MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 167236

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014623	CTT	2	6	246	251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817279
2	NC_014623	GCT	2	6	282	287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817279
3	NC_014623	GCC	2	6	351	356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817279
4	NC_014623	CCA	2	6	392	397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817279
5	NC_014623	GCC	2	6	408	413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817279
6	NC_014623	GTG	2	6	448	453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817279
7	NC_014623	CGC	6	18	474	491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817279
8	NC_014623	CAC	2	6	511	516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817279
9	NC_014623	GGC	2	6	538	543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817279
10	NC_014623	GTG	2	6	616	621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817279
11	NC_014623	CCG	2	6	690	695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817279
12	NC_014623	TGC	2	6	719	724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817279
13	NC_014623	CGA	2	6	729	734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817279
14	NC_014623	GAG	2	6	757	762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817279
15	NC_014623	TTC	2	6	775	780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817279
16	NC_014623	GGA	2	6	861	866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817279
17	NC_014623	TCC	2	6	941	946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817279
18	NC_014623	AGA	2	6	947	952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817279
19	NC_014623	GAC	2	6	982	987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817279
20	NC_014623	AGA	2	6	1016	1021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817279
21	NC_014623	CGC	2	6	1101	1106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817279
22	NC_014623	CGG	2	6	1216	1221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817279
23	NC_014623	CAA	2	6	1311	1316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817279
24	NC_014623	GGC	2	6	1417	1422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817279
25	NC_014623	AGG	2	6	1534	1539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817280
26	NC_014623	CAC	2	6	1604	1609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817280
27	NC_014623	GGC	2	6	1632	1637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817280
28	NC_014623	CAT	2	6	1721	1726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817280
29	NC_014623	GGC	2	6	1886	1891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817280
30	NC_014623	CTG	2	6	1905	1910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817280
31	NC_014623	CGG	2	6	2111	2116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817280
32	NC_014623	TGA	2	6	2122	2127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817280
33	NC_014623	CAT	2	6	2691	2696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817281
34	NC_014623	GCC	2	6	2707	2712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817281
35	NC_014623	CAG	2	6	2806	2811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817281
36	NC_014623	GCA	2	6	2891	2896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817281
37	NC_014623	AAC	2	6	3037	3042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817281
38	NC_014623	CTC	2	6	3051	3056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817281
39	NC_014623	ACA	2	6	3119	3124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817281
40	NC_014623	CGC	2	6	3329	3334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817282
41	NC_014623	CAT	2	6	3384	3389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817282
42	NC_014623	GCC	2	6	3400	3405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817282
43	NC_014623	CAG	2	6	3499	3504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817282
44	NC_014623	GCA	2	6	3584	3589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817282
45	NC_014623	CTT	2	6	3786	3791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817282
46	NC_014623	TCC	2	6	3859	3864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817282
47	NC_014623	ACG	2	6	3944	3949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817282
48	NC_014623	GGC	2	6	4261	4266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817283
49	NC_014623	GCC	2	6	4340	4345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817283
50	NC_014623	CCG	2	6	4389	4394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817283
51	NC_014623	CGA	2	6	4428	4433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817283
52	NC_014623	CCG	3	9	4437	4445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817283
53	NC_014623	CAC	2	6	4561	4566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817283
54	NC_014623	GGA	2	6	4596	4601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817283
55	NC_014623	CCT	2	6	4635	4640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817283
56	NC_014623	CCT	2	6	4650	4655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817283
57	NC_014623	GTG	2	6	4669	4674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817283
58	NC_014623	GAG	2	6	4750	4755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817283
59	NC_014623	GCC	2	6	4763	4768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817283
60	NC_014623	CAT	2	6	4955	4960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817284
61	NC_014623	GCG	2	6	5013	5018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817284
62	NC_014623	CTG	2	6	5019	5024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817284
63	NC_014623	CGG	2	6	5131	5136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817284
64	NC_014623	GGC	2	6	5144	5149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817284
65	NC_014623	GTG	2	6	5154	5159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817284
66	NC_014623	AGC	2	6	5200	5205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817284
67	NC_014623	CAC	2	6	5228	5233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817284
68	NC_014623	CGG	2	6	5306	5311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817284
69	NC_014623	GGT	2	6	5382	5387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817284
70	NC_014623	GCC	2	6	5529	5534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817285
71	NC_014623	AGC	2	6	5632	5637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817285
72	NC_014623	CCA	2	6	5640	5645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817285
73	NC_014623	GAA	2	6	5681	5686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817285
74	NC_014623	CTC	2	6	5706	5711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817285
75	NC_014623	AAC	2	6	5779	5784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817285
76	NC_014623	GCC	2	6	5890	5895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817285
