MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti AK83 plasmid pSINME01

Total Repeats: 3391

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015597	TC	3	6	50777	50782	0 %	50 %	0 %	50 %	334321261
502	NC_015597	GAT	2	6	50793	50798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334321261
503	NC_015597	GCC	2	6	50833	50838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321261
504	NC_015597	CGG	2	6	50844	50849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321261
505	NC_015597	GTC	2	6	50908	50913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321261
506	NC_015597	GTCG	2	8	50928	50935	0 %	25 %	50 %	25 %	334321261
507	NC_015597	CTC	2	6	50940	50945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334321261
508	NC_015597	TATTG	2	10	50958	50967	20 %	60 %	20 %	0 %	334321261
509	NC_015597	TCCT	2	8	51110	51117	0 %	50 %	0 %	50 %	334321261
510	NC_015597	TCCT	2	8	51178	51185	0 %	50 %	0 %	50 %	334321261
511	NC_015597	GCC	2	6	51201	51206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321261
512	NC_015597	CTC	2	6	51274	51279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334321261
513	NC_015597	CGG	2	6	51284	51289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321261
514	NC_015597	TGG	2	6	51323	51328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334321261
515	NC_015597	GAT	2	6	51361	51366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334321261
516	NC_015597	AAT	2	6	51368	51373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334321261
517	NC_015597	TGA	2	6	51375	51380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334321262
518	NC_015597	AAG	2	6	51384	51389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334321262
519	NC_015597	TTC	2	6	51390	51395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334321262
520	NC_015597	CAT	2	6	51400	51405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334321262
521	NC_015597	CGAGGC	2	12	51418	51429	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	334321262
522	NC_015597	TGGC	2	8	51436	51443	0 %	25 %	50 %	25 %	334321262
523	NC_015597	CCG	2	6	51729	51734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321262
524	NC_015597	AGG	2	6	51759	51764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334321262
525	NC_015597	AAC	2	6	51816	51821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334321262
526	NC_015597	GC	3	6	51865	51870	0 %	0 %	50 %	50 %	334321262
527	NC_015597	GCCG	2	8	51894	51901	0 %	0 %	50 %	50 %	334321262
528	NC_015597	TGA	2	6	51916	51921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334321262
529	NC_015597	CAC	2	6	51925	51930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334321262
530	NC_015597	CGC	2	6	51964	51969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321262
531	NC_015597	GTC	2	6	51980	51985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321262
532	NC_015597	GCG	2	6	52001	52006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321262
533	NC_015597	TGC	2	6	52062	52067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321262
534	NC_015597	CCTCG	2	10	52113	52122	0 %	20 %	20 %	60 %	334321262
535	NC_015597	CGA	2	6	52249	52254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321262
536	NC_015597	TCG	2	6	52293	52298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321262
537	NC_015597	CG	3	6	52327	52332	0 %	0 %	50 %	50 %	334321262
538	NC_015597	AAC	2	6	52422	52427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334321262
539	NC_015597	CGG	2	6	52505	52510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321262
540	NC_015597	ATCG	2	8	52598	52605	25 %	25 %	25 %	25 %	334321262
541	NC_015597	TCGC	2	8	52646	52653	0 %	25 %	25 %	50 %	334321262
542	NC_015597	TGA	2	6	52680	52685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334321262
543	NC_015597	CGA	2	6	52690	52695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321262
544	NC_015597	GCT	2	6	52741	52746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321262
545	NC_015597	AAAC	2	8	52764	52771	75 %	0 %	0 %	25 %	334321262
546	NC_015597	TCA	2	6	52785	52790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334321262
547	NC_015597	GTT	2	6	52853	52858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334321262
548	NC_015597	CTC	2	6	52916	52921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334321262
549	NC_015597	TCT	2	6	52960	52965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334321262
550	NC_015597	CCGC	2	8	52968	52975	0 %	0 %	25 %	75 %	334321262
551	NC_015597	CGA	2	6	54713	54718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321263
552	NC_015597	GAA	2	6	54721	54726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334321263
553	NC_015597	GCC	2	6	54856	54861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321263
554	NC_015597	CA	3	6	54897	54902	50 %	0 %	0 %	50 %	334321263
555	NC_015597	GAA	2	6	54922	54927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334321263
556	NC_015597	GA	3	6	54961	54966	50 %	0 %	50 %	0 %	334321263
557	NC_015597	TC	3	6	54990	54995	0 %	50 %	0 %	50 %	334321263
558	NC_015597	GAT	2	6	54996	55001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334321263
559	NC_015597	TGA	2	6	55023	55028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334321263
560	NC_015597	TGA	2	6	55047	55052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334321263
561	NC_015597	GGT	2	6	55101	55106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334321263
