MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Sulfuricurvum kujiense DSM 16994 plasmid pSULKU01

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014754	GATTT	2	10	2320	2329	20 %	60 %	20 %	0 %	313669335
2	NC_014754	GTTTT	2	10	2478	2487	0 %	80 %	20 %	0 %	313669335
3	NC_014754	GTTTT	2	10	8519	8528	0 %	80 %	20 %	0 %	313669344
4	NC_014754	CGGTA	2	10	11447	11456	20 %	20 %	40 %	20 %	313669348
5	NC_014754	GGGAT	2	10	12084	12093	20 %	20 %	60 %	0 %	313669348
6	NC_014754	GTGAA	2	10	13905	13914	40 %	20 %	40 %	0 %	313669349
7	NC_014754	AAAAT	2	10	15016	15025	80 %	20 %	0 %	0 %	313669351
8	NC_014754	CCTGC	2	10	20115	20124	0 %	20 %	20 %	60 %	313669357
9	NC_014754	ATTGA	2	10	24249	24258	40 %	40 %	20 %	0 %	313669358
10	NC_014754	TTCAT	2	10	24772	24781	20 %	60 %	0 %	20 %	313669359
11	NC_014754	GCAGG	2	10	25601	25610	20 %	0 %	60 %	20 %	313669360
12	NC_014754	CAATG	2	10	31774	31783	40 %	20 %	20 %	20 %	313669367
13	NC_014754	CAAAC	2	10	33572	33581	60 %	0 %	0 %	40 %	313669368
14	NC_014754	AGGGG	2	10	33871	33880	20 %	0 %	80 %	0 %	313669368
15	NC_014754	GAAGA	2	10	33976	33985	60 %	0 %	40 %	0 %	313669368
16	NC_014754	CAAAA	2	10	34418	34427	80 %	0 %	0 %	20 %	313669368
17	NC_014754	GAGTG	2	10	34537	34546	20 %	20 %	60 %	0 %	313669368
18	NC_014754	GCAGA	2	10	36787	36796	40 %	0 %	40 %	20 %	313669369
19	NC_014754	CATTC	2	10	37401	37410	20 %	40 %	0 %	40 %	313669370
20	NC_014754	CATTT	2	10	38007	38016	20 %	60 %	0 %	20 %	313669371
21	NC_014754	ATCAC	2	10	38170	38179	40 %	20 %	0 %	40 %	313669371
22	NC_014754	AAAAT	2	10	39355	39364	80 %	20 %	0 %	0 %	313669372
23	NC_014754	ATTTT	2	10	40501	40510	20 %	80 %	0 %	0 %	313669374
24	NC_014754	GGATC	2	10	41257	41266	20 %	20 %	40 %	20 %	313669374
25	NC_014754	TTTCA	2	10	44836	44845	20 %	60 %	0 %	20 %	313669377
26	NC_014754	GAAGA	2	10	46636	46645	60 %	0 %	40 %	0 %	313669380
27	NC_014754	TCGCT	2	10	47798	47807	0 %	40 %	20 %	40 %	313669381
28	NC_014754	GCAAA	2	10	48925	48934	60 %	0 %	20 %	20 %	313669382
29	NC_014754	TGCGA	2	10	51511	51520	20 %	20 %	40 %	20 %	313669385
30	NC_014754	GTTTT	2	10	51960	51969	0 %	80 %	20 %	0 %	313669385
31	NC_014754	TTCGG	2	10	57551	57560	0 %	40 %	40 %	20 %	313669391
32	NC_014754	CCGGA	2	10	59445	59454	20 %	0 %	40 %	40 %	313669391
33	NC_014754	CCAAA	2	10	59460	59469	60 %	0 %	0 %	40 %	313669391
34	NC_014754	GTAAA	2	10	59721	59730	60 %	20 %	20 %	0 %	313669391
35	NC_014754	GGATT	2	10	59963	59972	20 %	40 %	40 %	0 %	313669392
36	NC_014754	GGATG	2	10	60595	60604	20 %	20 %	60 %	0 %	313669392
37	NC_014754	ACAAA	2	10	62031	62040	80 %	0 %	0 %	20 %	313669394
38	NC_014754	AAAGA	2	10	62181	62190	80 %	0 %	20 %	0 %	313669395
