MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 39616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015436	GCT	2	6	346164	346169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836279
6002	NC_015436	TGTT	2	8	346183	346190	0 %	75 %	25 %	0 %	330836279
6003	NC_015436	TGTCCA	2	12	346745	346756	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	330836280
6004	NC_015436	AATC	2	8	346903	346910	50 %	25 %	0 %	25 %	330836280
6005	NC_015436	TGA	2	6	346924	346929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836280
6006	NC_015436	TAC	2	6	346949	346954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836280
6007	NC_015436	A	7	7	346966	346972	100 %	0 %	0 %	0 %	330836280
6008	NC_015436	AGG	2	6	347003	347008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836280
6009	NC_015436	GTT	2	6	347024	347029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836280
6010	NC_015436	CAT	2	6	347038	347043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836280
6011	NC_015436	A	6	6	347066	347071	100 %	0 %	0 %	0 %	330836280
6012	NC_015436	TCA	2	6	347101	347106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836280
6013	NC_015436	A	6	6	347360	347365	100 %	0 %	0 %	0 %	330836281
6014	NC_015436	GAAA	2	8	347443	347450	75 %	0 %	25 %	0 %	330836281
6015	NC_015436	CTG	2	6	347508	347513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836281
6016	NC_015436	TG	3	6	347602	347607	0 %	50 %	50 %	0 %	330836281
6017	NC_015436	CGGA	2	8	347712	347719	25 %	0 %	50 %	25 %	330836281
6018	NC_015436	CTG	2	6	347865	347870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836281
6019	NC_015436	TGT	2	6	347886	347891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836281
6020	NC_015436	GAT	2	6	347905	347910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836281
6021	NC_015436	AT	3	6	347932	347937	50 %	50 %	0 %	0 %	330836281
6022	NC_015436	CTT	2	6	347970	347975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836281
6023	NC_015436	TC	3	6	348033	348038	0 %	50 %	0 %	50 %	330836281
6024	NC_015436	TTC	2	6	348044	348049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836281
6025	NC_015436	GCAA	2	8	348055	348062	50 %	0 %	25 %	25 %	330836281
6026	NC_015436	TTCC	2	8	348087	348094	0 %	50 %	0 %	50 %	330836281
6027	NC_015436	CATC	2	8	348123	348130	25 %	25 %	0 %	50 %	330836281
6028	NC_015436	GGC	2	6	348151	348156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836281
6029	NC_015436	CTGG	2	8	348175	348182	0 %	25 %	50 %	25 %	330836281
6030	NC_015436	AGCA	2	8	348185	348192	50 %	0 %	25 %	25 %	330836281
6031	NC_015436	GTA	2	6	348236	348241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836281
6032	NC_015436	ATC	2	6	348559	348564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836282
6033	NC_015436	CTT	2	6	348571	348576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836282
6034	NC_015436	TCA	2	6	348590	348595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836282
6035	NC_015436	CAGG	2	8	348631	348638	25 %	0 %	50 %	25 %	330836282
6036	NC_015436	GAA	2	6	348654	348659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836282
6037	NC_015436	CTA	2	6	348690	348695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836282
6038	NC_015436	TTC	2	6	348706	348711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836282
6039	NC_015436	CAT	2	6	348837	348842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836282
6040	NC_015436	CCG	2	6	348847	348852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836282
6041	NC_015436	ATC	2	6	348871	348876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836282
6042	NC_015436	TCA	2	6	348899	348904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836282
6043	NC_015436	CTG	2	6	348913	348918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836282
6044	NC_015436	CTTT	2	8	348977	348984	0 %	75 %	0 %	25 %	330836282
6045	NC_015436	GTG	2	6	349007	349012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836282
6046	NC_015436	CGC	2	6	349044	349049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836282
6047	NC_015436	GTCC	2	8	349206	349213	0 %	25 %	25 %	50 %	330836282
6048	NC_015436	CCAT	2	8	349285	349292	25 %	25 %	0 %	50 %	330836282
6049	NC_015436	TCC	2	6	349304	349309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836282
6050	NC_015436	TCG	2	6	349366	349371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836282
6051	NC_015436	GCC	2	6	349390	349395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836282
6052	NC_015436	ATC	2	6	349438	349443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836282
6053	NC_015436	GTTG	2	8	349537	349544	0 %	50 %	50 %	0 %	330836282
6054	NC_015436	CGT	2	6	349651	349656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836282
6055	NC_015436	G	6	6	349815	349820	0 %	0 %	100 %	0 %	330836282
6056	NC_015436	GAA	2	6	349855	349860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836282
6057	NC_015436	CAG	2	6	349884	349889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836282
6058	NC_015436	T	6	6	349932	349937	0 %	100 %	0 %	0 %	330836282
6059	NC_015436	TGC	2	6	349983	349988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836282
6060	NC_015436	TGC	2	6	350064	350069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836282
6061	NC_015436	CAT	2	6	350082	350087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836282
6062	NC_015436	TGG	2	6	350105	350110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836282
6063	NC_015436	GAC	2	6	350151	350156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836282
6064	NC_015436	GAC	2	6	350177	350182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836282
6065	NC_015436	ATG	2	6	350191	350196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836283
6066	NC_015436	AAT	2	6	350269	350274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330836283
