MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingobium chlorophenolicum L-1 plasmid pSPHCH01

Total Repeats: 2688

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015595	CTT	2	6	22513	22518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334346544
502	NC_015595	GAACAG	2	12	22561	22572	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	334346544
503	NC_015595	CAG	3	9	22570	22578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346544
504	NC_015595	CAGCG	2	10	22600	22609	20 %	0 %	40 %	40 %	334346544
505	NC_015595	GCCG	2	8	22612	22619	0 %	0 %	50 %	50 %	334346544
506	NC_015595	CTT	2	6	22651	22656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334346544
507	NC_015595	GAA	2	6	22690	22695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334346544
508	NC_015595	CCG	2	6	22697	22702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346544
509	NC_015595	GC	3	6	22746	22751	0 %	0 %	50 %	50 %	334346544
510	NC_015595	CAG	2	6	22786	22791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346544
511	NC_015595	AGCGC	2	10	22976	22985	20 %	0 %	40 %	40 %	334346544
512	NC_015595	CCT	2	6	22989	22994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334346544
513	NC_015595	GGT	2	6	22999	23004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334346544
514	NC_015595	GC	3	6	23098	23103	0 %	0 %	50 %	50 %	334346544
515	NC_015595	GCG	2	6	23174	23179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346544
516	NC_015595	GGCAGC	2	12	23201	23212	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	334346544
517	NC_015595	GGC	2	6	23215	23220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346544
518	NC_015595	CAGG	2	8	23323	23330	25 %	0 %	50 %	25 %	334346544
519	NC_015595	CAA	2	6	23356	23361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334346544
520	NC_015595	GAC	2	6	23395	23400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346545
521	NC_015595	GC	4	8	23425	23432	0 %	0 %	50 %	50 %	334346545
522	NC_015595	GAT	2	6	23466	23471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334346545
523	NC_015595	CAG	2	6	23490	23495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346545
524	NC_015595	CAGCAC	2	12	23520	23531	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	334346545
525	NC_015595	GCC	2	6	23547	23552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346545
526	NC_015595	GGT	2	6	23580	23585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334346545
527	NC_015595	AGC	2	6	23626	23631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346545
528	NC_015595	GCAG	2	8	23633	23640	25 %	0 %	50 %	25 %	334346545
529	NC_015595	ACG	2	6	23650	23655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346545
530	NC_015595	CAT	2	6	23676	23681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334346545
531	NC_015595	GCC	2	6	23739	23744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346545
532	NC_015595	CAG	2	6	23754	23759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346545
533	NC_015595	GC	3	6	23876	23881	0 %	0 %	50 %	50 %	334346545
534	NC_015595	GAA	2	6	23892	23897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334346545
535	NC_015595	GAA	2	6	23907	23912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334346545
536	NC_015595	CGC	2	6	23925	23930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346545
537	NC_015595	CAG	3	9	23934	23942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346545
538	NC_015595	GCG	2	6	23958	23963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346545
539	NC_015595	TTG	2	6	23977	23982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334346545
540	NC_015595	ATC	2	6	23995	24000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334346545
541	NC_015595	CAT	2	6	24002	24007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334346546
542	NC_015595	CTC	2	6	24008	24013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334346546
543	NC_015595	CAG	2	6	24020	24025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346546
544	NC_015595	CGA	2	6	24037	24042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346546
545	NC_015595	TGA	2	6	24055	24060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334346546
546	NC_015595	CTC	2	6	24098	24103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334346546
547	NC_015595	AGC	2	6	24117	24122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346546
548	NC_015595	ATC	2	6	24153	24158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334346546
549	NC_015595	GCG	2	6	24171	24176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346546
550	NC_015595	CGGCA	2	10	24179	24188	20 %	0 %	40 %	40 %	334346546
551	NC_015595	GC	3	6	24193	24198	0 %	0 %	50 %	50 %	334346546
552	NC_015595	GCA	3	9	24205	24213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346546
553	NC_015595	GAT	2	6	24236	24241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334346546
554	NC_015595	GCGA	2	8	24250	24257	25 %	0 %	50 %	25 %	334346546
555	NC_015595	TCG	2	6	24273	24278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346546
556	NC_015595	CAG	2	6	24326	24331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346546
557	NC_015595	CGCC	2	8	24346	24353	0 %	0 %	25 %	75 %	334346546
558	NC_015595	CGCC	2	8	24472	24479	0 %	0 %	25 %	75 %	334346546
559	NC_015595	CCG	2	6	24483	24488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346546
560	NC_015595	GCC	2	6	24546	24551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346546
561	NC_015595	ACG	2	6	24558	24563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346546
562	NC_015595	CTC	2	6	24692	24697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334346547
563	NC_015595	CGCGT	2	10	24727	24736	0 %	20 %	40 %	40 %	334346547
564	NC_015595	CGAT	2	8	24742	24749	25 %	25 %	25 %	25 %	334346547
565	NC_015595	CCGC	2	8	24750	24757	0 %	0 %	25 %	75 %	334346547
