MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 39616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015436	TCT	2	6	261265	261270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836208
4502	NC_015436	GCC	2	6	261310	261315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836208
4503	NC_015436	TTC	2	6	261321	261326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836208
4504	NC_015436	CTG	2	6	261331	261336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836208
4505	NC_015436	GA	3	6	261341	261346	50 %	0 %	50 %	0 %	330836208
4506	NC_015436	AGG	2	6	261359	261364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836208
4507	NC_015436	CG	3	6	261369	261374	0 %	0 %	50 %	50 %	330836208
4508	NC_015436	CCAT	2	8	261377	261384	25 %	25 %	0 %	50 %	330836208
4509	NC_015436	GTT	2	6	261462	261467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836208
4510	NC_015436	GGA	2	6	261535	261540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836208
4511	NC_015436	GTT	2	6	261591	261596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836208
4512	NC_015436	GC	3	6	261597	261602	0 %	0 %	50 %	50 %	330836208
4513	NC_015436	AGGA	2	8	261608	261615	50 %	0 %	50 %	0 %	330836208
4514	NC_015436	CAT	2	6	261663	261668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836208
4515	NC_015436	GCG	2	6	261670	261675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836208
4516	NC_015436	GGC	2	6	261844	261849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836208
4517	NC_015436	ATG	2	6	261863	261868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836208
4518	NC_015436	GCA	2	6	261937	261942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836208
4519	NC_015436	TCA	2	6	261997	262002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836208
4520	NC_015436	CGG	2	6	262026	262031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836208
4521	NC_015436	GAA	2	6	262537	262542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836209
4522	NC_015436	A	6	6	262552	262557	100 %	0 %	0 %	0 %	330836209
4523	NC_015436	CAG	2	6	262662	262667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836209
4524	NC_015436	GGA	2	6	262767	262772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836209
4525	NC_015436	ACCA	2	8	262803	262810	50 %	0 %	0 %	50 %	330836209
4526	NC_015436	TGC	2	6	262817	262822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836209
4527	NC_015436	GAC	2	6	262848	262853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836209
4528	NC_015436	TCA	2	6	262873	262878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836209
4529	NC_015436	GAT	2	6	262890	262895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836209
4530	NC_015436	GAA	2	6	262919	262924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836209
4531	NC_015436	TGA	2	6	262948	262953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836209
4532	NC_015436	CGA	2	6	262991	262996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836209
4533	NC_015436	CCG	2	6	263102	263107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836209
4534	NC_015436	AAC	2	6	263139	263144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836209
4535	NC_015436	CTG	2	6	263250	263255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836209
4536	NC_015436	ATC	2	6	263358	263363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836209
4537	NC_015436	GCC	2	6	263403	263408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836209
4538	NC_015436	TCA	2	6	263618	263623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836209
4539	NC_015436	CCTG	2	8	263696	263703	0 %	25 %	25 %	50 %	330836209
4540	NC_015436	GGC	2	6	263729	263734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836209
4541	NC_015436	CAGC	2	8	263735	263742	25 %	0 %	25 %	50 %	330836209
4542	NC_015436	AG	3	6	263756	263761	50 %	0 %	50 %	0 %	330836209
4543	NC_015436	GAA	2	6	263877	263882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836209
4544	NC_015436	CATG	2	8	263912	263919	25 %	25 %	25 %	25 %	330836209
4545	NC_015436	AAGA	2	8	263964	263971	75 %	0 %	25 %	0 %	330836209
4546	NC_015436	GAA	2	6	263994	263999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836209
4547	NC_015436	GCG	2	6	264033	264038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836209
4548	NC_015436	GGA	2	6	264146	264151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836209
4549	NC_015436	GAT	2	6	264200	264205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836209
4550	NC_015436	GCC	2	6	264273	264278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836209
4551	NC_015436	CAA	2	6	264308	264313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836209
4552	NC_015436	GTC	2	6	264481	264486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836209
4553	NC_015436	CTC	2	6	264496	264501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836209
4554	NC_015436	TGA	2	6	264632	264637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836209
4555	NC_015436	CTGA	2	8	264645	264652	25 %	25 %	25 %	25 %	330836209
4556	NC_015436	GGT	2	6	264665	264670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836209
4557	NC_015436	ATC	3	9	264687	264695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836209
4558	NC_015436	CAG	2	6	264717	264722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836209
4559	NC_015436	GAG	2	6	264744	264749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836209
