MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 1359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015436	AACGA	2	10	422	431	60 %	0 %	20 %	20 %	330835984
2	NC_015436	ATTCC	2	10	1935	1944	20 %	40 %	0 %	40 %	330835985
3	NC_015436	AATAC	2	10	2261	2270	60 %	20 %	0 %	20 %	330835985
4	NC_015436	AGAAA	2	10	3189	3198	80 %	0 %	20 %	0 %	330835986
5	NC_015436	GACCA	2	10	3303	3312	40 %	0 %	20 %	40 %	330835986
6	NC_015436	GAAAA	2	10	11661	11670	80 %	0 %	20 %	0 %	330835996
7	NC_015436	TGATT	2	10	14398	14407	20 %	60 %	20 %	0 %	330835997
8	NC_015436	TGGTC	2	10	15716	15725	0 %	40 %	40 %	20 %	330835998
9	NC_015436	GATAG	2	10	16248	16257	40 %	20 %	40 %	0 %	330835998
10	NC_015436	CGGGA	2	10	18725	18734	20 %	0 %	60 %	20 %	330836000
11	NC_015436	GTAGC	2	10	26160	26169	20 %	20 %	40 %	20 %	330836007
12	NC_015436	GTACG	2	10	27236	27245	20 %	20 %	40 %	20 %	330836008
13	NC_015436	TGATG	2	10	28812	28821	20 %	40 %	40 %	0 %	330836009
14	NC_015436	TTGAG	2	10	30947	30956	20 %	40 %	40 %	0 %	330836012
15	NC_015436	GGGGA	2	10	31576	31585	20 %	0 %	80 %	0 %	330836012
16	NC_015436	GAAAA	2	10	32316	32325	80 %	0 %	20 %	0 %	330836013
17	NC_015436	GCTTG	2	10	34154	34163	0 %	40 %	40 %	20 %	330836014
18	NC_015436	TTGGA	2	10	38784	38793	20 %	40 %	40 %	0 %	330836020
19	NC_015436	CGGAA	2	10	39878	39887	40 %	0 %	40 %	20 %	330836021
20	NC_015436	CGAAC	2	10	39922	39931	40 %	0 %	20 %	40 %	330836021
21	NC_015436	CGGGG	2	10	41496	41505	0 %	0 %	80 %	20 %	330836022
22	NC_015436	AGGGA	2	10	42597	42606	40 %	0 %	60 %	0 %	330836024
23	NC_015436	GTCCA	2	10	45697	45706	20 %	20 %	20 %	40 %	330836027
24	NC_015436	TGTCC	2	10	49832	49841	0 %	40 %	20 %	40 %	330836030
25	NC_015436	CCGTC	2	10	53540	53549	0 %	20 %	20 %	60 %	330836034
26	NC_015436	ATGAA	2	10	55600	55609	60 %	20 %	20 %	0 %	330836034
27	NC_015436	CGTCC	2	10	56893	56902	0 %	20 %	20 %	60 %	330836035
28	NC_015436	ACGTC	2	10	57288	57297	20 %	20 %	20 %	40 %	330836035
29	NC_015436	AACGG	2	10	58904	58913	40 %	0 %	40 %	20 %	330836036
30	NC_015436	TGCAT	2	10	62201	62210	20 %	40 %	20 %	20 %	330836038
31	NC_015436	CCTTG	2	10	62301	62310	0 %	40 %	20 %	40 %	330836038
32	NC_015436	CAGGA	2	10	63058	63067	40 %	0 %	40 %	20 %	330836038
33	NC_015436	GAGCG	2	10	64713	64722	20 %	0 %	60 %	20 %	330836038
34	NC_015436	TGTCC	2	10	66591	66600	0 %	40 %	20 %	40 %	330836040
35	NC_015436	CCATG	2	10	66933	66942	20 %	20 %	20 %	40 %	330836040
36	NC_015436	CCGCG	2	10	68093	68102	0 %	0 %	40 %	60 %	330836041
37	NC_015436	AAAGG	2	10	74281	74290	60 %	0 %	40 %	0 %	330836044
38	NC_015436	CGGCA	2	10	80020	80029	20 %	0 %	40 %	40 %	330836048
39	NC_015436	GGGAA	2	10	85421	85430	40 %	0 %	60 %	0 %	330836055
40	NC_015436	GATGA	2	10	89947	89956	40 %	20 %	40 %	0 %	330836060
41	NC_015436	TGAAC	2	10	92289	92298	40 %	20 %	20 %	20 %	330836062
42	NC_015436	AGCCG	2	10	93783	93792	20 %	0 %	40 %	40 %	330836063
43	NC_015436	TTGAA	2	10	94308	94317	40 %	40 %	20 %	0 %	330836064
44	NC_015436	GAATC	2	10	97257	97266	40 %	20 %	20 %	20 %	330836066
45	NC_015436	TAAAA	2	10	97602	97611	80 %	20 %	0 %	0 %	330836066
