MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 57504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015152	TCG	2	6	312808	312813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970127
5502	NC_015152	GCA	2	6	312826	312831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970127
5503	NC_015152	TCG	2	6	312862	312867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970127
5504	NC_015152	AGC	2	6	312889	312894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970127
5505	NC_015152	CGA	2	6	312919	312924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970127
5506	NC_015152	GCC	2	6	313014	313019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325970127
5507	NC_015152	GAG	3	9	313047	313055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970127
5508	NC_015152	GAG	2	6	313074	313079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970127
5509	NC_015152	ATC	2	6	313098	313103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970127
5510	NC_015152	CGA	2	6	313160	313165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970127
5511	NC_015152	GCA	2	6	313193	313198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970127
5512	NC_015152	TTC	2	6	313203	313208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970127
5513	NC_015152	TGC	2	6	313276	313281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970127
5514	NC_015152	AAG	2	6	313405	313410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970127
5515	NC_015152	TCA	2	6	313498	313503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970127
5516	NC_015152	TTCG	2	8	313628	313635	0 %	50 %	25 %	25 %	325970127
5517	NC_015152	GGATC	2	10	313778	313787	20 %	20 %	40 %	20 %	325970127
5518	NC_015152	GCT	2	6	313850	313855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970127
5519	NC_015152	GAA	2	6	313910	313915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970127
5520	NC_015152	GCGG	2	8	313943	313950	0 %	0 %	75 %	25 %	325970127
5521	NC_015152	TGG	2	6	314042	314047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970127
5522	NC_015152	GAT	2	6	314048	314053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970127
5523	NC_015152	TCC	2	6	314057	314062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970127
5524	NC_015152	GGA	2	6	314081	314086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970127
5525	NC_015152	GA	3	6	314116	314121	50 %	0 %	50 %	0 %	325970127
5526	NC_015152	CAT	2	6	314165	314170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970127
5527	NC_015152	GCT	2	6	314258	314263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970127
5528	NC_015152	TGC	2	6	314579	314584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970127
5529	NC_015152	GGC	2	6	314585	314590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325970127
5530	NC_015152	TGC	2	6	314596	314601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970127
5531	NC_015152	GCC	2	6	314667	314672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325970127
5532	NC_015152	G	6	6	314695	314700	0 %	0 %	100 %	0 %	325970127
5533	NC_015152	GAT	2	6	314711	314716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970127
5534	NC_015152	CTG	2	6	314734	314739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970127
5535	NC_015152	CGT	2	6	314751	314756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970127
5536	NC_015152	GCA	2	6	314798	314803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970127
5537	NC_015152	GAA	2	6	314876	314881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970127
5538	NC_015152	GGA	2	6	314883	314888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970127
5539	NC_015152	CAT	2	6	314918	314923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970127
5540	NC_015152	ACC	2	6	314925	314930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970127
5541	NC_015152	AGC	2	6	314946	314951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970127
5542	NC_015152	CGA	2	6	315008	315013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970127
5543	NC_015152	AGTG	2	8	315041	315048	25 %	25 %	50 %	0 %	325970127
5544	NC_015152	AGG	2	6	315160	315165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970127
5545	NC_015152	ATC	2	6	315288	315293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970127
5546	NC_015152	GTGG	2	8	315389	315396	0 %	25 %	75 %	0 %	325970127
5547	NC_015152	GCAC	2	8	315586	315593	25 %	0 %	25 %	50 %	325970127
5548	NC_015152	AAC	2	6	315621	315626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970127
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5550	NC_015152	TG	3	6	315634	315639	0 %	50 %	50 %	0 %	325970127
5551	NC_015152	GGTG	2	8	315650	315657	0 %	25 %	75 %	0 %	325970127
5552	NC_015152	GAT	2	6	315666	315671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970127
5553	NC_015152	CACGC	2	10	315793	315802	20 %	0 %	20 %	60 %	325970128
5554	NC_015152	CTT	2	6	315833	315838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970128
5555	NC_015152	TCA	2	6	316177	316182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970129
5556	NC_015152	CAA	2	6	316190	316195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970129
5557	NC_015152	ACG	2	6	316299	316304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970129
5558	NC_015152	AGC	2	6	316407	316412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970129
5559	NC_015152	CGA	2	6	316445	316450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970129
5560	NC_015152	TGC	2	6	316462	316467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970129
5561	NC_015152	GTG	2	6	316484	316489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970129
5562	NC_015152	GCC	2	6	316508	316513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325970129
5563	NC_015152	ATC	2	6	316572	316577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970129
5564	NC_015152	GCT	2	6	316616	316621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970129
5565	NC_015152	CAG	2	6	316686	316691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970129
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5568	NC_015152	TCG	2	6	316931	316936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970130
5569	NC_015152	ATC	2	6	316964	316969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970130
5570	NC_015152	GCTT	2	8	317048	317055	0 %	50 %	25 %	25 %	325970130
5571	NC_015152	GAG	2	6	317059	317064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970130
