MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 39616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
39501	NC_015436	CCT	2	6	2220226	2220231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330837802
39502	NC_015436	TGC	2	6	2220262	2220267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837802
39503	NC_015436	CAT	2	6	2220271	2220276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837802
39504	NC_015436	GAA	2	6	2220339	2220344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330837802
39505	NC_015436	TCA	2	6	2220484	2220489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837802
39506	NC_015436	GAT	2	6	2220533	2220538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837802
39507	NC_015436	T	6	6	2220641	2220646	0 %	100 %	0 %	0 %	330837802
39508	NC_015436	AAG	2	6	2220648	2220653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330837802
39509	NC_015436	CAA	2	6	2220694	2220699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330837802
39510	NC_015436	ATG	2	6	2220717	2220722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837802
39511	NC_015436	CAG	2	6	2220857	2220862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837802
39512	NC_015436	CTT	2	6	2220866	2220871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837802
39513	NC_015436	GGC	2	6	2220887	2220892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330837802
39514	NC_015436	ACC	2	6	2220926	2220931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330837802
39515	NC_015436	ACG	2	6	2221217	2221222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837803
39516	NC_015436	TGA	2	6	2221248	2221253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837803
39517	NC_015436	CAA	2	6	2221254	2221259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330837803
39518	NC_015436	CGTC	2	8	2221266	2221273	0 %	25 %	25 %	50 %	330837803
39519	NC_015436	GCTG	2	8	2221288	2221295	0 %	25 %	50 %	25 %	330837803
39520	NC_015436	CAC	2	6	2221342	2221347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330837803
39521	NC_015436	GAA	3	9	2221378	2221386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330837803
39522	NC_015436	CAG	2	6	2222636	2222641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837804
39523	NC_015436	TCT	2	6	2222683	2222688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837804
39524	NC_015436	CGA	2	6	2222735	2222740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837804
39525	NC_015436	TTC	2	6	2222755	2222760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837804
39526	NC_015436	TTCC	2	8	2222788	2222795	0 %	50 %	0 %	50 %	330837804
39527	NC_015436	TGTC	2	8	2222829	2222836	0 %	50 %	25 %	25 %	330837804
39528	NC_015436	CAT	2	6	2222858	2222863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837804
39529	NC_015436	TCA	2	6	2222866	2222871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837804
39530	NC_015436	TCT	2	6	2222903	2222908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837804
39531	NC_015436	ATC	2	6	2223001	2223006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837804
39532	NC_015436	ATC	2	6	2223021	2223026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837804
39533	NC_015436	ATC	2	6	2223051	2223056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837804
39534	NC_015436	ACC	2	6	2223138	2223143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330837804
39535	NC_015436	CAT	2	6	2223156	2223161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837804
39536	NC_015436	GTC	2	6	2223162	2223167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837804
39537	NC_015436	TCA	2	6	2223176	2223181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837804
39538	NC_015436	GCTC	2	8	2223182	2223189	0 %	25 %	25 %	50 %	330837804
39539	NC_015436	TCA	2	6	2223208	2223213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837804
39540	NC_015436	GC	3	6	2223223	2223228	0 %	0 %	50 %	50 %	330837804
39541	NC_015436	TCA	2	6	2223313	2223318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837804
39542	NC_015436	TGA	2	6	2223335	2223340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837804
39543	NC_015436	GGA	2	6	2223342	2223347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330837804
39544	NC_015436	GCT	2	6	2223377	2223382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837804
39545	NC_015436	TGC	3	9	2223386	2223394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837804
39546	NC_015436	CGA	2	6	2223506	2223511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837804
39547	NC_015436	ATC	2	6	2223513	2223518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837804
39548	NC_015436	TGA	2	6	2223521	2223526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837804
39549	NC_015436	TCC	2	6	2223574	2223579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330837804
39550	NC_015436	ACG	2	6	2223583	2223588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837804
39551	NC_015436	TGA	2	6	2223611	2223616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837804
39552	NC_015436	TGA	2	6	2223638	2223643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837804
