MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 235229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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235002	NC_014623	TTG	2	6	10251462	10251467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310825619
235003	NC_014623	GCC	2	6	10251505	10251510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310825619
235004	NC_014623	GAC	2	6	10251546	10251551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310825619
235005	NC_014623	TTG	2	6	10251562	10251567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310825619
235006	NC_014623	GAG	2	6	10251712	10251717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310825619
235007	NC_014623	CCG	2	6	10251734	10251739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310825619
235008	NC_014623	GAT	2	6	10251771	10251776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310825619
235009	NC_014623	CAT	2	6	10251780	10251785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310825619
235010	NC_014623	CGG	2	6	10251854	10251859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310825619
235011	NC_014623	CTT	2	6	10251870	10251875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310825619
235012	NC_014623	CAG	2	6	10251907	10251912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310825619
235013	NC_014623	TCA	2	6	10251983	10251988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310825619
235014	NC_014623	CGC	2	6	10251990	10251995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310825619
235015	NC_014623	GCC	3	9	10252006	10252014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310825619
235016	NC_014623	GTT	2	6	10252029	10252034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310825619
235017	NC_014623	AGG	2	6	10252046	10252051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310825619
235018	NC_014623	GCTGT	2	10	10252131	10252140	0 %	40 %	40 %	20 %	310825619
235019	NC_014623	TCT	2	6	10252151	10252156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310825619
235020	NC_014623	CAG	2	6	10252185	10252190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310825619
235021	NC_014623	CAT	2	6	10252191	10252196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310825619
235022	NC_014623	CAG	4	12	10252203	10252214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310825619
235023	NC_014623	CG	3	6	10252346	10252351	0 %	0 %	50 %	50 %	310825620
235024	NC_014623	GGC	2	6	10252379	10252384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310825620
235025	NC_014623	CTG	2	6	10252404	10252409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310825620
235026	NC_014623	CTT	2	6	10252436	10252441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310825620
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235029	NC_014623	TCC	2	6	10252632	10252637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310825620
235030	NC_014623	CAC	2	6	10252655	10252660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310825620
235031	NC_014623	CGC	2	6	10252705	10252710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310825620
235032	NC_014623	GGT	2	6	10252712	10252717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310825620
235033	NC_014623	TGA	2	6	10252756	10252761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310825620
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235035	NC_014623	CGTC	2	8	10252828	10252835	0 %	25 %	25 %	50 %	310825620
235036	NC_014623	GGC	2	6	10252874	10252879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310825620
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235042	NC_014623	TGC	2	6	10253223	10253228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310825621
235043	NC_014623	CTG	2	6	10253231	10253236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310825621
235044	NC_014623	GAG	2	6	10253257	10253262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310825621
235045	NC_014623	TGA	2	6	10253265	10253270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310825621
235046	NC_014623	GTC	2	6	10253317	10253322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310825621
235047	NC_014623	AGA	2	6	10253358	10253363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310825621
235048	NC_014623	GTC	2	6	10253581	10253586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310825621
235049	NC_014623	TCG	2	6	10253588	10253593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310825621
235050	NC_014623	GGTC	2	8	10253607	10253614	0 %	25 %	50 %	25 %	310825621
235051	NC_014623	CGA	2	6	10253686	10253691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310825621
235052	NC_014623	GCCACC	2	12	10253695	10253706	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	310825621
235053	NC_014623	CCA	2	6	10253711	10253716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310825621
235054	NC_014623	CCGCCA	2	12	10253717	10253728	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	310825621
235055	NC_014623	TCC	2	6	10253732	10253737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310825621
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235066	NC_014623	AAG	2	6	10254311	10254316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310825622
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235068	NC_014623	CGT	2	6	10254351	10254356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310825622
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235085	NC_014623	CG	3	6	10255307	10255312	0 %	0 %	50 %	50 %	310825623
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235094	NC_014623	CG	3	6	10255768	10255773	0 %	0 %	50 %	50 %	310825624
235095	NC_014623	GAGGG	2	10	10255835	10255844	20 %	0 %	80 %	0 %	310825624
235096	NC_014623	CCG	2	6	10255881	10255886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310825624
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235098	NC_014623	GCA	2	6	10255941	10255946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310825624
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235100	NC_014623	GC	3	6	10255987	10255992	0 %	0 %	50 %	50 %	310825624
235101	NC_014623	GGC	2	6	10256010	10256015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310825624
235102	NC_014623	CG	3	6	10256094	10256099	0 %	0 %	50 %	50 %	310825624
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235105	NC_014623	GCCTCG	2	12	10256246	10256257	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310825624
235106	NC_014623	AGCGC	2	10	10256259	10256268	20 %	0 %	40 %	40 %	310825624
235107	NC_014623	CG	3	6	10256274	10256279	0 %	0 %	50 %	50 %	310825624
235108	NC_014623	GCCC	2	8	10256281	10256288	0 %	0 %	25 %	75 %	310825624
235109	NC_014623	TCG	2	6	10256291	10256296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310825624
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235111	NC_014623	CTC	2	6	10256362	10256367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310825624
235112	NC_014623	GC	4	8	10256370	10256377	0 %	0 %	50 %	50 %	310825624
235113	NC_014623	GC	3	6	10256391	10256396	0 %	0 %	50 %	50 %	310825624
235114	NC_014623	CGC	2	6	10256407	10256412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310825624
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235119	NC_014623	GGA	2	6	10256493	10256498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310825624
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235123	NC_014623	CAG	3	9	10256563	10256571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310825624
235124	NC_014623	GCA	2	6	10256574	10256579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310825624
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235214	NC_014623	GGC	2	6	10260075	10260080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310825629
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235216	NC_014623	ACC	2	6	10260100	10260105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310825629
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235218	NC_014623	GC	4	8	10260134	10260141	0 %	0 %	50 %	50 %	310825629
235219	NC_014623	CCGCAC	2	12	10260177	10260188	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	310825629
235220	NC_014623	AGCA	2	8	10260265	10260272	50 %	0 %	25 %	25 %	310825629
235221	NC_014623	TCT	2	6	10260284	10260289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310825629
235222	NC_014623	CCTGGA	2	12	10260299	10260310	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310825629
235223	NC_014623	GCA	2	6	10260326	10260331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310825629
235224	NC_014623	GGT	2	6	10260364	10260369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310825629
235225	NC_014623	CGTCA	2	10	10260387	10260396	20 %	20 %	20 %	40 %	310825629
235226	NC_014623	CTT	2	6	10260410	10260415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310825630
235227	NC_014623	CGG	2	6	10260418	10260423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310825630
235228	NC_014623	GCG	3	9	10260452	10260460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310825630
235229	NC_014623	ACG	2	6	10260575	10260580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310825630

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