MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 34437

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015433	CAA	2	6	264568	264573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832109
4502	NC_015433	GGT	2	6	264574	264579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832109
4503	NC_015433	TTC	2	6	264586	264591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832109
4504	NC_015433	AGA	2	6	264633	264638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832109
4505	NC_015433	TCAA	2	8	264680	264687	50 %	25 %	0 %	25 %	330832109
4506	NC_015433	TCT	3	9	264779	264787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832109
4507	NC_015433	TTC	2	6	264827	264832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832109
4508	NC_015433	ATTGA	2	10	264841	264850	40 %	40 %	20 %	0 %	330832109
4509	NC_015433	AGGTGT	2	12	264873	264884	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	330832109
4510	NC_015433	CTT	2	6	264885	264890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832109
4511	NC_015433	AAG	2	6	265022	265027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832109
4512	NC_015433	TGA	2	6	265029	265034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832109
4513	NC_015433	AGGT	2	8	265064	265071	25 %	25 %	50 %	0 %	330832109
4514	NC_015433	CCA	2	6	265138	265143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832109
4515	NC_015433	AAT	2	6	265192	265197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832109
4516	NC_015433	AAG	2	6	265277	265282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832109
4517	NC_015433	A	6	6	265294	265299	100 %	0 %	0 %	0 %	330832109
4518	NC_015433	AAG	2	6	265334	265339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832109
4519	NC_015433	AGAA	2	8	265373	265380	75 %	0 %	25 %	0 %	330832109
4520	NC_015433	A	6	6	265397	265402	100 %	0 %	0 %	0 %	330832109
4521	NC_015433	CAGC	2	8	265408	265415	25 %	0 %	25 %	50 %	330832109
4522	NC_015433	ATG	2	6	265435	265440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832109
4523	NC_015433	TGA	2	6	265460	265465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832109
4524	NC_015433	ATT	2	6	265665	265670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832110
4525	NC_015433	GAT	2	6	265741	265746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832110
4526	NC_015433	TTTCC	2	10	265802	265811	0 %	60 %	0 %	40 %	330832110
4527	NC_015433	TGA	2	6	265824	265829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832110
4528	NC_015433	CAG	2	6	265838	265843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832110
4529	NC_015433	AAG	2	6	265844	265849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832110
4530	NC_015433	GAA	2	6	265870	265875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832110
4531	NC_015433	CGA	2	6	265940	265945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832110
4532	NC_015433	GTCG	2	8	265957	265964	0 %	25 %	50 %	25 %	330832110
4533	NC_015433	ATG	2	6	265997	266002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832110
4534	NC_015433	TAT	2	6	266059	266064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832110
4535	NC_015433	TCA	2	6	266142	266147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832110
4536	NC_015433	AGCA	2	8	266546	266553	50 %	0 %	25 %	25 %	330832111
4537	NC_015433	TAT	2	6	266571	266576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832111
4538	NC_015433	AGTT	2	8	266659	266666	25 %	50 %	25 %	0 %	330832111
4539	NC_015433	CTA	2	6	266676	266681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832111
4540	NC_015433	GTA	2	6	266690	266695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832111
4541	NC_015433	GAA	2	6	266726	266731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832111
4542	NC_015433	AG	3	6	266740	266745	50 %	0 %	50 %	0 %	330832111
4543	NC_015433	GAA	2	6	266771	266776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832111
4544	NC_015433	GAT	2	6	266830	266835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832111
4545	NC_015433	GAA	2	6	266861	266866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832111
4546	NC_015433	ATA	2	6	266892	266897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832111
4547	NC_015433	ATC	2	6	266938	266943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832111
4548	NC_015433	TTG	2	6	267008	267013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832111
4549	NC_015433	AAGT	2	8	267042	267049	50 %	25 %	25 %	0 %	330832111
4550	NC_015433	ATC	2	6	267078	267083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832111
4551	NC_015433	TTTAT	2	10	267093	267102	20 %	80 %	0 %	0 %	330832111
4552	NC_015433	ATG	2	6	267147	267152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832111
4553	NC_015433	ATT	2	6	267154	267159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832111
4554	NC_015433	TAA	2	6	267172	267177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832111
4555	NC_015433	TAA	2	6	267190	267195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832111
4556	NC_015433	TAA	2	6	267223	267228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832111
4557	NC_015433	AGA	2	6	267229	267234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832111
4558	NC_015433	TAA	2	6	267250	267255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832111
