MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 57504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015152	TTC	2	6	139689	139694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325969967
2502	NC_015152	GAT	2	6	139799	139804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969967
2503	NC_015152	GT	3	6	139815	139820	0 %	50 %	50 %	0 %	325969967
2504	NC_015152	CGT	2	6	140032	140037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969967
2505	NC_015152	CGA	2	6	140059	140064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969967
2506	NC_015152	CT	3	6	140095	140100	0 %	50 %	0 %	50 %	325969967
2507	NC_015152	GCC	2	6	140129	140134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325969967
2508	NC_015152	GCA	2	6	140143	140148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969967
2509	NC_015152	ACG	2	6	140276	140281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969967
2510	NC_015152	CT	3	6	140293	140298	0 %	50 %	0 %	50 %	325969967
2511	NC_015152	TAAT	2	8	140353	140360	50 %	50 %	0 %	0 %	325969967
2512	NC_015152	TGC	2	6	140459	140464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969968
2513	NC_015152	GAA	2	6	140629	140634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969968
2514	NC_015152	AGG	2	6	140645	140650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325969968
2515	NC_015152	GTT	2	6	140660	140665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969968
2516	NC_015152	TCTT	2	8	140672	140679	0 %	75 %	0 %	25 %	325969968
2517	NC_015152	CA	3	6	140712	140717	50 %	0 %	0 %	50 %	325969968
2518	NC_015152	CAT	3	9	140736	140744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969968
2519	NC_015152	TAG	2	6	140775	140780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969968
2520	NC_015152	GCA	2	6	140813	140818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969968
2521	NC_015152	TTAC	2	8	140824	140831	25 %	50 %	0 %	25 %	325969968
2522	NC_015152	GT	3	6	140837	140842	0 %	50 %	50 %	0 %	325969968
2523	NC_015152	GCT	2	6	140903	140908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969968
2524	NC_015152	ACC	2	6	140911	140916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969968
2525	NC_015152	GTT	2	6	140940	140945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969968
2526	NC_015152	CGACC	2	10	140961	140970	20 %	0 %	20 %	60 %	325969968
2527	NC_015152	ATC	2	6	140977	140982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969968
2528	NC_015152	AGCGG	2	10	141001	141010	20 %	0 %	60 %	20 %	325969968
2529	NC_015152	ATC	2	6	141080	141085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969968
2530	NC_015152	GGC	2	6	141237	141242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969968
2531	NC_015152	CGAT	2	8	141386	141393	25 %	25 %	25 %	25 %	325969968
2532	NC_015152	GCC	2	6	141409	141414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325969968
2533	NC_015152	GAG	2	6	141454	141459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325969968
2534	NC_015152	AGG	2	6	141497	141502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325969968
2535	NC_015152	ATT	2	6	141514	141519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325969969
2536	NC_015152	AAGA	2	8	141586	141593	75 %	0 %	25 %	0 %	325969969
2537	NC_015152	ACC	2	6	141643	141648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969969
2538	NC_015152	GCT	2	6	141661	141666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969969
2539	NC_015152	TGG	2	6	141689	141694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969969
2540	NC_015152	TCA	2	6	141722	141727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969969
2541	NC_015152	AGG	2	6	141884	141889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325969969
2542	NC_015152	GCA	2	6	141902	141907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969969
2543	NC_015152	GAGC	2	8	141917	141924	25 %	0 %	50 %	25 %	325969969
2544	NC_015152	AGC	2	6	141942	141947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969969
2545	NC_015152	ACC	2	6	141961	141966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969969
2546	NC_015152	AAG	2	6	141976	141981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969969
2547	NC_015152	GAT	2	6	142050	142055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969969
2548	NC_015152	TCA	2	6	142085	142090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969969
2549	NC_015152	TTG	2	6	142129	142134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969969
2550	NC_015152	CTC	2	6	142137	142142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325969969
2551	NC_015152	CCA	2	6	142187	142192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969969
2552	NC_015152	TC	4	8	142237	142244	0 %	50 %	0 %	50 %	325969969
2553	NC_015152	TATG	2	8	142284	142291	25 %	50 %	25 %	0 %	325969969
2554	NC_015152	GGT	2	6	142359	142364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969969
2555	NC_015152	TTC	2	6	142438	142443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325969969
2556	NC_015152	GAA	2	6	142463	142468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969969
2557	NC_015152	GCG	2	6	142490	142495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969969
2558	NC_015152	TGA	2	6	142726	142731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969969
2559	NC_015152	GCA	2	6	142807	142812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969970
2560	NC_015152	GTG	2	6	142815	142820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969970
2561	NC_015152	TGG	2	6	142843	142848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969970
2562	NC_015152	GAA	2	6	142859	142864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969970
2563	NC_015152	GTCA	2	8	142865	142872	25 %	25 %	25 %	25 %	325969970
2564	NC_015152	GGT	3	9	142913	142921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969970
2565	NC_015152	GAG	2	6	143007	143012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325969970
2566	NC_015152	TGA	2	6	143066	143071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969970
2567	NC_015152	GCA	2	6	143134	143139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969970
2568	NC_015152	CAA	2	6	143225	143230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325969970
2569	NC_015152	GGT	2	6	143240	143245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969970
2570	NC_015152	TGGA	2	8	143260	143267	25 %	25 %	50 %	0 %	325969970
2571	NC_015152	ACA	2	6	143281	143286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325969970
2572	NC_015152	GGAA	2	8	143360	143367	50 %	0 %	50 %	0 %	325969970
