MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 57504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015152	A	6	6	255347	255352	100 %	0 %	0 %	0 %	325970072
4502	NC_015152	CTT	2	6	255372	255377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970072
4503	NC_015152	ATG	2	6	255436	255441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970072
4504	NC_015152	AGT	2	6	255640	255645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970072
4505	NC_015152	ATG	2	6	255652	255657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970072
4506	NC_015152	AT	3	6	255691	255696	50 %	50 %	0 %	0 %	325970072
4507	NC_015152	CTT	2	6	255815	255820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970073
4508	NC_015152	CAA	2	6	255917	255922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970073
4509	NC_015152	GT	3	6	255932	255937	0 %	50 %	50 %	0 %	325970073
4510	NC_015152	TTG	2	6	256014	256019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970073
4511	NC_015152	TCA	2	6	256035	256040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970073
4512	NC_015152	TGA	2	6	256112	256117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970073
4513	NC_015152	TCT	2	6	256158	256163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970073
4514	NC_015152	CTG	2	6	256199	256204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970073
4515	NC_015152	GAA	2	6	256238	256243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970073
4516	NC_015152	GCA	2	6	256303	256308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970073
4517	NC_015152	TTGT	2	8	256337	256344	0 %	75 %	25 %	0 %	325970073
4518	NC_015152	AAG	2	6	256373	256378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970073
4519	NC_015152	CAG	2	6	256417	256422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970073
4520	NC_015152	TTC	2	6	256440	256445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970073
4521	NC_015152	CAA	2	6	256486	256491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970073
4522	NC_015152	CCTT	2	8	256503	256510	0 %	50 %	0 %	50 %	325970073
4523	NC_015152	CAAT	2	8	256617	256624	50 %	25 %	0 %	25 %	325970073
4524	NC_015152	ATT	2	6	256640	256645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970073
4525	NC_015152	CAA	2	6	256646	256651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970073
4526	NC_015152	AAT	2	6	256709	256714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325970073
4527	NC_015152	ACAGT	2	10	256717	256726	40 %	20 %	20 %	20 %	325970073
4528	NC_015152	TAG	2	6	256734	256739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970073
4529	NC_015152	AGA	2	6	256775	256780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970073
4530	NC_015152	GAA	2	6	256818	256823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970073
4531	NC_015152	CAA	2	6	256843	256848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970073
4532	NC_015152	ATCC	2	8	257291	257298	25 %	25 %	0 %	50 %	325970074
4533	NC_015152	TAGA	2	8	257318	257325	50 %	25 %	25 %	0 %	325970074
4534	NC_015152	CTG	2	6	257330	257335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970074
4535	NC_015152	A	6	6	257354	257359	100 %	0 %	0 %	0 %	325970074
4536	NC_015152	A	7	7	257378	257384	100 %	0 %	0 %	0 %	325970074
4537	NC_015152	GGC	2	6	257395	257400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325970074
4538	NC_015152	ATG	2	6	257475	257480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970074
4539	NC_015152	TCA	2	6	257506	257511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970074
4540	NC_015152	CTT	2	6	257567	257572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970074
4541	NC_015152	GAA	2	6	257640	257645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970074
4542	NC_015152	GA	3	6	257785	257790	50 %	0 %	50 %	0 %	325970075
4543	NC_015152	GAT	2	6	257856	257861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970075
4544	NC_015152	AT	3	6	257936	257941	50 %	50 %	0 %	0 %	325970075
4545	NC_015152	CGA	2	6	257950	257955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970075
4546	NC_015152	GT	3	6	257973	257978	0 %	50 %	50 %	0 %	325970075
4547	NC_015152	CT	3	6	258028	258033	0 %	50 %	0 %	50 %	325970075
4548	NC_015152	TTGC	2	8	258108	258115	0 %	50 %	25 %	25 %	325970075
4549	NC_015152	ACC	2	6	258127	258132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970075
4550	NC_015152	AGG	2	6	258209	258214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970075
4551	NC_015152	CAG	2	6	258219	258224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970075
4552	NC_015152	TGA	2	6	258242	258247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970075
4553	NC_015152	GCAT	2	8	258313	258320	25 %	25 %	25 %	25 %	325970075
4554	NC_015152	GCA	2	6	258344	258349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970075
4555	NC_015152	T	7	7	258378	258384	0 %	100 %	0 %	0 %	325970075
4556	NC_015152	C	6	6	258436	258441	0 %	0 %	0 %	100 %	325970075
4557	NC_015152	CA	4	8	258522	258529	50 %	0 %	0 %	50 %	325970075
4558	NC_015152	TCC	2	6	258573	258578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970075
4559	NC_015152	GCA	2	6	258601	258606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970075
4560	NC_015152	GCG	2	6	258610	258615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325970075
4561	NC_015152	GAC	2	6	258645	258650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970075
4562	NC_015152	ATTT	2	8	258795	258802	25 %	75 %	0 %	0 %	325970075
4563	NC_015152	GAT	2	6	258822	258827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970075
4564	NC_015152	GC	3	6	258880	258885	0 %	0 %	50 %	50 %	325970075
4565	NC_015152	AAGA	2	8	258942	258949	75 %	0 %	25 %	0 %	325970075
4566	NC_015152	CTT	2	6	259040	259045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970075
4567	NC_015152	ATGT	2	8	259195	259202	25 %	50 %	25 %	0 %	325970075
4568	NC_015152	AGA	2	6	259332	259337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970076
4569	NC_015152	ATC	2	6	259340	259345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970076
4570	NC_015152	GCA	2	6	259367	259372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970076
4571	NC_015152	CCG	2	6	259400	259405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325970076
4572	NC_015152	GAAT	2	8	259470	259477	50 %	25 %	25 %	0 %	325970076
4573	NC_015152	AAG	2	6	259493	259498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970076
4574	NC_015152	TGG	2	6	259512	259517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970076
4575	NC_015152	GAT	2	6	259582	259587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970076
4576	NC_015152	ATG	2	6	259721	259726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970076
4577	NC_015152	GCT	2	6	259795	259800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970076
4578	NC_015152	GCT	2	6	259831	259836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970076
4579	NC_015152	ATC	2	6	260012	260017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970076
