MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus gallolyticus subsp. gallolyticus ATCC BAA-2069 plasmid pSGG1

Total Repeats: 270

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015219	GCT	2	6	314	319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325926839
2	NC_015219	TAA	2	6	348	353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325926839
3	NC_015219	CTG	2	6	369	374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325926839
4	NC_015219	AACC	2	8	459	466	50 %	0 %	0 %	50 %	325926839
5	NC_015219	T	6	6	469	474	0 %	100 %	0 %	0 %	325926839
6	NC_015219	TTTGA	2	10	602	611	20 %	60 %	20 %	0 %	325926839
7	NC_015219	AAC	2	6	733	738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325926839
8	NC_015219	ACC	2	6	748	753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325926839
9	NC_015219	CGA	2	6	860	865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325926839
10	NC_015219	CATGA	2	10	1057	1066	40 %	20 %	20 %	20 %	325926839
11	NC_015219	TAT	2	6	1257	1262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926839
12	NC_015219	ATA	2	6	1321	1326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325926839
13	NC_015219	TTC	2	6	2788	2793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325926840
14	NC_015219	T	6	6	2851	2856	0 %	100 %	0 %	0 %	325926840
15	NC_015219	TATT	2	8	2882	2889	25 %	75 %	0 %	0 %	325926840
16	NC_015219	T	6	6	2907	2912	0 %	100 %	0 %	0 %	325926840
17	NC_015219	T	6	6	3106	3111	0 %	100 %	0 %	0 %	325926840
18	NC_015219	ACA	2	6	3224	3229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325926840
19	NC_015219	ATA	2	6	3272	3277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325926840
20	NC_015219	AAAT	2	8	3295	3302	75 %	25 %	0 %	0 %	325926840
21	NC_015219	GTT	2	6	3318	3323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325926840
22	NC_015219	ATA	2	6	3334	3339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325926840
23	NC_015219	TCA	2	6	3431	3436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325926840
24	NC_015219	AGAAA	2	10	3487	3496	80 %	0 %	20 %	0 %	325926840
25	NC_015219	A	6	6	3494	3499	100 %	0 %	0 %	0 %	325926840
26	NC_015219	TCT	2	6	3506	3511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325926840
27	NC_015219	ATT	2	6	3547	3552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926840
28	NC_015219	ATA	2	6	4415	4420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325926841
29	NC_015219	TGT	2	6	4475	4480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325926841
30	NC_015219	CCTGCT	2	12	4536	4547	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	325926841
31	NC_015219	GTT	2	6	4623	4628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325926841
32	NC_015219	TGA	2	6	4637	4642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325926841
33	NC_015219	TTA	2	6	4671	4676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926841
34	NC_015219	ATA	2	6	4769	4774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325926841
35	NC_015219	CAG	2	6	4849	4854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325926841
36	NC_015219	TTC	2	6	4871	4876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325926841
37	NC_015219	TAGAC	2	10	4911	4920	40 %	20 %	20 %	20 %	325926841
38	NC_015219	CAT	2	6	4921	4926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325926841
39	NC_015219	TTC	2	6	5006	5011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325926841
40	NC_015219	TTCCGT	2	12	5063	5074	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	325926841
41	NC_015219	TTG	2	6	5168	5173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325926841
42	NC_015219	GCTCCT	2	12	5187	5198	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	325926841
43	NC_015219	T	6	6	5237	5242	0 %	100 %	0 %	0 %	325926841
44	NC_015219	TGA	2	6	5790	5795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325926842
45	NC_015219	TATCC	2	10	5900	5909	20 %	40 %	0 %	40 %	325926842
46	NC_015219	TTA	2	6	6020	6025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926842
47	NC_015219	TCTT	2	8	6037	6044	0 %	75 %	0 %	25 %	325926842
48	NC_015219	CTC	2	6	6079	6084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325926842
49	NC_015219	AAC	2	6	6175	6180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325926842
50	NC_015219	ACC	2	6	6190	6195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325926842
51	NC_015219	CATGA	2	10	6499	6508	40 %	20 %	20 %	20 %	325926842
52	NC_015219	CTA	2	6	6555	6560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325926842
53	NC_015219	CAG	2	6	6633	6638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325926843
54	NC_015219	ATT	2	6	6645	6650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926843
55	NC_015219	CTA	2	6	6662	6667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325926843
56	NC_015219	ACG	2	6	6738	6743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325926843
57	NC_015219	ACT	2	6	6773	6778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325926843
58	NC_015219	GAAAAA	2	12	6791	6802	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325926843
59	NC_015219	A	6	6	6804	6809	100 %	0 %	0 %	0 %	325926843
60	NC_015219	ATT	2	6	6865	6870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926843
61	NC_015219	A	6	6	6921	6926	100 %	0 %	0 %	0 %	325926843
62	NC_015219	AC	3	6	6931	6936	50 %	0 %	0 %	50 %	325926843
63	NC_015219	AGC	2	6	6938	6943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325926843
64	NC_015219	TGA	2	6	6977	6982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325926843
65	NC_015219	AAT	2	6	7092	7097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325926843
66	NC_015219	TTGA	2	8	7098	7105	25 %	50 %	25 %	0 %	325926843
67	NC_015219	TA	3	6	7201	7206	50 %	50 %	0 %	0 %	325926843
68	NC_015219	AAG	2	6	7219	7224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325926843
69	NC_015219	CT	3	6	7228	7233	0 %	50 %	0 %	50 %	325926843
70	NC_015219	TAT	2	6	7264	7269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926843
71	NC_015219	TTTA	2	8	7315	7322	25 %	75 %	0 %	0 %	325926844
72	NC_015219	CTT	2	6	7363	7368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325926844
