MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 57504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015152	TCA	2	6	342702	342707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970159
6002	NC_015152	CTT	3	9	342728	342736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970159
6003	NC_015152	GCA	2	6	342746	342751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970159
6004	NC_015152	CTATGA	2	12	342814	342825	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325970159
6005	NC_015152	AGC	3	9	342835	342843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970159
6006	NC_015152	CAC	2	6	342888	342893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970159
6007	NC_015152	GCA	2	6	342896	342901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970159
6008	NC_015152	TGA	2	6	342952	342957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970159
6009	NC_015152	GAGAA	2	10	342979	342988	60 %	0 %	40 %	0 %	325970159
6010	NC_015152	AAC	2	6	342998	343003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970159
6011	NC_015152	ATT	2	6	343040	343045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970159
6012	NC_015152	CCT	2	6	343088	343093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970159
6013	NC_015152	ATC	2	6	343157	343162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970159
6014	NC_015152	GAA	2	6	343220	343225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970159
6015	NC_015152	TGC	2	6	343288	343293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970159
6016	NC_015152	TGA	2	6	343309	343314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970159
6017	NC_015152	AAG	2	6	343346	343351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970159
6018	NC_015152	TCC	2	6	343474	343479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970159
6019	NC_015152	CCTA	2	8	343580	343587	25 %	25 %	0 %	50 %	325970159
6020	NC_015152	TGC	2	6	343621	343626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970159
6021	NC_015152	TCA	2	6	343990	343995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970160
6022	NC_015152	AAAG	2	8	343997	344004	75 %	0 %	25 %	0 %	325970160
6023	NC_015152	CTTA	2	8	344052	344059	25 %	50 %	0 %	25 %	325970160
6024	NC_015152	TTCA	2	8	344107	344114	25 %	50 %	0 %	25 %	325970160
6025	NC_015152	TGC	2	6	344372	344377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970160
6026	NC_015152	ATT	2	6	344484	344489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970160
6027	NC_015152	TCTG	2	8	344491	344498	0 %	50 %	25 %	25 %	325970160
6028	NC_015152	CAAA	2	8	344593	344600	75 %	0 %	0 %	25 %	325970160
6029	NC_015152	CCAT	2	8	344611	344618	25 %	25 %	0 %	50 %	325970160
6030	NC_015152	TAT	2	6	344645	344650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970160
6031	NC_015152	ATT	2	6	344811	344816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970160
6032	NC_015152	GGGA	2	8	344879	344886	25 %	0 %	75 %	0 %	325970160
6033	NC_015152	CTT	2	6	344954	344959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970160
6034	NC_015152	GTA	2	6	344964	344969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970160
6035	NC_015152	CT	3	6	344995	345000	0 %	50 %	0 %	50 %	325970160
6036	NC_015152	CTGG	2	8	345019	345026	0 %	25 %	50 %	25 %	325970160
6037	NC_015152	ACT	2	6	345098	345103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970160
6038	NC_015152	TTA	2	6	345117	345122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970160
6039	NC_015152	TGG	2	6	345190	345195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970160
6040	NC_015152	TGT	2	6	345203	345208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970160
6041	NC_015152	TGC	2	6	345290	345295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970160
6042	NC_015152	CTG	3	9	345351	345359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970160
6043	NC_015152	GAA	2	6	345444	345449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970160
6044	NC_015152	GCA	2	6	345450	345455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970160
6045	NC_015152	TGGT	2	8	345470	345477	0 %	50 %	50 %	0 %	325970160
6046	NC_015152	GTT	2	6	345521	345526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970160
6047	NC_015152	ACC	2	6	345612	345617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970160
6048	NC_015152	ATT	2	6	345675	345680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970160
6049	NC_015152	CGG	2	6	345749	345754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325970160
6050	NC_015152	TGAT	2	8	345786	345793	25 %	50 %	25 %	0 %	325970161
6051	NC_015152	AAG	2	6	345815	345820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970161
6052	NC_015152	TGTC	2	8	345880	345887	0 %	50 %	25 %	25 %	325970161
6053	NC_015152	GAC	2	6	345913	345918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970161
6054	NC_015152	GAT	2	6	345928	345933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970161
6055	NC_015152	ATG	2	6	345954	345959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970161
6056	NC_015152	ATT	2	6	345962	345967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970161
6057	NC_015152	GTCC	2	8	346013	346020	0 %	25 %	25 %	50 %	325970161
6058	NC_015152	TCG	2	6	346143	346148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970161
6059	NC_015152	CAA	2	6	346220	346225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970161
6060	NC_015152	GCA	2	6	346301	346306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970161
6061	NC_015152	GCA	2	6	346356	346361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970161
6062	NC_015152	TGA	2	6	346422	346427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970161
6063	NC_015152	TCC	2	6	346513	346518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970161
6064	NC_015152	TGG	2	6	346527	346532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970161
6065	NC_015152	AAG	2	6	346574	346579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970161
6066	NC_015152	GCT	2	6	346586	346591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970161
6067	NC_015152	GATG	2	8	346600	346607	25 %	25 %	50 %	0 %	325970161
6068	NC_015152	TGA	2	6	346669	346674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970161
6069	NC_015152	TTG	2	6	346761	346766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970161
6070	NC_015152	CCTC	2	8	346796	346803	0 %	25 %	0 %	75 %	325970161
6071	NC_015152	GAT	2	6	346852	346857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970161
6072	NC_015152	AAC	2	6	346891	346896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970161
