MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 34437

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015433	AGA	2	6	151298	151303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832004
2502	NC_015433	AAG	2	6	151312	151317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832004
2503	NC_015433	AGC	2	6	151337	151342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832004
2504	NC_015433	AAG	2	6	151366	151371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832004
2505	NC_015433	GTG	2	6	151396	151401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832004
2506	NC_015433	TTG	2	6	151450	151455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832004
2507	NC_015433	AAGA	2	8	151485	151492	75 %	0 %	25 %	0 %	330832004
2508	NC_015433	ACG	2	6	151501	151506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832004
2509	NC_015433	AAG	2	6	151666	151671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832004
2510	NC_015433	TGG	2	6	151709	151714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832004
2511	NC_015433	CTT	2	6	151752	151757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832004
2512	NC_015433	GGT	3	9	151782	151790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832004
2513	NC_015433	AGA	3	9	151844	151852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832004
2514	NC_015433	CTT	2	6	151875	151880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832004
2515	NC_015433	AAG	2	6	151921	151926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832004
2516	NC_015433	GTT	2	6	152058	152063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832004
2517	NC_015433	AAC	2	6	152140	152145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832004
2518	NC_015433	ATCA	2	8	152156	152163	50 %	25 %	0 %	25 %	330832004
2519	NC_015433	GGT	3	9	152166	152174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832004
2520	NC_015433	TGG	3	9	152234	152242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832004
2521	NC_015433	CTC	2	6	152256	152261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330832004
2522	NC_015433	A	6	6	152305	152310	100 %	0 %	0 %	0 %	330832004
2523	NC_015433	CT	3	6	152784	152789	0 %	50 %	0 %	50 %	330832005
2524	NC_015433	CAG	2	6	152790	152795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832005
2525	NC_015433	TTTAT	2	10	152886	152895	20 %	80 %	0 %	0 %	330832005
2526	NC_015433	TAT	2	6	152965	152970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832005
2527	NC_015433	TAA	2	6	152986	152991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832005
2528	NC_015433	TTA	2	6	153003	153008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832005
2529	NC_015433	CT	3	6	153036	153041	0 %	50 %	0 %	50 %	330832005
2530	NC_015433	ATAAA	2	10	153138	153147	80 %	20 %	0 %	0 %	330832005
2531	NC_015433	A	6	6	153145	153150	100 %	0 %	0 %	0 %	330832005
2532	NC_015433	CTTT	2	8	153154	153161	0 %	75 %	0 %	25 %	330832005
2533	NC_015433	GA	3	6	153248	153253	50 %	0 %	50 %	0 %	330832006
2534	NC_015433	CGC	2	6	153384	153389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330832006
2535	NC_015433	TAC	2	6	153415	153420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832006
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2537	NC_015433	A	6	6	153468	153473	100 %	0 %	0 %	0 %	330832006
2538	NC_015433	CAGAA	2	10	153511	153520	60 %	0 %	20 %	20 %	330832006
2539	NC_015433	TGA	2	6	153530	153535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832006
2540	NC_015433	CGT	2	6	153543	153548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832006
2541	NC_015433	ATG	2	6	153556	153561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832006
2542	NC_015433	GTC	2	6	153608	153613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832006
2543	NC_015433	TGA	2	6	153732	153737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832007
2544	NC_015433	AGA	2	6	153760	153765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832007
2545	NC_015433	A	6	6	153983	153988	100 %	0 %	0 %	0 %	330832007
2546	NC_015433	TCG	2	6	153994	153999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832007
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2550	NC_015433	GGT	2	6	154106	154111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832007
2551	NC_015433	TCG	2	6	154150	154155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832007
2552	NC_015433	CCA	2	6	154204	154209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832007
2553	NC_015433	ATA	2	6	154272	154277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832007
2554	NC_015433	GTTG	2	8	154291	154298	0 %	50 %	50 %	0 %	330832007
2555	NC_015433	TAA	2	6	154411	154416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832007
2556	NC_015433	CTT	2	6	154420	154425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832007
2557	NC_015433	AGA	2	6	154432	154437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832007
2558	NC_015433	GGT	2	6	154481	154486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832007
2559	NC_015433	GGCA	2	8	154588	154595	25 %	0 %	50 %	25 %	330832007
2560	NC_015433	GAA	2	6	154787	154792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832007
2561	NC_015433	GAT	2	6	154859	154864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832007
2562	NC_015433	GTT	2	6	154865	154870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832007
2563	NC_015433	CTT	2	6	154903	154908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832007