566	NC_015595	CGC	2	6	24778	24783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346547
567	NC_015595	GC	4	8	24805	24812	0 %	0 %	50 %	50 %	334346547
568	NC_015595	CGT	2	6	24895	24900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346547
569	NC_015595	ATG	2	6	24909	24914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334346547
570	NC_015595	ACG	2	6	25017	25022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346547
571	NC_015595	GC	3	6	25028	25033	0 %	0 %	50 %	50 %	334346547
572	NC_015595	CGA	2	6	25110	25115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346547
573	NC_015595	GGCAG	2	10	25136	25145	20 %	0 %	60 %	20 %	334346547
574	NC_015595	CAT	2	6	25276	25281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334346548
575	NC_015595	CGG	2	6	25282	25287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346548
576	NC_015595	CGA	2	6	25338	25343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346548
577	NC_015595	GCC	2	6	25377	25382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346548
578	NC_015595	CTG	2	6	25423	25428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346548
579	NC_015595	GGC	2	6	25445	25450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346548
580	NC_015595	TTTC	2	8	25451	25458	0 %	75 %	0 %	25 %	334346548
581	NC_015595	CGC	2	6	25465	25470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346548
582	NC_015595	CGG	2	6	25491	25496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346548
583	NC_015595	GCA	2	6	25497	25502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346548
584	NC_015595	CAT	3	9	25516	25524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334346548
585	NC_015595	TCC	2	6	25532	25537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334346549
586	NC_015595	GGC	2	6	25646	25651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346549
587	NC_015595	CAT	2	6	25656	25661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334346549
588	NC_015595	CGC	2	6	25662	25667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346549
589	NC_015595	GCC	2	6	25719	25724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346549
590	NC_015595	ATCGA	2	10	25806	25815	40 %	20 %	20 %	20 %	334346549
591	NC_015595	ATC	2	6	25896	25901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334346549
592	NC_015595	GAT	2	6	25931	25936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334346549
593	NC_015595	CCG	2	6	25972	25977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346549
594	NC_015595	GTT	2	6	26072	26077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334346550
595	NC_015595	GTC	2	6	26096	26101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346550
596	NC_015595	CTC	2	6	26111	26116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334346550
597	NC_015595	GCA	2	6	26173	26178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346550
598	NC_015595	AAG	2	6	26189	26194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334346550
599	NC_015595	CCG	2	6	26211	26216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346550
600	NC_015595	GAC	2	6	26219	26224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346550
601	NC_015595	ATG	2	6	26310	26315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334346550
602	NC_015595	GCC	2	6	26454	26459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346550
603	NC_015595	CGC	2	6	26500	26505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346550
604	NC_015595	CCA	2	6	26506	26511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334346550
605	NC_015595	AGC	2	6	26577	26582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346550
606	NC_015595	AAGC	2	8	26595	26602	50 %	0 %	25 %	25 %	334346550
607	NC_015595	GCC	2	6	26654	26659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346550
608	NC_015595	GGCA	2	8	26678	26685	25 %	0 %	50 %	25 %	334346550
609	NC_015595	CGC	2	6	26705	26710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346550
610	NC_015595	ACG	2	6	26724	26729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346550
611	NC_015595	CACG	2	8	26746	26753	25 %	0 %	25 %	50 %	334346550
612	NC_015595	CAC	3	9	26762	26770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334346550
613	NC_015595	ACC	2	6	26814	26819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334346550
614	NC_015595	GCC	3	9	26852	26860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346550
615	NC_015595	GCACCT	2	12	26869	26880	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	334346550
616	NC_015595	CAC	2	6	26927	26932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334346550
617	NC_015595	CGCC	2	8	26973	26980	0 %	0 %	25 %	75 %	334346550
618	NC_015595	TCG	2	6	26983	26988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346550
619	NC_015595	TCGCG	2	10	27037	27046	0 %	20 %	40 %	40 %	334346550
620	NC_015595	GTC	2	6	27078	27083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346550
621	NC_015595	GCA	2	6	27121	27126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346550
622	NC_015595	CCG	2	6	27127	27132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346550
623	NC_015595	GTC	2	6	27167	27172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346550
624	NC_015595	CGC	2	6	27196	27201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346550
625	NC_015595	CTC	2	6	27305	27310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334346550
626	NC_015595	GTCG	2	8	27365	27372	0 %	25 %	50 %	25 %	334346550
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753	NC_015595	GAT	2	6	32855	32860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334346554
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755	NC_015595	CGC	2	6	32899	32904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346554
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1000	NC_015595	G	6	6	44813	44818	0 %	0 %	100 %	0 %	334346566

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