MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 34437

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015433	GTT	2	6	179225	179230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832031
3002	NC_015433	GGT	2	6	179282	179287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832031
3003	NC_015433	ATT	2	6	179300	179305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832031
3004	NC_015433	CTT	2	6	179353	179358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832031
3005	NC_015433	GGT	2	6	179396	179401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832031
3006	NC_015433	GCTA	2	8	179551	179558	25 %	25 %	25 %	25 %	330832031
3007	NC_015433	A	6	6	179633	179638	100 %	0 %	0 %	0 %	330832031
3008	NC_015433	AGAA	2	8	179643	179650	75 %	0 %	25 %	0 %	330832031
3009	NC_015433	ATA	2	6	179653	179658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832031
3010	NC_015433	TGG	2	6	179750	179755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832032
3011	NC_015433	GCT	2	6	179781	179786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832032
3012	NC_015433	TCT	2	6	179826	179831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832032
3013	NC_015433	CTT	2	6	179906	179911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832032
3014	NC_015433	AAG	2	6	180054	180059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832032
3015	NC_015433	CTATAC	2	12	180077	180088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832032
3016	NC_015433	AGC	2	6	180131	180136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832032
3017	NC_015433	CAC	2	6	180150	180155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832032
3018	NC_015433	A	6	6	180192	180197	100 %	0 %	0 %	0 %	330832032
3019	NC_015433	TTG	2	6	180241	180246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832032
3020	NC_015433	TTGG	2	8	180262	180269	0 %	50 %	50 %	0 %	330832032
3021	NC_015433	TAT	2	6	180305	180310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832032
3022	NC_015433	AAGT	2	8	180335	180342	50 %	25 %	25 %	0 %	330832032
3023	NC_015433	CTC	2	6	180343	180348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330832032
3024	NC_015433	TAC	2	6	180371	180376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832032
3025	NC_015433	CTT	2	6	180395	180400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832032
3026	NC_015433	AGA	2	6	180401	180406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832032
3027	NC_015433	GA	3	6	180482	180487	50 %	0 %	50 %	0 %	330832032
3028	NC_015433	GACA	2	8	180507	180514	50 %	0 %	25 %	25 %	330832033
3029	NC_015433	AGC	2	6	180577	180582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832033
3030	NC_015433	CAA	2	6	180616	180621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832033
3031	NC_015433	AGC	2	6	180688	180693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832033
3032	NC_015433	TCT	2	6	180703	180708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832033
3033	NC_015433	TC	3	6	180777	180782	0 %	50 %	0 %	50 %	330832033
3034	NC_015433	TGG	2	6	180847	180852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832033
3035	NC_015433	GAG	2	6	180869	180874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832033
3036	NC_015433	GGA	2	6	181066	181071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832033
3037	NC_015433	CTTG	2	8	181078	181085	0 %	50 %	25 %	25 %	330832033
3038	NC_015433	TAT	2	6	181093	181098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832033
3039	NC_015433	GGC	2	6	181117	181122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330832033
3040	NC_015433	TAT	2	6	181206	181211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832033
3041	NC_015433	TGG	2	6	181252	181257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832033
3042	NC_015433	GTA	2	6	181263	181268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832033
3043	NC_015433	CAA	2	6	181349	181354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832033
3044	NC_015433	CTTA	2	8	181356	181363	25 %	50 %	0 %	25 %	330832033
3045	NC_015433	CAG	2	6	181383	181388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832033
3046	NC_015433	AT	3	6	181390	181395	50 %	50 %	0 %	0 %	330832033
3047	NC_015433	ACA	2	6	181420	181425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832033
3048	NC_015433	A	6	6	181645	181650	100 %	0 %	0 %	0 %	330832034
3049	NC_015433	CTT	2	6	181682	181687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832034
3050	NC_015433	TTTG	2	8	181710	181717	0 %	75 %	25 %	0 %	330832034
3051	NC_015433	CGA	2	6	181783	181788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832034
3052	NC_015433	TGT	2	6	181792	181797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832034
3053	NC_015433	T	6	6	181845	181850	0 %	100 %	0 %	0 %	330832034
3054	NC_015433	TGG	2	6	181966	181971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832034
3055	NC_015433	CAG	2	6	181985	181990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832034
3056	NC_015433	TTC	2	6	182029	182034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832034
3057	NC_015433	TAT	2	6	182064	182069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832034
3058	NC_015433	TAA	2	6	182072	182077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832034