2573	NC_015152	CAAGGA	2	12	143372	143383	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	325969970
2574	NC_015152	TGC	2	6	143481	143486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969970
2575	NC_015152	CGGG	2	8	143531	143538	0 %	0 %	75 %	25 %	325969970
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2578	NC_015152	GAAA	2	8	143724	143731	75 %	0 %	25 %	0 %	325969971
2579	NC_015152	GGA	2	6	143747	143752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325969971
2580	NC_015152	GTC	2	6	143810	143815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969971
2581	NC_015152	TAC	2	6	143846	143851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969971
2582	NC_015152	GTG	2	6	143925	143930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969971
2583	NC_015152	GCT	2	6	143945	143950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969971
2584	NC_015152	GCAC	2	8	143990	143997	25 %	0 %	25 %	50 %	325969971
2585	NC_015152	CAT	2	6	144001	144006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969971
2586	NC_015152	CAA	2	6	144121	144126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325969971
2587	NC_015152	ATC	2	6	144170	144175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969971
2588	NC_015152	G	6	6	144196	144201	0 %	0 %	100 %	0 %	325969971
2589	NC_015152	TCC	2	6	144225	144230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325969971
2590	NC_015152	ATG	2	6	144276	144281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969971
2591	NC_015152	CAC	2	6	144355	144360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969971
2592	NC_015152	CGG	2	6	144376	144381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969971
2593	NC_015152	CAG	2	6	144536	144541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969971
2594	NC_015152	CT	3	6	144594	144599	0 %	50 %	0 %	50 %	325969971
2595	NC_015152	GCG	2	6	144600	144605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969971
2596	NC_015152	TCC	2	6	144649	144654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325969971
2597	NC_015152	GTC	2	6	144662	144667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969971
2598	NC_015152	TGG	2	6	144693	144698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969971
2599	NC_015152	ACG	2	6	144711	144716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969971
2600	NC_015152	CTTCG	2	10	144719	144728	0 %	40 %	20 %	40 %	325969971
2601	NC_015152	TGG	2	6	144738	144743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969971
2602	NC_015152	TG	3	6	144892	144897	0 %	50 %	50 %	0 %	325969972
2603	NC_015152	TCG	2	6	145048	145053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969972
2604	NC_015152	CAG	2	6	145134	145139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969972
2605	NC_015152	GAG	2	6	145236	145241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325969972
2606	NC_015152	TAT	2	6	145316	145321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325969972
2607	NC_015152	GGAG	2	8	145385	145392	25 %	0 %	75 %	0 %	325969972
2608	NC_015152	TCC	2	6	145398	145403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325969972
2609	NC_015152	GCG	2	6	145542	145547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969972
2610	NC_015152	TGA	2	6	145561	145566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969972
2611	NC_015152	ATT	2	6	145614	145619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325969972
2612	NC_015152	TGG	2	6	145680	145685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969972
2613	NC_015152	GGC	2	6	145736	145741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969972
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2616	NC_015152	CGA	2	6	145943	145948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969972
2617	NC_015152	GAG	2	6	146004	146009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325969972
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2619	NC_015152	GCC	2	6	146225	146230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325969972
2620	NC_015152	CCA	2	6	146374	146379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969972
2621	NC_015152	AGG	2	6	146380	146385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325969972
2622	NC_015152	CTGT	2	8	146399	146406	0 %	50 %	25 %	25 %	325969972
2623	NC_015152	TGC	2	6	146432	146437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969972
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2626	NC_015152	TCA	2	6	146902	146907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969973
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2865	NC_015152	AATAA	2	10	160650	160659	80 %	20 %	0 %	0 %	325969984
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2978	NC_015152	CA	3	6	168225	168230	50 %	0 %	0 %	50 %	325969992
2979	NC_015152	A	6	6	168309	168314	100 %	0 %	0 %	0 %	325969992
2980	NC_015152	AG	3	6	168362	168367	50 %	0 %	50 %	0 %	325969992
2981	NC_015152	AGAC	2	8	168374	168381	50 %	0 %	25 %	25 %	325969992
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2984	NC_015152	TGC	2	6	168480	168485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969992
2985	NC_015152	AACGAT	2	12	168568	168579	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	325969992
2986	NC_015152	ATC	2	6	168593	168598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969992
2987	NC_015152	CGG	2	6	168625	168630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969992
2988	NC_015152	TGGT	2	8	168704	168711	0 %	50 %	50 %	0 %	325969992
2989	NC_015152	GTG	3	9	168731	168739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969992
2990	NC_015152	TGC	2	6	168758	168763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969992
2991	NC_015152	AGA	2	6	168775	168780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969992
2992	NC_015152	AAG	2	6	168799	168804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969992
2993	NC_015152	AAT	3	9	168898	168906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325969993
2994	NC_015152	GGC	2	6	169066	169071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969993
2995	NC_015152	GAAG	2	8	169074	169081	50 %	0 %	50 %	0 %	325969993
2996	NC_015152	CAC	2	6	169104	169109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969993
2997	NC_015152	GAA	2	6	169143	169148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969993
2998	NC_015152	ATGTT	2	10	169166	169175	20 %	60 %	20 %	0 %	325969993
2999	NC_015152	A	6	6	169188	169193	100 %	0 %	0 %	0 %	325969993
3000	NC_015152	AAT	2	6	169267	169272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325969993

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