MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 57504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015152	CAT	2	6	84927	84932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969917
1502	NC_015152	TGA	3	9	84974	84982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969917
1503	NC_015152	CGA	2	6	84986	84991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969917
1504	NC_015152	GAT	2	6	85011	85016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969917
1505	NC_015152	GGT	2	6	85033	85038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969917
1506	NC_015152	GGC	2	6	85051	85056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969917
1507	NC_015152	GGC	2	6	85071	85076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969917
1508	NC_015152	GCG	2	6	85116	85121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969917
1509	NC_015152	CAT	3	9	85149	85157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969917
1510	NC_015152	TTG	2	6	85178	85183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969917
1511	NC_015152	ATG	2	6	85198	85203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969917
1512	NC_015152	TTG	2	6	85214	85219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969917
1513	NC_015152	CTC	2	6	85254	85259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325969917
1514	NC_015152	ATC	2	6	85267	85272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969917
1515	NC_015152	CAA	2	6	85308	85313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325969917
1516	NC_015152	GGA	2	6	85327	85332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325969917
1517	NC_015152	TGC	2	6	85398	85403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969917
1518	NC_015152	ATT	2	6	85414	85419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325969917
1519	NC_015152	GAA	2	6	85452	85457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969917
1520	NC_015152	TGG	2	6	85470	85475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969917
1521	NC_015152	GCT	2	6	85486	85491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969917
1522	NC_015152	TTGG	2	8	85522	85529	0 %	50 %	50 %	0 %	325969917
1523	NC_015152	GCC	2	6	85579	85584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325969917
1524	NC_015152	CAA	2	6	85598	85603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325969917
1525	NC_015152	CCT	2	6	85640	85645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325969917
1526	NC_015152	GTC	2	6	85648	85653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969917
1527	NC_015152	GGT	2	6	85654	85659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969917
1528	NC_015152	ACC	2	6	85666	85671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969917
1529	NC_015152	GGT	2	6	85672	85677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969917
1530	NC_015152	ATT	2	6	85711	85716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325969917
1531	NC_015152	TCA	2	6	85724	85729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969917
1532	NC_015152	CAT	2	6	85773	85778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969917
1533	NC_015152	ATT	2	6	85789	85794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325969917
1534	NC_015152	CGG	2	6	85799	85804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969917
1535	NC_015152	AGT	2	6	85838	85843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969917
1536	NC_015152	GTA	2	6	85977	85982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969918
1537	NC_015152	CCTT	2	8	85992	85999	0 %	50 %	0 %	50 %	325969918
1538	NC_015152	ATG	2	6	86175	86180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969918
1539	NC_015152	TCCC	2	8	86324	86331	0 %	25 %	0 %	75 %	325969918
1540	NC_015152	AAAG	2	8	86466	86473	75 %	0 %	25 %	0 %	325969918
1541	NC_015152	GCG	2	6	86631	86636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969918
1542	NC_015152	GAAA	2	8	86732	86739	75 %	0 %	25 %	0 %	325969919
1543	NC_015152	CCA	2	6	86774	86779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969919
1544	NC_015152	A	6	6	86825	86830	100 %	0 %	0 %	0 %	325969919
1545	NC_015152	TCA	2	6	86920	86925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969919
1546	NC_015152	AGGA	2	8	86955	86962	50 %	0 %	50 %	0 %	325969919
1547	NC_015152	TAA	2	6	86968	86973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325969919
1548	NC_015152	G	8	8	86999	87006	0 %	0 %	100 %	0 %	325969919
1549	NC_015152	GTTT	2	8	87054	87061	0 %	75 %	25 %	0 %	325969919
1550	NC_015152	TC	3	6	87125	87130	0 %	50 %	0 %	50 %	325969919
1551	NC_015152	AAG	2	6	87163	87168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969919
1552	NC_015152	ATA	2	6	87205	87210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325969919
1553	NC_015152	ATT	2	6	87211	87216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325969919
1554	NC_015152	CAT	2	6	87233	87238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969919
1555	NC_015152	ATGGA	2	10	87291	87300	40 %	20 %	40 %	0 %	325969919
1556	NC_015152	GTT	2	6	87327	87332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969919
1557	NC_015152	T	6	6	87404	87409	0 %	100 %	0 %	0 %	325969919
1558	NC_015152	ACA	2	6	87466	87471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325969919
1559	NC_015152	AT	3	6	87486	87491	50 %	50 %	0 %	0 %	325969919
1560	NC_015152	GT	3	6	87657	87662	0 %	50 %	50 %	0 %	325969920
1561	NC_015152	GCAA	2	8	87714	87721	50 %	0 %	25 %	25 %	325969920
1562	NC_015152	TG	3	6	87729	87734	0 %	50 %	50 %	0 %	325969920
1563	NC_015152	TAA	2	6	87740	87745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325969920
1564	NC_015152	CAG	2	6	87813	87818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969920
1565	NC_015152	AACC	2	8	87821	87828	50 %	0 %	0 %	50 %	325969920
1566	NC_015152	T	6	6	87904	87909	0 %	100 %	0 %	0 %	325969920
1567	NC_015152	CTG	2	6	87921	87926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969920
