MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 235229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014623	CG	3	6	183600	183605	0 %	0 %	50 %	50 %	310817424
4002	NC_014623	TCCGT	2	10	183674	183683	0 %	40 %	20 %	40 %	310817424
4003	NC_014623	CGTG	2	8	183717	183724	0 %	25 %	50 %	25 %	310817424
4004	NC_014623	CCG	2	6	183770	183775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817424
4005	NC_014623	ACG	2	6	183812	183817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817424
4006	NC_014623	AGG	2	6	183833	183838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817424
4007	NC_014623	G	6	6	183837	183842	0 %	0 %	100 %	0 %	310817424
4008	NC_014623	GCA	2	6	183882	183887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817424
4009	NC_014623	CGG	2	6	183896	183901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817424
4010	NC_014623	ACC	2	6	183920	183925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817424
4011	NC_014623	GC	3	6	184012	184017	0 %	0 %	50 %	50 %	310817424
4012	NC_014623	TCG	2	6	184046	184051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817424
4013	NC_014623	TCC	2	6	184091	184096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817424
4014	NC_014623	GCCG	2	8	184125	184132	0 %	0 %	50 %	50 %	310817424
4015	NC_014623	CAC	2	6	184168	184173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817424
4016	NC_014623	TGG	2	6	184224	184229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817424
4017	NC_014623	CAG	2	6	184246	184251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817424
4018	NC_014623	CGG	2	6	184254	184259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817424
4019	NC_014623	CCG	2	6	184269	184274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817424
4020	NC_014623	CTC	2	6	184297	184302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817424
4021	NC_014623	GCC	2	6	184351	184356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817424
4022	NC_014623	AGC	2	6	184418	184423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817424
4023	NC_014623	CGA	2	6	184431	184436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817424
4024	NC_014623	GGAC	2	8	184502	184509	25 %	0 %	50 %	25 %	310817424
4025	NC_014623	CGC	2	6	184596	184601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817424
4026	NC_014623	GATG	2	8	184624	184631	25 %	25 %	50 %	0 %	310817424
4027	NC_014623	TGC	2	6	184861	184866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817425
4028	NC_014623	CGG	2	6	184870	184875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817425
4029	NC_014623	CTG	2	6	184920	184925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817425
4030	NC_014623	AGG	2	6	184927	184932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817425
4031	NC_014623	ACG	2	6	185071	185076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817425
4032	NC_014623	TTC	2	6	185133	185138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817425
4033	NC_014623	GGC	2	6	185147	185152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817425
4034	NC_014623	ACG	2	6	185356	185361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817425
4035	NC_014623	CGG	2	6	185425	185430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817425
4036	NC_014623	CCT	2	6	185485	185490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817425
4037	NC_014623	GGA	2	6	185552	185557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817425
4038	NC_014623	GGT	3	9	185612	185620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817425
4039	NC_014623	ACA	2	6	185626	185631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817425
4040	NC_014623	GCC	2	6	185647	185652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817425
4041	NC_014623	AGG	2	6	185708	185713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817425
4042	NC_014623	GCT	2	6	185788	185793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817426
4043	NC_014623	GCG	2	6	185807	185812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817426
4044	NC_014623	CAT	2	6	185848	185853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817426
4045	NC_014623	GAG	2	6	185885	185890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817426
4046	NC_014623	TGG	2	6	185925	185930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817426
4047	NC_014623	TCG	2	6	185967	185972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817426
4048	NC_014623	TGG	2	6	186015	186020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817426
4049	NC_014623	TGAGC	2	10	186070	186079	20 %	20 %	40 %	20 %	310817426
4050	NC_014623	GCG	2	6	186105	186110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817426
4051	NC_014623	GGA	2	6	186178	186183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817426
4052	NC_014623	GAA	2	6	186214	186219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817426
4053	NC_014623	GCT	2	6	186277	186282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817426
4054	NC_014623	CG	3	6	186348	186353	0 %	0 %	50 %	50 %	310817426
4055	NC_014623	TGC	2	6	186408	186413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817426
4056	NC_014623	GCC	2	6	186429	186434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817426
4057	NC_014623	CTG	2	6	186455	186460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817426
4058	NC_014623	GCT	3	9	186475	186483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817426
4059	NC_014623	TC	3	6	186511	186516	0 %	50 %	0 %	50 %	310817426
4060	NC_014623	GAT	2	6	186523	186528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817426
4061	NC_014623	TGA	2	6	186546	186551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817426
4062	NC_014623	GGC	2	6	186589	186594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817426
4063	NC_014623	GC	3	6	186645	186650	0 %	0 %	50 %	50 %	310817426
4064	NC_014623	GAC	2	6	186688	186693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817426
4065	NC_014623	TCA	2	6	186705	186710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817426
4066	NC_014623	GTTCG	2	10	186745	186754	0 %	40 %	40 %	20 %	310817426
4067	NC_014623	GGT	2	6	186784	186789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817426
4068	NC_014623	GC	3	6	186832	186837	0 %	0 %	50 %	50 %	310817426
4069	NC_014623	GCC	2	6	186841	186846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817426
4070	NC_014623	GCT	2	6	186889	186894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817426
4071	NC_014623	TGG	2	6	186924	186929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817426
4072	NC_014623	GAT	2	6	186949	186954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817426
4073	NC_014623	CCGAT	2	10	186996	187005	20 %	20 %	20 %	40 %	310817426
4074	NC_014623	AGGG	2	8	187110	187117	25 %	0 %	75 %	0 %	310817426
4075	NC_014623	CCG	2	6	187128	187133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817426
