MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 57504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015152	CAG	2	6	28909	28914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969875
502	NC_015152	GCT	2	6	28928	28933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969875
503	NC_015152	CCGC	2	8	29013	29020	0 %	0 %	25 %	75 %	325969875
504	NC_015152	T	6	6	29078	29083	0 %	100 %	0 %	0 %	325969875
505	NC_015152	AGA	2	6	29113	29118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969875
506	NC_015152	A	6	6	29260	29265	100 %	0 %	0 %	0 %	325969875
507	NC_015152	TGC	2	6	29385	29390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969875
508	NC_015152	CCTA	2	8	29396	29403	25 %	25 %	0 %	50 %	325969875
509	NC_015152	GCA	2	6	29436	29441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969875
510	NC_015152	A	6	6	29502	29507	100 %	0 %	0 %	0 %	325969875
511	NC_015152	TGA	2	6	29536	29541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969875
512	NC_015152	ATCG	2	8	29545	29552	25 %	25 %	25 %	25 %	325969875
513	NC_015152	AGC	2	6	29583	29588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969875
514	NC_015152	GGC	2	6	29638	29643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969875
515	NC_015152	AGA	2	6	29646	29651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969875
516	NC_015152	GAA	2	6	29692	29697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969875
517	NC_015152	AGAATG	2	12	29757	29768	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325969876
518	NC_015152	A	6	6	29785	29790	100 %	0 %	0 %	0 %	325969876
519	NC_015152	GA	3	6	29865	29870	50 %	0 %	50 %	0 %	325969876
520	NC_015152	CTG	2	6	29889	29894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969876
521	NC_015152	ACGA	2	8	30063	30070	50 %	0 %	25 %	25 %	325969876
522	NC_015152	GAG	2	6	30135	30140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325969876
523	NC_015152	ATC	2	6	30246	30251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969876
524	NC_015152	A	6	6	30303	30308	100 %	0 %	0 %	0 %	325969876
525	NC_015152	AAG	2	6	30311	30316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969876
526	NC_015152	GCT	2	6	30321	30326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969876
527	NC_015152	CAG	2	6	30464	30469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969876
528	NC_015152	CGAAG	2	10	30472	30481	40 %	0 %	40 %	20 %	325969876
529	NC_015152	CT	3	6	30522	30527	0 %	50 %	0 %	50 %	325969877
530	NC_015152	GCT	2	6	30570	30575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969877
531	NC_015152	CCA	2	6	30586	30591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969877
532	NC_015152	ATG	2	6	30678	30683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969877
533	NC_015152	GAA	2	6	30689	30694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969877
534	NC_015152	AG	3	6	30712	30717	50 %	0 %	50 %	0 %	325969877
535	NC_015152	CTA	2	6	30741	30746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969877
536	NC_015152	GGC	2	6	30791	30796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969877
537	NC_015152	CAG	2	6	30800	30805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969877
538	NC_015152	ACC	2	6	30839	30844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969877
539	NC_015152	GAA	2	6	30941	30946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969877
540	NC_015152	TGC	2	6	30949	30954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969877
541	NC_015152	AG	3	6	30961	30966	50 %	0 %	50 %	0 %	325969877
542	NC_015152	CGG	2	6	30967	30972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969877
543	NC_015152	CAG	2	6	31055	31060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969877
544	NC_015152	GAT	2	6	31079	31084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969877
545	NC_015152	AAG	2	6	31095	31100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969877
546	NC_015152	CAA	2	6	31108	31113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325969877
547	NC_015152	GCA	2	6	31155	31160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969877
548	NC_015152	TGAG	2	8	31222	31229	25 %	25 %	50 %	0 %	325969877
549	NC_015152	AAG	2	6	31317	31322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969877
550	NC_015152	CT	3	6	31323	31328	0 %	50 %	0 %	50 %	325969877
551	NC_015152	GCA	2	6	31360	31365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969877
552	NC_015152	G	6	6	31393	31398	0 %	0 %	100 %	0 %	325969877
553	NC_015152	ACG	2	6	31453	31458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969877
554	NC_015152	GAA	2	6	31460	31465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969877
555	NC_015152	CAA	3	9	31493	31501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325969877
556	NC_015152	GTA	2	6	31527	31532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969877
557	NC_015152	AC	3	6	31540	31545	50 %	0 %	0 %	50 %	325969877
558	NC_015152	TTG	2	6	31661	31666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969877
559	NC_015152	AG	4	8	31899	31906	50 %	0 %	50 %	0 %	325969878
560	NC_015152	AGAT	2	8	31914	31921	50 %	25 %	25 %	0 %	325969878
561	NC_015152	CCT	2	6	31936	31941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325969878
562	NC_015152	ATC	2	6	32045	32050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969878
563	NC_015152	AGC	2	6	32157	32162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969878
564	NC_015152	GT	3	6	32164	32169	0 %	50 %	50 %	0 %	325969878
