MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 57504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015152	ATT	2	6	286234	286239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970102
5002	NC_015152	TGG	2	6	286276	286281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970102
5003	NC_015152	GAAT	2	8	286326	286333	50 %	25 %	25 %	0 %	325970102
5004	NC_015152	GA	3	6	286383	286388	50 %	0 %	50 %	0 %	325970102
5005	NC_015152	TAA	2	6	286462	286467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325970102
5006	NC_015152	GTC	2	6	286565	286570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970102
5007	NC_015152	GATGT	2	10	286578	286587	20 %	40 %	40 %	0 %	325970102
5008	NC_015152	AAG	2	6	286628	286633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970102
5009	NC_015152	AAT	2	6	286667	286672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325970102
5010	NC_015152	GAT	2	6	286739	286744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970102
5011	NC_015152	T	9	9	286744	286752	0 %	100 %	0 %	0 %	325970102
5012	NC_015152	AAG	2	6	286786	286791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970102
5013	NC_015152	TTG	2	6	286800	286805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970102
5014	NC_015152	T	6	6	286873	286878	0 %	100 %	0 %	0 %	325970102
5015	NC_015152	CAG	2	6	286953	286958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970102
5016	NC_015152	ATTT	2	8	286989	286996	25 %	75 %	0 %	0 %	325970102
5017	NC_015152	TTG	2	6	287064	287069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970102
5018	NC_015152	AAG	2	6	287112	287117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970102
5019	NC_015152	TAA	2	6	287127	287132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325970102
5020	NC_015152	AGA	2	6	287146	287151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970102
5021	NC_015152	TA	3	6	287153	287158	50 %	50 %	0 %	0 %	325970102
5022	NC_015152	AAT	2	6	287164	287169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325970102
5023	NC_015152	AG	3	6	287245	287250	50 %	0 %	50 %	0 %	325970102
5024	NC_015152	ATG	2	6	287264	287269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970102
5025	NC_015152	GA	3	6	287294	287299	50 %	0 %	50 %	0 %	325970102
5026	NC_015152	TGA	2	6	287602	287607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970103
5027	NC_015152	AGT	2	6	287662	287667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970103
5028	NC_015152	CCG	2	6	287725	287730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325970103
5029	NC_015152	TTC	2	6	287913	287918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970103
5030	NC_015152	GCG	2	6	287958	287963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325970103
5031	NC_015152	TGC	2	6	287968	287973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970103
5032	NC_015152	GAC	2	6	288044	288049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970103
5033	NC_015152	TGG	2	6	288103	288108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970103
5034	NC_015152	TTCC	2	8	288184	288191	0 %	50 %	0 %	50 %	325970103
5035	NC_015152	GCCT	2	8	288219	288226	0 %	25 %	25 %	50 %	325970103
5036	NC_015152	GAC	2	6	288248	288253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970103
5037	NC_015152	CAT	2	6	288467	288472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970103
5038	NC_015152	GCCGCT	2	12	288482	288493	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325970103
5039	NC_015152	TGA	2	6	288538	288543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970103
5040	NC_015152	AGC	2	6	288568	288573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970103
5041	NC_015152	GAA	2	6	288581	288586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970103
5042	NC_015152	TC	3	6	288605	288610	0 %	50 %	0 %	50 %	325970103
5043	NC_015152	GT	3	6	288613	288618	0 %	50 %	50 %	0 %	325970103
5044	NC_015152	GCT	2	6	288709	288714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970103
5045	NC_015152	CGGA	2	8	288718	288725	25 %	0 %	50 %	25 %	325970103
5046	NC_015152	AGTGA	2	10	288735	288744	40 %	20 %	40 %	0 %	325970103
5047	NC_015152	GATC	2	8	288799	288806	25 %	25 %	25 %	25 %	325970103
5048	NC_015152	TA	3	6	289293	289298	50 %	50 %	0 %	0 %	325970104
5049	NC_015152	ATTGG	2	10	289328	289337	20 %	40 %	40 %	0 %	325970104
5050	NC_015152	A	6	6	289372	289377	100 %	0 %	0 %	0 %	325970104
5051	NC_015152	GA	3	6	289447	289452	50 %	0 %	50 %	0 %	325970104
5052	NC_015152	TAG	2	6	289533	289538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970104
5053	NC_015152	TTG	2	6	289635	289640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970104
5054	NC_015152	T	7	7	289729	289735	0 %	100 %	0 %	0 %	325970104
5055	NC_015152	AATC	2	8	289756	289763	50 %	25 %	0 %	25 %	325970104
5056	NC_015152	AAT	2	6	289792	289797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325970104