4560	NC_015436	TCA	2	6	264799	264804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836209
4561	NC_015436	TGA	2	6	264812	264817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836209
4562	NC_015436	ATC	2	6	264819	264824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836209
4563	NC_015436	GCT	2	6	264881	264886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836209
4564	NC_015436	GGC	2	6	264892	264897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836209
4565	NC_015436	ATG	2	6	264964	264969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836209
4566	NC_015436	TCA	2	6	265313	265318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836210
4567	NC_015436	CTT	2	6	265354	265359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836210
4568	NC_015436	AAGAA	2	10	265363	265372	80 %	0 %	20 %	0 %	330836210
4569	NC_015436	GTG	2	6	265393	265398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836210
4570	NC_015436	TCA	2	6	265466	265471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836210
4571	NC_015436	TC	3	6	265537	265542	0 %	50 %	0 %	50 %	330836210
4572	NC_015436	GAA	3	9	265585	265593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836210
4573	NC_015436	GTC	2	6	265660	265665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836210
4574	NC_015436	ATT	2	6	265694	265699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836210
4575	NC_015436	CAT	2	6	265740	265745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836210
4576	NC_015436	CTT	2	6	265809	265814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836210
4577	NC_015436	GA	3	6	265850	265855	50 %	0 %	50 %	0 %	330836210
4578	NC_015436	GGC	2	6	265872	265877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836210
4579	NC_015436	CTG	2	6	265891	265896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836210
4580	NC_015436	TGA	2	6	265898	265903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836210
4581	NC_015436	CTGC	2	8	265951	265958	0 %	25 %	25 %	50 %	330836210
4582	NC_015436	CCG	2	6	265982	265987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836210
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4585	NC_015436	ATA	2	6	266197	266202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330836211
4586	NC_015436	CGG	2	6	266211	266216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836211
4587	NC_015436	GGC	2	6	266242	266247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836211
4588	NC_015436	GTC	2	6	266315	266320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836211
4589	NC_015436	ATC	2	6	266356	266361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836211
4590	NC_015436	TGA	2	6	266427	266432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836211
4591	NC_015436	CTG	2	6	266433	266438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836211
4592	NC_015436	GGA	2	6	266447	266452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836211
4593	NC_015436	GGC	2	6	266488	266493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836211
4594	NC_015436	GGT	2	6	266497	266502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836211
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4599	NC_015436	T	8	8	266878	266885	0 %	100 %	0 %	0 %	330836211
4600	NC_015436	ATG	2	6	266917	266922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836211
4601	NC_015436	TCA	2	6	266936	266941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836211
4602	NC_015436	CG	3	6	266966	266971	0 %	0 %	50 %	50 %	330836211
4603	NC_015436	AAG	2	6	266989	266994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836211
4604	NC_015436	ATG	2	6	267011	267016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836211
4605	NC_015436	GA	3	6	267140	267145	50 %	0 %	50 %	0 %	330836211
4606	NC_015436	GCAG	2	8	267152	267159	25 %	0 %	50 %	25 %	330836211
4607	NC_015436	CCAT	2	8	267200	267207	25 %	25 %	0 %	50 %	330836211
4608	NC_015436	ATGG	2	8	267262	267269	25 %	25 %	50 %	0 %	330836211
4609	NC_015436	TTCTT	2	10	267407	267416	0 %	80 %	0 %	20 %	330836211
4610	NC_015436	T	6	6	267415	267420	0 %	100 %	0 %	0 %	330836211
4611	NC_015436	CGG	2	6	267459	267464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836211
4612	NC_015436	T	7	7	267540	267546	0 %	100 %	0 %	0 %	330836212
4613	NC_015436	TGGA	2	8	267589	267596	25 %	25 %	50 %	0 %	330836212
4614	NC_015436	TGC	2	6	267627	267632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836212
4615	NC_015436	TGA	2	6	267635	267640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836212
4616	NC_015436	GAAA	3	12	267701	267712	75 %	0 %	25 %	0 %	330836213
4617	NC_015436	GAA	2	6	267785	267790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836213
4618	NC_015436	CAAGGA	2	12	267826	267837	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	330836213
4619	NC_015436	TAC	2	6	267845	267850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836213
4620	NC_015436	TGA	2	6	267952	267957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836213
4621	NC_015436	ATC	2	6	267959	267964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836213
4622	NC_015436	CA	3	6	267975	267980	50 %	0 %	0 %	50 %	330836213
4623	NC_015436	AAAG	2	8	268024	268031	75 %	0 %	25 %	0 %	330836213
4624	NC_015436	GGGA	2	8	268034	268041	25 %	0 %	75 %	0 %	330836213
4625	NC_015436	TCC	2	6	268046	268051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836213