562	NC_015597	T	6	6	55108	55113	0 %	100 %	0 %	0 %	334321263
563	NC_015597	GGA	2	6	55128	55133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334321263
564	NC_015597	TCTG	2	8	55134	55141	0 %	50 %	25 %	25 %	334321263
565	NC_015597	AGGGG	2	10	55161	55170	20 %	0 %	80 %	0 %	334321263
566	NC_015597	TCA	2	6	55261	55266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334321263
567	NC_015597	GAT	2	6	55282	55287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334321263
568	NC_015597	CGGG	2	8	55317	55324	0 %	0 %	75 %	25 %	334321263
569	NC_015597	TGG	2	6	55392	55397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334321263
570	NC_015597	CAT	2	6	55407	55412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334321263
571	NC_015597	GAA	2	6	55434	55439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334321263
572	NC_015597	CTGT	2	8	55600	55607	0 %	50 %	25 %	25 %	334321263
573	NC_015597	CAGG	2	8	55639	55646	25 %	0 %	50 %	25 %	334321263
574	NC_015597	GTC	2	6	55693	55698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321263
575	NC_015597	AT	3	6	55701	55706	50 %	50 %	0 %	0 %	334321263
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577	NC_015597	TG	3	6	56224	56229	0 %	50 %	50 %	0 %	334321264
578	NC_015597	GC	3	6	56241	56246	0 %	0 %	50 %	50 %	334321264
579	NC_015597	AAG	2	6	56247	56252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334321264
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581	NC_015597	ATC	2	6	56343	56348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334321264
582	NC_015597	TTG	2	6	56356	56361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334321264
583	NC_015597	TGC	2	6	56399	56404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321264
584	NC_015597	CGA	2	6	56414	56419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321264
585	NC_015597	CCG	2	6	56485	56490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321264
586	NC_015597	GAG	2	6	56523	56528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334321264
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588	NC_015597	AGC	2	6	56650	56655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321264
589	NC_015597	GC	3	6	56664	56669	0 %	0 %	50 %	50 %	334321264
590	NC_015597	CGC	2	6	56763	56768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321264
591	NC_015597	GCA	2	6	56771	56776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321264
592	NC_015597	CAC	2	6	56811	56816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334321264
593	NC_015597	CGC	2	6	56821	56826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321264
594	NC_015597	TTG	2	6	57316	57321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334321265
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596	NC_015597	TTC	2	6	57349	57354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334321265
597	NC_015597	CTC	2	6	57446	57451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334321265
598	NC_015597	GGC	2	6	57535	57540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321265
599	NC_015597	TCA	2	6	57587	57592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334321265
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601	NC_015597	GCAT	2	8	57725	57732	25 %	25 %	25 %	25 %	334321265
602	NC_015597	GCA	2	6	57820	57825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321265
603	NC_015597	TC	4	8	57888	57895	0 %	50 %	0 %	50 %	334321265
604	NC_015597	GCC	2	6	57917	57922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321265
605	NC_015597	TCG	2	6	57969	57974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321265
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608	NC_015597	CT	3	6	61390	61395	0 %	50 %	0 %	50 %	334321266
609	NC_015597	CGC	2	6	61407	61412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321266
610	NC_015597	CTG	2	6	61456	61461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321266
611	NC_015597	CTG	2	6	61474	61479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321266
612	NC_015597	TGT	2	6	61506	61511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334321266
613	NC_015597	CAAA	2	8	61586	61593	75 %	0 %	0 %	25 %	334321266
614	NC_015597	TGG	2	6	61706	61711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334321266
615	NC_015597	GGTC	2	8	61839	61846	0 %	25 %	50 %	25 %	334321266
616	NC_015597	GCG	2	6	61856	61861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321266
617	NC_015597	GCC	2	6	61870	61875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321266
618	NC_015597	GAA	2	6	61940	61945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334321266
619	NC_015597	AAC	2	6	64385	64390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334321267
620	NC_015597	CGACA	2	10	64403	64412	40 %	0 %	20 %	40 %	334321267
621	NC_015597	GGC	2	6	64455	64460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321267
622	NC_015597	CTA	2	6	64464	64469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334321267
623	NC_015597	GCA	2	6	64545	64550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321267
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625	NC_015597	GCA	2	6	64572	64577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321267
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627	NC_015597	ACC	2	6	64725	64730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334321267
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