39553	NC_015436	TAA	2	6	2223781	2223786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330837804
39554	NC_015436	GAT	2	6	2223867	2223872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837804
39555	NC_015436	TGA	2	6	2223950	2223955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837804
39556	NC_015436	TCA	2	6	2223967	2223972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837804
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39559	NC_015436	GGA	2	6	2224175	2224180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330837804
39560	NC_015436	GT	3	6	2224184	2224189	0 %	50 %	50 %	0 %	330837804
39561	NC_015436	CCA	2	6	2224226	2224231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330837804
39562	NC_015436	TCA	2	6	2224258	2224263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837804
39563	NC_015436	TCT	2	6	2224310	2224315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837804
39564	NC_015436	CTC	2	6	2224386	2224391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330837804
39565	NC_015436	GAT	2	6	2224446	2224451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837804
39566	NC_015436	TCG	2	6	2224595	2224600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837804
39567	NC_015436	GCT	2	6	2224620	2224625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837804
39568	NC_015436	GGAG	2	8	2224676	2224683	25 %	0 %	75 %	0 %	330837804
39569	NC_015436	TCA	2	6	2224684	2224689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837804
39570	NC_015436	CGG	2	6	2224785	2224790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330837804
39571	NC_015436	GAC	2	6	2224827	2224832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837804
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39573	NC_015436	CGA	2	6	2224925	2224930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837804
39574	NC_015436	CGCA	2	8	2224959	2224966	25 %	0 %	25 %	50 %	330837804
39575	NC_015436	CATA	2	8	2224976	2224983	50 %	25 %	0 %	25 %	330837804
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39578	NC_015436	TTC	2	6	2225186	2225191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837805
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39581	NC_015436	GGC	2	6	2225363	2225368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330837805
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39583	NC_015436	CAA	2	6	2225540	2225545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330837805
39584	NC_015436	CATCAG	2	12	2225569	2225580	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	330837805
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39586	NC_015436	TTC	2	6	2225690	2225695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837805
39587	NC_015436	AGGA	2	8	2225732	2225739	50 %	0 %	50 %	0 %	330837805
39588	NC_015436	CTCC	2	8	2225775	2225782	0 %	25 %	0 %	75 %	330837805
39589	NC_015436	GGC	2	6	2225906	2225911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330837805
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39594	NC_015436	CT	3	6	2226110	2226115	0 %	50 %	0 %	50 %	330837805
39595	NC_015436	GTC	2	6	2226126	2226131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837805
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39597	NC_015436	TTG	2	6	2226363	2226368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330837805
39598	NC_015436	TTG	2	6	2226372	2226377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330837805
39599	NC_015436	CAA	2	6	2226385	2226390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330837805
39600	NC_015436	GCC	2	6	2226401	2226406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330837805
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39602	NC_015436	CTC	2	6	2226434	2226439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330837805
39603	NC_015436	TTG	2	6	2226474	2226479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330837805
39604	NC_015436	TCG	2	6	2226528	2226533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837805
39605	NC_015436	TCCA	2	8	2226675	2226682	25 %	25 %	0 %	50 %	330837805
39606	NC_015436	ACG	2	6	2226699	2226704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837805
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39608	NC_015436	GCC	2	6	2226725	2226730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330837805
39609	NC_015436	TCC	2	6	2226761	2226766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330837805
39610	NC_015436	GAC	2	6	2226785	2226790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837805
39611	NC_015436	GATG	2	8	2226817	2226824	25 %	25 %	50 %	0 %	330837805
39612	NC_015436	TGT	2	6	2226928	2226933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330837805
39613	NC_015436	GTG	2	6	2226953	2226958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330837805
39614	NC_015436	ATG	2	6	2227085	2227090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837805
39615	NC_015436	T	6	6	2227100	2227105	0 %	100 %	0 %	0 %	330837805
39616	NC_015436	ATC	2	6	2227127	2227132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837805

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