MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 39616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015436	ATC	2	6	289254	289259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836234
5002	NC_015436	TG	3	6	289276	289281	0 %	50 %	50 %	0 %	330836234
5003	NC_015436	GTTC	2	8	289286	289293	0 %	50 %	25 %	25 %	330836234
5004	NC_015436	TGG	2	6	289301	289306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836234
5005	NC_015436	A	7	7	289328	289334	100 %	0 %	0 %	0 %	330836234
5006	NC_015436	AT	3	6	289515	289520	50 %	50 %	0 %	0 %	330836234
5007	NC_015436	GTG	2	6	289599	289604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836234
5008	NC_015436	CGA	2	6	289627	289632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836234
5009	NC_015436	TAT	2	6	289638	289643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836234
5010	NC_015436	CCG	2	6	289696	289701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836234
5011	NC_015436	TCA	2	6	289705	289710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836234
5012	NC_015436	GGA	2	6	289741	289746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836234
5013	NC_015436	TGGC	2	8	289750	289757	0 %	25 %	50 %	25 %	330836234
5014	NC_015436	AGC	2	6	289868	289873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836234
5015	NC_015436	GGA	2	6	289877	289882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836234
5016	NC_015436	CTG	2	6	289940	289945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836234
5017	NC_015436	CAGG	2	8	290016	290023	25 %	0 %	50 %	25 %	330836234
5018	NC_015436	TGCC	2	8	290056	290063	0 %	25 %	25 %	50 %	330836234
5019	NC_015436	CA	3	6	290066	290071	50 %	0 %	0 %	50 %	330836234
5020	NC_015436	TCT	2	6	290096	290101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836234
5021	NC_015436	CT	3	6	290114	290119	0 %	50 %	0 %	50 %	330836234
5022	NC_015436	CGC	2	6	290213	290218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836234
5023	NC_015436	CAT	2	6	290246	290251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836234
5024	NC_015436	GGCA	2	8	290296	290303	25 %	0 %	50 %	25 %	330836234
5025	NC_015436	GAT	2	6	290352	290357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836234
5026	NC_015436	CCT	2	6	290459	290464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836234
5027	NC_015436	TGTC	2	8	290507	290514	0 %	50 %	25 %	25 %	330836234
5028	NC_015436	TGG	2	6	290568	290573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836234
5029	NC_015436	GCATGG	2	12	290601	290612	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330836234
5030	NC_015436	ATG	3	9	290647	290655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836234
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5032	NC_015436	GAA	2	6	290721	290726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836234
5033	NC_015436	CTG	2	6	290736	290741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836234
5034	NC_015436	GAA	2	6	290760	290765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836234
5035	NC_015436	TCT	2	6	290773	290778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836234
5036	NC_015436	GAT	2	6	290798	290803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836234
5037	NC_015436	TG	3	6	290842	290847	0 %	50 %	50 %	0 %	330836234
5038	NC_015436	TGAC	2	8	290926	290933	25 %	25 %	25 %	25 %	330836234
5039	NC_015436	TC	3	6	290963	290968	0 %	50 %	0 %	50 %	330836234
5040	NC_015436	GGT	2	6	290970	290975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836234
5041	NC_015436	AGT	2	6	291002	291007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836234
5042	NC_015436	CCT	2	6	291021	291026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836234
5043	NC_015436	CA	3	6	291114	291119	50 %	0 %	0 %	50 %	330836235
5044	NC_015436	AT	3	6	291130	291135	50 %	50 %	0 %	0 %	330836235
5045	NC_015436	AT	3	6	291201	291206	50 %	50 %	0 %	0 %	330836235
5046	NC_015436	CAAG	2	8	291287	291294	50 %	0 %	25 %	25 %	330836235
5047	NC_015436	TGA	2	6	291354	291359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836235
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5049	NC_015436	GTTG	2	8	291501	291508	0 %	50 %	50 %	0 %	330836235
5050	NC_015436	GGT	2	6	291597	291602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836235
5051	NC_015436	AT	3	6	291636	291641	50 %	50 %	0 %	0 %	330836235
5052	NC_015436	A	6	6	291664	291669	100 %	0 %	0 %	0 %	330836235
5053	NC_015436	TG	3	6	291749	291754	0 %	50 %	50 %	0 %	330836235
5054	NC_015436	ATT	2	6	291878	291883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836235
5055	NC_015436	TGA	2	6	291933	291938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836235
5056	NC_015436	GAT	2	6	291969	291974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836235
5057	NC_015436	ATCG	2	8	292057	292064	25 %	25 %	25 %	25 %	330836235
5058	NC_015436	CAT	2	6	292125	292130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836235
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5064	NC_015436	CATC	2	8	293010	293017	25 %	25 %	0 %	50 %	330836236
5065	NC_015436	TCTA	2	8	293031	293038	25 %	50 %	0 %	25 %	330836236
5066	NC_015436	CCTG	2	8	293071	293078	0 %	25 %	25 %	50 %	330836236
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5070	NC_015436	CAT	3	9	293290	293298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836236
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5075	NC_015436	ATGC	2	8	293729	293736	25 %	25 %	25 %	25 %	330836237
5076	NC_015436	GGGGT	2	10	293740	293749	0 %	20 %	80 %	0 %	330836237
5077	NC_015436	A	6	6	293771	293776	100 %	0 %	0 %	0 %	330836237
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5104	NC_015436	AATC	2	8	295610	295617	50 %	25 %	0 %	25 %	330836238
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5109	NC_015436	AAT	2	6	295712	295717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330836238
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5115	NC_015436	A	6	6	296118	296123	100 %	0 %	0 %	0 %	330836238
5116	NC_015436	AAGG	2	8	296142	296149	50 %	0 %	50 %	0 %	330836238
5117	NC_015436	CATG	2	8	296305	296312	25 %	25 %	25 %	25 %	330836238
5118	NC_015436	TCAG	2	8	296320	296327	25 %	25 %	25 %	25 %	330836238
5119	NC_015436	GCA	2	6	296396	296401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836238
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5123	NC_015436	CGC	2	6	296862	296867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836239
5124	NC_015436	TATCG	2	10	296922	296931	20 %	40 %	20 %	20 %	330836239
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5203	NC_015436	CTG	2	6	301272	301277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836242
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5227	NC_015436	GTC	2	6	303949	303954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836243
