MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 235229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_014623	C	6	6	1022208	1022213	0 %	0 %	0 %	100 %	310818105
23002	NC_014623	CAG	2	6	1022234	1022239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310818105
23003	NC_014623	CCT	2	6	1022242	1022247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310818105
23004	NC_014623	CCA	2	6	1022311	1022316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310818105
23005	NC_014623	GGCTG	2	10	1022317	1022326	0 %	20 %	60 %	20 %	310818105
23006	NC_014623	TTG	2	6	1022340	1022345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310818105
23007	NC_014623	GCC	2	6	1022358	1022363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310818105
23008	NC_014623	TCA	2	6	1022531	1022536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310818106
23009	NC_014623	GCT	2	6	1022553	1022558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310818106
23010	NC_014623	CGC	2	6	1022562	1022567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310818106
23011	NC_014623	TCC	2	6	1022592	1022597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310818106
23012	NC_014623	CTG	2	6	1022644	1022649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310818106
23013	NC_014623	GCTCCC	2	12	1022698	1022709	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	310818106
23014	NC_014623	CCTC	2	8	1022716	1022723	0 %	25 %	0 %	75 %	310818106
23015	NC_014623	CTC	2	6	1022735	1022740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310818106
23016	NC_014623	GAG	2	6	1022744	1022749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310818106
23017	NC_014623	CGAG	2	8	1023127	1023134	25 %	0 %	50 %	25 %	310818107
23018	NC_014623	C	6	6	1023162	1023167	0 %	0 %	0 %	100 %	310818107
23019	NC_014623	C	6	6	1023224	1023229	0 %	0 %	0 %	100 %	310818107
23020	NC_014623	GAG	2	6	1023273	1023278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310818107
23021	NC_014623	CGCC	2	8	1023288	1023295	0 %	0 %	25 %	75 %	310818107
23022	NC_014623	CAG	2	6	1023311	1023316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310818107
23023	NC_014623	TCTT	2	8	1023360	1023367	0 %	75 %	0 %	25 %	310818107
23024	NC_014623	GCT	2	6	1023406	1023411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310818107
23025	NC_014623	GC	4	8	1023455	1023462	0 %	0 %	50 %	50 %	310818107
23026	NC_014623	CG	3	6	1023466	1023471	0 %	0 %	50 %	50 %	310818107
23027	NC_014623	GTG	2	6	1023491	1023496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310818107
23028	NC_014623	TCC	2	6	1023546	1023551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310818107
23029	NC_014623	GTG	2	6	1023605	1023610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310818107
23030	NC_014623	CGT	2	6	1023625	1023630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310818107
23031	NC_014623	GC	4	8	1023631	1023638	0 %	0 %	50 %	50 %	310818107
23032	NC_014623	ACA	2	6	1023687	1023692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310818107
23033	NC_014623	TCC	2	6	1023747	1023752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310818107
23034	NC_014623	AGG	2	6	1023759	1023764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310818107
23035	NC_014623	GGCGTG	2	12	1023809	1023820	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	310818107
23036	NC_014623	TCC	2	6	1023939	1023944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310818107
23037	NC_014623	GGCC	2	8	1023958	1023965	0 %	0 %	50 %	50 %	310818107
23038	NC_014623	CGC	2	6	1024063	1024068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310818107
23039	NC_014623	TGG	2	6	1024080	1024085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310818107
23040	NC_014623	GCGCAA	2	12	1024096	1024107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310818107
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23042	NC_014623	TTC	2	6	1024158	1024163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310818107
23043	NC_014623	GAGAGC	2	12	1024196	1024207	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	310818107
23044	NC_014623	GCC	2	6	1024244	1024249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310818107
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23046	NC_014623	GC	3	6	1024278	1024283	0 %	0 %	50 %	50 %	310818107
23047	NC_014623	CGT	2	6	1024318	1024323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310818107
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23049	NC_014623	GC	3	6	1024357	1024362	0 %	0 %	50 %	50 %	310818107
23050	NC_014623	CCGG	2	8	1024417	1024424	0 %	0 %	50 %	50 %	310818107
23051	NC_014623	TGA	2	6	1024467	1024472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310818107
23052	NC_014623	CTC	2	6	1024474	1024479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310818107
23053	NC_014623	CTCG	2	8	1024483	1024490	0 %	25 %	25 %	50 %	310818107
23054	NC_014623	CGG	2	6	1024511	1024516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310818107
23055	NC_014623	GC	3	6	1024523	1024528	0 %	0 %	50 %	50 %	310818107
23056	NC_014623	TGC	2	6	1024560	1024565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310818107
23057	NC_014623	CGC	2	6	1024577	1024582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310818107
23058	NC_014623	GAG	2	6	1024619	1024624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310818107
23059	NC_014623	CGA	2	6	1024690	1024695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310818107
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23061	NC_014623	AGG	2	6	1024818	1024823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310818107
23062	NC_014623	GAT	2	6	1024885	1024890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310818107
23063	NC_014623	CAG	2	6	1024891	1024896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310818107
23064	NC_014623	GC	3	6	1024926	1024931	0 %	0 %	50 %	50 %	310818107
23065	NC_014623	GCT	2	6	1024936	1024941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310818107
23066	NC_014623	CGC	2	6	1024948	1024953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310818107
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23069	NC_014623	GCT	2	6	1024990	1024995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310818107