5057	NC_015152	GCT	2	6	289907	289912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970104
5058	NC_015152	ATGA	2	8	289955	289962	50 %	25 %	25 %	0 %	325970104
5059	NC_015152	AAT	2	6	289969	289974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325970104
5060	NC_015152	TAA	2	6	289978	289983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325970104
5061	NC_015152	AAG	2	6	290001	290006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970104
5062	NC_015152	TGC	2	6	290014	290019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970104
5063	NC_015152	CATTG	2	10	290069	290078	20 %	40 %	20 %	20 %	325970104
5064	NC_015152	ATC	2	6	290135	290140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970104
5065	NC_015152	ACG	2	6	290160	290165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970104
5066	NC_015152	AAG	2	6	290198	290203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970104
5067	NC_015152	GTTCTT	2	12	290240	290251	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	325970104
5068	NC_015152	AG	3	6	290321	290326	50 %	0 %	50 %	0 %	325970104
5069	NC_015152	AAG	2	6	290370	290375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970104
5070	NC_015152	AAAG	2	8	290419	290426	75 %	0 %	25 %	0 %	325970104
5071	NC_015152	TTG	2	6	290439	290444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970104
5072	NC_015152	T	7	7	290494	290500	0 %	100 %	0 %	0 %	325970104
5073	NC_015152	TTC	2	6	290687	290692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970105
5074	NC_015152	TCGT	2	8	290705	290712	0 %	50 %	25 %	25 %	325970105
5075	NC_015152	GAA	2	6	290742	290747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970105
5076	NC_015152	CATT	2	8	290780	290787	25 %	50 %	0 %	25 %	325970105
5077	NC_015152	AGC	2	6	290856	290861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970105
5078	NC_015152	T	6	6	290897	290902	0 %	100 %	0 %	0 %	325970105
5079	NC_015152	ATG	2	6	290935	290940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970105
5080	NC_015152	GCA	2	6	290944	290949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970105
5081	NC_015152	TTTA	2	8	290971	290978	25 %	75 %	0 %	0 %	325970105
5082	NC_015152	TCA	2	6	290983	290988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970105
5083	NC_015152	TGA	2	6	291003	291008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970105
5084	NC_015152	GAAG	2	8	291024	291031	50 %	0 %	50 %	0 %	325970105
5085	NC_015152	TGC	2	6	291183	291188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970105
5086	NC_015152	AAT	2	6	291220	291225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325970105
5087	NC_015152	TA	3	6	291274	291279	50 %	50 %	0 %	0 %	325970105
5088	NC_015152	ATG	2	6	291323	291328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970105
5089	NC_015152	TGG	2	6	291357	291362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970105
5090	NC_015152	CTT	2	6	291493	291498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970105
5091	NC_015152	ATG	2	6	291593	291598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970106
5092	NC_015152	GTT	2	6	291620	291625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970106
5093	NC_015152	GAAG	2	8	291691	291698	50 %	0 %	50 %	0 %	325970106
5094	NC_015152	TTA	2	6	291708	291713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970106
5095	NC_015152	ATG	2	6	291717	291722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970106
5096	NC_015152	TCT	2	6	291725	291730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970106
5097	NC_015152	ATT	2	6	291746	291751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970106
5098	NC_015152	TAT	2	6	291781	291786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970106
5099	NC_015152	GAT	2	6	291875	291880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970106
5100	NC_015152	CTGATG	2	12	291933	291944	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325970106
5101	NC_015152	ATT	2	6	292019	292024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970106
5102	NC_015152	TCT	2	6	292031	292036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970106
5103	NC_015152	TGC	2	6	292045	292050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970106
5104	NC_015152	TAA	2	6	292066	292071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325970106
5105	NC_015152	TCT	2	6	292112	292117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970106
5106	NC_015152	TTA	2	6	292119	292124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970106
5107	NC_015152	A	6	6	292126	292131	100 %	0 %	0 %	0 %	325970106
5108	NC_015152	T	7	7	292137	292143	0 %	100 %	0 %	0 %	325970106
5109	NC_015152	TTA	2	6	292161	292166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970106
5110	NC_015152	TAGT	2	8	292221	292228	25 %	50 %	25 %	0 %	325970106
5111	NC_015152	TA	3	6	292236	292241	50 %	50 %	0 %	0 %	325970106
5112	NC_015152	TA	4	8	292294	292301	50 %	50 %	0 %	0 %	325970106
5113	NC_015152	T	6	6	292371	292376	0 %	100 %	0 %	0 %	325970106
