MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 34437

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_015433	ATC	2	6	1364872	1364877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833140
23003	NC_015433	CGC	2	6	1364914	1364919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330833140
23004	NC_015433	TAG	2	6	1365014	1365019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833140
23005	NC_015433	GAT	2	6	1365076	1365081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833140
23006	NC_015433	CAA	2	6	1365169	1365174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330833140
23007	NC_015433	ATAG	2	8	1365184	1365191	50 %	25 %	25 %	0 %	330833140
23008	NC_015433	TCC	2	6	1365209	1365214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833140
23009	NC_015433	CTT	2	6	1365228	1365233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833140
23010	NC_015433	TTC	2	6	1365289	1365294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833140
23011	NC_015433	A	6	6	1365329	1365334	100 %	0 %	0 %	0 %	330833140
23012	NC_015433	ATC	2	6	1365379	1365384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833140
23013	NC_015433	GC	3	6	1365395	1365400	0 %	0 %	50 %	50 %	330833140
23014	NC_015433	CAAA	2	8	1365439	1365446	75 %	0 %	0 %	25 %	330833140
23015	NC_015433	T	6	6	1365453	1365458	0 %	100 %	0 %	0 %	330833140
23016	NC_015433	TTCA	2	8	1365467	1365474	25 %	50 %	0 %	25 %	330833140
23017	NC_015433	TCTTCA	2	12	1365486	1365497	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	330833141
23018	NC_015433	ACT	2	6	1365503	1365508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833141
23019	NC_015433	AT	3	6	1365560	1365565	50 %	50 %	0 %	0 %	330833141
23020	NC_015433	AGA	2	6	1365576	1365581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833141
23021	NC_015433	AAT	2	6	1365615	1365620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833141
23022	NC_015433	CAAT	2	8	1365748	1365755	50 %	25 %	0 %	25 %	330833141
23023	NC_015433	AAGA	2	8	1365783	1365790	75 %	0 %	25 %	0 %	330833141
23024	NC_015433	CAA	2	6	1365889	1365894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330833141
23025	NC_015433	TC	3	6	1365972	1365977	0 %	50 %	0 %	50 %	330833141
23026	NC_015433	TTGG	2	8	1365981	1365988	0 %	50 %	50 %	0 %	330833141
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23029	NC_015433	CAA	2	6	1366147	1366152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330833141
23030	NC_015433	GAAG	2	8	1366260	1366267	50 %	0 %	50 %	0 %	330833141
23031	NC_015433	TCCA	2	8	1366395	1366402	25 %	25 %	0 %	50 %	330833141
23032	NC_015433	ATC	2	6	1366446	1366451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833141
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23035	NC_015433	AAAT	2	8	1366513	1366520	75 %	25 %	0 %	0 %	330833141
23036	NC_015433	A	6	6	1366527	1366532	100 %	0 %	0 %	0 %	330833141
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23039	NC_015433	GAA	2	6	1366868	1366873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833142
23040	NC_015433	CTAC	2	8	1366881	1366888	25 %	25 %	0 %	50 %	330833142
23041	NC_015433	AGG	2	6	1366942	1366947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330833142
23042	NC_015433	TACTC	2	10	1366972	1366981	20 %	40 %	0 %	40 %	330833142
23043	NC_015433	TGT	2	6	1366987	1366992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330833142
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23051	NC_015433	TTG	2	6	1367646	1367651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330833142
23052	NC_015433	ATTG	2	8	1367866	1367873	25 %	50 %	25 %	0 %	330833143
23053	NC_015433	CAAA	2	8	1367874	1367881	75 %	0 %	0 %	25 %	330833143
23054	NC_015433	GAA	2	6	1367909	1367914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833143
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23058	NC_015433	TGTT	2	8	1368246	1368253	0 %	75 %	25 %	0 %	330833144
23059	NC_015433	T	6	6	1368252	1368257	0 %	100 %	0 %	0 %	330833144
23060	NC_015433	GCAAG	2	10	1368258	1368267	40 %	0 %	40 %	20 %	330833144
23061	NC_015433	AACC	2	8	1368297	1368304	50 %	0 %	0 %	50 %	330833144
23062	NC_015433	AG	3	6	1368310	1368315	50 %	0 %	50 %	0 %	330833144
23063	NC_015433	GAT	2	6	1368316	1368321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833144
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23068	NC_015433	TGA	2	6	1368571	1368576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833144
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23071	NC_015433	TA	3	6	1368619	1368624	50 %	50 %	0 %	0 %	330833144
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23086	NC_015433	GAA	2	6	1369992	1369997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833147
23087	NC_015433	GTC	2	6	1369998	1370003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833147
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23089	NC_015433	TGA	2	6	1370090	1370095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833147
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23092	NC_015433	ATG	2	6	1370242	1370247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833147
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23100	NC_015433	ACC	2	6	1370499	1370504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833147
23101	NC_015433	TGA	2	6	1370507	1370512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833147
23102	NC_015433	TCA	2	6	1370516	1370521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833147
23103	NC_015433	CCA	2	6	1370551	1370556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833147
23104	NC_015433	CAG	3	9	1370588	1370596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330833147
23105	NC_015433	TTG	2	6	1370694	1370699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330833147
23106	NC_015433	GAT	2	6	1370718	1370723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833147
23107	NC_015433	GTT	2	6	1370739	1370744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330833147
23108	NC_015433	ACCAAG	2	12	1370769	1370780	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	330833147
23109	NC_015433	ACTTCA	2	12	1370884	1370895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833147
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23112	NC_015433	A	6	6	1371027	1371032	100 %	0 %	0 %	0 %	330833148
23113	NC_015433	GAAA	2	8	1371047	1371054	75 %	0 %	25 %	0 %	330833148
23114	NC_015433	CCTT	2	8	1371066	1371073	0 %	50 %	0 %	50 %	330833148
23115	NC_015433	TAC	2	6	1371121	1371126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833149
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23117	NC_015433	AAC	2	6	1371171	1371176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330833149
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23230	NC_015433	TG	4	8	1377296	1377303	0 %	50 %	50 %	0 %	330833155
23231	NC_015433	TTG	2	6	1377308	1377313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330833155
23232	NC_015433	ACTA	2	8	1377319	1377326	50 %	25 %	0 %	25 %	330833155
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23234	NC_015433	ATC	2	6	1377376	1377381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833155
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23468	NC_015433	TC	3	6	1391578	1391583	0 %	50 %	0 %	50 %	330833169
23469	NC_015433	TCT	2	6	1391596	1391601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833169
23470	NC_015433	CTT	2	6	1391673	1391678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833169
23471	NC_015433	TA	3	6	1391687	1391692	50 %	50 %	0 %	0 %	330833169
23472	NC_015433	AAC	2	6	1391739	1391744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330833169
23473	NC_015433	CTT	2	6	1391750	1391755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833169
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23477	NC_015433	ACATGG	2	12	1391938	1391949	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	330833169
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23495	NC_015433	GTT	2	6	1393489	1393494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330833171
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