MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 235229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014623	GC	3	6	67737	67742	0 %	0 %	50 %	50 %	310817323
1502	NC_014623	CCGG	2	8	67750	67757	0 %	0 %	50 %	50 %	310817323
1503	NC_014623	GCGG	2	8	67784	67791	0 %	0 %	75 %	25 %	310817323
1504	NC_014623	GCA	2	6	67792	67797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817323
1505	NC_014623	TCC	2	6	67818	67823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817323
1506	NC_014623	CCG	2	6	67841	67846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817323
1507	NC_014623	CG	3	6	67845	67850	0 %	0 %	50 %	50 %	310817323
1508	NC_014623	CTC	2	6	68042	68047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817323
1509	NC_014623	GGGGT	2	10	68091	68100	0 %	20 %	80 %	0 %	310817323
1510	NC_014623	CAG	2	6	68129	68134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817323
1511	NC_014623	CGG	2	6	68167	68172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817323
1512	NC_014623	GGC	2	6	68264	68269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817323
1513	NC_014623	TGGC	2	8	68313	68320	0 %	25 %	50 %	25 %	310817323
1514	NC_014623	CA	3	6	68329	68334	50 %	0 %	0 %	50 %	310817323
1515	NC_014623	TCGA	2	8	68345	68352	25 %	25 %	25 %	25 %	310817323
1516	NC_014623	CTC	2	6	68371	68376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817324
1517	NC_014623	CGG	2	6	68383	68388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817324
1518	NC_014623	GCA	2	6	68425	68430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817324
1519	NC_014623	GTT	2	6	68432	68437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310817324
1520	NC_014623	GCCGG	2	10	68498	68507	0 %	0 %	60 %	40 %	310817324
1521	NC_014623	GCC	2	6	68627	68632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817324
1522	NC_014623	GCT	2	6	68638	68643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817324
1523	NC_014623	CCT	2	6	68647	68652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817324
1524	NC_014623	GTA	2	6	68660	68665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817324
1525	NC_014623	CGC	2	6	68699	68704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817324
1526	NC_014623	CTGG	2	8	68732	68739	0 %	25 %	50 %	25 %	310817324
1527	NC_014623	ATGCGC	2	12	68754	68765	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310817324
1528	NC_014623	GCCTG	2	10	68837	68846	0 %	20 %	40 %	40 %	310817324
1529	NC_014623	GAA	2	6	68942	68947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817324
1530	NC_014623	GAT	2	6	68960	68965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817324
1531	NC_014623	CAG	2	6	69017	69022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817324
1532	NC_014623	GAGG	2	8	69026	69033	25 %	0 %	75 %	0 %	310817324
1533	NC_014623	CAC	2	6	69038	69043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817324
1534	NC_014623	CGG	3	9	69124	69132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817324
1535	NC_014623	CGC	2	6	69225	69230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817324
1536	NC_014623	CGG	2	6	69314	69319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817324
1537	NC_014623	ACC	2	6	69351	69356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817324
1538	NC_014623	TTG	2	6	69357	69362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310817324
1539	NC_014623	CGA	2	6	69394	69399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817324
1540	NC_014623	TCG	2	6	69408	69413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817324
1541	NC_014623	GAT	2	6	69428	69433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817324
1542	NC_014623	GGGA	2	8	69468	69475	25 %	0 %	75 %	0 %	310817324
1543	NC_014623	CGT	2	6	69538	69543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817324
1544	NC_014623	GGGA	2	8	69545	69552	25 %	0 %	75 %	0 %	310817324
1545	NC_014623	GTC	2	6	69572	69577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817324
1546	NC_014623	GTCCAG	2	12	69599	69610	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310817324
1547	NC_014623	GTG	2	6	69669	69674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817324
1548	NC_014623	CTC	2	6	69788	69793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817324
1549	NC_014623	GGC	2	6	69807	69812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817324
1550	NC_014623	CTG	2	6	70157	70162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817325
1551	NC_014623	GTG	2	6	70173	70178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817325
1552	NC_014623	CGAAC	2	10	70179	70188	40 %	0 %	20 %	40 %	310817325
1553	NC_014623	CGC	2	6	70194	70199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817325
1554	NC_014623	GCC	2	6	70242	70247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817325
1555	NC_014623	GTT	2	6	70292	70297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310817325
1556	NC_014623	CCT	2	6	70316	70321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817325
1557	NC_014623	CAGCC	2	10	70373	70382	20 %	0 %	20 %	60 %	310817325
1558	NC_014623	CT	3	6	70424	70429	0 %	50 %	0 %	50 %	310817325
1559	NC_014623	CGA	2	6	70438	70443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817325
1560	NC_014623	ACA	2	6	70492	70497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817325
1561	NC_014623	GAG	2	6	70505	70510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817325
1562	NC_014623	CG	3	6	70545	70550	0 %	0 %	50 %	50 %	310817325