565	NC_015152	GAA	2	6	32225	32230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969878
566	NC_015152	CTC	2	6	32294	32299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325969878
567	NC_015152	AGCA	2	8	32333	32340	50 %	0 %	25 %	25 %	325969878
568	NC_015152	GGC	2	6	32387	32392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969878
569	NC_015152	CCA	2	6	32416	32421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969878
570	NC_015152	TCGC	2	8	32459	32466	0 %	25 %	25 %	50 %	325969878
571	NC_015152	TGG	2	6	32473	32478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969878
572	NC_015152	GAA	2	6	32510	32515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969878
573	NC_015152	TCC	2	6	32786	32791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325969878
574	NC_015152	GTC	2	6	32823	32828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969878
575	NC_015152	CTG	2	6	32855	32860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969878
576	NC_015152	GTT	2	6	32906	32911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969878
577	NC_015152	ACA	2	6	32914	32919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325969878
578	NC_015152	CCCGCT	2	12	32926	32937	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	325969878
579	NC_015152	CTG	2	6	32966	32971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969878
580	NC_015152	TTGG	2	8	33083	33090	0 %	50 %	50 %	0 %	325969878
581	NC_015152	TGG	2	6	33184	33189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969878
582	NC_015152	ACA	2	6	33190	33195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325969878
583	NC_015152	ATCCCC	2	12	33218	33229	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	325969878
584	NC_015152	TGT	2	6	33376	33381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969878
585	NC_015152	CAT	2	6	33422	33427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969878
586	NC_015152	GCAA	2	8	33441	33448	50 %	0 %	25 %	25 %	325969878
587	NC_015152	ACC	2	6	33483	33488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969878
588	NC_015152	CCATA	2	10	33535	33544	40 %	20 %	0 %	40 %	325969878
589	NC_015152	CTT	2	6	33608	33613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325969878
590	NC_015152	CTG	2	6	33674	33679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969878
591	NC_015152	AGG	2	6	33772	33777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325969878
592	NC_015152	CAG	2	6	33814	33819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969878
593	NC_015152	TAG	2	6	33834	33839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969878
594	NC_015152	GAA	2	6	33873	33878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969878
595	NC_015152	GGA	2	6	33912	33917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325969878
596	NC_015152	TGCC	2	8	34046	34053	0 %	25 %	25 %	50 %	325969878
597	NC_015152	TTC	2	6	34083	34088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325969878
598	NC_015152	CA	3	6	34123	34128	50 %	0 %	0 %	50 %	325969878
599	NC_015152	CAC	2	6	34405	34410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969878
600	NC_015152	G	6	6	34416	34421	0 %	0 %	100 %	0 %	325969878
601	NC_015152	TCC	3	9	34434	34442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325969878
602	NC_015152	AGC	2	6	34464	34469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969878
603	NC_015152	AAGG	2	8	34568	34575	50 %	0 %	50 %	0 %	325969878
604	NC_015152	TCC	2	6	34625	34630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325969878
605	NC_015152	CAGGG	2	10	34709	34718	20 %	0 %	60 %	20 %	325969878
606	NC_015152	CTC	2	6	34760	34765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325969878
607	NC_015152	GGAA	2	8	34808	34815	50 %	0 %	50 %	0 %	325969878
608	NC_015152	CCT	2	6	34840	34845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325969878
609	NC_015152	TTG	2	6	34860	34865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969878
610	NC_015152	A	6	6	34887	34892	100 %	0 %	0 %	0 %	325969878
611	NC_015152	CGG	2	6	34951	34956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969878
612	NC_015152	C	6	6	34992	34997	0 %	0 %	0 %	100 %	325969878
613	NC_015152	TGT	2	6	35014	35019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969878
614	NC_015152	GCTT	2	8	35040	35047	0 %	50 %	25 %	25 %	325969878
615	NC_015152	A	7	7	35090	35096	100 %	0 %	0 %	0 %	325969878
616	NC_015152	GAAGA	2	10	35267	35276	60 %	0 %	40 %	0 %	325969879
617	NC_015152	ATA	2	6	35277	35282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325969879
618	NC_015152	CTC	2	6	35331	35336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325969879
619	NC_015152	TTGA	2	8	35440	35447	25 %	50 %	25 %	0 %	325969879
620	NC_015152	GCCC	2	8	35462	35469	0 %	0 %	25 %	75 %	325969879
621	NC_015152	CTC	2	6	35474	35479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325969879
622	NC_015152	GTC	2	6	35517	35522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969879
623	NC_015152	TCAT	2	8	35593	35600	25 %	50 %	0 %	25 %	325969879
624	NC_015152	GTC	2	6	35605	35610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969879
625	NC_015152	CCAA	2	8	35703	35710	50 %	0 %	0 %	50 %	325969879
626	NC_015152	TAT	2	6	35711	35716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325969879
627	NC_015152	GTA	2	6	35854	35859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969880
628	NC_015152	TGG	2	6	36020	36025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969880
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