MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti AK83 plasmid pSINME02

Total Repeats: 137

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015592	GCCA	2	8	187	194	25 %	0 %	25 %	50 %	334321157
2	NC_015592	CGTT	2	8	869	876	0 %	50 %	25 %	25 %	334321158
3	NC_015592	GCGA	2	8	924	931	25 %	0 %	50 %	25 %	334321158
4	NC_015592	CCAG	2	8	2543	2550	25 %	0 %	25 %	50 %	334321159
5	NC_015592	CCGG	2	8	5463	5470	0 %	0 %	50 %	50 %	334321160
6	NC_015592	CAAC	2	8	5712	5719	50 %	0 %	0 %	50 %	334321160
7	NC_015592	TCGG	2	8	6064	6071	0 %	25 %	50 %	25 %	334321160
8	NC_015592	GGCC	2	8	6572	6579	0 %	0 %	50 %	50 %	334321161
9	NC_015592	GGCC	2	8	6863	6870	0 %	0 %	50 %	50 %	334321161
10	NC_015592	ATGT	2	8	8106	8113	25 %	50 %	25 %	0 %	334321162
11	NC_015592	GCAA	2	8	8603	8610	50 %	0 %	25 %	25 %	334321162
12	NC_015592	CGGC	2	8	10929	10936	0 %	0 %	50 %	50 %	334321163
13	NC_015592	CGTT	2	8	11056	11063	0 %	50 %	25 %	25 %	334321163
14	NC_015592	CAGC	2	8	11277	11284	25 %	0 %	25 %	50 %	334321163
15	NC_015592	AAAG	2	8	11751	11758	75 %	0 %	25 %	0 %	334321163
16	NC_015592	CGAT	2	8	12059	12066	25 %	25 %	25 %	25 %	334321163
17	NC_015592	ACGC	2	8	13097	13104	25 %	0 %	25 %	50 %	334321165
18	NC_015592	CAGT	2	8	13219	13226	25 %	25 %	25 %	25 %	334321165
19	NC_015592	TGGC	2	8	13479	13486	0 %	25 %	50 %	25 %	334321165
20	NC_015592	CGTG	2	8	13847	13854	0 %	25 %	50 %	25 %	334321165
21	NC_015592	TCGG	2	8	14354	14361	0 %	25 %	50 %	25 %	334321166
22	NC_015592	ATTG	2	8	14850	14857	25 %	50 %	25 %	0 %	334321166
23	NC_015592	ATCG	2	8	16207	16214	25 %	25 %	25 %	25 %	334321167
24	NC_015592	AGCG	2	8	16276	16283	25 %	0 %	50 %	25 %	334321167
25	NC_015592	AGCA	2	8	16330	16337	50 %	0 %	25 %	25 %	334321167
26	NC_015592	TTCA	2	8	16381	16388	25 %	50 %	0 %	25 %	334321167
27	NC_015592	TCGC	2	8	16708	16715	0 %	25 %	25 %	50 %	334321168
28	NC_015592	ATCG	2	8	17083	17090	25 %	25 %	25 %	25 %	334321168
29	NC_015592	ATCG	2	8	17554	17561	25 %	25 %	25 %	25 %	334321168
30	NC_015592	AACG	2	8	17974	17981	50 %	0 %	25 %	25 %	334321168
31	NC_015592	GATC	2	8	18072	18079	25 %	25 %	25 %	25 %	334321168
32	NC_015592	CGTT	2	8	18257	18264	0 %	50 %	25 %	25 %	334321169
33	NC_015592	GTCG	2	8	18311	18318	0 %	25 %	50 %	25 %	334321169
34	NC_015592	CCAG	2	8	18601	18608	25 %	0 %	25 %	50 %	334321169
35	NC_015592	GCCG	2	8	18817	18824	0 %	0 %	50 %	50 %	334321169
36	NC_015592	CTGC	2	8	19243	19250	0 %	25 %	25 %	50 %	334321169
37	NC_015592	GGCC	2	8	19373	19380	0 %	0 %	50 %	50 %	334321170
38	NC_015592	AAGT	2	8	19392	19399	50 %	25 %	25 %	0 %	334321170
39	NC_015592	TATT	2	8	19911	19918	25 %	75 %	0 %	0 %	334321170
40	NC_015592	GAAA	2	8	19999	20006	75 %	0 %	25 %	0 %	334321170
41	NC_015592	CCAA	2	8	20644	20651	50 %	0 %	0 %	50 %	334321171
42	NC_015592	ATCG	2	8	20949	20956	25 %	25 %	25 %	25 %	334321171
43	NC_015592	GCTT	2	8	21133	21140	0 %	50 %	25 %	25 %	334321172
44	NC_015592	CGAT	2	8	21463	21470	25 %	25 %	25 %	25 %	334321172
45	NC_015592	ATGG	2	8	21589	21596	25 %	25 %	50 %	0 %	334321172