1563	NC_014623	AAC	2	6	70672	70677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817325
1564	NC_014623	CGA	2	6	70690	70695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817325
1565	NC_014623	GGT	2	6	70696	70701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817325
1566	NC_014623	GAA	2	6	70702	70707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817325
1567	NC_014623	GC	3	6	70781	70786	0 %	0 %	50 %	50 %	310817325
1568	NC_014623	TG	3	6	70820	70825	0 %	50 %	50 %	0 %	310817325
1569	NC_014623	ACAA	2	8	70902	70909	75 %	0 %	0 %	25 %	310817325
1570	NC_014623	GT	3	6	70950	70955	0 %	50 %	50 %	0 %	310817325
1571	NC_014623	CCA	2	6	71055	71060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817326
1572	NC_014623	AGCG	2	8	71102	71109	25 %	0 %	50 %	25 %	310817326
1573	NC_014623	AGGA	2	8	71144	71151	50 %	0 %	50 %	0 %	310817326
1574	NC_014623	GCTG	2	8	71173	71180	0 %	25 %	50 %	25 %	310817326
1575	NC_014623	CTT	2	6	71200	71205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817326
1576	NC_014623	TCA	2	6	71222	71227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817326
1577	NC_014623	ATC	2	6	71238	71243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817326
1578	NC_014623	CTT	2	6	71265	71270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817326
1579	NC_014623	GAAT	2	8	71303	71310	50 %	25 %	25 %	0 %	310817326
1580	NC_014623	AGG	2	6	71399	71404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817326
1581	NC_014623	GCT	2	6	71412	71417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817326
1582	NC_014623	TC	3	6	71442	71447	0 %	50 %	0 %	50 %	310817326
1583	NC_014623	CCCAG	2	10	71527	71536	20 %	0 %	20 %	60 %	310817326
1584	NC_014623	GGA	2	6	71569	71574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817326
1585	NC_014623	GGGA	2	8	71678	71685	25 %	0 %	75 %	0 %	310817326
1586	NC_014623	CA	3	6	71733	71738	50 %	0 %	0 %	50 %	310817326
1587	NC_014623	CTGC	2	8	71749	71756	0 %	25 %	25 %	50 %	310817326
1588	NC_014623	TCG	2	6	71796	71801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817326
1589	NC_014623	CTC	2	6	71817	71822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817326
1590	NC_014623	AGCAG	2	10	71823	71832	40 %	0 %	40 %	20 %	310817326
1591	NC_014623	CGC	2	6	71851	71856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817326
1592	NC_014623	GAC	2	6	71953	71958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817327
1593	NC_014623	TC	3	6	71967	71972	0 %	50 %	0 %	50 %	310817327
1594	NC_014623	GTGC	2	8	72022	72029	0 %	25 %	50 %	25 %	310817327
1595	NC_014623	GC	3	6	72084	72089	0 %	0 %	50 %	50 %	310817327
1596	NC_014623	GCT	2	6	72160	72165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817327
1597	NC_014623	CT	3	6	72164	72169	0 %	50 %	0 %	50 %	310817327
1598	NC_014623	CTC	2	6	72268	72273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817327
1599	NC_014623	TGC	2	6	72318	72323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817327
1600	NC_014623	GGC	2	6	72352	72357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817327
1601	NC_014623	CGC	2	6	72364	72369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817327
1602	NC_014623	CCT	2	6	72403	72408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817327
1603	NC_014623	TCGGC	2	10	72447	72456	0 %	20 %	40 %	40 %	310817327
1604	NC_014623	CTC	3	9	72471	72479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817327
1605	NC_014623	CGA	2	6	72484	72489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817327
1606	NC_014623	CTCC	2	8	72494	72501	0 %	25 %	0 %	75 %	310817327
1607	NC_014623	CCCT	2	8	72508	72515	0 %	25 %	0 %	75 %	310817327
1608	NC_014623	GCA	2	6	72556	72561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817327
1609	NC_014623	TCC	2	6	72646	72651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817327
1610	NC_014623	GCT	2	6	72671	72676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817327
1611	NC_014623	CCG	2	6	72714	72719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817327
1612	NC_014623	GAA	2	6	72775	72780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817327
1613	NC_014623	CTC	2	6	72784	72789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817327
1614	NC_014623	GCG	2	6	72800	72805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817327
1615	NC_014623	CCT	2	6	72908	72913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817327
1616	NC_014623	TC	4	8	72914	72921	0 %	50 %	0 %	50 %	310817327
1617	NC_014623	GCT	4	12	72953	72964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817327
1618	NC_014623	GGC	2	6	73008	73013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817327
1619	NC_014623	CCT	2	6	73040	73045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817327
1620	NC_014623	GAA	2	6	73171	73176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817327
1621	NC_014623	TGCT	2	8	73300	73307	0 %	50 %	25 %	25 %	310817327
1622	NC_014623	GTCC	2	8	73328	73335	0 %	25 %	25 %	50 %	310817327
1623	NC_014623	TCC	2	6	73790	73795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817328
1624	NC_014623	GAA	2	6	73875	73880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817328
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1626	NC_014623	CCA	2	6	74076	74081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817328
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1650	NC_014623	CA	3	6	74923	74928	50 %	0 %	0 %	50 %	310817328
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