2564	NC_015433	GT	3	6	155308	155313	0 %	50 %	50 %	0 %	330832008
2565	NC_015433	T	6	6	155363	155368	0 %	100 %	0 %	0 %	330832008
2566	NC_015433	TC	3	6	155500	155505	0 %	50 %	0 %	50 %	330832008
2567	NC_015433	ATC	2	6	155548	155553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832008
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2569	NC_015433	TCT	2	6	155596	155601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832008
2570	NC_015433	ATG	2	6	155740	155745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832008
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2572	NC_015433	TTG	2	6	155871	155876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832008
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2574	NC_015433	TGT	2	6	155900	155905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832008
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2577	NC_015433	CTGG	2	8	156017	156024	0 %	25 %	50 %	25 %	330832008
2578	NC_015433	GA	3	6	156059	156064	50 %	0 %	50 %	0 %	330832008
2579	NC_015433	TGC	2	6	156066	156071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832008
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2581	NC_015433	ATG	2	6	156307	156312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832008
2582	NC_015433	GACC	2	8	156350	156357	25 %	0 %	25 %	50 %	330832008
2583	NC_015433	GAG	2	6	156408	156413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832008
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2585	NC_015433	CTG	2	6	156458	156463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832008
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2588	NC_015433	GAA	2	6	156573	156578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832008
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2590	NC_015433	GATT	2	8	156617	156624	25 %	50 %	25 %	0 %	330832008
2591	NC_015433	TTC	2	6	156657	156662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832008
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2593	NC_015433	AAG	2	6	156730	156735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832008
2594	NC_015433	TAA	2	6	156770	156775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832008
2595	NC_015433	AGT	2	6	156815	156820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832008
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2597	NC_015433	CGA	2	6	156878	156883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832008
2598	NC_015433	ACC	2	6	156939	156944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832008
2599	NC_015433	TGA	2	6	156984	156989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832008
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2601	NC_015433	TGT	2	6	157076	157081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832009
2602	NC_015433	GGTT	2	8	157091	157098	0 %	50 %	50 %	0 %	330832009
2603	NC_015433	CCA	2	6	157100	157105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832009
2604	NC_015433	CG	3	6	157111	157116	0 %	0 %	50 %	50 %	330832009
2605	NC_015433	ATA	2	6	157117	157122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832009
2606	NC_015433	GCA	2	6	157141	157146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832009
2607	NC_015433	TGG	2	6	157722	157727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832011
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2609	NC_015433	T	6	6	157804	157809	0 %	100 %	0 %	0 %	330832011
2610	NC_015433	GTG	2	6	157853	157858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832011
2611	NC_015433	GTGGCG	2	12	157892	157903	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	330832011
2612	NC_015433	TGG	2	6	157941	157946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832011
2613	NC_015433	TCC	2	6	157972	157977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330832011
2614	NC_015433	TGG	2	6	157992	157997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832011
2615	NC_015433	CCG	2	6	158014	158019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330832011
2616	NC_015433	ACTT	2	8	158091	158098	25 %	50 %	0 %	25 %	330832011
2617	NC_015433	GAAG	2	8	158113	158120	50 %	0 %	50 %	0 %	330832011
2618	NC_015433	CAG	2	6	158244	158249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832011
2619	NC_015433	TAC	2	6	158368	158373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832012
2620	NC_015433	CTAGC	2	10	158462	158471	20 %	20 %	20 %	40 %	330832012
2621	NC_015433	ATT	2	6	158486	158491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832012
2622	NC_015433	GCT	2	6	158620	158625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832012
2623	NC_015433	ACT	2	6	158732	158737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832012
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2625	NC_015433	TGA	2	6	158781	158786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832012
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2742	NC_015433	GA	3	6	165127	165132	50 %	0 %	50 %	0 %	330832018
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2991	NC_015433	CA	3	6	178679	178684	50 %	0 %	0 %	50 %	330832031
2992	NC_015433	TA	3	6	178686	178691	50 %	50 %	0 %	0 %	330832031
2993	NC_015433	TGGG	2	8	178755	178762	0 %	25 %	75 %	0 %	330832031
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2995	NC_015433	TAG	2	6	178887	178892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832031
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