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23105	NC_014623	CTGCGT	2	12	1026215	1026226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310818108
23106	NC_014623	AGGA	2	8	1026233	1026240	50 %	0 %	50 %	0 %	310818108
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23116	NC_014623	TGA	2	6	1026783	1026788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310818108
23117	NC_014623	TGG	2	6	1026822	1026827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310818108
23118	NC_014623	GTC	2	6	1026849	1026854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310818108
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23233	NC_014623	GCC	2	6	1031522	1031527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310818112
23234	NC_014623	GC	3	6	1031528	1031533	0 %	0 %	50 %	50 %	310818112
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23240	NC_014623	GCT	2	6	1031716	1031721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310818112
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23263	NC_014623	GCGCCC	2	12	1032373	1032384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310818113
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23349	NC_014623	CAGC	2	8	1035805	1035812	25 %	0 %	25 %	50 %	310818116
23350	NC_014623	TCC	2	6	1035815	1035820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310818116
23351	NC_014623	TCC	2	6	1035885	1035890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310818116
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23449	NC_014623	TCC	3	9	1039938	1039946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310818119
23450	NC_014623	CGC	2	6	1039964	1039969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310818119
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23452	NC_014623	TGCA	2	8	1040008	1040015	25 %	25 %	25 %	25 %	310818119
23453	NC_014623	GCA	2	6	1040050	1040055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310818119
23454	NC_014623	TGA	2	6	1040113	1040118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310818119
23455	NC_014623	CG	3	6	1040213	1040218	0 %	0 %	50 %	50 %	310818119
23456	NC_014623	GGA	2	6	1040269	1040274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310818119
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23458	NC_014623	CCTCG	2	10	1040333	1040342	0 %	20 %	20 %	60 %	310818119
23459	NC_014623	AAGG	2	8	1040343	1040350	50 %	0 %	50 %	0 %	310818119
23460	NC_014623	CAC	2	6	1040360	1040365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310818119
23461	NC_014623	AGG	2	6	1040376	1040381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310818119
23462	NC_014623	GGC	2	6	1040505	1040510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310818119
23463	NC_014623	TAT	2	6	1040513	1040518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310818119
23464	NC_014623	CCGC	2	8	1040529	1040536	0 %	0 %	25 %	75 %	310818119
23465	NC_014623	GAG	2	6	1040549	1040554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310818119
23466	NC_014623	TTA	2	6	1040614	1040619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310818119
23467	NC_014623	TCC	3	9	1040629	1040637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310818119
23468	NC_014623	G	6	6	1040810	1040815	0 %	0 %	100 %	0 %	310818120
23469	NC_014623	CGTG	2	8	1040827	1040834	0 %	25 %	50 %	25 %	310818120
23470	NC_014623	GAA	2	6	1040864	1040869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310818120
23471	NC_014623	GAA	2	6	1040898	1040903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310818120
23472	NC_014623	CAC	2	6	1040938	1040943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310818120
23473	NC_014623	CTC	2	6	1040952	1040957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310818120
23474	NC_014623	AGGC	2	8	1041076	1041083	25 %	0 %	50 %	25 %	310818120
23475	NC_014623	TTGC	2	8	1041188	1041195	0 %	50 %	25 %	25 %	310818120
23476	NC_014623	CAG	2	6	1041196	1041201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310818120
23477	NC_014623	TGC	2	6	1041308	1041313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310818120
23478	NC_014623	TTTGGA	2	12	1041365	1041376	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	310818120
23479	NC_014623	CGCAA	2	10	1041405	1041414	40 %	0 %	20 %	40 %	310818120
23480	NC_014623	GAG	2	6	1041432	1041437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310818121
23481	NC_014623	GCTG	2	8	1041439	1041446	0 %	25 %	50 %	25 %	310818121
23482	NC_014623	GCC	2	6	1041465	1041470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310818121
23483	NC_014623	GC	3	6	1041472	1041477	0 %	0 %	50 %	50 %	310818121
23484	NC_014623	CAT	2	6	1041491	1041496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310818121
23485	NC_014623	CGT	2	6	1041514	1041519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310818121
23486	NC_014623	GGA	2	6	1041541	1041546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310818121
23487	NC_014623	GTG	2	6	1041549	1041554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310818121
23488	NC_014623	GC	3	6	1041623	1041628	0 %	0 %	50 %	50 %	310818121
23489	NC_014623	TCT	2	6	1041634	1041639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310818121
23490	NC_014623	TGC	2	6	1041679	1041684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310818121
23491	NC_014623	GCT	2	6	1041686	1041691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310818121
23492	NC_014623	CCA	2	6	1041718	1041723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310818121
23493	NC_014623	GGC	2	6	1041761	1041766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310818121
23494	NC_014623	GCA	2	6	1041772	1041777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310818121
23495	NC_014623	GCT	2	6	1041805	1041810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310818121
23496	NC_014623	C	6	6	1041814	1041819	0 %	0 %	0 %	100 %	310818121
23497	NC_014623	GC	3	6	1041904	1041909	0 %	0 %	50 %	50 %	310818121
23498	NC_014623	C	7	7	1041914	1041920	0 %	0 %	0 %	100 %	310818121
23499	NC_014623	CCT	2	6	1041925	1041930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310818121
23500	NC_014623	TGG	2	6	1041943	1041948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310818121

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