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321414
3092	NC_015597	GC	3	6	235113	235118	0 %	0 %	50 %	50 %	334321414
3093	NC_015597	CG	3	6	235145	235150	0 %	0 %	50 %	50 %	334321414
3094	NC_015597	GCC	2	6	235184	235189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321414
3095	NC_015597	GC	3	6	235266	235271	0 %	0 %	50 %	50 %	334321414
3096	NC_015597	CAG	2	6	235367	235372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321414
3097	NC_015597	ATC	2	6	235391	235396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334321414
3098	NC_015597	GTC	2	6	235403	235408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321414
3099	NC_015597	TCTT	2	8	235469	235476	0 %	75 %	0 %	25 %	334321414
3100	NC_015597	GAG	2	6	235536	235541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334321414
3101	NC_015597	GAG	2	6	235609	235614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334321415
3102	NC_015597	ACC	2	6	235642	235647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334321415
3103	NC_015597	GCCG	2	8	235660	235667	0 %	0 %	50 %	50 %	334321415
3104	NC_015597	CTCG	2	8	235737	235744	0 %	25 %	25 %	50 %	334321415
3105	NC_015597	TCG	2	6	235769	235774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321415
3106	NC_015597	GCT	2	6	235881	235886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321415
3107	NC_015597	ATCGA	2	10	235891	235900	40 %	20 %	20 %	20 %	334321415
3108	NC_015597	CCA	2	6	236048	236053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334321415
3109	NC_015597	CCT	2	6	236058	236063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334321415
3110	NC_015597	GC	4	8	236086	236093	0 %	0 %	50 %	50 %	334321415
3111	NC_015597	ATC	2	6	236101	236106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334321415
3112	NC_015597	CGG	2	6	236193	236198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321415
3113	NC_015597	CGA	2	6	236205	236210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321415
3114	NC_015597	TGC	2	6	236212	236217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321415
3115	NC_015597	CGG	2	6	236262	236267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321415
3116	NC_015597	ATA	2	6	236270	236275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334321415
3117	NC_015597	GCC	2	6	236332	236337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321415
3118	NC_015597	TGT	2	6	236349	236354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334321415
3119	NC_015597	ACC	2	6	236630	236635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334321415
3120	NC_015597	TGG	2	6	236681	236686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334321415
3121	NC_015597	GTC	2	6	237182	237187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321416
3122	NC_015597	GCG	2	6	237207	237212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321416
3123	NC_015597	AGT	2	6	237252	237257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334321416
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3126	NC_015597	CGT	2	6	237793	237798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321416
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3220	NC_015597	CG	3	6	243599	243604	0 %	0 %	50 %	50 %	334321421
3221	NC_015597	CAAC	2	8	243690	243697	50 %	0 %	0 %	50 %	334321421
3222	NC_015597	AGGT	2	8	243700	243707	25 %	25 %	50 %	0 %	334321421
3223	NC_015597	A	6	6	243711	243716	100 %	0 %	0 %	0 %	334321421
3224	NC_015597	GGC	2	6	243736	243741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321421
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3228	NC_015597	GTT	3	9	243966	243974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334321421
3229	NC_015597	CTG	2	6	244012	244017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321421
3230	NC_015597	GTTT	2	8	244021	244028	0 %	75 %	25 %	0 %	334321421
3231	NC_015597	CG	3	6	244171	244176	0 %	0 %	50 %	50 %	334321421
3232	NC_015597	CGG	2	6	244188	244193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321421
3233	NC_015597	AACCA	2	10	244202	244211	60 %	0 %	0 %	40 %	334321421
3234	NC_015597	TGA	2	6	244303	244308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334321421
3235	NC_015597	GGC	2	6	244323	244328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321421
3236	NC_015597	CGA	2	6	244452	244457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321421
3237	NC_015597	CGT	2	6	244461	244466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321421
3238	NC_015597	CCA	2	6	244477	244482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334321421
3239	NC_015597	ATC	2	6	244517	244522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334321421
3240	NC_015597	GTC	2	6	244600	244605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321421
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3242	NC_015597	CGG	2	6	244692	244697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321421
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3362	NC_015597	CGA	2	6	252178	252183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321429
3363	NC_015597	GGC	2	6	252221	252226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321429
3364	NC_015597	CGC	2	6	252227	252232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321429
3365	NC_015597	TTCA	2	8	252236	252243	25 %	50 %	0 %	25 %	334321429
3366	NC_015597	GGCT	2	8	252281	252288	0 %	25 %	50 %	25 %	334321429
3367	NC_015597	TG	3	6	252289	252294	0 %	50 %	50 %	0 %	334321429
3368	NC_015597	CGTC	2	8	252313	252320	0 %	25 %	25 %	50 %	334321429
3369	NC_015597	TACCC	2	10	252373	252382	20 %	20 %	0 %	60 %	334321429
3370	NC_015597	CAT	2	6	252535	252540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334321430
3371	NC_015597	CGT	2	6	252603	252608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321430
3372	NC_015597	CCT	2	6	252666	252671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334321430
3373	NC_015597	CAC	2	6	252673	252678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334321430
3374	NC_015597	CA	3	6	252771	252776	50 %	0 %	0 %	50 %	334321430
3375	NC_015597	CGG	2	6	252805	252810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321430
3376	NC_015597	GAA	2	6	252874	252879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334321430
3377	NC_015597	ACC	2	6	252995	253000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334321430
3378	NC_015597	CGT	2	6	253023	253028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321430
3379	NC_015597	GCAAG	2	10	253146	253155	40 %	0 %	40 %	20 %	334321430
3380	NC_015597	GTT	2	6	253181	253186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334321430
3381	NC_015597	ACC	2	6	253220	253225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334321430
3382	NC_015597	CGG	2	6	253244	253249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321430
3383	NC_015597	TTCG	2	8	253268	253275	0 %	50 %	25 %	25 %	334321430
3384	NC_015597	CTT	2	6	253302	253307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334321430
3385	NC_015597	CGC	2	6	253433	253438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321430
3386	NC_015597	CCA	2	6	253493	253498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334321430
3387	NC_015597	TCG	2	6	253526	253531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321430
3388	NC_015597	CAA	2	6	253563	253568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334321430
3389	NC_015597	TCG	2	6	253578	253583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321430
3390	NC_015597	GC	4	8	256106	256113	0 %	0 %	50 %	50 %	334321431
3391	NC_015597	GCGG	2	8	256125	256132	0 %	0 %	75 %	25 %	334321431

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.