MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus pseudintermedius HKU10-03 chromosome

Total Repeats: 1469

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014925	GAATG	2	10	4750	4759	40 %	20 %	40 %	0 %	319891295
2	NC_014925	AATGG	2	10	12056	12065	40 %	20 %	40 %	0 %	319891305
3	NC_014925	TGTCG	2	10	15491	15500	0 %	40 %	40 %	20 %	319891309
4	NC_014925	CCAAC	2	10	20465	20474	40 %	0 %	0 %	60 %	319891312
5	NC_014925	GTTTC	2	10	21362	21371	0 %	60 %	20 %	20 %	319891312
6	NC_014925	TCAGT	2	10	21512	21521	20 %	40 %	20 %	20 %	319891312
7	NC_014925	TTATT	2	10	27981	27990	20 %	80 %	0 %	0 %	319891319
8	NC_014925	TTAGT	2	10	30644	30653	20 %	60 %	20 %	0 %	319891321
9	NC_014925	TTGAT	2	10	32302	32311	20 %	60 %	20 %	0 %	319891322
10	NC_014925	TTTTG	2	10	32441	32450	0 %	80 %	20 %	0 %	319891322
11	NC_014925	GCTTA	2	10	33406	33415	20 %	40 %	20 %	20 %	319891323
12	NC_014925	AATTT	2	10	34963	34972	40 %	60 %	0 %	0 %	319891326
13	NC_014925	TTTAT	2	10	35019	35028	20 %	80 %	0 %	0 %	319891326
14	NC_014925	AAAGC	2	10	38347	38356	60 %	0 %	20 %	20 %	319891330
15	NC_014925	TCGAT	2	10	41137	41146	20 %	40 %	20 %	20 %	319891333
16	NC_014925	TAAAA	2	10	42483	42492	80 %	20 %	0 %	0 %	319891334
17	NC_014925	GTATT	2	10	43158	43167	20 %	60 %	20 %	0 %	319891335
18	NC_014925	AAGCC	2	10	44766	44775	40 %	0 %	20 %	40 %	319891336
19	NC_014925	TTGAT	2	10	46294	46303	20 %	60 %	20 %	0 %	319891337
20	NC_014925	ATCAA	2	10	46576	46585	60 %	20 %	0 %	20 %	319891337
21	NC_014925	TGTAC	2	10	48840	48849	20 %	40 %	20 %	20 %	319891340
22	NC_014925	ATTTT	2	10	49528	49537	20 %	80 %	0 %	0 %	319891340
23	NC_014925	TGTAT	2	10	49893	49902	20 %	60 %	20 %	0 %	319891340
24	NC_014925	AGGTG	2	10	51236	51245	20 %	20 %	60 %	0 %	319891342
25	NC_014925	GTGAA	2	10	52284	52293	40 %	20 %	40 %	0 %	319891343
26	NC_014925	TACTG	2	10	52328	52337	20 %	40 %	20 %	20 %	319891343
27	NC_014925	GCAAT	2	10	52974	52983	40 %	20 %	20 %	20 %	319891343
28	NC_014925	AATTA	2	10	53170	53179	60 %	40 %	0 %	0 %	319891343
29	NC_014925	TTTTA	2	10	53286	53295	20 %	80 %	0 %	0 %	319891344
30	NC_014925	CAAGC	2	10	53537	53546	40 %	0 %	20 %	40 %	319891344
31	NC_014925	GATTT	2	10	56558	56567	20 %	60 %	20 %	0 %	319891347
32	NC_014925	AAAAC	2	10	57424	57433	80 %	0 %	0 %	20 %	319891348
33	NC_014925	CTAAA	2	10	61358	61367	60 %	20 %	0 %	20 %	319891351
34	NC_014925	ACATC	2	10	62000	62009	40 %	20 %	0 %	40 %	319891351
35	NC_014925	GTTTC	2	10	62761	62770	0 %	60 %	20 %	20 %	319891352
36	NC_014925	TATTG	2	10	65610	65619	20 %	60 %	20 %	0 %	319891356
37	NC_014925	TTATA	2	10	67092	67101	40 %	60 %	0 %	0 %	319891357
38	NC_014925	TGTTT	2	10	70021	70030	0 %	80 %	20 %	0 %	319891360
39	NC_014925	TACCA	2	10	73024	73033	40 %	20 %	0 %	40 %	319891361
40	NC_014925	AAATA	2	10	76547	76556	80 %	20 %	0 %	0 %	319891363
41	NC_014925	TGATA	2	10	77162	77171	40 %	40 %	20 %	0 %	319891363
42	NC_014925	AATTG	2	10	77603	77612	40 %	40 %	20 %	0 %	319891363
43	NC_014925	CGTAT	2	10	78340	78349	20 %	40 %	20 %	20 %	319891364
44	NC_014925	GAAAT	2	10	81254	81263	60 %	20 %	20 %	0 %	319891367
