MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 39616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015436	GTTC	2	8	25895	25902	0 %	50 %	25 %	25 %	330836007
502	NC_015436	CTC	2	6	25949	25954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836007
503	NC_015436	TGG	2	6	25977	25982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836007
504	NC_015436	AATC	2	8	25996	26003	50 %	25 %	0 %	25 %	330836007
505	NC_015436	GTAGC	2	10	26160	26169	20 %	20 %	40 %	20 %	330836007
506	NC_015436	ATG	2	6	26175	26180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836007
507	NC_015436	CGG	2	6	26287	26292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836007
508	NC_015436	CTT	2	6	26305	26310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836007
509	NC_015436	TGA	2	6	26329	26334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836007
510	NC_015436	ATC	2	6	26348	26353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836007
511	NC_015436	ATG	2	6	26391	26396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836007
512	NC_015436	AAG	2	6	26465	26470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836007
513	NC_015436	GAA	2	6	26526	26531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836007
514	NC_015436	A	6	6	26530	26535	100 %	0 %	0 %	0 %	330836007
515	NC_015436	AAG	2	6	26539	26544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836007
516	NC_015436	CAT	2	6	26710	26715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836008
517	NC_015436	CGT	2	6	26808	26813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836008
518	NC_015436	CCAT	2	8	26854	26861	25 %	25 %	0 %	50 %	330836008
519	NC_015436	TTC	2	6	26996	27001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836008
520	NC_015436	CCG	2	6	27035	27040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836008
521	NC_015436	TAT	2	6	27041	27046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836008
522	NC_015436	A	6	6	27072	27077	100 %	0 %	0 %	0 %	330836008
523	NC_015436	TC	3	6	27091	27096	0 %	50 %	0 %	50 %	330836008
524	NC_015436	AGG	2	6	27106	27111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836008
525	NC_015436	AGG	2	6	27127	27132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836008
526	NC_015436	GGACGG	2	12	27182	27193	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	330836008
527	NC_015436	AC	3	6	27201	27206	50 %	0 %	0 %	50 %	330836008
528	NC_015436	CAG	2	6	27230	27235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836008
529	NC_015436	GTACG	2	10	27236	27245	20 %	20 %	40 %	20 %	330836008
530	NC_015436	TGA	2	6	27302	27307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836008
531	NC_015436	CTT	2	6	27340	27345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836008
532	NC_015436	ACA	2	6	27388	27393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836008
533	NC_015436	TGA	2	6	27406	27411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836008
534	NC_015436	GGA	2	6	27418	27423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836008
535	NC_015436	GCG	2	6	27493	27498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836008
536	NC_015436	TGCC	2	8	27566	27573	0 %	25 %	25 %	50 %	330836008
537	NC_015436	AGA	2	6	27622	27627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836008
538	NC_015436	TTC	2	6	27630	27635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836008
539	NC_015436	GCC	2	6	27869	27874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836009
540	NC_015436	ATC	2	6	27984	27989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836009
541	NC_015436	GGT	2	6	27990	27995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836009
542	NC_015436	GCG	2	6	28027	28032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836009
543	NC_015436	ACT	2	6	28093	28098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836009
544	NC_015436	CCCG	2	8	28102	28109	0 %	0 %	25 %	75 %	330836009
545	NC_015436	GTT	2	6	28197	28202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836009
546	NC_015436	TGA	2	6	28256	28261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836009
547	NC_015436	ATG	2	6	28360	28365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836009
548	NC_015436	TGT	2	6	28372	28377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836009
549	NC_015436	AGA	2	6	28409	28414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836009
550	NC_015436	GAT	2	6	28518	28523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836009
551	NC_015436	GAA	2	6	28525	28530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836009
552	NC_015436	CAT	2	6	28610	28615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836009
553	NC_015436	GT	3	6	28670	28675	0 %	50 %	50 %	0 %	330836009
554	NC_015436	CGTTTG	2	12	28741	28752	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	330836009
555	NC_015436	TCAG	2	8	28753	28760	25 %	25 %	25 %	25 %	330836009
556	NC_015436	TGATG	2	10	28812	28821	20 %	40 %	40 %	0 %	330836009
557	NC_015436	GT	3	6	28832	28837	0 %	50 %	50 %	0 %	330836009
558	NC_015436	GGC	2	6	29028	29033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836010
559	NC_015436	AGGC	2	8	29051	29058	25 %	0 %	50 %	25 %	330836010
