MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 34437

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015433	GCT	2	6	365401	365406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832196
6002	NC_015433	AAGC	2	8	365417	365424	50 %	0 %	25 %	25 %	330832196
6003	NC_015433	ACC	2	6	365498	365503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832196
6004	NC_015433	ATT	2	6	365506	365511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832196
6005	NC_015433	TAC	2	6	365563	365568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832196
6006	NC_015433	AGC	2	6	365633	365638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832196
6007	NC_015433	TTG	2	6	365647	365652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832196
6008	NC_015433	TTG	2	6	365656	365661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832196
6009	NC_015433	GGC	2	6	365741	365746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330832196
6010	NC_015433	CTT	2	6	365875	365880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832196
6011	NC_015433	GAT	2	6	365923	365928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832196
6012	NC_015433	CTC	2	6	365960	365965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330832196
6013	NC_015433	GAG	2	6	365996	366001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832196
6014	NC_015433	AGA	2	6	366045	366050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832196
6015	NC_015433	CATCCA	2	12	366070	366081	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	330832196
6016	NC_015433	AAAG	2	8	366096	366103	75 %	0 %	25 %	0 %	330832196
6017	NC_015433	TTGA	2	8	366115	366122	25 %	50 %	25 %	0 %	330832196
6018	NC_015433	ATC	2	6	366218	366223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832196
6019	NC_015433	GTT	2	6	366286	366291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832196
6020	NC_015433	GAGT	2	8	366550	366557	25 %	25 %	50 %	0 %	330832197
6021	NC_015433	GTG	2	6	366577	366582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832197
6022	NC_015433	TTG	2	6	366612	366617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832197
6023	NC_015433	TTCT	2	8	366627	366634	0 %	75 %	0 %	25 %	330832197
6024	NC_015433	TTG	2	6	366699	366704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832197
6025	NC_015433	TTTTTG	2	12	366709	366720	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	330832197
6026	NC_015433	T	6	6	366905	366910	0 %	100 %	0 %	0 %	330832197
6027	NC_015433	TA	3	6	366997	367002	50 %	50 %	0 %	0 %	330832197
6028	NC_015433	GGT	2	6	367071	367076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832197
6029	NC_015433	GCA	2	6	367106	367111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832197
6030	NC_015433	TGG	2	6	367127	367132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832197
6031	NC_015433	TGGT	2	8	367210	367217	0 %	50 %	50 %	0 %	330832197
6032	NC_015433	T	6	6	367266	367271	0 %	100 %	0 %	0 %	330832197
6033	NC_015433	TGGT	2	8	367278	367285	0 %	50 %	50 %	0 %	330832197
6034	NC_015433	TTG	2	6	367312	367317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832197
6035	NC_015433	TGT	2	6	367321	367326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832197
6036	NC_015433	AT	3	6	367363	367368	50 %	50 %	0 %	0 %	330832197
6037	NC_015433	GT	3	6	367673	367678	0 %	50 %	50 %	0 %	330832198
6038	NC_015433	TTGAT	2	10	367886	367895	20 %	60 %	20 %	0 %	330832198
6039	NC_015433	AAT	2	6	367933	367938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832198
6040	NC_015433	TTG	2	6	367941	367946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832198
6041	NC_015433	GTC	2	6	367949	367954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832198
6042	NC_015433	CCA	2	6	368013	368018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832198
6043	NC_015433	ATA	2	6	368071	368076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832198
6044	NC_015433	CT	3	6	368207	368212	0 %	50 %	0 %	50 %	330832198
6045	NC_015433	CTT	3	9	368424	368432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832198
6046	NC_015433	ATTGAG	2	12	368463	368474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832198
6047	NC_015433	CTT	2	6	368530	368535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832198
6048	NC_015433	GAC	2	6	368595	368600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832198
6049	NC_015433	GAT	2	6	368626	368631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832198
6050	NC_015433	TTC	2	6	368874	368879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832198
6051	NC_015433	TTG	2	6	368904	368909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832198
6052	NC_015433	GAT	2	6	369066	369071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832199
6053	NC_015433	TG	3	6	369143	369148	0 %	50 %	50 %	0 %	330832199
6054	NC_015433	ACG	2	6	369169	369174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832199
6055	NC_015433	ATG	2	6	369292	369297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832199
6056	NC_015433	AGC	2	6	369312	369317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832199
6057	NC_015433	TTGG	2	8	369369	369376	0 %	50 %	50 %	0 %	330832199
6058	NC_015433	TGG	2	6	369609	369614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832199
6059	NC_015433	TTA	2	6	369643	369648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832199
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6061	NC_015433	ATT	2	6	369684	369689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832199
6062	NC_015433	GTGA	2	8	369945	369952	25 %	25 %	50 %	0 %	330832200
6063	NC_015433	ACAG	2	8	370093	370100	50 %	0 %	25 %	25 %	330832200
6064	NC_015433	ATG	2	6	370114	370119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832200
6065	NC_015433	AAG	2	6	370122	370127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832200
6066	NC_015433	GAT	2	6	370161	370166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832200
6067	NC_015433	GGATGA	2	12	370208	370219	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	330832200
6068	NC_015433	ATTG	3	12	370269	370280	25 %	50 %	25 %	0 %	330832200
6069	NC_015433	ATG	2	6	370507	370512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832201
6070	NC_015433	A	6	6	370530	370535	100 %	0 %	0 %	0 %	330832201
6071	NC_015433	AGT	2	6	370547	370552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832201
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6073	NC_015433	ATA	2	6	370567	370572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832201
6074	NC_015433	AAT	2	6	370587	370592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832201
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6081	NC_015433	A	7	7	370938	370944	100 %	0 %	0 %	0 %	330832201
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6089	NC_015433	TTGA	2	8	371445	371452	25 %	50 %	25 %	0 %	330832202
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6107	NC_015433	GGGA	2	8	372824	372831	25 %	0 %	75 %	0 %	330832204
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6489	NC_015433	ACCAA	2	10	392438	392447	60 %	0 %	0 %	40 %	330832222
6490	NC_015433	GTTC	2	8	392460	392467	0 %	50 %	25 %	25 %	330832222
6491	NC_015433	GT	3	6	392509	392514	0 %	50 %	50 %	0 %	330832222
6492	NC_015433	A	6	6	392546	392551	100 %	0 %	0 %	0 %	330832222
6493	NC_015433	AAT	2	6	392562	392567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832222
6494	NC_015433	T	6	6	392612	392617	0 %	100 %	0 %	0 %	330832222
6495	NC_015433	A	6	6	392632	392637	100 %	0 %	0 %	0 %	330832222
6496	NC_015433	AAT	2	6	392671	392676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832222
6497	NC_015433	AG	4	8	392730	392737	50 %	0 %	50 %	0 %	330832222
6498	NC_015433	GCT	2	6	392826	392831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832222
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