45	NC_014925	GTGAA	2	10	83721	83730	40 %	20 %	40 %	0 %	319891369
46	NC_014925	AATGC	2	10	85298	85307	40 %	20 %	20 %	20 %	319891370
47	NC_014925	GATGT	2	10	85887	85896	20 %	40 %	40 %	0 %	319891371
48	NC_014925	GGGCA	2	10	88156	88165	20 %	0 %	60 %	20 %	319891374
49	NC_014925	TAATA	2	10	89376	89385	60 %	40 %	0 %	0 %	319891375
50	NC_014925	CCATT	2	10	89423	89432	20 %	40 %	0 %	40 %	319891375
51	NC_014925	TGAAG	2	10	90266	90275	40 %	20 %	40 %	0 %	319891376
52	NC_014925	ATGAA	2	10	90480	90489	60 %	20 %	20 %	0 %	319891376
53	NC_014925	AAGTA	2	10	90534	90543	60 %	20 %	20 %	0 %	319891376
54	NC_014925	AAAAT	2	10	94970	94979	80 %	20 %	0 %	0 %	319891380
55	NC_014925	ATGCG	2	10	98692	98701	20 %	20 %	40 %	20 %	319891384
56	NC_014925	TTGTA	2	10	99503	99512	20 %	60 %	20 %	0 %	319891384
57	NC_014925	ATCGT	2	10	99972	99981	20 %	40 %	20 %	20 %	319891385
58	NC_014925	TTTCG	2	10	103472	103481	0 %	60 %	20 %	20 %	319891389
59	NC_014925	TATCA	2	10	109162	109171	40 %	40 %	0 %	20 %	319891393
60	NC_014925	ATATT	2	10	111841	111850	40 %	60 %	0 %	0 %	319891395
61	NC_014925	TTAAT	2	10	112107	112116	40 %	60 %	0 %	0 %	319891396
62	NC_014925	GCAAT	2	10	112230	112239	40 %	20 %	20 %	20 %	319891396
63	NC_014925	TTGGA	2	10	112455	112464	20 %	40 %	40 %	0 %	319891396
64	NC_014925	TTTAA	2	10	114029	114038	40 %	60 %	0 %	0 %	319891396
65	NC_014925	AAAGC	2	10	117154	117163	60 %	0 %	20 %	20 %	319891398
66	NC_014925	CTATC	2	10	117447	117456	20 %	40 %	0 %	40 %	319891398
67	NC_014925	TATTT	2	10	118652	118661	20 %	80 %	0 %	0 %	319891398
68	NC_014925	TCGTA	2	10	119112	119121	20 %	40 %	20 %	20 %	319891399
69	NC_014925	GATAC	2	10	119228	119237	40 %	20 %	20 %	20 %	319891399
70	NC_014925	GCGTG	2	10	120439	120448	0 %	20 %	60 %	20 %	319891401
71	NC_014925	AGGTG	2	10	122208	122217	20 %	20 %	60 %	0 %	319891403
72	NC_014925	TACAG	2	10	123097	123106	40 %	20 %	20 %	20 %	319891405
73	NC_014925	TTCTA	2	10	123636	123645	20 %	60 %	0 %	20 %	319891405
74	NC_014925	AAGAT	2	10	124329	124338	60 %	20 %	20 %	0 %	319891406
75	NC_014925	CGTCA	2	10	126848	126857	20 %	20 %	20 %	40 %	319891408
76	NC_014925	TACCC	2	10	127621	127630	20 %	20 %	0 %	60 %	319891409
77	NC_014925	TAGCT	2	10	127782	127791	20 %	40 %	20 %	20 %	319891409
78	NC_014925	ATTTT	2	10	129508	129517	20 %	80 %	0 %	0 %	319891411
79	NC_014925	TATAA	2	10	129987	129996	60 %	40 %	0 %	0 %	319891412
80	NC_014925	TTATT	2	10	131786	131795	20 %	80 %	0 %	0 %	319891413
81	NC_014925	TATCA	2	10	132034	132043	40 %	40 %	0 %	20 %	319891414
82	NC_014925	AAAAC	2	10	133485	133494	80 %	0 %	0 %	20 %	319891415
83	NC_014925	TATAT	2	10	135741	135750	40 %	60 %	0 %	0 %	319891418
84	NC_014925	ACATT	2	10	137210	137219	40 %	40 %	0 %	20 %	319891419
85	NC_014925	AGAGA	2	10	137235	137244	60 %	0 %	40 %	0 %	319891419
86	NC_014925	CAAGC	2	10	140056	140065	40 %	0 %	20 %	40 %	319891421
87	NC_014925	GACGT	2	10	143298	143307	20 %	20 %	40 %	20 %	319891424
88	NC_014925	ATGAA	2	10	151529	151538	60 %	20 %	20 %	0 %	319891427
89	NC_014925	ATTTG	2	10	151710	151719	20 %	60 %	20 %	0 %	319891427
90	NC_014925	ATATG	2	10	164150	164159	40 %	40 %	20 %	0 %	319891434