560	NC_015436	CAA	2	6	29087	29092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836010
561	NC_015436	GCG	2	6	29097	29102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836010
562	NC_015436	GCC	2	6	29115	29120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836010
563	NC_015436	TGG	2	6	29185	29190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836010
564	NC_015436	GCT	2	6	29192	29197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836010
565	NC_015436	CCGT	3	12	29259	29270	0 %	25 %	25 %	50 %	330836010
566	NC_015436	CCTT	2	8	29273	29280	0 %	50 %	0 %	50 %	330836010
567	NC_015436	CTT	2	6	29313	29318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836010
568	NC_015436	TCT	2	6	29456	29461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836010
569	NC_015436	GCC	2	6	29547	29552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836010
570	NC_015436	GCC	2	6	29586	29591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836010
571	NC_015436	TGC	2	6	29756	29761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836010
572	NC_015436	ATG	2	6	29803	29808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836010
573	NC_015436	GTT	2	6	29877	29882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836010
574	NC_015436	CGG	2	6	29965	29970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836010
575	NC_015436	CTG	2	6	29973	29978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836010
576	NC_015436	CAT	2	6	29981	29986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836010
577	NC_015436	GTC	2	6	29991	29996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836010
578	NC_015436	TTC	2	6	30054	30059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836010
579	NC_015436	ATC	2	6	30090	30095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836010
580	NC_015436	GTC	2	6	30117	30122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836010
581	NC_015436	ATA	2	6	30189	30194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330836010
582	NC_015436	CT	3	6	30199	30204	0 %	50 %	0 %	50 %	330836010
583	NC_015436	AAT	2	6	30310	30315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330836010
584	NC_015436	TA	3	6	30547	30552	50 %	50 %	0 %	0 %	330836011
585	NC_015436	ATA	2	6	30714	30719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330836012
586	NC_015436	TCCC	2	8	30760	30767	0 %	25 %	0 %	75 %	330836012
587	NC_015436	CCTG	2	8	30821	30828	0 %	25 %	25 %	50 %	330836012
588	NC_015436	GGC	2	6	30840	30845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836012
589	NC_015436	ATC	2	6	30859	30864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836012
590	NC_015436	AGG	2	6	30880	30885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836012
591	NC_015436	GAT	2	6	30900	30905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836012
592	NC_015436	ATA	3	9	30913	30921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330836012
593	NC_015436	CGGA	2	8	30925	30932	25 %	0 %	50 %	25 %	330836012
594	NC_015436	TTGAG	2	10	30947	30956	20 %	40 %	40 %	0 %	330836012
595	NC_015436	GTT	2	6	31010	31015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836012
596	NC_015436	AGC	2	6	31052	31057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836012
597	NC_015436	TCA	2	6	31091	31096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836012
598	NC_015436	GCC	2	6	31108	31113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836012
599	NC_015436	ATG	2	6	31258	31263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836012
600	NC_015436	TTCC	2	8	31282	31289	0 %	50 %	0 %	50 %	330836012
601	NC_015436	GACG	2	8	31372	31379	25 %	0 %	50 %	25 %	330836012
602	NC_015436	TG	3	6	31394	31399	0 %	50 %	50 %	0 %	330836012
603	NC_015436	GGAC	2	8	31452	31459	25 %	0 %	50 %	25 %	330836012
604	NC_015436	TGA	2	6	31497	31502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836012
605	NC_015436	GGTC	2	8	31515	31522	0 %	25 %	50 %	25 %	330836012
606	NC_015436	GGGGA	2	10	31576	31585	20 %	0 %	80 %	0 %	330836012
607	NC_015436	GAG	2	6	31651	31656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836012
608	NC_015436	TGG	2	6	31657	31662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836012
609	NC_015436	GAT	2	6	31690	31695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836012
610	NC_015436	ACA	2	6	31697	31702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836012
611	NC_015436	A	6	6	31736	31741	100 %	0 %	0 %	0 %	330836012
612	NC_015436	GTAC	2	8	31796	31803	25 %	25 %	25 %	25 %	330836012
613	NC_015436	AGG	2	6	31823	31828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836012
614	NC_015436	ATG	2	6	32249	32254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836013
615	NC_015436	A	6	6	32291	32296	100 %	0 %	0 %	0 %	330836013
616	NC_015436	GAAAA	2	10	32316	32325	80 %	0 %	20 %	0 %	330836013
617	NC_015436	A	6	6	32322	32327	100 %	0 %	0 %	0 %	330836013
618	NC_015436	GCC	2	6	32366	32371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836013
619	NC_015436	ATC	2	6	32396	32401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836013
620	NC_015436	CG	3	6	32437	32442	0 %	0 %	50 %	50 %	330836013
621	NC_015436	GAC	2	6	32465	32470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836013