3059	NC_015433	TTGATT	2	12	182136	182147	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	330832034
3060	NC_015433	TCC	2	6	182149	182154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330832034
3061	NC_015433	TTC	2	6	182160	182165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832034
3062	NC_015433	ATTT	2	8	182202	182209	25 %	75 %	0 %	0 %	330832034
3063	NC_015433	AGG	2	6	182336	182341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832034
3064	NC_015433	CTT	2	6	182389	182394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832034
3065	NC_015433	CTGG	2	8	182396	182403	0 %	25 %	50 %	25 %	330832034
3066	NC_015433	CTA	2	6	182435	182440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832034
3067	NC_015433	AGT	2	6	182444	182449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832034
3068	NC_015433	ATG	2	6	182460	182465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832034
3069	NC_015433	CCT	2	6	182477	182482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330832034
3070	NC_015433	AAC	2	6	182491	182496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832034
3071	NC_015433	CCG	2	6	182507	182512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330832034
3072	NC_015433	TCA	2	6	182525	182530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832034
3073	NC_015433	TCTGG	2	10	182556	182565	0 %	40 %	40 %	20 %	330832034
3074	NC_015433	GATG	2	8	182717	182724	25 %	25 %	50 %	0 %	330832034
3075	NC_015433	CATG	2	8	182756	182763	25 %	25 %	25 %	25 %	330832034
3076	NC_015433	CTT	2	6	182872	182877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832034
3077	NC_015433	TGA	2	6	182879	182884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832034
3078	NC_015433	ATT	2	6	182918	182923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832034
3079	NC_015433	A	7	7	182978	182984	100 %	0 %	0 %	0 %	330832034
3080	NC_015433	TAT	2	6	183041	183046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832034
3081	NC_015433	CTT	2	6	183080	183085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832034
3082	NC_015433	TTC	2	6	183088	183093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832034
3083	NC_015433	TTCAA	2	10	183096	183105	40 %	40 %	0 %	20 %	330832034
3084	NC_015433	CGA	2	6	183112	183117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832034
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3087	NC_015433	ATC	2	6	183264	183269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832034
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3089	NC_015433	GACC	2	8	183281	183288	25 %	0 %	25 %	50 %	330832034
3090	NC_015433	GGA	2	6	183302	183307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832034
3091	NC_015433	A	7	7	183379	183385	100 %	0 %	0 %	0 %	330832034
3092	NC_015433	T	6	6	183453	183458	0 %	100 %	0 %	0 %	330832035
3093	NC_015433	TCG	2	6	183469	183474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832035
3094	NC_015433	ATC	2	6	183531	183536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832035
3095	NC_015433	AGC	3	9	183636	183644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832035
3096	NC_015433	CAT	2	6	183696	183701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832035
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3098	NC_015433	AGA	2	6	184015	184020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832036
3099	NC_015433	GGAA	2	8	184080	184087	50 %	0 %	50 %	0 %	330832036
3100	NC_015433	A	6	6	184116	184121	100 %	0 %	0 %	0 %	330832036
3101	NC_015433	ATCA	2	8	184138	184145	50 %	25 %	0 %	25 %	330832036
3102	NC_015433	GTT	2	6	184169	184174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832036
3103	NC_015433	TTG	2	6	184200	184205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832036
3104	NC_015433	GTC	2	6	184290	184295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832036
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3107	NC_015433	TCT	2	6	184569	184574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832036
3108	NC_015433	GCCA	2	8	184576	184583	25 %	0 %	25 %	50 %	330832036
3109	NC_015433	AAG	2	6	184587	184592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832036
3110	NC_015433	GCT	2	6	184598	184603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832036
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3112	NC_015433	CAG	2	6	184761	184766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832036
3113	NC_015433	CAC	2	6	184791	184796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832036
3114	NC_015433	TCA	2	6	184824	184829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832036
3115	NC_015433	ATG	2	6	184884	184889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832036
3116	NC_015433	AGC	2	6	184972	184977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832036
3117	NC_015433	CAT	2	6	185062	185067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832036
3118	NC_015433	CAA	2	6	185083	185088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832036
3119	NC_015433	GTG	2	6	185129	185134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832036
3120	NC_015433	A	6	6	185312	185317	100 %	0 %	0 %	0 %	330832037
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