MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus pseudintermedius HKU10-03 chromosome

Total Repeats: 45912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014925	TTTA	2	8	238053	238060	25 %	75 %	0 %	0 %	319891493
4002	NC_014925	GGT	2	6	238077	238082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319891493
4003	NC_014925	AT	3	6	238120	238125	50 %	50 %	0 %	0 %	319891493
4004	NC_014925	GCA	2	6	238201	238206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319891493
4005	NC_014925	GGT	2	6	238299	238304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319891493
4006	NC_014925	ATC	2	6	238361	238366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319891493
4007	NC_014925	AAC	2	6	238400	238405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319891493
4008	NC_014925	GA	3	6	238436	238441	50 %	0 %	50 %	0 %	319891493
4009	NC_014925	GAT	2	6	238447	238452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891493
4010	NC_014925	TA	3	6	238458	238463	50 %	50 %	0 %	0 %	319891493
4011	NC_014925	AAG	2	6	238482	238487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891494
4012	NC_014925	ATGT	2	8	238520	238527	25 %	50 %	25 %	0 %	319891494
4013	NC_014925	GT	3	6	238526	238531	0 %	50 %	50 %	0 %	319891494
4014	NC_014925	CGT	2	6	238598	238603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319891494
4015	NC_014925	TGA	2	6	238657	238662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891494
4016	NC_014925	A	6	6	238763	238768	100 %	0 %	0 %	0 %	319891494
4017	NC_014925	CG	3	6	238782	238787	0 %	0 %	50 %	50 %	319891494
4018	NC_014925	ATT	2	6	238808	238813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319891494
4019	NC_014925	TTA	2	6	238818	238823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319891494
4020	NC_014925	AGTT	2	8	238827	238834	25 %	50 %	25 %	0 %	319891494
4021	NC_014925	GTG	2	6	238857	238862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319891494
4022	NC_014925	TGA	2	6	238924	238929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891494
4023	NC_014925	AGA	2	6	238969	238974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891494
4024	NC_014925	A	6	6	238997	239002	100 %	0 %	0 %	0 %	319891494
4025	NC_014925	ACT	2	6	239199	239204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319891494
4026	NC_014925	TTA	2	6	239220	239225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319891494
4027	NC_014925	A	6	6	239238	239243	100 %	0 %	0 %	0 %	319891494
4028	NC_014925	ATT	2	6	239282	239287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319891494
4029	NC_014925	AAG	2	6	239289	239294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891494
4030	NC_014925	TTG	2	6	239367	239372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319891494
4031	NC_014925	AGC	2	6	239374	239379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319891494
4032	NC_014925	AATA	2	8	239576	239583	75 %	25 %	0 %	0 %	319891494
4033	NC_014925	AGA	2	6	239590	239595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891494
4034	NC_014925	AAG	2	6	239628	239633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891494
4035	NC_014925	CGA	2	6	239698	239703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319891494
4036	NC_014925	GAA	2	6	239723	239728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891494
4037	NC_014925	CAT	2	6	239800	239805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319891494
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4039	NC_014925	ACT	2	6	239864	239869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319891495
4040	NC_014925	TCGC	2	8	239880	239887	0 %	25 %	25 %	50 %	319891495
4041	NC_014925	CGTA	2	8	239922	239929	25 %	25 %	25 %	25 %	319891495
4042	NC_014925	TAT	2	6	239930	239935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319891495
4043	NC_014925	GAA	2	6	240104	240109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891495
4044	NC_014925	AAG	2	6	240181	240186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891495
4045	NC_014925	TTG	2	6	240214	240219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319891495
4046	NC_014925	GAA	2	6	240228	240233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891495
4047	NC_014925	ATT	2	6	240260	240265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319891496
4048	NC_014925	GA	3	6	240283	240288	50 %	0 %	50 %	0 %	319891496
4049	NC_014925	TAA	2	6	240313	240318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891496
4050	NC_014925	AAG	2	6	240330	240335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891496
4051	NC_014925	AAG	2	6	240341	240346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891496
4052	NC_014925	CAA	2	6	240347	240352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319891496
4053	NC_014925	GAA	2	6	240356	240361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891496
4054	NC_014925	ATC	2	6	240379	240384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319891496
4055	NC_014925	CAAAAT	2	12	240408	240419	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	319891496
4056	NC_014925	AAG	2	6	240519	240524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891496
4057	NC_014925	AGA	2	6	240556	240561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891496
4058	NC_014925	CA	3	6	240564	240569	50 %	0 %	0 %	50 %	319891496
4059	NC_014925	ATT	3	9	240617	240625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319891496
4060	NC_014925	CGT	2	6	240632	240637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319891496
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4062	NC_014925	GTC	2	6	240855	240860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319891496
4063	NC_014925	TGA	2	6	240945	240950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891496
4064	NC_014925	CGG	2	6	240982	240987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319891496
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4066	NC_014925	AGA	2	6	241084	241089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891497
4067	NC_014925	GA	3	6	241093	241098	50 %	0 %	50 %	0 %	319891497
4068	NC_014925	TG	5	10	241150	241159	0 %	50 %	50 %	0 %	319891497
4069	NC_014925	CAC	2	6	241182	241187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319891497
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4074	NC_014925	AGA	2	6	241471	241476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891497
