MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 23210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015433	AAC	2	6	11	16	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330831850
2	NC_015433	TAC	2	6	267	272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330831850
3	NC_015433	AAG	2	6	279	284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831850
4	NC_015433	CTC	2	6	323	328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330831850
5	NC_015433	AAT	2	6	400	405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330831850
6	NC_015433	ATT	2	6	465	470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831850
7	NC_015433	TGG	2	6	477	482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330831850
8	NC_015433	TCA	2	6	581	586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330831850
9	NC_015433	TGA	2	6	666	671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831850
10	NC_015433	TAA	2	6	687	692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330831850
11	NC_015433	CAA	2	6	695	700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330831850
12	NC_015433	GAA	2	6	706	711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831850
13	NC_015433	GAA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831850
14	NC_015433	TGC	2	6	1041	1046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330831850
15	NC_015433	CTC	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330831850
16	NC_015433	GAT	2	6	1321	1326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831850
17	NC_015433	TAA	2	6	1545	1550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330831851
18	NC_015433	TTA	2	6	1772	1777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831851
19	NC_015433	AAG	2	6	1880	1885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831851
20	NC_015433	GTC	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330831851
21	NC_015433	TGA	2	6	2115	2120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831851
22	NC_015433	TGT	2	6	2127	2132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330831851
23	NC_015433	GAT	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831851
24	NC_015433	TCT	2	6	2198	2203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330831851
25	NC_015433	AAT	2	6	2209	2214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330831851
26	NC_015433	TTA	2	6	2257	2262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831851
27	NC_015433	AAC	2	6	2310	2315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330831851
28	NC_015433	TCT	2	6	2364	2369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330831851
29	NC_015433	TAA	2	6	2412	2417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330831851
30	NC_015433	TGT	2	6	2418	2423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330831851
31	NC_015433	TCT	2	6	2581	2586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330831851
32	NC_015433	AAT	2	6	2611	2616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330831851
33	NC_015433	CTG	2	6	2951	2956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330831852
34	NC_015433	AGT	2	6	3073	3078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831852
35	NC_015433	TTA	2	6	3147	3152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831852
36	NC_015433	ATT	2	6	3405	3410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831852
37	NC_015433	TGA	2	6	3444	3449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831852
38	NC_015433	TGG	2	6	3507	3512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330831852
39	NC_015433	TTA	2	6	3616	3621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831852
40	NC_015433	TCT	2	6	3637	3642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330831852
41	NC_015433	ATT	3	9	3696	3704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831852
42	NC_015433	AGG	2	6	3777	3782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330831852
43	NC_015433	TCA	2	6	3836	3841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330831853
44	NC_015433	AAG	2	6	3853	3858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831853
45	NC_015433	ATG	2	6	3931	3936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831853
46	NC_015433	TGG	2	6	4311	4316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330831854
47	NC_015433	AAC	2	6	4317	4322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330831854
48	NC_015433	GAA	2	6	4355	4360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831854
49	NC_015433	CAG	2	6	4581	4586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330831855
50	NC_015433	TCG	2	6	4590	4595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330831855
51	NC_015433	TGG	2	6	4698	4703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330831855
52	NC_015433	TCA	2	6	4740	4745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330831855
53	NC_015433	TTG	2	6	4935	4940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330831855
54	NC_015433	CAA	2	6	5002	5007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330831855
55	NC_015433	AGA	2	6	5101	5106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831855
56	NC_015433	GAA	2	6	5141	5146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831855
57	NC_015433	GTG	3	9	5291	5299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330831855
58	NC_015433	GAA	3	9	5315	5323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831855
59	NC_015433	CGA	2	6	5335	5340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330831855
60	NC_015433	CAG	2	6	5445	5450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330831855
61	NC_015433	AGG	2	6	5457	5462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330831855
62	NC_015433	CTC	2	6	5496	5501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330831855
63	NC_015433	GAT	2	6	5567	5572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831855
64	NC_015433	AAG	2	6	5604	5609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831855
65	NC_015433	GAA	2	6	5624	5629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831855
66	NC_015433	CAT	2	6	5659	5664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330831855
67	NC_015433	ATC	2	6	5856	5861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330831856
68	NC_015433	TGC	2	6	5917	5922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330831856
69	NC_015433	TTA	2	6	6080	6085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831856
70	NC_015433	TAG	2	6	6109	6114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831856