1568	NC_015152	TGT	2	6	87968	87973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969920
1569	NC_015152	GAA	2	6	88013	88018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969920
1570	NC_015152	AAT	2	6	88077	88082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325969920
1571	NC_015152	CTG	2	6	88253	88258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969920
1572	NC_015152	TAA	2	6	88360	88365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325969921
1573	NC_015152	TAT	2	6	88373	88378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325969921
1574	NC_015152	ACAAT	2	10	88477	88486	60 %	20 %	0 %	20 %	325969921
1575	NC_015152	AGGG	2	8	88492	88499	25 %	0 %	75 %	0 %	325969921
1576	NC_015152	ATC	2	6	88512	88517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969921
1577	NC_015152	AAC	2	6	88532	88537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325969921
1578	NC_015152	AAC	2	6	88627	88632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325969921
1579	NC_015152	AAGA	2	8	88640	88647	75 %	0 %	25 %	0 %	325969921
1580	NC_015152	TGA	2	6	88654	88659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969921
1581	NC_015152	TGG	2	6	88681	88686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969921
1582	NC_015152	TGC	2	6	88754	88759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969921
1583	NC_015152	TGAAAA	2	12	88843	88854	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325969921
1584	NC_015152	AGC	2	6	88877	88882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969921
1585	NC_015152	GCC	2	6	88890	88895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325969921
1586	NC_015152	AAG	2	6	88931	88936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969921
1587	NC_015152	GAA	2	6	88957	88962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969921
1588	NC_015152	T	7	7	89027	89033	0 %	100 %	0 %	0 %	325969921
1589	NC_015152	CGC	2	6	89119	89124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325969921
1590	NC_015152	GCG	2	6	89187	89192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969921
1591	NC_015152	GCG	2	6	89199	89204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969921
1592	NC_015152	GCA	2	6	89238	89243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969921
1593	NC_015152	GCA	2	6	89265	89270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969921
1594	NC_015152	AGCC	2	8	89346	89353	25 %	0 %	25 %	50 %	325969921
1595	NC_015152	AC	3	6	89355	89360	50 %	0 %	0 %	50 %	325969921
1596	NC_015152	TCA	2	6	89404	89409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969921
1597	NC_015152	GCA	2	6	89415	89420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969921
1598	NC_015152	AAAG	2	8	89446	89453	75 %	0 %	25 %	0 %	325969921
1599	NC_015152	GAA	2	6	89482	89487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969921
1600	NC_015152	TCCA	2	8	89496	89503	25 %	25 %	0 %	50 %	325969921
1601	NC_015152	AG	3	6	89556	89561	50 %	0 %	50 %	0 %	325969921
1602	NC_015152	GAT	2	6	89591	89596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969921
1603	NC_015152	ACA	2	6	89620	89625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325969921
1604	NC_015152	TTC	2	6	89640	89645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325969922
1605	NC_015152	GAA	2	6	89672	89677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969922
1606	NC_015152	GAGGTA	2	12	89708	89719	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	325969922
1607	NC_015152	ATC	3	9	89886	89894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969922
1608	NC_015152	GAC	2	6	89933	89938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969922
1609	NC_015152	GA	3	6	89988	89993	50 %	0 %	50 %	0 %	325969922
1610	NC_015152	CAA	2	6	90004	90009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325969922
1611	NC_015152	GAT	2	6	90014	90019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969922
1612	NC_015152	T	6	6	90080	90085	0 %	100 %	0 %	0 %	325969922
1613	NC_015152	CTG	2	6	90178	90183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969923
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1616	NC_015152	GCA	2	6	90329	90334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969923
1617	NC_015152	TCT	2	6	90383	90388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325969923
1618	NC_015152	GTA	2	6	90478	90483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969923
1619	NC_015152	CAA	2	6	90567	90572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325969923
1620	NC_015152	AGGG	2	8	90616	90623	25 %	0 %	75 %	0 %	325969923
1621	NC_015152	CAC	2	6	90696	90701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969923
1622	NC_015152	TGA	2	6	90720	90725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969923
1623	NC_015152	CTC	2	6	90817	90822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325969923
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1625	NC_015152	TC	5	10	90912	90921	0 %	50 %	0 %	50 %	325969923
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1749	NC_015152	CTCTT	2	10	98465	98474	0 %	60 %	0 %	40 %	325969929
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1753	NC_015152	TGG	2	6	98663	98668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969930
1754	NC_015152	TTGG	2	8	98700	98707	0 %	50 %	50 %	0 %	325969930
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1995	NC_015152	ATGTCG	2	12	111717	111728	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325969944
1996	NC_015152	TAG	2	6	111729	111734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969944
1997	NC_015152	TCG	2	6	111813	111818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969944
1998	NC_015152	CCTGGT	2	12	111880	111891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969944
1999	NC_015152	AAG	2	6	111910	111915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969944
2000	NC_015152	GCCAT	2	10	111942	111951	20 %	20 %	20 %	40 %	325969944

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