MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 235229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2003	NC_014623	CGC	3	9	93170	93178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817345
2004	NC_014623	CTC	2	6	93212	93217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817345
2005	NC_014623	CGG	2	6	93246	93251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817345
2006	NC_014623	GGA	2	6	93255	93260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817345
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2127	NC_014623	GAC	2	6	99254	99259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817350
2128	NC_014623	GAG	2	6	99274	99279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817350
2129	NC_014623	GGC	2	6	99281	99286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817350
2130	NC_014623	CGCTGG	2	12	99424	99435	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	310817350
2131	NC_014623	CCACGC	2	12	99454	99465	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	310817350
2132	NC_014623	GCA	2	6	99536	99541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817350
2133	NC_014623	GATG	2	8	99575	99582	25 %	25 %	50 %	0 %	310817350
2134	NC_014623	CCG	2	6	99609	99614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817350
2135	NC_014623	CTG	2	6	99651	99656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817350
2136	NC_014623	GC	3	6	99731	99736	0 %	0 %	50 %	50 %	310817350
2137	NC_014623	AGG	2	6	100103	100108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817351
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2139	NC_014623	CTT	2	6	100149	100154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817351
2140	NC_014623	GCG	2	6	100218	100223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817351
2141	NC_014623	CG	3	6	100292	100297	0 %	0 %	50 %	50 %	310817351
2142	NC_014623	GC	4	8	100407	100414	0 %	0 %	50 %	50 %	310817351
2143	NC_014623	GAT	2	6	100417	100422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817351
2144	NC_014623	GGC	2	6	100467	100472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817351
2145	NC_014623	CTA	2	6	100542	100547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817351
2146	NC_014623	GGT	2	6	100578	100583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817351
2147	NC_014623	TGA	2	6	100589	100594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817351
2148	NC_014623	CAG	2	6	100600	100605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817351
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2150	NC_014623	GCA	2	6	100668	100673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817351
2151	NC_014623	GC	3	6	100692	100697	0 %	0 %	50 %	50 %	310817351
2152	NC_014623	CCCG	2	8	100710	100717	0 %	0 %	25 %	75 %	310817351
2153	NC_014623	ATGG	2	8	100753	100760	25 %	25 %	50 %	0 %	310817351
2154	NC_014623	GC	3	6	100789	100794	0 %	0 %	50 %	50 %	310817351
2155	NC_014623	GCT	2	6	100809	100814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817351
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2159	NC_014623	AAGCTG	2	12	100891	100902	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	310817351
2160	NC_014623	CCG	2	6	100904	100909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817351
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2162	NC_014623	TGG	2	6	100967	100972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817351
2163	NC_014623	CCT	2	6	101044	101049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817352
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2166	NC_014623	TGG	2	6	101098	101103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817352
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2171	NC_014623	TGCC	2	8	101437	101444	0 %	25 %	25 %	50 %	310817352
2172	NC_014623	ACC	3	9	101642	101650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817353
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2174	NC_014623	CG	3	6	101732	101737	0 %	0 %	50 %	50 %	310817353
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2223	NC_014623	GCT	2	6	103700	103705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817354
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2230	NC_014623	CGG	2	6	103993	103998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817355
2231	NC_014623	CGG	2	6	104058	104063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817355
2232	NC_014623	GCA	2	6	104070	104075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817355
2233	NC_014623	GCG	2	6	104086	104091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817355
2234	NC_014623	CAG	2	6	104092	104097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817355
2235	NC_014623	CAG	2	6	104122	104127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817355
2236	NC_014623	TTGCC	2	10	104135	104144	0 %	40 %	20 %	40 %	310817355
2237	NC_014623	GTCC	2	8	104148	104155	0 %	25 %	25 %	50 %	310817355
2238	NC_014623	CGC	2	6	104157	104162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817355
2239	NC_014623	CGT	2	6	104163	104168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817355
2240	NC_014623	CACG	2	8	104230	104237	25 %	0 %	25 %	50 %	310817355
2241	NC_014623	CGG	2	6	104286	104291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817355
2242	NC_014623	CCA	2	6	104301	104306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817355
2243	NC_014623	GCA	3	9	104307	104315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817355
2244	NC_014623	TGGGC	2	10	104379	104388	0 %	20 %	60 %	20 %	310817355
2245	NC_014623	ACGT	2	8	104399	104406	25 %	25 %	25 %	25 %	310817355
2246	NC_014623	GAT	3	9	104440	104448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817355
2247	NC_014623	TGA	2	6	104478	104483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817355
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2373	NC_014623	TGC	2	6	109772	109777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817358
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2482	NC_014623	CCA	2	6	113865	113870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817361
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2484	NC_014623	CCAC	2	8	114280	114287	25 %	0 %	0 %	75 %	310817362
2485	NC_014623	G	6	6	114338	114343	0 %	0 %	100 %	0 %	310817362
2486	NC_014623	TCC	2	6	114351	114356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817362
2487	NC_014623	ACGGTG	2	12	114357	114368	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	310817362
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2489	NC_014623	GGGCCA	2	12	114444	114455	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	310817362
2490	NC_014623	CCGTGG	2	12	114508	114519	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	310817362
2491	NC_014623	CGC	2	6	114544	114549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817362
2492	NC_014623	GTC	2	6	114600	114605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817362
2493	NC_014623	TTC	2	6	114620	114625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817362
2494	NC_014623	GCC	2	6	114646	114651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817362
2495	NC_014623	ACCC	2	8	114694	114701	25 %	0 %	0 %	75 %	310817362
2496	NC_014623	CCA	2	6	114830	114835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817362
2497	NC_014623	CGT	2	6	114901	114906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817362
2498	NC_014623	GCC	2	6	114938	114943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817362
2499	NC_014623	GCCAT	2	10	114948	114957	20 %	20 %	20 %	40 %	310817362
2500	NC_014623	GC	3	6	114994	114999	0 %	0 %	50 %	50 %	310817362

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