77	NC_014623	CAC	2	6	6336	6341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817286
78	NC_014623	TGA	2	6	6362	6367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817286
79	NC_014623	GGC	2	6	6471	6476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817286
80	NC_014623	TCA	2	6	6503	6508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817286
81	NC_014623	TGA	2	6	6584	6589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817286
82	NC_014623	CCG	2	6	6722	6727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817286
83	NC_014623	ATG	2	6	6823	6828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817286
84	NC_014623	GCG	2	6	6899	6904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817286
85	NC_014623	CCA	2	6	6935	6940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817286
86	NC_014623	GAT	2	6	7371	7376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817287
87	NC_014623	GTG	2	6	7433	7438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817287
88	NC_014623	AGG	2	6	7441	7446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817287
89	NC_014623	TCA	2	6	7486	7491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817287
90	NC_014623	TGC	2	6	7504	7509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817287
91	NC_014623	TCC	2	6	7531	7536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817287
92	NC_014623	TGG	2	6	7666	7671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817287
93	NC_014623	CTG	2	6	7812	7817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817287
94	NC_014623	GCG	2	6	7842	7847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817287
95	NC_014623	TGG	2	6	7864	7869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817287
96	NC_014623	GCG	2	6	7996	8001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817287
97	NC_014623	TGA	2	6	8040	8045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817288
98	NC_014623	GCC	2	6	8206	8211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817288
99	NC_014623	GAG	2	6	8516	8521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817288
100	NC_014623	GGT	2	6	8605	8610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817288
101	NC_014623	GCG	2	6	8611	8616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817288
102	NC_014623	CAG	2	6	8681	8686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817288
103	NC_014623	TGA	2	6	8817	8822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817288
104	NC_014623	CAA	2	6	8861	8866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817288
105	NC_014623	CGG	2	6	8871	8876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817288
106	NC_014623	GGC	3	9	8905	8913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817288
107	NC_014623	AGG	2	6	8919	8924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817288
108	NC_014623	GGC	2	6	8935	8940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817288
109	NC_014623	GCG	2	6	8960	8965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817288
110	NC_014623	TGG	2	6	9024	9029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817288
111	NC_014623	GCC	2	6	9042	9047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817288
112	NC_014623	GCA	2	6	9064	9069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817288
113	NC_014623	CCG	2	6	9101	9106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817288
114	NC_014623	GAC	2	6	9122	9127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817288
115	NC_014623	GTG	2	6	9203	9208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817288
116	NC_014623	TCG	2	6	9291	9296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817288
117	NC_014623	GCG	2	6	9298	9303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817288
118	NC_014623	TGC	2	6	9381	9386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817288
119	NC_014623	CGG	2	6	9421	9426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817288
120	NC_014623	CCG	2	6	9506	9511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817288
121	NC_014623	TCG	2	6	9685	9690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817289
122	NC_014623	CGC	3	9	9707	9715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817289
123	NC_014623	CAT	2	6	9860	9865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817289
124	NC_014623	CTC	2	6	9951	9956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817289
125	NC_014623	CGA	2	6	9958	9963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817289
126	NC_014623	GGC	2	6	10016	10021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817289
127	NC_014623	GCA	2	6	10106	10111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817289
128	NC_014623	GGA	3	9	10118	10126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817289
129	NC_014623	CAG	2	6	10184	10189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817289
130	NC_014623	CTT	2	6	10253	10258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817289
131	NC_014623	CTG	2	6	10260	10265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817289
132	NC_014623	GGC	2	6	10286	10291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817289
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148	NC_014623	CGG	2	6	10796	10801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817290
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243	NC_014623	CTT	2	6	17021	17026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817294
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249	NC_014623	TCC	2	6	17398	17403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817294
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251	NC_014623	GGC	2	6	17772	17777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817294
252	NC_014623	TGA	2	6	18192	18197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817295
253	NC_014623	GCG	2	6	18216	18221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817295
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255	NC_014623	GTA	2	6	18244	18249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817295
256	NC_014623	CCA	2	6	18274	18279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817295
257	NC_014623	CGC	2	6	18367	18372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817295
258	NC_014623	CAC	2	6	18436	18441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817295
259	NC_014623	GGC	2	6	18467	18472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817295
260	NC_014623	CGC	2	6	18477	18482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817295
261	NC_014623	GGC	2	6	18546	18551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817295
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280	NC_014623	GTC	2	6	19832	19837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817296
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292	NC_014623	CTC	2	6	20700	20705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817297
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