46	NC_015592	GCTT	2	8	21717	21724	0 %	50 %	25 %	25 %	334321172
47	NC_015592	GTTC	2	8	22994	23001	0 %	50 %	25 %	25 %	334321173
48	NC_015592	CGGA	2	8	23318	23325	25 %	0 %	50 %	25 %	334321173
49	NC_015592	GGGA	2	8	23442	23449	25 %	0 %	75 %	0 %	334321173
50	NC_015592	GAAA	2	8	23678	23685	75 %	0 %	25 %	0 %	334321173
51	NC_015592	CCGT	2	8	24153	24160	0 %	25 %	25 %	50 %	334321173
52	NC_015592	AACG	2	8	24494	24501	50 %	0 %	25 %	25 %	334321174
53	NC_015592	AATA	2	8	24534	24541	75 %	25 %	0 %	0 %	334321174
54	NC_015592	TTCT	2	8	25028	25035	0 %	75 %	0 %	25 %	334321174
55	NC_015592	ATAG	2	8	25059	25066	50 %	25 %	25 %	0 %	334321174
56	NC_015592	GAAA	2	8	25168	25175	75 %	0 %	25 %	0 %	334321174
57	NC_015592	ACTC	2	8	25184	25191	25 %	25 %	0 %	50 %	334321174
58	NC_015592	GTCG	2	8	25455	25462	0 %	25 %	50 %	25 %	334321174
59	NC_015592	ACTC	2	8	25694	25701	25 %	25 %	0 %	50 %	334321174
60	NC_015592	CTGA	2	8	26546	26553	25 %	25 %	25 %	25 %	334321175
61	NC_015592	GATC	2	8	26747	26754	25 %	25 %	25 %	25 %	334321175
62	NC_015592	CAAC	2	8	26774	26781	50 %	0 %	0 %	50 %	334321175
63	NC_015592	TGGA	2	8	27062	27069	25 %	25 %	50 %	0 %	334321175
64	NC_015592	CTAA	2	8	27091	27098	50 %	25 %	0 %	25 %	334321175
65	NC_015592	TACG	2	8	27135	27142	25 %	25 %	25 %	25 %	334321175
66	NC_015592	GCCA	2	8	28599	28606	25 %	0 %	25 %	50 %	334321177
67	NC_015592	TTCT	2	8	28900	28907	0 %	75 %	0 %	25 %	334321178
68	NC_015592	CGCC	2	8	29061	29068	0 %	0 %	25 %	75 %	334321178
69	NC_015592	TGCG	2	8	29235	29242	0 %	25 %	50 %	25 %	334321178
70	NC_015592	TGAA	2	8	29510	29517	50 %	25 %	25 %	0 %	334321178
71	NC_015592	GCCG	2	8	29842	29849	0 %	0 %	50 %	50 %	334321178
72	NC_015592	CAGC	2	8	30773	30780	25 %	0 %	25 %	50 %	334321179
73	NC_015592	GCCC	2	8	33422	33429	0 %	0 %	25 %	75 %	334321180
74	NC_015592	CGCC	2	8	34948	34955	0 %	0 %	25 %	75 %	334321181
75	NC_015592	GTCC	2	8	35261	35268	0 %	25 %	25 %	50 %	334321181
76	NC_015592	CCGT	2	8	35704	35711	0 %	25 %	25 %	50 %	334321181
77	NC_015592	TGCG	2	8	35745	35752	0 %	25 %	50 %	25 %	334321181
78	NC_015592	TGTC	2	8	36373	36380	0 %	50 %	25 %	25 %	334321181
79	NC_015592	CCCG	2	8	36575	36582	0 %	0 %	25 %	75 %	334321181
80	NC_015592	CGCC	2	8	36597	36604	0 %	0 %	25 %	75 %	334321181
81	NC_015592	GCCT	2	8	36642	36649	0 %	25 %	25 %	50 %	334321181
82	NC_015592	GGTT	2	8	37095	37102	0 %	50 %	50 %	0 %	334321181
83	NC_015592	GATC	2	8	37136	37143	25 %	25 %	25 %	25 %	334321181
84	NC_015592	TCGT	2	8	37645	37652	0 %	50 %	25 %	25 %	334321181
85	NC_015592	TCGC	2	8	37703	37710	0 %	25 %	25 %	50 %	334321181
86	NC_015592	CGCC	2	8	38064	38071	0 %	0 %	25 %	75 %	334321182
87	NC_015592	ACAA	2	8	38127	38134	75 %	0 %	0 %	25 %	334321182
88	NC_015592	GAAC	2	8	38898	38905	50 %	0 %	25 %	25 %	334321183
89	NC_015592	TCGA	2	8	38977	38984	25 %	25 %	25 %	25 %	334321183
90	NC_015592	CGGG	2	8	43454	43461	0 %	0 %	75 %	25 %	334321187
91	NC_015592	GGCG	2	8	43751	43758	0 %	0 %	75 %	25 %	334321188
92	NC_015592	TTCC	2	8	43930	43937	0 %	50 %	0 %	50 %	334321188