4626	NC_015436	ATC	2	6	268052	268057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836213
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4628	NC_015436	ATT	2	6	268096	268101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836213
4629	NC_015436	ATG	2	6	268116	268121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836213
4630	NC_015436	ATG	2	6	268125	268130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836213
4631	NC_015436	TCA	2	6	268167	268172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836213
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4641	NC_015436	TAT	2	6	268568	268573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836214
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4647	NC_015436	ATC	2	6	268792	268797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836214
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4649	NC_015436	AGT	2	6	268854	268859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836214
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4653	NC_015436	TGT	2	6	269066	269071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836214
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4659	NC_015436	ATC	2	6	269323	269328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836214
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4692	NC_015436	CCA	2	6	271176	271181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836215
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4694	NC_015436	GAAGAT	2	12	271267	271278	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	330836215
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4713	NC_015436	TGC	2	6	272314	272319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836215
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4725	NC_015436	TGG	2	6	273197	273202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836215
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4731	NC_015436	AAATT	2	10	273488	273497	60 %	40 %	0 %	0 %	330836216
4732	NC_015436	TGAT	2	8	273516	273523	25 %	50 %	25 %	0 %	330836216
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4735	NC_015436	TCATT	2	10	273616	273625	20 %	60 %	0 %	20 %	330836217
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4737	NC_015436	A	6	6	273715	273720	100 %	0 %	0 %	0 %	330836217
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4742	NC_015436	AGC	2	6	274011	274016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836218
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4746	NC_015436	G	6	6	274223	274228	0 %	0 %	100 %	0 %	330836218
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4865	NC_015436	ACG	2	6	282429	282434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836226
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4868	NC_015436	GAC	2	6	282548	282553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836226
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4872	NC_015436	GCC	2	6	282644	282649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836226
4873	NC_015436	GCT	2	6	282650	282655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836226
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4892	NC_015436	A	7	7	283520	283526	100 %	0 %	0 %	0 %	330836228
4893	NC_015436	GGTT	2	8	283539	283546	0 %	50 %	50 %	0 %	330836228
4894	NC_015436	TAT	2	6	283567	283572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836228
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4898	NC_015436	GCA	2	6	283803	283808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836228
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4934	NC_015436	GGCG	2	8	286292	286299	0 %	0 %	75 %	25 %	330836231
4935	NC_015436	GAAT	2	8	286400	286407	50 %	25 %	25 %	0 %	330836231
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4951	NC_015436	T	6	6	287337	287342	0 %	100 %	0 %	0 %	330836232
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4956	NC_015436	TGC	2	6	287486	287491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836232
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4970	NC_015436	CATC	2	8	288192	288199	25 %	25 %	0 %	50 %	330836233
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4974	NC_015436	TTC	2	6	288274	288279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836233
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4976	NC_015436	T	6	6	288305	288310	0 %	100 %	0 %	0 %	330836233
4977	NC_015436	AG	3	6	288377	288382	50 %	0 %	50 %	0 %	330836233
4978	NC_015436	GCT	2	6	288405	288410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836233
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4980	NC_015436	TTCAAG	2	12	288478	288489	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	330836233
4981	NC_015436	CGC	2	6	288516	288521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836233
4982	NC_015436	ATC	2	6	288547	288552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836233
4983	NC_015436	CGTCTG	2	12	288577	288588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836233
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4986	NC_015436	TGT	2	6	288656	288661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836233
4987	NC_015436	GAG	2	6	288691	288696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836233
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