4580	NC_015152	GAT	2	6	260029	260034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970076
4581	NC_015152	ATC	2	6	260054	260059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970076
4582	NC_015152	T	7	7	260094	260100	0 %	100 %	0 %	0 %	325970076
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4586	NC_015152	CCA	2	6	260364	260369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970077
4587	NC_015152	GAA	2	6	260376	260381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970077
4588	NC_015152	TTC	2	6	260385	260390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970077
4589	NC_015152	AGG	2	6	260435	260440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970077
4590	NC_015152	AAT	2	6	260473	260478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325970077
4591	NC_015152	ACC	2	6	260600	260605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970077
4592	NC_015152	GTT	2	6	260788	260793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970077
4593	NC_015152	TCG	2	6	260816	260821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970077
4594	NC_015152	GAT	2	6	260824	260829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970077
4595	NC_015152	AGG	2	6	260880	260885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970077
4596	NC_015152	ATG	2	6	260921	260926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970077
4597	NC_015152	GCG	2	6	260930	260935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325970077
4598	NC_015152	CAG	2	6	260956	260961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970077
4599	NC_015152	TGT	2	6	260984	260989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970077
4600	NC_015152	ACCG	2	8	261067	261074	25 %	0 %	25 %	50 %	325970078
4601	NC_015152	CAT	2	6	261134	261139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970078
4602	NC_015152	GCA	2	6	261177	261182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970078
4603	NC_015152	TTG	2	6	261372	261377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970078
4604	NC_015152	TGT	2	6	261511	261516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970078
4605	NC_015152	CCG	2	6	261528	261533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325970078
4606	NC_015152	GTC	2	6	261668	261673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970078
4607	NC_015152	TC	3	6	261725	261730	0 %	50 %	0 %	50 %	325970078
4608	NC_015152	CTG	2	6	261802	261807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970078
4609	NC_015152	GTT	2	6	261884	261889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970078
4610	NC_015152	TC	3	6	261937	261942	0 %	50 %	0 %	50 %	325970078
4611	NC_015152	GCCTTG	2	12	261950	261961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970078
4612	NC_015152	TC	3	6	262049	262054	0 %	50 %	0 %	50 %	325970078
4613	NC_015152	CAG	2	6	262064	262069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970078
4614	NC_015152	GCCATA	2	12	262130	262141	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325970078
4615	NC_015152	CCA	2	6	262186	262191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970078
4616	NC_015152	GGT	2	6	262211	262216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970078
4617	NC_015152	GGT	2	6	262253	262258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970078
4618	NC_015152	TCA	2	6	262481	262486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970079
4619	NC_015152	GCT	2	6	262510	262515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970079
4620	NC_015152	GCA	2	6	262607	262612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970079
4621	NC_015152	CA	3	6	262703	262708	50 %	0 %	0 %	50 %	325970079
4622	NC_015152	CCA	3	9	262766	262774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970079
4623	NC_015152	GAG	2	6	262783	262788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970079
4624	NC_015152	GTT	2	6	262830	262835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970079
4625	NC_015152	GT	3	6	262900	262905	0 %	50 %	50 %	0 %	325970079
4626	NC_015152	CGT	2	6	262907	262912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970079
4627	NC_015152	C	6	6	262982	262987	0 %	0 %	0 %	100 %	325970079
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4633	NC_015152	CTT	2	6	263365	263370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970079
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4638	NC_015152	GGA	2	6	263532	263537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970079
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4642	NC_015152	GATG	2	8	264100	264107	25 %	25 %	50 %	0 %	325970080
4643	NC_015152	TG	3	6	264206	264211	0 %	50 %	50 %	0 %	325970080
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4650	NC_015152	AG	3	6	264465	264470	50 %	0 %	50 %	0 %	325970080
4651	NC_015152	CTT	2	6	264486	264491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970080
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4736	NC_015152	GCC	2	6	270465	270470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325970086
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4738	NC_015152	CACC	2	8	270527	270534	25 %	0 %	0 %	75 %	325970086
4739	NC_015152	TCC	2	6	270553	270558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970086
4740	NC_015152	TGA	2	6	270563	270568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970086
4741	NC_015152	GGT	2	6	270630	270635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970086
4742	NC_015152	TGA	2	6	270642	270647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970086
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4745	NC_015152	GAA	2	6	270794	270799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970087
4746	NC_015152	GAA	3	9	270857	270865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970087
4747	NC_015152	ACC	2	6	270933	270938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970087
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4764	NC_015152	TGA	2	6	271465	271470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970087
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4990	NC_015152	GAA	2	6	285660	285665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970101
4991	NC_015152	GAG	2	6	285694	285699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970101
4992	NC_015152	GAG	2	6	285712	285717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970101
4993	NC_015152	TGA	2	6	285731	285736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970101
4994	NC_015152	AAG	2	6	285802	285807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970101
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4996	NC_015152	GAG	2	6	285934	285939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970101
4997	NC_015152	GA	3	6	285985	285990	50 %	0 %	50 %	0 %	325970101
4998	NC_015152	CGA	2	6	286107	286112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970101
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5000	NC_015152	GAT	2	6	286149	286154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970101

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