46	NC_015436	AGGGA	2	10	103741	103750	40 %	0 %	60 %	0 %	330836071
47	NC_015436	CCAAT	2	10	106017	106026	40 %	20 %	0 %	40 %	330836072
48	NC_015436	TCGGC	2	10	107830	107839	0 %	20 %	40 %	40 %	330836073
49	NC_015436	CGTTT	2	10	108485	108494	0 %	60 %	20 %	20 %	330836074
50	NC_015436	ACATA	2	10	115250	115259	60 %	20 %	0 %	20 %	330836079
51	NC_015436	GAAAG	2	10	118477	118486	60 %	0 %	40 %	0 %	330836082
52	NC_015436	TTTGG	2	10	119974	119983	0 %	60 %	40 %	0 %	330836083
53	NC_015436	GTTTT	2	10	120319	120328	0 %	80 %	20 %	0 %	330836083
54	NC_015436	GCATG	2	10	124402	124411	20 %	20 %	40 %	20 %	330836086
55	NC_015436	AATGG	2	10	124510	124519	40 %	20 %	40 %	0 %	330836086
56	NC_015436	AGCGT	2	10	127209	127218	20 %	20 %	40 %	20 %	330836088
57	NC_015436	AGGAC	2	10	134484	134493	40 %	0 %	40 %	20 %	330836095
58	NC_015436	ACAGA	2	10	134923	134932	60 %	0 %	20 %	20 %	330836096
59	NC_015436	TGAAA	2	10	136192	136201	60 %	20 %	20 %	0 %	330836097
60	NC_015436	CATTG	2	10	139472	139481	20 %	40 %	20 %	20 %	330836100
61	NC_015436	GTAAG	2	10	141138	141147	40 %	20 %	40 %	0 %	330836101
62	NC_015436	TGCTG	2	10	144119	144128	0 %	40 %	40 %	20 %	330836104
63	NC_015436	TGGCT	2	10	144489	144498	0 %	40 %	40 %	20 %	330836104
64	NC_015436	CAAGG	2	10	146630	146639	40 %	0 %	40 %	20 %	330836106
65	NC_015436	GAGGG	3	15	151036	151050	20 %	0 %	80 %	0 %	330836109
66	NC_015436	GTTTT	2	10	153662	153671	0 %	80 %	20 %	0 %	330836111
67	NC_015436	AGCCA	2	10	156353	156362	40 %	0 %	20 %	40 %	330836113
68	NC_015436	TGTGG	2	10	159439	159448	0 %	40 %	60 %	0 %	330836116
69	NC_015436	TTTTC	2	10	160812	160821	0 %	80 %	0 %	20 %	330836118
70	NC_015436	GTTCT	2	10	161383	161392	0 %	60 %	20 %	20 %	330836119
71	NC_015436	CATTG	2	10	163729	163738	20 %	40 %	20 %	20 %	330836122
72	NC_015436	GTGAT	2	10	164202	164211	20 %	40 %	40 %	0 %	330836122
73	NC_015436	CATGC	2	10	166995	167004	20 %	20 %	20 %	40 %	330836125
74	NC_015436	TTTCT	2	10	167053	167062	0 %	80 %	0 %	20 %	330836125
75	NC_015436	TGGAT	2	10	168771	168780	20 %	40 %	40 %	0 %	330836126
76	NC_015436	CAAGA	2	10	169590	169599	60 %	0 %	20 %	20 %	330836127
77	NC_015436	TAATA	2	10	171270	171279	60 %	40 %	0 %	0 %	330836130
78	NC_015436	TTTTC	2	10	171583	171592	0 %	80 %	0 %	20 %	330836130
79	NC_015436	GATGA	2	10	173739	173748	40 %	20 %	40 %	0 %	330836133
80	NC_015436	CCATG	2	10	174325	174334	20 %	20 %	20 %	40 %	330836133
81	NC_015436	CACAT	2	10	175041	175050	40 %	20 %	0 %	40 %	330836133
82	NC_015436	CATCG	2	10	178404	178413	20 %	20 %	20 %	40 %	330836136
83	NC_015436	CACCG	2	10	179956	179965	20 %	0 %	20 %	60 %	330836137
84	NC_015436	TGTCC	2	10	180645	180654	0 %	40 %	20 %	40 %	330836137
85	NC_015436	TCATC	2	10	182410	182419	20 %	40 %	0 %	40 %	330836139
86	NC_015436	CAAGG	2	10	184876	184885	40 %	0 %	40 %	20 %	330836141
87	NC_015436	GATGA	2	10	188312	188321	40 %	20 %	40 %	0 %	330836145
88	NC_015436	CATGC	2	10	188479	188488	20 %	20 %	20 %	40 %	330836145
89	NC_015436	TCCTG	2	10	189358	189367	0 %	40 %	20 %	40 %	330836145
90	NC_015436	AATGC	2	10	189739	189748	40 %	20 %	20 %	20 %	330836145