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5573	NC_015152	GAA	2	6	317214	317219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970130
5574	NC_015152	TGGGGG	2	12	317318	317329	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	325970130
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5578	NC_015152	TG	3	6	317667	317672	0 %	50 %	50 %	0 %	325970131
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5584	NC_015152	GAG	2	6	317750	317755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970131
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5587	NC_015152	GAC	2	6	317969	317974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970131
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5589	NC_015152	AG	3	6	318163	318168	50 %	0 %	50 %	0 %	325970132
5590	NC_015152	TAG	2	6	318205	318210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970132
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5592	NC_015152	GAA	2	6	318363	318368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970132
5593	NC_015152	GACAA	2	10	318480	318489	60 %	0 %	20 %	20 %	325970133
5594	NC_015152	GCT	2	6	318572	318577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970133
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5601	NC_015152	CA	3	6	318849	318854	50 %	0 %	0 %	50 %	325970133
5602	NC_015152	AGCC	2	8	318929	318936	25 %	0 %	25 %	50 %	325970133
5603	NC_015152	GAC	2	6	318960	318965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970133
5604	NC_015152	AG	3	6	318974	318979	50 %	0 %	50 %	0 %	325970133
5605	NC_015152	A	6	6	318990	318995	100 %	0 %	0 %	0 %	325970133
5606	NC_015152	ACC	2	6	318999	319004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970133
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5610	NC_015152	CGAGAA	2	12	319247	319258	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	325970133
5611	NC_015152	ACCT	2	8	319272	319279	25 %	25 %	0 %	50 %	325970133
5612	NC_015152	CGA	2	6	319301	319306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970133
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5619	NC_015152	AAG	2	6	319716	319721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970134
5620	NC_015152	TGG	2	6	319753	319758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970134
5621	NC_015152	CCT	2	6	319785	319790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970134
5622	NC_015152	TAC	2	6	319812	319817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970134
5623	NC_015152	AGG	2	6	319870	319875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970134
5624	NC_015152	GAA	2	6	320037	320042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970135
5625	NC_015152	TGG	2	6	320063	320068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970135
5626	NC_015152	TGT	2	6	320156	320161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970135
5627	NC_015152	ATC	2	6	320185	320190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970135
5628	NC_015152	GGC	2	6	320233	320238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325970135
5629	NC_015152	ACT	2	6	320279	320284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970136
5630	NC_015152	GGC	2	6	320308	320313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325970136
5631	NC_015152	GCA	2	6	320366	320371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970136
5632	NC_015152	ATC	2	6	320686	320691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970137
5633	NC_015152	GCC	2	6	320752	320757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325970137
5634	NC_015152	GGA	2	6	320781	320786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970137
5635	NC_015152	CTA	2	6	320817	320822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970137
5636	NC_015152	TGG	2	6	320858	320863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970137
5637	NC_015152	TGA	3	9	320894	320902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970137
5638	NC_015152	GCC	2	6	320906	320911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325970137
5639	NC_015152	GAT	2	6	320925	320930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970137
5640	NC_015152	GTGC	2	8	321015	321022	0 %	25 %	50 %	25 %	325970137
5641	NC_015152	GGGCAT	2	12	321033	321044	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325970137
5642	NC_015152	GAT	2	6	321096	321101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970137
5643	NC_015152	CGC	2	6	321114	321119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325970137
5644	NC_015152	AGG	2	6	321128	321133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970137
5645	NC_015152	GC	3	6	321199	321204	0 %	0 %	50 %	50 %	325970137
5646	NC_015152	AGGGA	2	10	321312	321321	40 %	0 %	60 %	0 %	325970137
5647	NC_015152	GA	3	6	321351	321356	50 %	0 %	50 %	0 %	325970137
5648	NC_015152	GGT	2	6	321386	321391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970137
5649	NC_015152	TGC	2	6	321413	321418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970137
5650	NC_015152	ACC	2	6	321448	321453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970137
5651	NC_015152	GAA	2	6	321480	321485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970137
5652	NC_015152	ATC	3	9	321530	321538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970137
5653	NC_015152	AGG	2	6	321620	321625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970137
5654	NC_015152	ACAT	2	8	321641	321648	50 %	25 %	0 %	25 %	325970138
5655	NC_015152	GA	3	6	321694	321699	50 %	0 %	50 %	0 %	325970138
5656	NC_015152	GGC	2	6	321731	321736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325970138
5657	NC_015152	AGC	3	9	321763	321771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970138
5658	NC_015152	AGC	2	6	321774	321779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970138
5659	NC_015152	GAC	2	6	321782	321787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970138
5660	NC_015152	CGCC	2	8	321815	321822	0 %	0 %	25 %	75 %	325970138
5661	NC_015152	GAG	2	6	321858	321863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970138
5662	NC_015152	CAT	2	6	321935	321940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970138
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5664	NC_015152	ACA	2	6	322042	322047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970138
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5669	NC_015152	GAG	2	6	322230	322235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970138