71	NC_015433	ATG	2	6	6118	6123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831856
72	NC_015433	TGG	2	6	6173	6178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330831856
73	NC_015433	AGA	2	6	6305	6310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831856
74	NC_015433	GAA	2	6	6369	6374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831856
75	NC_015433	GAT	2	6	6375	6380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831856
76	NC_015433	TAT	2	6	6492	6497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831857
77	NC_015433	AAT	2	6	6562	6567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330831857
78	NC_015433	ATG	2	6	6588	6593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831857
79	NC_015433	TAG	2	6	6615	6620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831857
80	NC_015433	ATT	2	6	6623	6628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831857
81	NC_015433	GAT	2	6	6659	6664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831857
82	NC_015433	CTA	2	6	6744	6749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330831857
83	NC_015433	GCT	2	6	6776	6781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330831857
84	NC_015433	AAT	2	6	6872	6877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330831857
85	NC_015433	TAG	2	6	7117	7122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831857
86	NC_015433	TTG	2	6	7274	7279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330831857
87	NC_015433	GAT	2	6	7313	7318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831857
88	NC_015433	TTG	2	6	7370	7375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330831857
89	NC_015433	GAT	2	6	7379	7384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831857
90	NC_015433	CTT	2	6	7465	7470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330831857
91	NC_015433	CCA	2	6	7552	7557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330831857
92	NC_015433	GTT	2	6	7610	7615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330831857
93	NC_015433	GCA	2	6	7694	7699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330831857
94	NC_015433	TAG	2	6	7707	7712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831857
95	NC_015433	TCA	2	6	7782	7787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330831857
96	NC_015433	TGT	2	6	7894	7899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330831857
97	NC_015433	ATT	2	6	7968	7973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831857
98	NC_015433	TCT	2	6	8029	8034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330831857
99	NC_015433	TAA	2	6	8074	8079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330831857
100	NC_015433	GGA	2	6	8131	8136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330831857
101	NC_015433	GAT	2	6	8144	8149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831857
102	NC_015433	GAT	2	6	8204	8209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831857
103	NC_015433	ACT	2	6	8232	8237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330831857
104	NC_015433	CGA	2	6	8254	8259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330831857
105	NC_015433	TGA	2	6	8275	8280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831857
106	NC_015433	ATG	2	6	8388	8393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831857
107	NC_015433	TGT	2	6	8599	8604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330831857
108	NC_015433	CTA	2	6	8955	8960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330831857
109	NC_015433	CAA	2	6	9051	9056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330831857
110	NC_015433	GTG	2	6	9306	9311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330831857
111	NC_015433	TGC	2	6	9328	9333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330831857
112	NC_015433	AGA	2	6	9429	9434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831857
113	NC_015433	GAA	2	6	9566	9571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831857
114	NC_015433	GTA	2	6	9602	9607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831857
115	NC_015433	GAC	2	6	9675	9680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330831857
116	NC_015433	TGT	2	6	9805	9810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330831857
117	NC_015433	ATT	2	6	9990	9995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831858
118	NC_015433	TAA	2	6	10112	10117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330831858
119	NC_015433	ACT	2	6	10118	10123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330831858
120	NC_015433	GAA	2	6	10218	10223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831858
121	NC_015433	AAT	2	6	10243	10248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330831859
122	NC_015433	CAA	2	6	10300	10305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330831859
123	NC_015433	TTG	2	6	10373	10378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330831859
124	NC_015433	CAG	3	9	10396	10404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330831859
125	NC_015433	GAA	2	6	10438	10443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831859
126	NC_015433	GCA	2	6	10504	10509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330831859
127	NC_015433	AAG	2	6	10541	10546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831859
128	NC_015433	TGA	2	6	10628	10633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831860
129	NC_015433	AGA	2	6	10640	10645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831860
130	NC_015433	AGA	2	6	10676	10681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831860
131	NC_015433	AAG	2	6	10798	10803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831861
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246	NC_015433	AGA	2	6	25893	25898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831868
247	NC_015433	AAC	2	6	25949	25954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330831868
248	NC_015433	TGG	2	6	26064	26069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330831868
249	NC_015433	CGG	2	6	26105	26110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330831868
250	NC_015433	ATG	2	6	26204	26209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831868
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252	NC_015433	TGT	2	6	26274	26279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330831868
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