5228	NC_015436	CATGG	2	10	303960	303969	20 %	20 %	40 %	20 %	330836243
5229	NC_015436	CAA	2	6	303984	303989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836243
5230	NC_015436	A	8	8	304229	304236	100 %	0 %	0 %	0 %	330836244
5231	NC_015436	ATA	2	6	304238	304243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330836244
5232	NC_015436	CGA	2	6	304305	304310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836244
5233	NC_015436	GC	3	6	304361	304366	0 %	0 %	50 %	50 %	330836244
5234	NC_015436	TGA	2	6	304375	304380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836244
5235	NC_015436	ATG	2	6	304461	304466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836244
5236	NC_015436	ATTC	2	8	304480	304487	25 %	50 %	0 %	25 %	330836244
5237	NC_015436	TAT	2	6	304571	304576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836244
5238	NC_015436	AGA	2	6	304675	304680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836244
5239	NC_015436	TCATGA	2	12	304710	304721	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	330836244
5240	NC_015436	CTG	2	6	304754	304759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836244
5241	NC_015436	GCT	2	6	304765	304770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836244
5242	NC_015436	TCG	2	6	304791	304796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836244
5243	NC_015436	GTTC	2	8	304804	304811	0 %	50 %	25 %	25 %	330836244
5244	NC_015436	ATT	2	6	304855	304860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836244
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5249	NC_015436	TGA	2	6	305091	305096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836244
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5365	NC_015436	GCA	2	6	312418	312423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836249
5366	NC_015436	GGT	2	6	312471	312476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836249
5367	NC_015436	CT	3	6	312537	312542	0 %	50 %	0 %	50 %	330836249
5368	NC_015436	CAG	2	6	312571	312576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836249
5369	NC_015436	TGA	2	6	312588	312593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836249
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5372	NC_015436	ATG	2	6	312623	312628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836249
5373	NC_015436	GGC	2	6	312648	312653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836249
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5375	NC_015436	GAA	2	6	312727	312732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836249
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5390	NC_015436	CGC	2	6	313231	313236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836250
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5395	NC_015436	GA	3	6	313350	313355	50 %	0 %	50 %	0 %	330836250
5396	NC_015436	AGCTG	2	10	313474	313483	20 %	20 %	40 %	20 %	330836250
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5400	NC_015436	GCTT	2	8	313824	313831	0 %	50 %	25 %	25 %	330836250
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5403	NC_015436	AAGA	2	8	313964	313971	75 %	0 %	25 %	0 %	330836250
5404	NC_015436	CTA	2	6	314125	314130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836250
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5410	NC_015436	CGGG	2	8	314632	314639	0 %	0 %	75 %	25 %	330836251
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5424	NC_015436	TGA	2	6	315182	315187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836251
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5432	NC_015436	CTG	2	6	315491	315496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836251
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5436	NC_015436	CTTGG	2	10	315741	315750	0 %	40 %	40 %	20 %	330836252
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5441	NC_015436	TCG	2	6	316179	316184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836252
5442	NC_015436	GCCT	2	8	316219	316226	0 %	25 %	25 %	50 %	330836252
5443	NC_015436	GAT	2	6	316272	316277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836252
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5445	NC_015436	ATG	2	6	316453	316458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836253
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5453	NC_015436	GCT	2	6	316903	316908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836253
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5459	NC_015436	GAT	2	6	317118	317123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836253
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5461	NC_015436	GCATG	2	10	317213	317222	20 %	20 %	40 %	20 %	330836253
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5470	NC_015436	A	7	7	318036	318042	100 %	0 %	0 %	0 %	330836254
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5475	NC_015436	GCG	2	6	318235	318240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836254
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5479	NC_015436	CCG	2	6	318481	318486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836254
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5485	NC_015436	GTAT	2	8	318979	318986	25 %	50 %	25 %	0 %	330836255
5486	NC_015436	GTG	2	6	318998	319003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836255
5487	NC_015436	CCG	2	6	319035	319040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836255
5488	NC_015436	ACC	2	6	319056	319061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836255
5489	NC_015436	GGA	2	6	319135	319140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836255
5490	NC_015436	GCG	2	6	319157	319162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836255
5491	NC_015436	CGG	2	6	319186	319191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836255
5492	NC_015436	TCC	2	6	319262	319267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836255
5493	NC_015436	TTC	2	6	319319	319324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836255
5494	NC_015436	CTGT	2	8	319377	319384	0 %	50 %	25 %	25 %	330836255
5495	NC_015436	CGTGC	2	10	319430	319439	0 %	20 %	40 %	40 %	330836255
5496	NC_015436	TGG	2	6	319446	319451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836255
5497	NC_015436	GCTTCA	2	12	319486	319497	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	330836255
5498	NC_015436	CTT	2	6	319604	319609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836255
5499	NC_015436	TTATTT	2	12	319625	319636	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	330836256
5500	NC_015436	GAC	2	6	319641	319646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836256

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