622	NC_015436	GGAT	2	8	32534	32541	25 %	25 %	50 %	0 %	330836013
623	NC_015436	TTGCCT	2	12	32574	32585	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	330836013
624	NC_015436	ATCA	2	8	32642	32649	50 %	25 %	0 %	25 %	330836013
625	NC_015436	TTC	2	6	32657	32662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836013
626	NC_015436	AAG	2	6	32807	32812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836013
627	NC_015436	CTG	2	6	32845	32850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836013
628	NC_015436	ACTG	2	8	32878	32885	25 %	25 %	25 %	25 %	330836013
629	NC_015436	CCT	2	6	32941	32946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836013
630	NC_015436	GAA	2	6	33002	33007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836013
631	NC_015436	CCGGAG	2	12	33015	33026	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330836013
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633	NC_015436	GCT	2	6	33373	33378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836013
634	NC_015436	GGAG	2	8	33400	33407	25 %	0 %	75 %	0 %	330836013
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636	NC_015436	GGA	2	6	33451	33456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836013
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641	NC_015436	CAG	2	6	33804	33809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836014
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643	NC_015436	CCT	2	6	33934	33939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836014
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653	NC_015436	TCA	2	6	34465	34470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836015
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743	NC_015436	GAG	2	6	39440	39445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836020
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746	NC_015436	CGGAA	2	10	39878	39887	40 %	0 %	40 %	20 %	330836021
747	NC_015436	CGAAC	2	10	39922	39931	40 %	0 %	20 %	40 %	330836021
748	NC_015436	CAT	2	6	40085	40090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836021
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751	NC_015436	TC	3	6	40113	40118	0 %	50 %	0 %	50 %	330836021
752	NC_015436	CCG	2	6	40154	40159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836021
753	NC_015436	GTT	2	6	40277	40282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836021
754	NC_015436	AGC	2	6	40310	40315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836021
755	NC_015436	TTC	2	6	40405	40410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836021
756	NC_015436	GA	3	6	40447	40452	50 %	0 %	50 %	0 %	330836021
757	NC_015436	ATG	2	6	40630	40635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836022
758	NC_015436	GCC	2	6	40650	40655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836022
759	NC_015436	TGCA	2	8	40842	40849	25 %	25 %	25 %	25 %	330836022
760	NC_015436	CCTG	2	8	40852	40859	0 %	25 %	25 %	50 %	330836022
761	NC_015436	ATG	2	6	40876	40881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836022
762	NC_015436	TGG	2	6	40926	40931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836022
763	NC_015436	GAA	2	6	40985	40990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836022
764	NC_015436	TGC	2	6	40994	40999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836022
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773	NC_015436	AAT	2	6	41544	41549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330836022
774	NC_015436	T	6	6	41605	41610	0 %	100 %	0 %	0 %	330836022
775	NC_015436	TAC	2	6	41636	41641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836022
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782	NC_015436	A	6	6	42061	42066	100 %	0 %	0 %	0 %	330836023
783	NC_015436	AT	3	6	42087	42092	50 %	50 %	0 %	0 %	330836023
784	NC_015436	CAT	2	6	42166	42171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836023
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788	NC_015436	GCC	2	6	42435	42440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836024
789	NC_015436	GCC	2	6	42468	42473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836024
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791	NC_015436	ACCG	2	8	42518	42525	25 %	0 %	25 %	50 %	330836024
792	NC_015436	AGG	2	6	42550	42555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836024
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794	NC_015436	TTC	2	6	42621	42626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836024
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995	NC_015436	GACT	2	8	54629	54636	25 %	25 %	25 %	25 %	330836034
996	NC_015436	CAG	2	6	54652	54657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836034
997	NC_015436	ATCTCA	2	12	54693	54704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836034
998	NC_015436	CTT	2	6	54721	54726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836034
999	NC_015436	TGT	2	6	54748	54753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836034
1000	NC_015436	TGC	2	6	54759	54764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836034

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