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6074	NC_015152	AT	3	6	346964	346969	50 %	50 %	0 %	0 %	325970162
6075	NC_015152	TGG	2	6	346979	346984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970162
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6077	NC_015152	AT	3	6	347096	347101	50 %	50 %	0 %	0 %	325970162
6078	NC_015152	TGGAT	2	10	347133	347142	20 %	40 %	40 %	0 %	325970162
6079	NC_015152	CCCT	2	8	347157	347164	0 %	25 %	0 %	75 %	325970162
6080	NC_015152	GT	3	6	347279	347284	0 %	50 %	50 %	0 %	325970162
6081	NC_015152	GCAT	2	8	347351	347358	25 %	25 %	25 %	25 %	325970162
6082	NC_015152	TTG	2	6	347452	347457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970162
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6085	NC_015152	TGC	2	6	347579	347584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970162
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6088	NC_015152	G	7	7	347623	347629	0 %	0 %	100 %	0 %	325970162
6089	NC_015152	GA	3	6	347650	347655	50 %	0 %	50 %	0 %	325970162
6090	NC_015152	TG	4	8	347690	347697	0 %	50 %	50 %	0 %	325970162
6091	NC_015152	TAGAA	2	10	347714	347723	60 %	20 %	20 %	0 %	325970162
6092	NC_015152	TGT	2	6	348019	348024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970163
6093	NC_015152	CTTT	2	8	348044	348051	0 %	75 %	0 %	25 %	325970163
6094	NC_015152	GGA	2	6	348125	348130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970163
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6101	NC_015152	TAC	2	6	348434	348439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970163
6102	NC_015152	CTT	2	6	348468	348473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970163
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6104	NC_015152	GT	3	6	348524	348529	0 %	50 %	50 %	0 %	325970163
6105	NC_015152	CAA	2	6	348533	348538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970163
6106	NC_015152	ATC	2	6	348555	348560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970163
6107	NC_015152	CAA	2	6	348563	348568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970163
6108	NC_015152	A	7	7	348583	348589	100 %	0 %	0 %	0 %	325970163
6109	NC_015152	AT	3	6	348640	348645	50 %	50 %	0 %	0 %	325970163
6110	NC_015152	CT	3	6	348656	348661	0 %	50 %	0 %	50 %	325970163
6111	NC_015152	TCTACG	2	12	348687	348698	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325970163
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6113	NC_015152	AAGG	2	8	348755	348762	50 %	0 %	50 %	0 %	325970163
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6116	NC_015152	AGA	2	6	348842	348847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970163
6117	NC_015152	AGT	2	6	348870	348875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970163
6118	NC_015152	GAA	2	6	348977	348982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970163
6119	NC_015152	TTTC	2	8	348985	348992	0 %	75 %	0 %	25 %	325970163
6120	NC_015152	GTT	2	6	349025	349030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970163
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6122	NC_015152	GATC	2	8	349088	349095	25 %	25 %	25 %	25 %	325970163
6123	NC_015152	GAA	3	9	349151	349159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970163
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6125	NC_015152	A	7	7	349243	349249	100 %	0 %	0 %	0 %	325970163
6126	NC_015152	ATTC	2	8	349360	349367	25 %	50 %	0 %	25 %	325970163
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6131	NC_015152	TAC	2	6	349587	349592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970164
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6134	NC_015152	TAT	2	6	349702	349707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970164
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6223	NC_015152	TCTT	2	8	354461	354468	0 %	75 %	0 %	25 %	325970169
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6228	NC_015152	TGC	3	9	355005	355013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970170
6229	NC_015152	GGGAA	2	10	355028	355037	40 %	0 %	60 %	0 %	325970170
6230	NC_015152	AG	3	6	355105	355110	50 %	0 %	50 %	0 %	325970170
6231	NC_015152	CCCT	2	8	355151	355158	0 %	25 %	0 %	75 %	325970170
6232	NC_015152	GCAT	2	8	355181	355188	25 %	25 %	25 %	25 %	325970170
6233	NC_015152	T	6	6	355190	355195	0 %	100 %	0 %	0 %	325970170
6234	NC_015152	A	6	6	355196	355201	100 %	0 %	0 %	0 %	325970170
6235	NC_015152	ATC	2	6	355205	355210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970170
6236	NC_015152	GAT	2	6	355368	355373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970170
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6238	NC_015152	CTC	2	6	355570	355575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970170
6239	NC_015152	TGC	2	6	355588	355593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970170
6240	NC_015152	GGT	2	6	355597	355602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970170
6241	NC_015152	TTG	2	6	355654	355659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970170
6242	NC_015152	AAT	2	6	355674	355679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325970170
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6245	NC_015152	AT	3	6	355762	355767	50 %	50 %	0 %	0 %	325970170
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6487	NC_015152	CAG	2	6	369324	369329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970181
6488	NC_015152	ATT	2	6	369343	369348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970181
6489	NC_015152	TCA	2	6	369473	369478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970181
6490	NC_015152	TGA	2	6	369507	369512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970181
6491	NC_015152	AGC	2	6	369522	369527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970181
6492	NC_015152	ATC	3	9	369568	369576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970181
6493	NC_015152	TGA	2	6	369581	369586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970181
6494	NC_015152	ACCGA	2	10	369643	369652	40 %	0 %	20 %	40 %	325970181
6495	NC_015152	TGCT	2	8	369659	369666	0 %	50 %	25 %	25 %	325970181
6496	NC_015152	TCC	2	6	369678	369683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970181
6497	NC_015152	TCA	3	9	369710	369718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970181
6498	NC_015152	G	6	6	369726	369731	0 %	0 %	100 %	0 %	325970181
6499	NC_015152	ATT	2	6	369810	369815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970181
6500	NC_015152	GCA	2	6	369826	369831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970181

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