4559	NC_015433	CAG	2	6	267270	267275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832111
4560	NC_015433	AATGA	2	10	267287	267296	60 %	20 %	20 %	0 %	330832111
4561	NC_015433	TAA	2	6	267298	267303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832111
4562	NC_015433	TCAAA	2	10	267401	267410	60 %	20 %	0 %	20 %	330832111
4563	NC_015433	TGA	2	6	267432	267437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832111
4564	NC_015433	GAAA	2	8	267508	267515	75 %	0 %	25 %	0 %	330832111
4565	NC_015433	ACC	2	6	267523	267528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832111
4566	NC_015433	AAG	2	6	267599	267604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832111
4567	NC_015433	AGA	2	6	267679	267684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832111
4568	NC_015433	GAAG	2	8	267709	267716	50 %	0 %	50 %	0 %	330832111
4569	NC_015433	GCTCCA	2	12	267719	267730	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330832111
4570	NC_015433	AGA	2	6	267754	267759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832111
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4572	NC_015433	GAC	2	6	267818	267823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832111
4573	NC_015433	CAC	2	6	267855	267860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832111
4574	NC_015433	CAC	2	6	267903	267908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832111
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4580	NC_015433	CAC	2	6	268095	268100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832111
4581	NC_015433	CAC	2	6	268143	268148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832111
4582	NC_015433	GAC	2	6	268154	268159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832111
4583	NC_015433	CAC	2	6	268191	268196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832111
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4586	NC_015433	AGA	2	6	268282	268287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832111
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4589	NC_015433	CGA	2	6	268456	268461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832111
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4591	NC_015433	AAC	2	6	268560	268565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832111
4592	NC_015433	GAC	2	6	268589	268594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832111
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4594	NC_015433	CGA	2	6	268621	268626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832111
4595	NC_015433	AAGA	2	8	268661	268668	75 %	0 %	25 %	0 %	330832111
4596	NC_015433	AAC	2	6	268725	268730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832111
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4599	NC_015433	GGT	2	6	268898	268903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832111
4600	NC_015433	CAAAAA	2	12	268939	268950	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	330832111
4601	NC_015433	AGA	2	6	268951	268956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832111
4602	NC_015433	ATCT	2	8	271867	271874	25 %	50 %	0 %	25 %	330832112
4603	NC_015433	A	6	6	271886	271891	100 %	0 %	0 %	0 %	330832112
4604	NC_015433	ATT	2	6	271936	271941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832112
4605	NC_015433	ATTT	2	8	271944	271951	25 %	75 %	0 %	0 %	330832112
4606	NC_015433	T	6	6	272085	272090	0 %	100 %	0 %	0 %	330832113
4607	NC_015433	GTTT	2	8	272117	272124	0 %	75 %	25 %	0 %	330832113
4608	NC_015433	T	6	6	272122	272127	0 %	100 %	0 %	0 %	330832113
4609	NC_015433	TAT	2	6	272200	272205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832114
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4612	NC_015433	GTA	2	6	272244	272249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832114
4613	NC_015433	AGT	2	6	272289	272294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832114
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4617	NC_015433	TTC	2	6	272350	272355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832114
4618	NC_015433	TTTC	2	8	272387	272394	0 %	75 %	0 %	25 %	330832114
4619	NC_015433	TAT	2	6	272659	272664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832115
4620	NC_015433	TAC	2	6	272697	272702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832115
4621	NC_015433	GCA	2	6	272745	272750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832115
4622	NC_015433	GACA	2	8	272833	272840	50 %	0 %	25 %	25 %	330832115
4623	NC_015433	GTT	2	6	272918	272923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832115
4624	NC_015433	GCAG	2	8	273016	273023	25 %	0 %	50 %	25 %	330832115
4625	NC_015433	GTC	2	6	273024	273029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832115
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4631	NC_015433	CGC	2	6	273219	273224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330832115
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4988	NC_015433	CCA	2	6	296511	296516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832133
4989	NC_015433	ACCA	2	8	296537	296544	50 %	0 %	0 %	50 %	330832133
4990	NC_015433	GAG	2	6	296792	296797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832133
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4993	NC_015433	GGA	2	6	296881	296886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832133
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