MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 34437

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_015433	TC	3	6	84286	84291	0 %	50 %	0 %	50 %	330831939
1503	NC_015433	AGA	2	6	84305	84310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831939
1504	NC_015433	AAT	2	6	84316	84321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330831939
1505	NC_015433	CAT	2	6	84523	84528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330831940
1506	NC_015433	GCGGTG	2	12	84580	84591	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	330831940
1507	NC_015433	CGT	2	6	84630	84635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330831940
1508	NC_015433	GAA	2	6	84809	84814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831940
1509	NC_015433	GCT	2	6	84828	84833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330831940
1510	NC_015433	GAA	2	6	84852	84857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831940
1511	NC_015433	T	6	6	84913	84918	0 %	100 %	0 %	0 %	330831941
1512	NC_015433	GTA	2	6	84956	84961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831941
1513	NC_015433	CAT	2	6	85155	85160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330831941
1514	NC_015433	TTG	2	6	85196	85201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330831941
1515	NC_015433	GTC	2	6	85226	85231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330831941
1516	NC_015433	TCAA	2	8	85281	85288	50 %	25 %	0 %	25 %	330831941
1517	NC_015433	CAG	2	6	85298	85303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330831941
1518	NC_015433	TTG	2	6	85363	85368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330831941
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1520	NC_015433	ATT	2	6	85396	85401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831941
1521	NC_015433	CTGG	2	8	85407	85414	0 %	25 %	50 %	25 %	330831941
1522	NC_015433	ATGGTA	2	12	85439	85450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831941
1523	NC_015433	ATC	2	6	85459	85464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330831941
1524	NC_015433	ATT	2	6	85474	85479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831941
1525	NC_015433	TGC	2	6	85569	85574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330831941
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1527	NC_015433	TGT	2	6	85596	85601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330831941
1528	NC_015433	ACA	2	6	85620	85625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330831941
1529	NC_015433	CAG	2	6	85709	85714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330831941
1530	NC_015433	CTT	2	6	85760	85765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330831941
1531	NC_015433	GGT	2	6	85802	85807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330831941
1532	NC_015433	ATT	2	6	85832	85837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831941
1533	NC_015433	ATT	2	6	85873	85878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831941
1534	NC_015433	TTC	2	6	85888	85893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330831941
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1537	NC_015433	TGC	2	6	86057	86062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330831941
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1539	NC_015433	CTT	2	6	86176	86181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330831941
1540	NC_015433	AGAAT	2	10	86214	86223	60 %	20 %	20 %	0 %	330831941
1541	NC_015433	TTG	2	6	86372	86377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330831942
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1543	NC_015433	TAT	2	6	86697	86702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831942
1544	NC_015433	GA	3	6	86717	86722	50 %	0 %	50 %	0 %	330831942
1545	NC_015433	CGT	2	6	86812	86817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330831942
1546	NC_015433	AGA	2	6	87085	87090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831943
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1550	NC_015433	AGA	2	6	87575	87580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831944
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1553	NC_015433	CGT	2	6	87663	87668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330831944
1554	NC_015433	GTAAAG	2	12	87781	87792	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	330831944
1555	NC_015433	A	6	6	87813	87818	100 %	0 %	0 %	0 %	330831944
1556	NC_015433	CGT	2	6	87860	87865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330831945
1557	NC_015433	TAA	2	6	87913	87918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330831945
1558	NC_015433	TCA	2	6	87965	87970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330831945
1559	NC_015433	GCT	3	9	88037	88045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330831945
1560	NC_015433	TGC	2	6	88132	88137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330831945
1561	NC_015433	CA	3	6	88182	88187	50 %	0 %	0 %	50 %	330831945
1562	NC_015433	TCC	2	6	88198	88203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330831945
1563	NC_015433	CAA	2	6	88286	88291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330831946
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1565	NC_015433	CT	3	6	88374	88379	0 %	50 %	0 %	50 %	330831946
1566	NC_015433	TCG	2	6	88380	88385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330831946
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1568	NC_015433	TGC	2	6	88410	88415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330831946
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1571	NC_015433	GTA	2	6	88561	88566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831946
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1583	NC_015433	ATCT	2	8	89030	89037	25 %	50 %	0 %	25 %	330831946
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1591	NC_015433	GTG	2	6	89377	89382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330831947
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1599	NC_015433	TGC	2	6	89573	89578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330831947
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1602	NC_015433	ATG	2	6	91083	91088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831948
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1606	NC_015433	GA	3	6	91319	91324	50 %	0 %	50 %	0 %	330831948
1607	NC_015433	A	6	6	91331	91336	100 %	0 %	0 %	0 %	330831948
1608	NC_015433	ATTA	2	8	91370	91377	50 %	50 %	0 %	0 %	330831948
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1611	NC_015433	AGT	2	6	92070	92075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831949
1612	NC_015433	AGTAA	2	10	92092	92101	60 %	20 %	20 %	0 %	330831949
1613	NC_015433	ATG	2	6	92159	92164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831949
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1619	NC_015433	AG	3	6	92637	92642	50 %	0 %	50 %	0 %	330831949
1620	NC_015433	AATC	2	8	92719	92726	50 %	25 %	0 %	25 %	330831949
1621	NC_015433	TGG	2	6	92832	92837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330831949
1622	NC_015433	CT	3	6	92873	92878	0 %	50 %	0 %	50 %	330831950
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1989	NC_015433	GTC	2	6	121524	121529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330831973
1990	NC_015433	CTTG	2	8	121609	121616	0 %	50 %	25 %	25 %	330831973
1991	NC_015433	TTGA	2	8	121784	121791	25 %	50 %	25 %	0 %	330831973
1992	NC_015433	GAT	2	6	121799	121804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831973
1993	NC_015433	GAA	2	6	121823	121828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831973
1994	NC_015433	AGA	2	6	122005	122010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831973
1995	NC_015433	ACT	3	9	122115	122123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330831973
1996	NC_015433	GTGAAG	2	12	122145	122156	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	330831973
1997	NC_015433	ATG	2	6	122288	122293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831973
1998	NC_015433	CTT	2	6	122398	122403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330831973
1999	NC_015433	CCA	2	6	122453	122458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330831973
2000	NC_015433	AAG	2	6	122462	122467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831973

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