73	NC_015219	CACGAA	2	12	7423	7434	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	325926844
74	NC_015219	T	7	7	7457	7463	0 %	100 %	0 %	0 %	325926844
75	NC_015219	TCAC	2	8	7519	7526	25 %	25 %	0 %	50 %	325926844
76	NC_015219	ATT	2	6	7676	7681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926845
77	NC_015219	GAA	3	9	7708	7716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325926845
78	NC_015219	TACA	2	8	7776	7783	50 %	25 %	0 %	25 %	325926845
79	NC_015219	TCT	2	6	7788	7793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325926845
80	NC_015219	ACAG	2	8	7832	7839	50 %	0 %	25 %	25 %	325926845
81	NC_015219	ATT	2	6	7984	7989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926845
82	NC_015219	AAT	2	6	8370	8375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325926846
83	NC_015219	ACA	2	6	8413	8418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325926846
84	NC_015219	GTG	2	6	8444	8449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325926846
85	NC_015219	CAA	2	6	8483	8488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325926846
86	NC_015219	CAG	2	6	8537	8542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325926846
87	NC_015219	GGA	2	6	8559	8564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325926846
88	NC_015219	T	6	6	8604	8609	0 %	100 %	0 %	0 %	325926846
89	NC_015219	CAA	2	6	8745	8750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325926846
90	NC_015219	CCG	2	6	8810	8815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325926846
91	NC_015219	ATC	2	6	8821	8826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325926846
92	NC_015219	GGA	2	6	8862	8867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325926846
93	NC_015219	ATT	2	6	8916	8921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926846
94	NC_015219	GGA	2	6	8970	8975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325926846
95	NC_015219	GCG	2	6	8979	8984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325926846
96	NC_015219	TAT	2	6	9013	9018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926846
97	NC_015219	GATG	2	8	9054	9061	25 %	25 %	50 %	0 %	325926846
98	NC_015219	GCC	2	6	9103	9108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325926846
99	NC_015219	GCG	2	6	9153	9158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325926846
100	NC_015219	TCTA	2	8	9161	9168	25 %	50 %	0 %	25 %	325926846
101	NC_015219	GA	3	6	9219	9224	50 %	0 %	50 %	0 %	325926846
102	NC_015219	TCCA	2	8	9252	9259	25 %	25 %	0 %	50 %	325926846
103	NC_015219	GACA	2	8	9276	9283	50 %	0 %	25 %	25 %	325926846
104	NC_015219	TGA	2	6	9315	9320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325926846
105	NC_015219	T	6	6	9531	9536	0 %	100 %	0 %	0 %	325926846
106	NC_015219	AGA	2	6	9573	9578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325926846
107	NC_015219	TTAT	2	8	9617	9624	25 %	75 %	0 %	0 %	325926846
108	NC_015219	AATC	2	8	9772	9779	50 %	25 %	0 %	25 %	325926846
109	NC_015219	ATGG	2	8	9833	9840	25 %	25 %	50 %	0 %	325926846
110	NC_015219	TAT	2	6	9880	9885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926846
111	NC_015219	GCT	2	6	9915	9920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325926846
112	NC_015219	A	7	7	9948	9954	100 %	0 %	0 %	0 %	325926846
113	NC_015219	TC	3	6	10014	10019	0 %	50 %	0 %	50 %	325926846
114	NC_015219	ATG	2	6	10031	10036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325926846
115	NC_015219	CCAG	2	8	10194	10201	25 %	0 %	25 %	50 %	325926846
116	NC_015219	ATTT	2	8	10212	10219	25 %	75 %	0 %	0 %	325926846
117	NC_015219	CGC	2	6	10228	10233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325926846
118	NC_015219	GAAAG	2	10	10721	10730	60 %	0 %	40 %	0 %	325926847
119	NC_015219	GAA	2	6	10752	10757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325926847
120	NC_015219	TGA	2	6	10897	10902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325926847
121	NC_015219	CAGG	2	8	10974	10981	25 %	0 %	50 %	25 %	325926847
122	NC_015219	TAC	2	6	11022	11027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325926847
123	NC_015219	GA	3	6	11067	11072	50 %	0 %	50 %	0 %	325926847
124	NC_015219	CAG	2	6	11083	11088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325926847
125	NC_015219	AGCAG	2	10	11090	11099	40 %	0 %	40 %	20 %	325926847
126	NC_015219	AG	3	6	11104	11109	50 %	0 %	50 %	0 %	325926847
127	NC_015219	AAG	2	6	11165	11170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325926847
128	NC_015219	CGT	2	6	11222	11227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325926848
129	NC_015219	TGG	2	6	11232	11237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325926848
130	NC_015219	ATT	2	6	11240	11245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926848
131	NC_015219	CAA	2	6	11278	11283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325926848
132	NC_015219	GTG	2	6	11369	11374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325926848
133	NC_015219	CCAA	2	8	11398	11405	50 %	0 %	0 %	50 %	325926848
134	NC_015219	GAA	2	6	11431	11436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325926848
135	NC_015219	TGA	2	6	11454	11459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325926848
136	NC_015219	TGA	2	6	11462	11467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325926848
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140	NC_015219	GAT	2	6	11572	11577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325926848
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260	NC_015219	T	7	7	20083	20089	0 %	100 %	0 %	0 %	325926858
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265	NC_015219	TTC	2	6	20233	20238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325926858
266	NC_015219	TAA	3	9	20329	20337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325926858
267	NC_015219	A	6	6	20341	20346	100 %	0 %	0 %	0 %	325926858
268	NC_015219	A	6	6	20358	20363	100 %	0 %	0 %	0 %	325926858
269	NC_015219	ATTT	2	8	20367	20374	25 %	75 %	0 %	0 %	325926858
270	NC_015219	TAA	2	6	20377	20382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325926858

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.