93	NC_015592	CGGC	2	8	44103	44110	0 %	0 %	50 %	50 %	334321188
94	NC_015592	GCTC	2	8	44604	44611	0 %	25 %	25 %	50 %	334321189
95	NC_015592	CGTT	2	8	45012	45019	0 %	50 %	25 %	25 %	334321189
96	NC_015592	CCGT	2	8	45140	45147	0 %	25 %	25 %	50 %	334321189
97	NC_015592	CGTC	2	8	48075	48082	0 %	25 %	25 %	50 %	334321190
98	NC_015592	TCGC	2	8	48549	48556	0 %	25 %	25 %	50 %	334321190
99	NC_015592	GGCG	2	8	48672	48679	0 %	0 %	75 %	25 %	334321191
100	NC_015592	CCAA	2	8	51073	51080	50 %	0 %	0 %	50 %	334321193
101	NC_015592	AACG	2	8	52039	52046	50 %	0 %	25 %	25 %	334321194
102	NC_015592	GTCA	2	8	52241	52248	25 %	25 %	25 %	25 %	334321194
103	NC_015592	CCGG	2	8	52541	52548	0 %	0 %	50 %	50 %	334321194
104	NC_015592	GGTT	2	8	52867	52874	0 %	50 %	50 %	0 %	334321194
105	NC_015592	GGCA	2	8	52900	52907	25 %	0 %	50 %	25 %	334321194
106	NC_015592	GGCG	2	8	53421	53428	0 %	0 %	75 %	25 %	334321194
107	NC_015592	CCGG	2	8	53659	53666	0 %	0 %	50 %	50 %	334321194
108	NC_015592	AACC	2	8	53674	53681	50 %	0 %	0 %	50 %	334321194
109	NC_015592	TCGA	2	8	53735	53742	25 %	25 %	25 %	25 %	334321194
110	NC_015592	GGGC	2	8	54519	54526	0 %	0 %	75 %	25 %	334321195
111	NC_015592	CCGC	2	8	54830	54837	0 %	0 %	25 %	75 %	334321195
112	NC_015592	CTTA	2	8	55175	55182	25 %	50 %	0 %	25 %	334321196
113	NC_015592	GTTT	2	8	55220	55227	0 %	75 %	25 %	0 %	334321196
114	NC_015592	GCCA	2	8	56100	56107	25 %	0 %	25 %	50 %	334321197
115	NC_015592	GATC	2	8	56178	56185	25 %	25 %	25 %	25 %	334321197
116	NC_015592	CGGC	2	8	56927	56934	0 %	0 %	50 %	50 %	334321198
117	NC_015592	CTGG	2	8	57280	57287	0 %	25 %	50 %	25 %	334321199
118	NC_015592	GCCT	2	8	57709	57716	0 %	25 %	25 %	50 %	334321200
119	NC_015592	TCGC	2	8	58161	58168	0 %	25 %	25 %	50 %	334321201
120	NC_015592	AGCG	2	8	58256	58263	25 %	0 %	50 %	25 %	334321201
121	NC_015592	GTCT	2	8	59438	59445	0 %	50 %	25 %	25 %	334321204
122	NC_015592	GCCC	2	8	59489	59496	0 %	0 %	25 %	75 %	334321204
123	NC_015592	GCTC	2	8	59525	59532	0 %	25 %	25 %	50 %	334321204
124	NC_015592	GGCA	2	8	60972	60979	25 %	0 %	50 %	25 %	334321205
125	NC_015592	CAGC	2	8	61064	61071	25 %	0 %	25 %	50 %	334321205
126	NC_015592	CGCA	2	8	61323	61330	25 %	0 %	25 %	50 %	334321205
127	NC_015592	CATG	2	8	61825	61832	25 %	25 %	25 %	25 %	334321205
128	NC_015592	AGCG	2	8	61970	61977	25 %	0 %	50 %	25 %	334321205
129	NC_015592	GGCA	2	8	63448	63455	25 %	0 %	50 %	25 %	334321206
130	NC_015592	CGGC	2	8	63647	63654	0 %	0 %	50 %	50 %	334321206
131	NC_015592	GTCT	2	8	64448	64455	0 %	50 %	25 %	25 %	334321208
132	NC_015592	CGAG	2	8	64833	64840	25 %	0 %	50 %	25 %	334321210
133	NC_015592	GCCT	2	8	65567	65574	0 %	25 %	25 %	50 %	334321211
134	NC_015592	GGAG	2	8	65707	65714	25 %	0 %	75 %	0 %	334321211
135	NC_015592	TGGC	2	8	67738	67745	0 %	25 %	50 %	25 %	334321212
136	NC_015592	GGTC	2	8	68655	68662	0 %	25 %	50 %	25 %	334321213
137	NC_015592	TCCG	2	8	69461	69468	0 %	25 %	25 %	50 %	334321214

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.