39	NC_014754	AAAAT	2	10	63528	63537	80 %	20 %	0 %	0 %	313669396
40	NC_014754	GCAAA	2	10	64728	64737	60 %	0 %	20 %	20 %	313669399
41	NC_014754	AGCAA	2	10	65186	65195	60 %	0 %	20 %	20 %	313669400
42	NC_014754	GAATT	2	10	65476	65485	40 %	40 %	20 %	0 %	313669400
43	NC_014754	CAAAC	2	10	72231	72240	60 %	0 %	0 %	40 %	313669403
44	NC_014754	GTTTT	2	10	72252	72261	0 %	80 %	20 %	0 %	313669403
45	NC_014754	ATGGA	2	10	73171	73180	40 %	20 %	40 %	0 %	313669405
46	NC_014754	GATCT	2	10	74892	74901	20 %	40 %	20 %	20 %	313669407
47	NC_014754	TCCCT	2	10	75491	75500	0 %	40 %	0 %	60 %	313669409
48	NC_014754	TTTTA	2	10	76044	76053	20 %	80 %	0 %	0 %	313669409
49	NC_014754	CAAAT	2	10	76185	76194	60 %	20 %	0 %	20 %	313669409
50	NC_014754	ATTAT	2	10	79670	79679	40 %	60 %	0 %	0 %	313669414
51	NC_014754	ATTTT	2	10	81011	81020	20 %	80 %	0 %	0 %	313669416
52	NC_014754	GGTTA	2	10	87141	87150	20 %	40 %	40 %	0 %	313669420
53	NC_014754	TAAGG	2	10	87904	87913	40 %	20 %	40 %	0 %	313669421
54	NC_014754	CCTTT	2	10	88157	88166	0 %	60 %	0 %	40 %	313669421
55	NC_014754	GATAA	2	10	90432	90441	60 %	20 %	20 %	0 %	313669423
56	NC_014754	CAAAA	2	10	91053	91062	80 %	0 %	0 %	20 %	313669424
57	NC_014754	GCAAA	2	10	92011	92020	60 %	0 %	20 %	20 %	313669425
58	NC_014754	ACAAA	2	10	92235	92244	80 %	0 %	0 %	20 %	313669425
59	NC_014754	CAACG	2	10	94093	94102	40 %	0 %	20 %	40 %	313669426
60	NC_014754	GAATT	2	10	95593	95602	40 %	40 %	20 %	0 %	313669428
61	NC_014754	GCTTC	2	10	96094	96103	0 %	40 %	20 %	40 %	313669428
62	NC_014754	GAGCA	2	10	99140	99149	40 %	0 %	40 %	20 %	313669430
63	NC_014754	ATTCG	2	10	99539	99548	20 %	40 %	20 %	20 %	313669430
64	NC_014754	CGAAC	2	10	99605	99614	40 %	0 %	20 %	40 %	313669430
65	NC_014754	TGATA	2	10	99685	99694	40 %	40 %	20 %	0 %	313669430
66	NC_014754	TCGTA	2	10	100870	100879	20 %	40 %	20 %	20 %	313669430
67	NC_014754	TTTTG	2	10	102063	102072	0 %	80 %	20 %	0 %	313669431
68	NC_014754	TCCAC	2	10	104055	104064	20 %	20 %	0 %	60 %	313669433
69	NC_014754	CCATC	2	10	105378	105387	20 %	20 %	0 %	60 %	313669433
70	NC_014754	AATTT	2	10	105836	105845	40 %	60 %	0 %	0 %	313669433
71	NC_014754	CGTAT	2	10	112893	112902	20 %	40 %	20 %	20 %	313669441
72	NC_014754	GGTGA	2	10	113328	113337	20 %	20 %	60 %	0 %	313669441
73	NC_014754	TCGCT	2	10	113727	113736	0 %	40 %	20 %	40 %	313669442
74	NC_014754	TGTGC	2	10	114165	114174	0 %	40 %	40 %	20 %	313669442
75	NC_014754	GAAGG	2	10	114683	114692	40 %	0 %	60 %	0 %	313669442
76	NC_014754	TTTCG	2	10	115078	115087	0 %	60 %	20 %	20 %	313669442
77	NC_014754	GCCGA	2	10	116665	116674	20 %	0 %	40 %	40 %	313669443

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.