91	NC_015436	TCCTG	2	10	190248	190257	0 %	40 %	20 %	40 %	330836145
92	NC_015436	AGGTA	2	10	190796	190805	40 %	20 %	40 %	0 %	330836145
93	NC_015436	TTCCG	2	10	194492	194501	0 %	40 %	20 %	40 %	330836149
94	NC_015436	TCCGT	2	10	195934	195943	0 %	40 %	20 %	40 %	330836150
95	NC_015436	AATCA	2	10	198047	198056	60 %	20 %	0 %	20 %	330836151
96	NC_015436	AAGTG	2	10	199544	199553	40 %	20 %	40 %	0 %	330836152
97	NC_015436	AGAAA	2	10	200576	200585	80 %	0 %	20 %	0 %	330836153
98	NC_015436	CTTGG	2	10	200721	200730	0 %	40 %	40 %	20 %	330836153
99	NC_015436	TTCTT	2	10	201409	201418	0 %	80 %	0 %	20 %	330836153
100	NC_015436	GGACG	2	10	202542	202551	20 %	0 %	60 %	20 %	330836155
101	NC_015436	TCTCA	2	10	202783	202792	20 %	40 %	0 %	40 %	330836155
102	NC_015436	TGTTC	2	10	207902	207911	0 %	60 %	20 %	20 %	330836160
103	NC_015436	TTTCA	2	10	207944	207953	20 %	60 %	0 %	20 %	330836160
104	NC_015436	GAAAA	2	10	209748	209757	80 %	0 %	20 %	0 %	330836160
105	NC_015436	AAGAC	2	10	210157	210166	60 %	0 %	20 %	20 %	330836160
106	NC_015436	ATTAT	2	10	212721	212730	40 %	60 %	0 %	0 %	330836162
107	NC_015436	CAACT	2	10	213483	213492	40 %	20 %	0 %	40 %	330836163
108	NC_015436	ACTTG	2	10	213592	213601	20 %	40 %	20 %	20 %	330836163
109	NC_015436	TCCGT	2	10	219500	219509	0 %	40 %	20 %	40 %	330836172
110	NC_015436	TGCCG	2	10	219644	219653	0 %	20 %	40 %	40 %	330836172
111	NC_015436	GTCCA	2	10	222065	222074	20 %	20 %	20 %	40 %	330836176
112	NC_015436	TCACA	2	10	223038	223047	40 %	20 %	0 %	40 %	330836178
113	NC_015436	AAAGG	2	10	223062	223071	60 %	0 %	40 %	0 %	330836178
114	NC_015436	CAAGG	2	10	225351	225360	40 %	0 %	40 %	20 %	330836180
115	NC_015436	ACATC	2	10	227098	227107	40 %	20 %	0 %	40 %	330836182
116	NC_015436	CTTTT	2	10	227112	227121	0 %	80 %	0 %	20 %	330836182
117	NC_015436	GGAAG	2	10	227285	227294	40 %	0 %	60 %	0 %	330836182
118	NC_015436	GCGCC	2	10	233267	233276	0 %	0 %	40 %	60 %	330836188
119	NC_015436	TGGCT	2	10	235603	235612	0 %	40 %	40 %	20 %	330836190
120	NC_015436	TGTCC	2	10	235870	235879	0 %	40 %	20 %	40 %	330836190
121	NC_015436	GGAAT	2	10	237448	237457	40 %	20 %	40 %	0 %	330836191
122	NC_015436	GGTCT	2	10	240026	240035	0 %	40 %	40 %	20 %	330836194
123	NC_015436	TGGGA	2	10	241243	241252	20 %	20 %	60 %	0 %	330836195
124	NC_015436	TGGCA	2	10	241528	241537	20 %	20 %	40 %	20 %	330836195
125	NC_015436	TGAAC	2	10	241583	241592	40 %	20 %	20 %	20 %	330836195
126	NC_015436	ATGCG	2	10	242485	242494	20 %	20 %	40 %	20 %	330836195
127	NC_015436	TTTCT	2	10	243297	243306	0 %	80 %	0 %	20 %	330836196
128	NC_015436	GAAAA	2	10	250591	250600	80 %	0 %	20 %	0 %	330836198
129	NC_015436	CCGTT	2	10	251422	251431	0 %	40 %	20 %	40 %	330836199
130	NC_015436	GGAGC	2	10	252033	252042	20 %	0 %	60 %	20 %	330836200
131	NC_015436	TCAGG	2	10	254869	254878	20 %	20 %	40 %	20 %	330836203
132	NC_015436	GGACG	2	10	257984	257993	20 %	0 %	60 %	20 %	330836205
133	NC_015436	GGACG	2	10	258131	258140	20 %	0 %	60 %	20 %	330836205
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