4076	NC_014623	GGCC	2	8	187168	187175	0 %	0 %	50 %	50 %	310817426
4077	NC_014623	GAT	2	6	187219	187224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817426
4078	NC_014623	ATG	2	6	187239	187244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817426
4079	NC_014623	CGG	2	6	187251	187256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817426
4080	NC_014623	TGC	2	6	187299	187304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817426
4081	NC_014623	CCGC	2	8	187461	187468	0 %	0 %	25 %	75 %	310817426
4082	NC_014623	TC	3	6	187486	187491	0 %	50 %	0 %	50 %	310817426
4083	NC_014623	GTG	2	6	187562	187567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817426
4084	NC_014623	ATG	2	6	187568	187573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817426
4085	NC_014623	TC	3	6	187578	187583	0 %	50 %	0 %	50 %	310817426
4086	NC_014623	TCCG	2	8	187586	187593	0 %	25 %	25 %	50 %	310817426
4087	NC_014623	CTG	2	6	187601	187606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817426
4088	NC_014623	GAC	2	6	187724	187729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817426
4089	NC_014623	TCA	2	6	187740	187745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817426
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4091	NC_014623	GAT	2	6	187825	187830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817426
4092	NC_014623	CTG	2	6	187871	187876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817426
4093	NC_014623	GCT	2	6	187906	187911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817426
4094	NC_014623	GCTGAT	2	12	187948	187959	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	310817426
4095	NC_014623	TTG	2	6	187967	187972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310817426
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4097	NC_014623	AGGG	2	8	188034	188041	25 %	0 %	75 %	0 %	310817426
4098	NC_014623	GCGCC	2	10	188049	188058	0 %	0 %	40 %	60 %	310817426
4099	NC_014623	GCC	2	6	188060	188065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817426
4100	NC_014623	GGT	3	9	188107	188115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817426
4101	NC_014623	CTG	2	6	188129	188134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817426
4102	NC_014623	ATC	2	6	188177	188182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817426
4103	NC_014623	GCG	2	6	188225	188230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817426
4104	NC_014623	GCG	2	6	188275	188280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817426
4105	NC_014623	TCA	2	6	188283	188288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817426
4106	NC_014623	CGC	2	6	188438	188443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817426
4107	NC_014623	AGA	2	6	188457	188462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817426
4108	NC_014623	AGC	2	6	188522	188527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817426
4109	NC_014623	AGG	2	6	188637	188642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817426
4110	NC_014623	GCA	2	6	188653	188658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817426
4111	NC_014623	CCA	2	6	188742	188747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817426
4112	NC_014623	GAA	2	6	188770	188775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817426
4113	NC_014623	CAG	2	6	188779	188784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817426
4114	NC_014623	CTT	3	9	188785	188793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817426
4115	NC_014623	TGC	2	6	188942	188947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817427
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4118	NC_014623	CCGGAC	2	12	189020	189031	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	310817427
4119	NC_014623	GCCCG	2	10	189079	189088	0 %	0 %	40 %	60 %	310817427
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4121	NC_014623	GCC	2	6	189194	189199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817427
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4244	NC_014623	ACCGCC	2	12	194805	194816	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	310817431
4245	NC_014623	ACGGCG	2	12	194820	194831	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	310817431
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4356	NC_014623	GGGC	2	8	199582	199589	0 %	0 %	75 %	25 %	310817434
4357	NC_014623	CG	3	6	199597	199602	0 %	0 %	50 %	50 %	310817434
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4361	NC_014623	CG	4	8	199778	199785	0 %	0 %	50 %	50 %	310817434
4362	NC_014623	GGC	3	9	199802	199810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817434
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4364	NC_014623	GCA	2	6	199936	199941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817434
4365	NC_014623	CGA	2	6	199954	199959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817434
4366	NC_014623	GCCG	2	8	199966	199973	0 %	0 %	50 %	50 %	310817434
4367	NC_014623	CAC	2	6	199982	199987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817434
4368	NC_014623	CGGGG	2	10	200058	200067	0 %	0 %	80 %	20 %	310817434
4369	NC_014623	AGCGC	2	10	200086	200095	20 %	0 %	40 %	40 %	310817434
4370	NC_014623	G	6	6	200098	200103	0 %	0 %	100 %	0 %	310817434
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4376	NC_014623	GC	3	6	200414	200419	0 %	0 %	50 %	50 %	310817434
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4484	NC_014623	GC	3	6	204310	204315	0 %	0 %	50 %	50 %	310817435
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4487	NC_014623	CAG	2	6	204370	204375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817435
4488	NC_014623	CGG	2	6	204392	204397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817435
4489	NC_014623	AGC	2	6	204476	204481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817435
4490	NC_014623	GGC	2	6	204511	204516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817435
4491	NC_014623	GC	3	6	204521	204526	0 %	0 %	50 %	50 %	310817435
4492	NC_014623	GCG	2	6	204553	204558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817435
4493	NC_014623	TGA	2	6	204576	204581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817435
4494	NC_014623	GAT	2	6	204598	204603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817435
4495	NC_014623	AGC	2	6	204626	204631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817435
4496	NC_014623	CGCGG	2	10	204634	204643	0 %	0 %	60 %	40 %	310817435
4497	NC_014623	GAG	2	6	204667	204672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817435
4498	NC_014623	AGC	2	6	204680	204685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817435
4499	NC_014623	CGG	2	6	204741	204746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817435
4500	NC_014623	CGC	2	6	204817	204822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817435

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