91	NC_014925	TCTTT	2	10	168839	168848	0 %	80 %	0 %	20 %	319891440
92	NC_014925	CACCG	2	10	170218	170227	20 %	0 %	20 %	60 %	319891442
93	NC_014925	ACATT	2	10	170462	170471	40 %	40 %	0 %	20 %	319891442
94	NC_014925	TTCGG	2	10	171681	171690	0 %	40 %	40 %	20 %	319891443
95	NC_014925	GTCAT	2	10	178947	178956	20 %	40 %	20 %	20 %	319891452
96	NC_014925	ATCAA	2	10	182597	182606	60 %	20 %	0 %	20 %	319891455
97	NC_014925	AATGA	2	10	182956	182965	60 %	20 %	20 %	0 %	319891455
98	NC_014925	GATTC	2	10	183666	183675	20 %	40 %	20 %	20 %	319891456
99	NC_014925	ATTAT	2	10	183745	183754	40 %	60 %	0 %	0 %	319891456
100	NC_014925	GATTG	2	10	187062	187071	20 %	40 %	40 %	0 %	319891457
101	NC_014925	TTAAT	2	10	187544	187553	40 %	60 %	0 %	0 %	319891457
102	NC_014925	AAACC	2	10	192214	192223	60 %	0 %	0 %	40 %	319891463
103	NC_014925	CGAAG	2	10	197880	197889	40 %	0 %	40 %	20 %	319891467
104	NC_014925	TGAAA	2	10	198501	198510	60 %	20 %	20 %	0 %	319891468
105	NC_014925	TTCAG	2	10	201214	201223	20 %	40 %	20 %	20 %	319891471
106	NC_014925	TGAAT	2	10	214421	214430	40 %	40 %	20 %	0 %	319891472
107	NC_014925	AAATG	2	10	214463	214472	60 %	20 %	20 %	0 %	319891472
108	NC_014925	AAGAA	2	10	215325	215334	80 %	0 %	20 %	0 %	319891472
109	NC_014925	GTGGC	2	10	217838	217847	0 %	20 %	60 %	20 %	319891474
110	NC_014925	GTCAT	2	10	224129	224138	20 %	40 %	20 %	20 %	319891481
111	NC_014925	TAAAT	2	10	225550	225559	60 %	40 %	0 %	0 %	319891481
112	NC_014925	AATGA	2	10	226987	226996	60 %	20 %	20 %	0 %	319891482
113	NC_014925	CAACA	2	10	228839	228848	60 %	0 %	0 %	40 %	319891484
114	NC_014925	GTGTT	2	10	230643	230652	0 %	60 %	40 %	0 %	319891486
115	NC_014925	AACTC	2	10	231149	231158	40 %	20 %	0 %	40 %	319891487
116	NC_014925	CGATG	2	10	231677	231686	20 %	20 %	40 %	20 %	319891487
117	NC_014925	TCAAC	2	10	232690	232699	40 %	20 %	0 %	40 %	319891488
118	NC_014925	CGTAT	2	10	232992	233001	20 %	40 %	20 %	20 %	319891488
119	NC_014925	TGAAA	2	10	233053	233062	60 %	20 %	20 %	0 %	319891488
120	NC_014925	ACATT	2	10	241835	241844	40 %	40 %	0 %	20 %	319891498
121	NC_014925	CAAGT	2	10	243032	243041	40 %	20 %	20 %	20 %	319891500
122	NC_014925	AAATC	2	10	245234	245243	60 %	20 %	0 %	20 %	319891503
123	NC_014925	TTGCT	2	10	254545	254554	0 %	60 %	20 %	20 %	319891508
124	NC_014925	TCGTA	2	10	256150	256159	20 %	40 %	20 %	20 %	319891511
125	NC_014925	CAATT	2	10	256245	256254	40 %	40 %	0 %	20 %	319891511
126	NC_014925	TCAAA	2	10	258731	258740	60 %	20 %	0 %	20 %	319891512
127	NC_014925	CACAC	2	10	258926	258935	40 %	0 %	0 %	60 %	319891512
128	NC_014925	GAAAA	2	10	262911	262920	80 %	0 %	20 %	0 %	319891515
129	NC_014925	TTACT	2	10	263777	263786	20 %	60 %	0 %	20 %	319891516
130	NC_014925	AGAGG	2	10	265219	265228	40 %	0 %	60 %	0 %	319891518
131	NC_014925	AAAAG	2	10	267412	267421	80 %	0 %	20 %	0 %	319891521
132	NC_014925	TATAT	2	10	272649	272658	40 %	60 %	0 %	0 %	319891526
133	NC_014925	TGAGA	2	10	272929	272938	40 %	20 %	40 %	0 %	319891527
134	NC_014925	ATTTT	2	10	273011	273020	20 %	80 %	0 %	0 %	319891527
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