5670	NC_015152	GGA	2	6	322255	322260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970138
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5672	NC_015152	GGGA	2	8	322340	322347	25 %	0 %	75 %	0 %	325970138
5673	NC_015152	CGG	2	6	322429	322434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325970138
5674	NC_015152	TC	3	6	322439	322444	0 %	50 %	0 %	50 %	325970138
5675	NC_015152	CTG	2	6	322470	322475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970138
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5678	NC_015152	CTG	2	6	322554	322559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970138
5679	NC_015152	TAT	2	6	322593	322598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970138
5680	NC_015152	TGA	2	6	322630	322635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970138
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5682	NC_015152	GCC	2	6	322692	322697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325970138
5683	NC_015152	GTG	2	6	322711	322716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970138
5684	NC_015152	CCT	2	6	322723	322728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970138
5685	NC_015152	GAT	2	6	322785	322790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970138
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5687	NC_015152	GATC	2	8	322878	322885	25 %	25 %	25 %	25 %	325970138
5688	NC_015152	GTTG	2	8	322889	322896	0 %	50 %	50 %	0 %	325970138
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5691	NC_015152	GCT	2	6	322973	322978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970138
5692	NC_015152	GT	3	6	323050	323055	0 %	50 %	50 %	0 %	325970138
5693	NC_015152	GCG	2	6	323065	323070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325970138
5694	NC_015152	TC	3	6	323124	323129	0 %	50 %	0 %	50 %	325970138
5695	NC_015152	TCG	2	6	323164	323169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970138
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5700	NC_015152	GTA	2	6	323267	323272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970138
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5704	NC_015152	ATG	2	6	323477	323482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970139
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5718	NC_015152	GT	3	6	324269	324274	0 %	50 %	50 %	0 %	325970139
5719	NC_015152	AGC	2	6	324300	324305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970139
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5721	NC_015152	GGT	2	6	324430	324435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970139
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5727	NC_015152	AAAG	2	8	324851	324858	75 %	0 %	25 %	0 %	325970141
5728	NC_015152	CCA	2	6	324864	324869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970141
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5730	NC_015152	CAA	2	6	324901	324906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970141
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5734	NC_015152	CTC	2	6	325023	325028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970142
5735	NC_015152	TCT	2	6	325068	325073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970142
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5741	NC_015152	TGA	2	6	325477	325482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970143
5742	NC_015152	TGT	2	6	325546	325551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970143
5743	NC_015152	AT	3	6	325572	325577	50 %	50 %	0 %	0 %	325970143
5744	NC_015152	TCA	2	6	325635	325640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970143
5745	NC_015152	T	8	8	325666	325673	0 %	100 %	0 %	0 %	325970143
5746	NC_015152	T	7	7	325709	325715	0 %	100 %	0 %	0 %	325970143
5747	NC_015152	CATT	2	8	325722	325729	25 %	50 %	0 %	25 %	325970143
5748	NC_015152	CTG	2	6	325813	325818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970143
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5750	NC_015152	TTC	2	6	325838	325843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970143
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5754	NC_015152	TTG	2	6	326022	326027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970143
5755	NC_015152	TC	4	8	326035	326042	0 %	50 %	0 %	50 %	325970143
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5779	NC_015152	ATCT	2	8	327976	327983	25 %	50 %	0 %	25 %	325970145
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5850	NC_015152	GAA	2	6	331163	331168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970147
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5854	NC_015152	GAA	2	6	331361	331366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970147
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5858	NC_015152	T	6	6	331535	331540	0 %	100 %	0 %	0 %	325970148
5859	NC_015152	CGT	2	6	331592	331597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970148
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5862	NC_015152	GAT	2	6	332210	332215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970149
5863	NC_015152	GAAA	2	8	332298	332305	75 %	0 %	25 %	0 %	325970149
5864	NC_015152	GTAG	2	8	332316	332323	25 %	25 %	50 %	0 %	325970149
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5867	NC_015152	GAT	2	6	332524	332529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970149
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5986	NC_015152	AAT	2	6	341994	341999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325970158
5987	NC_015152	GGAGT	2	10	342000	342009	20 %	20 %	60 %	0 %	325970158
5988	NC_015152	CTT	3	9	342027	342035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970158
5989	NC_015152	GCCA	2	8	342092	342099	25 %	0 %	25 %	50 %	325970158
5990	NC_015152	CAA	2	6	342101	342106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970158
5991	NC_015152	CTT	2	6	342131	342136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970158
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5993	NC_015152	AAAG	2	8	342193	342200	75 %	0 %	25 %	0 %	325970158
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5995	NC_015152	TCT	2	6	342281	342286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970158
5996	NC_015152	CCTGG	2	10	342305	342314	0 %	20 %	40 %	40 %	325970158
5997	NC_015152	TCA	2	6	342334	342339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970158
5998	NC_015152	CTG	2	6	342373	342378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970158
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