MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 235229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014623	GCG	2	6	24649	24654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817300
502	NC_014623	TTG	2	6	24684	24689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310817300
503	NC_014623	GTT	2	6	24755	24760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310817300
504	NC_014623	GTG	3	9	24795	24803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817300
505	NC_014623	CGC	2	6	24829	24834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817300
506	NC_014623	GC	3	6	24869	24874	0 %	0 %	50 %	50 %	310817300
507	NC_014623	TTG	2	6	24936	24941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310817300
508	NC_014623	GCC	2	6	24998	25003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817300
509	NC_014623	CAC	2	6	25022	25027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817300
510	NC_014623	GC	3	6	25034	25039	0 %	0 %	50 %	50 %	310817300
511	NC_014623	CGC	2	6	25073	25078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817300
512	NC_014623	ACC	2	6	25098	25103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817300
513	NC_014623	GCA	2	6	25123	25128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817300
514	NC_014623	CCG	2	6	25149	25154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817300
515	NC_014623	GC	3	6	25180	25185	0 %	0 %	50 %	50 %	310817300
516	NC_014623	GCGGTG	2	12	25203	25214	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	310817300
517	NC_014623	CGCA	2	8	25286	25293	25 %	0 %	25 %	50 %	310817300
518	NC_014623	GA	3	6	25407	25412	50 %	0 %	50 %	0 %	310817300
519	NC_014623	GA	3	6	25467	25472	50 %	0 %	50 %	0 %	310817300
520	NC_014623	AGG	2	6	25528	25533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817300
521	NC_014623	GAAA	2	8	25539	25546	75 %	0 %	25 %	0 %	310817300
522	NC_014623	GGA	2	6	25669	25674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817301
523	NC_014623	AAT	2	6	25685	25690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310817301
524	NC_014623	CTC	2	6	25728	25733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817301
525	NC_014623	GGC	2	6	25735	25740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817301
526	NC_014623	CAG	2	6	25833	25838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817301
527	NC_014623	ACG	2	6	25843	25848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817301
528	NC_014623	GCG	2	6	25865	25870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817301
529	NC_014623	GCGGAA	2	12	25872	25883	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	310817301
530	NC_014623	C	7	7	25934	25940	0 %	0 %	0 %	100 %	310817301
531	NC_014623	AGC	2	6	25978	25983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817301
532	NC_014623	AGCC	2	8	25987	25994	25 %	0 %	25 %	50 %	310817301
533	NC_014623	TC	3	6	26003	26008	0 %	50 %	0 %	50 %	310817301
534	NC_014623	CATC	2	8	26066	26073	25 %	25 %	0 %	50 %	310817301
535	NC_014623	GCG	2	6	26105	26110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817301
536	NC_014623	TGT	2	6	26240	26245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310817301
537	NC_014623	CAT	2	6	26262	26267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817301
538	NC_014623	GCC	2	6	26282	26287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817301
539	NC_014623	CGA	2	6	26354	26359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817301
540	NC_014623	GTG	2	6	26362	26367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817301
541	NC_014623	CGG	2	6	26382	26387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817301
542	NC_014623	TGG	2	6	26392	26397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817301
543	NC_014623	GTCGA	2	10	26419	26428	20 %	20 %	40 %	20 %	310817301
544	NC_014623	ACC	2	6	26440	26445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817301
545	NC_014623	TCT	2	6	26447	26452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817301
546	NC_014623	CGT	2	6	26513	26518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817301
547	NC_014623	GGA	2	6	26546	26551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817301
548	NC_014623	GAT	2	6	26613	26618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817301
549	NC_014623	CTGGCG	2	12	26646	26657	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	310817301
550	NC_014623	GGA	2	6	26765	26770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817301
551	NC_014623	TGA	2	6	26780	26785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817301
552	NC_014623	GC	3	6	26786	26791	0 %	0 %	50 %	50 %	310817301
553	NC_014623	GAT	2	6	26811	26816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817301
554	NC_014623	TGA	2	6	26882	26887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817302
555	NC_014623	CAA	2	6	26968	26973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817302
556	NC_014623	GGT	2	6	26979	26984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817302
557	NC_014623	CGCC	2	8	27012	27019	0 %	0 %	25 %	75 %	310817302
558	NC_014623	TCG	2	6	27074	27079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817302
559	NC_014623	AAC	2	6	27152	27157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817302
560	NC_014623	GCC	2	6	27176	27181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817302
561	NC_014623	CGG	2	6	27208	27213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817302
562	NC_014623	GGA	2	6	27263	27268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817302
563	NC_014623	AGGTAG	2	12	27323	27334	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	310817302
564	NC_014623	CGT	2	6	27370	27375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817302
565	NC_014623	CCA	2	6	27435	27440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817302
566	NC_014623	CAG	2	6	27445	27450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817302
567	NC_014623	CGCC	2	8	27462	27469	0 %	0 %	25 %	75 %	310817302
568	NC_014623	GCT	2	6	27477	27482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817302
569	NC_014623	TCG	2	6	27599	27604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817302
570	NC_014623	GC	3	6	27670	27675	0 %	0 %	50 %	50 %	310817302
571	NC_014623	ACGCC	2	10	27693	27702	20 %	0 %	20 %	60 %	310817302
572	NC_014623	GAA	2	6	27718	27723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817302
573	NC_014623	GCG	2	6	27726	27731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817302
574	NC_014623	CAG	2	6	27760	27765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817302
575	NC_014623	GAC	2	6	27767	27772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817302