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4077	NC_014925	GCAACA	2	12	241655	241666	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	319891498
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4079	NC_014925	TGA	2	6	241754	241759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891498
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4082	NC_014925	AGCA	2	8	241803	241810	50 %	0 %	25 %	25 %	319891498
4083	NC_014925	ACATT	2	10	241835	241844	40 %	40 %	0 %	20 %	319891498
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4090	NC_014925	ACA	2	6	242494	242499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319891499
4091	NC_014925	TTC	2	6	242521	242526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319891499
4092	NC_014925	TTG	2	6	242527	242532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319891499
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4101	NC_014925	CAAGT	2	10	243032	243041	40 %	20 %	20 %	20 %	319891500
4102	NC_014925	AG	3	6	243106	243111	50 %	0 %	50 %	0 %	319891500
4103	NC_014925	A	6	6	243324	243329	100 %	0 %	0 %	0 %	319891501
4104	NC_014925	AGT	2	6	243338	243343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891501
4105	NC_014925	CAG	2	6	243358	243363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319891501
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4109	NC_014925	ACC	2	6	243533	243538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319891501
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4111	NC_014925	A	6	6	243555	243560	100 %	0 %	0 %	0 %	319891501
4112	NC_014925	GCA	2	6	243561	243566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319891501
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4120	NC_014925	A	6	6	243938	243943	100 %	0 %	0 %	0 %	319891502
4121	NC_014925	AAG	2	6	243957	243962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891502
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4123	NC_014925	AGA	2	6	244000	244005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891502
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4245	NC_014925	GAC	2	6	250020	250025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319891506
4246	NC_014925	TGA	2	6	250111	250116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891506
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4250	NC_014925	TAAA	2	8	250519	250526	75 %	25 %	0 %	0 %	319891507
4251	NC_014925	A	6	6	250561	250566	100 %	0 %	0 %	0 %	319891507
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4274	NC_014925	GTC	2	6	251413	251418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319891507
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4320	NC_014925	TGGT	2	8	254350	254357	0 %	50 %	50 %	0 %	319891508
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4322	NC_014925	CG	4	8	254438	254445	0 %	0 %	50 %	50 %	319891508
4323	NC_014925	TTC	2	6	254484	254489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319891508
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4328	NC_014925	ACA	2	6	254871	254876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319891509
4329	NC_014925	TTGTAC	2	12	254931	254942	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319891509
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4331	NC_014925	TCGT	2	8	254985	254992	0 %	50 %	25 %	25 %	319891509
4332	NC_014925	A	6	6	255053	255058	100 %	0 %	0 %	0 %	319891509
4333	NC_014925	A	6	6	255062	255067	100 %	0 %	0 %	0 %	319891509
4334	NC_014925	TAT	2	6	255147	255152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319891510
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4337	NC_014925	TAT	2	6	255354	255359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319891510
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4351	NC_014925	CAA	2	6	256131	256136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319891511
4352	NC_014925	TCGTA	2	10	256150	256159	20 %	40 %	20 %	20 %	319891511
4353	NC_014925	TGC	2	6	256237	256242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319891511
4354	NC_014925	CAATT	2	10	256245	256254	40 %	40 %	0 %	20 %	319891511
4355	NC_014925	ACGA	2	8	256322	256329	50 %	0 %	25 %	25 %	319891511
4356	NC_014925	GAA	2	6	256346	256351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891511
4357	NC_014925	GC	3	6	256378	256383	0 %	0 %	50 %	50 %	319891511
4358	NC_014925	GAA	2	6	256385	256390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891511
4359	NC_014925	ATTG	2	8	256402	256409	25 %	50 %	25 %	0 %	319891511
4360	NC_014925	A	6	6	256443	256448	100 %	0 %	0 %	0 %	319891511
4361	NC_014925	GAA	2	6	256454	256459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891511
4362	NC_014925	TGA	2	6	256474	256479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891511
4363	NC_014925	CAA	2	6	256503	256508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319891511
4364	NC_014925	GAT	2	6	256640	256645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891511
4365	NC_014925	TGA	2	6	256648	256653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891511
4366	NC_014925	GAC	2	6	256673	256678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319891511
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4471	NC_014925	TCAA	2	8	262152	262159	50 %	25 %	0 %	25 %	319891515
4472	NC_014925	ATG	2	6	262177	262182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891515
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4475	NC_014925	TGA	2	6	262276	262281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891515
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4480	NC_014925	GAT	2	6	262386	262391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891515
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4485	NC_014925	ATTG	3	12	262685	262696	25 %	50 %	25 %	0 %	319891515
4486	NC_014925	ATT	2	6	262899	262904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319891515
4487	NC_014925	GAAAA	2	10	262911	262920	80 %	0 %	20 %	0 %	319891515
4488	NC_014925	CAA	2	6	262923	262928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319891515
4489	NC_014925	GAA	2	6	262947	262952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891515
4490	NC_014925	CTG	2	6	263023	263028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319891515
4491	NC_014925	ACA	2	6	263034	263039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319891515
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4499	NC_014925	TTACT	2	10	263777	263786	20 %	60 %	0 %	20 %	319891516
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