5114	NC_015152	TAA	2	6	292429	292434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325970106
5115	NC_015152	GAA	2	6	292445	292450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970106
5116	NC_015152	TTA	2	6	292472	292477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970106
5117	NC_015152	ATG	2	6	292506	292511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970106
5118	NC_015152	AGA	2	6	292551	292556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970106
5119	NC_015152	TGT	2	6	292569	292574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970106
5120	NC_015152	ACAA	2	8	292602	292609	75 %	0 %	0 %	25 %	325970106
5121	NC_015152	GTTGT	2	10	292616	292625	0 %	60 %	40 %	0 %	325970106
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5123	NC_015152	AATCA	2	10	292687	292696	60 %	20 %	0 %	20 %	325970107
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5360	NC_015152	ATC	2	6	303766	303771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970115
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5367	NC_015152	ATG	3	9	304392	304400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970116
5368	NC_015152	TCT	2	6	304424	304429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970116
5369	NC_015152	GAT	2	6	304448	304453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970116
5370	NC_015152	ATC	2	6	304527	304532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970116
5371	NC_015152	GAT	2	6	304533	304538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970116
5372	NC_015152	GCA	2	6	304604	304609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970116
5373	NC_015152	GAT	2	6	304619	304624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970116
5374	NC_015152	GC	3	6	304638	304643	0 %	0 %	50 %	50 %	325970116
5375	NC_015152	CCCT	2	8	304651	304658	0 %	25 %	0 %	75 %	325970116
5376	NC_015152	GGA	2	6	304708	304713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970116
5377	NC_015152	CCT	2	6	304784	304789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970116
5378	NC_015152	GACA	2	8	304801	304808	50 %	0 %	25 %	25 %	325970116
5379	NC_015152	GGGTG	2	10	304829	304838	0 %	20 %	80 %	0 %	325970116
5380	NC_015152	GAA	2	6	304853	304858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970116
5381	NC_015152	CCT	2	6	304862	304867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970116
5382	NC_015152	GGC	2	6	304899	304904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325970116
5383	NC_015152	GAT	2	6	304914	304919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970116
5384	NC_015152	TTG	2	6	304993	304998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970116
5385	NC_015152	TCT	2	6	305070	305075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970117
5386	NC_015152	CCA	2	6	305087	305092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970117
5387	NC_015152	TTTG	2	8	305133	305140	0 %	75 %	25 %	0 %	325970117
5388	NC_015152	CTG	2	6	305156	305161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970117
5389	NC_015152	TCC	2	6	305354	305359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970117
5390	NC_015152	TGG	2	6	305424	305429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970117
5391	NC_015152	TGG	2	6	305441	305446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970117
5392	NC_015152	TCA	2	6	305453	305458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970117
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5394	NC_015152	GATC	2	8	305484	305491	25 %	25 %	25 %	25 %	325970117
5395	NC_015152	TCT	2	6	305505	305510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970117
5396	NC_015152	CTT	2	6	305532	305537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970117
5397	NC_015152	CTCG	2	8	305553	305560	0 %	25 %	25 %	50 %	325970117
5398	NC_015152	TTG	2	6	305572	305577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970117
5399	NC_015152	AG	3	6	305660	305665	50 %	0 %	50 %	0 %	325970117
5400	NC_015152	TGG	2	6	305676	305681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970117
5401	NC_015152	TGT	2	6	305709	305714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970117
5402	NC_015152	TGC	2	6	305733	305738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970117
5403	NC_015152	GAA	2	6	305842	305847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970117
5404	NC_015152	GACA	2	8	306008	306015	50 %	0 %	25 %	25 %	325970117
5405	NC_015152	TGA	2	6	306027	306032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970117
5406	NC_015152	TGA	2	6	306084	306089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970117
5407	NC_015152	CTG	2	6	306161	306166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970117
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5409	NC_015152	TCA	2	6	306647	306652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970118