576	NC_014623	GGT	2	6	27784	27789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817302
577	NC_014623	CG	3	6	27799	27804	0 %	0 %	50 %	50 %	310817302
578	NC_014623	CAG	2	6	27883	27888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817302
579	NC_014623	AGC	2	6	27959	27964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817302
580	NC_014623	GCT	2	6	27987	27992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817302
581	NC_014623	G	6	6	28030	28035	0 %	0 %	100 %	0 %	310817302
582	NC_014623	CG	3	6	28046	28051	0 %	0 %	50 %	50 %	310817302
583	NC_014623	CGGA	2	8	28081	28088	25 %	0 %	50 %	25 %	310817302
584	NC_014623	GGAC	2	8	28101	28108	25 %	0 %	50 %	25 %	310817302
585	NC_014623	CG	3	6	28127	28132	0 %	0 %	50 %	50 %	310817302
586	NC_014623	A	6	6	28180	28185	100 %	0 %	0 %	0 %	310817302
587	NC_014623	GCA	2	6	28239	28244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817302
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589	NC_014623	ACC	3	9	28278	28286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817302
590	NC_014623	CCA	2	6	28338	28343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817302
591	NC_014623	CCG	2	6	28355	28360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817302
592	NC_014623	GCA	2	6	28365	28370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817302
593	NC_014623	GCC	2	6	28371	28376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817302
594	NC_014623	CGCGT	2	10	28406	28415	0 %	20 %	40 %	40 %	310817302
595	NC_014623	CTC	2	6	28453	28458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817302
596	NC_014623	GC	3	6	28478	28483	0 %	0 %	50 %	50 %	310817302
597	NC_014623	C	6	6	28510	28515	0 %	0 %	0 %	100 %	310817302
598	NC_014623	CGC	2	6	28526	28531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817302
599	NC_014623	GCC	2	6	28532	28537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817302
600	NC_014623	CGA	2	6	28554	28559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817302
601	NC_014623	CAG	2	6	28630	28635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817302
602	NC_014623	CGG	2	6	28670	28675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817302
603	NC_014623	CGG	2	6	28697	28702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817302
604	NC_014623	CCT	2	6	28707	28712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817302
605	NC_014623	CTG	2	6	28768	28773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817302
606	NC_014623	GCC	2	6	28789	28794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817302
607	NC_014623	CGT	2	6	28839	28844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817302
608	NC_014623	CGG	2	6	28923	28928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817302
609	NC_014623	GC	3	6	28938	28943	0 %	0 %	50 %	50 %	310817302
610	NC_014623	AAG	2	6	28955	28960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817302
611	NC_014623	CA	3	6	29129	29134	50 %	0 %	0 %	50 %	310817302
612	NC_014623	TCC	2	6	29219	29224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817302
613	NC_014623	CG	3	6	29251	29256	0 %	0 %	50 %	50 %	310817302
614	NC_014623	CGCC	2	8	29352	29359	0 %	0 %	25 %	75 %	310817302
615	NC_014623	CCA	2	6	29391	29396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817302
616	NC_014623	TCCTC	2	10	29402	29411	0 %	40 %	0 %	60 %	310817302
617	NC_014623	GAG	2	6	29420	29425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817302
618	NC_014623	CGG	2	6	29488	29493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817302
619	NC_014623	C	6	6	29627	29632	0 %	0 %	0 %	100 %	310817302
620	NC_014623	CCA	2	6	29661	29666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817302
621	NC_014623	CGAGCG	2	12	29667	29678	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	310817302
622	NC_014623	GCC	2	6	29711	29716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817302
623	NC_014623	CAC	2	6	29743	29748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817302
624	NC_014623	GCCG	2	8	29750	29757	0 %	0 %	50 %	50 %	310817302
625	NC_014623	CCA	2	6	29773	29778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817302
626	NC_014623	AGG	2	6	29822	29827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817302
627	NC_014623	AG	4	8	29867	29874	50 %	0 %	50 %	0 %	310817302
628	NC_014623	AGC	2	6	29891	29896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817302
629	NC_014623	CCT	2	6	29913	29918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817302
630	NC_014623	CGG	2	6	30021	30026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817302
631	NC_014623	GGC	2	6	30064	30069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817302
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633	NC_014623	GCG	2	6	30209	30214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817302
634	NC_014623	GC	3	6	30220	30225	0 %	0 %	50 %	50 %	310817302
635	NC_014623	CCT	2	6	30282	30287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817302
636	NC_014623	CG	3	6	30337	30342	0 %	0 %	50 %	50 %	310817302
637	NC_014623	CG	3	6	30358	30363	0 %	0 %	50 %	50 %	310817302
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643	NC_014623	GC	3	6	30570	30575	0 %	0 %	50 %	50 %	310817302
644	NC_014623	GCG	2	6	30596	30601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817302
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646	NC_014623	GTT	2	6	30757	30762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310817302
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741	NC_014623	CCAG	2	8	34588	34595	25 %	0 %	25 %	50 %	310817303
742	NC_014623	ACGCC	2	10	34654	34663	20 %	0 %	20 %	60 %	310817303
743	NC_014623	GGT	2	6	34666	34671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817303
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747	NC_014623	GAGCT	2	10	34821	34830	20 %	20 %	40 %	20 %	310817303
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749	NC_014623	G	7	7	34877	34883	0 %	0 %	100 %	0 %	310817303
750	NC_014623	TCC	2	6	34896	34901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817303
751	NC_014623	CGG	2	6	34985	34990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817303
752	NC_014623	TGT	2	6	35011	35016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310817303
753	NC_014623	CACGGC	2	12	35024	35035	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	310817303
754	NC_014623	TCCC	2	8	35083	35090	0 %	25 %	0 %	75 %	310817303
755	NC_014623	CG	3	6	35151	35156	0 %	0 %	50 %	50 %	310817303
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757	NC_014623	CAA	2	6	35210	35215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817303
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