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6068	NC_015436	GAT	2	6	350398	350403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836283
6069	NC_015436	GCAA	2	8	350528	350535	50 %	0 %	25 %	25 %	330836283
6070	NC_015436	GAT	2	6	350559	350564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836283
6071	NC_015436	CGG	2	6	350616	350621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836283
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6073	NC_015436	CAA	2	6	350658	350663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836283
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6075	NC_015436	CAG	2	6	350877	350882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836283
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6077	NC_015436	GAT	2	6	351082	351087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836283
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6080	NC_015436	GTC	2	6	351250	351255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836283
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6084	NC_015436	GA	3	6	351469	351474	50 %	0 %	50 %	0 %	330836284
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6088	NC_015436	GCC	3	9	351570	351578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836284
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6091	NC_015436	CGC	2	6	351674	351679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836284
6092	NC_015436	TCA	2	6	351784	351789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836284
6093	NC_015436	TCGG	2	8	351826	351833	0 %	25 %	50 %	25 %	330836284
6094	NC_015436	T	6	6	351856	351861	0 %	100 %	0 %	0 %	330836284
6095	NC_015436	GCG	2	6	351957	351962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836284
6096	NC_015436	AT	3	6	351997	352002	50 %	50 %	0 %	0 %	330836284
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6101	NC_015436	GCTT	2	8	352468	352475	0 %	50 %	25 %	25 %	330836285
6102	NC_015436	CGT	2	6	352676	352681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836285
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6104	NC_015436	CT	3	6	352998	353003	0 %	50 %	0 %	50 %	330836285
6105	NC_015436	GAA	2	6	353078	353083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836285
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6108	NC_015436	AAT	2	6	353185	353190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330836285
6109	NC_015436	GAT	2	6	353283	353288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836286
6110	NC_015436	ACT	2	6	353350	353355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836286
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6112	NC_015436	TGA	2	6	353387	353392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836286
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6114	NC_015436	CT	3	6	353492	353497	0 %	50 %	0 %	50 %	330836286
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6117	NC_015436	CG	3	6	353572	353577	0 %	0 %	50 %	50 %	330836286
6118	NC_015436	TGA	2	6	353850	353855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836286
6119	NC_015436	CTGA	2	8	353944	353951	25 %	25 %	25 %	25 %	330836286
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6122	NC_015436	ATG	2	6	354042	354047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836287
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6141	NC_015436	CTGC	2	8	355427	355434	0 %	25 %	25 %	50 %	330836288
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6152	NC_015436	CGC	2	6	356232	356237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836289
6153	NC_015436	TGC	2	6	356256	356261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836289
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6230	NC_015436	GTC	2	6	360725	360730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836293
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6233	NC_015436	ATC	2	6	360815	360820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836293
6234	NC_015436	AAGC	2	8	360957	360964	50 %	0 %	25 %	25 %	330836293
6235	NC_015436	TCC	2	6	361007	361012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836293
6236	NC_015436	CAAAG	2	10	361084	361093	60 %	0 %	20 %	20 %	330836293
6237	NC_015436	GTCA	2	8	361103	361110	25 %	25 %	25 %	25 %	330836293
6238	NC_015436	TGA	2	6	361220	361225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836294
6239	NC_015436	AGGC	2	8	361246	361253	25 %	0 %	50 %	25 %	330836294
6240	NC_015436	GC	3	6	361320	361325	0 %	0 %	50 %	50 %	330836294
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6242	NC_015436	TTC	2	6	361358	361363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836294
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6354	NC_015436	ATGG	2	8	368476	368483	25 %	25 %	50 %	0 %	330836299
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6485	NC_015436	GGC	2	6	375866	375871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836303
6486	NC_015436	TCA	2	6	375906	375911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836303
6487	NC_015436	GTG	2	6	375957	375962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836303
6488	NC_015436	CAA	2	6	376009	376014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836303
6489	NC_015436	AC	3	6	376045	376050	50 %	0 %	0 %	50 %	330836303
6490	NC_015436	TTCT	2	8	376056	376063	0 %	75 %	0 %	25 %	330836303
6491	NC_015436	TAT	2	6	376420	376425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836304
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6493	NC_015436	CTT	2	6	376634	376639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836304
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6499	NC_015436	CAT	2	6	376945	376950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836304
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