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5413	NC_015152	ATC	2	6	306777	306782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970118
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5423	NC_015152	CAG	2	6	307297	307302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970119
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5426	NC_015152	CTATTG	2	12	307602	307613	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	325970120
5427	NC_015152	GAC	2	6	307732	307737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970120
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5429	NC_015152	GTC	2	6	307825	307830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970120
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5431	NC_015152	GATCA	2	10	307871	307880	40 %	20 %	20 %	20 %	325970120
5432	NC_015152	C	6	6	307890	307895	0 %	0 %	0 %	100 %	325970121
5433	NC_015152	CAT	2	6	307924	307929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970121
5434	NC_015152	TCA	2	6	307986	307991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970121
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5436	NC_015152	AT	3	6	308077	308082	50 %	50 %	0 %	0 %	325970121
5437	NC_015152	CAG	2	6	308211	308216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970122
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5439	NC_015152	T	6	6	308249	308254	0 %	100 %	0 %	0 %	325970122
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5441	NC_015152	AT	3	6	308321	308326	50 %	50 %	0 %	0 %	325970122
5442	NC_015152	GTT	2	6	308336	308341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970122
5443	NC_015152	GAT	2	6	308369	308374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970122
5444	NC_015152	GA	3	6	308398	308403	50 %	0 %	50 %	0 %	325970122
5445	NC_015152	AAC	2	6	308772	308777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970123
5446	NC_015152	GCATG	2	10	308779	308788	20 %	20 %	40 %	20 %	325970123
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5451	NC_015152	AT	3	6	309046	309051	50 %	50 %	0 %	0 %	325970123
5452	NC_015152	ATG	2	6	309085	309090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970123
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5456	NC_015152	ACT	2	6	309727	309732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970124
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5459	NC_015152	AGC	2	6	310125	310130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970124
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5462	NC_015152	A	6	6	310234	310239	100 %	0 %	0 %	0 %	325970124
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5464	NC_015152	GCAT	2	8	310367	310374	25 %	25 %	25 %	25 %	325970124
5465	NC_015152	A	6	6	310410	310415	100 %	0 %	0 %	0 %	325970124
5466	NC_015152	A	6	6	310501	310506	100 %	0 %	0 %	0 %	325970124
5467	NC_015152	TGA	2	6	310521	310526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970124
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5472	NC_015152	TGG	2	6	311059	311064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970125
5473	NC_015152	CAG	2	6	311150	311155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970125
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5476	NC_015152	CTTT	2	8	311205	311212	0 %	75 %	0 %	25 %	325970125
5477	NC_015152	ACG	2	6	311262	311267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970125
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5479	NC_015152	GGC	2	6	311467	311472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325970125
5480	NC_015152	TCG	2	6	311478	311483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970125
5481	NC_015152	GCT	2	6	311545	311550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970125
5482	NC_015152	AGC	2	6	311631	311636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970125
5483	NC_015152	CA	3	6	311689	311694	50 %	0 %	0 %	50 %	325970125
5484	NC_015152	CTCG	2	8	311828	311835	0 %	25 %	25 %	50 %	325970125
5485	NC_015152	CA	3	6	311842	311847	50 %	0 %	0 %	50 %	325970125
5486	NC_015152	CT	3	6	311849	311854	0 %	50 %	0 %	50 %	325970125
5487	NC_015152	GAA	2	6	311918	311923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970125
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5489	NC_015152	CGC	2	6	311989	311994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325970125
5490	NC_015152	CAC	2	6	312002	312007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970125
5491	NC_015152	TC	3	6	312040	312045	0 %	50 %	0 %	50 %	325970125
5492	NC_015152	CAG	2	6	312056	312061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970125
5493	NC_015152	GAG	2	6	312405	312410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970126
5494	NC_015152	CGG	2	6	312464	312469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325970126
5495	NC_015152	ATC	2	6	312500	312505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970126
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