MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 235229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014623	AGG	2	6	251802	251807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817471
5502	NC_014623	GCC	3	9	251838	251846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817471
5503	NC_014623	GCT	2	6	251880	251885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817471
5504	NC_014623	CGG	2	6	251963	251968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817471
5505	NC_014623	CT	3	6	252013	252018	0 %	50 %	0 %	50 %	310817471
5506	NC_014623	TGC	2	6	252032	252037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817471
5507	NC_014623	GGA	3	9	252051	252059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817471
5508	NC_014623	GAG	2	6	252082	252087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817471
5509	NC_014623	TAC	2	6	252100	252105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817471
5510	NC_014623	CGG	2	6	252119	252124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817471
5511	NC_014623	GAG	2	6	252151	252156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817471
5512	NC_014623	CAG	2	6	252190	252195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817471
5513	NC_014623	GGT	2	6	252252	252257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817471
5514	NC_014623	CGG	2	6	252260	252265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817471
5515	NC_014623	ACGG	2	8	252348	252355	25 %	0 %	50 %	25 %	310817471
5516	NC_014623	CAA	2	6	252439	252444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817471
5517	NC_014623	CGG	2	6	252485	252490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817471
5518	NC_014623	G	6	6	252501	252506	0 %	0 %	100 %	0 %	310817471
5519	NC_014623	AAC	2	6	252526	252531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817471
5520	NC_014623	G	6	6	252573	252578	0 %	0 %	100 %	0 %	310817471
5521	NC_014623	G	6	6	252580	252585	0 %	0 %	100 %	0 %	310817471
5522	NC_014623	CAAGT	2	10	252586	252595	40 %	20 %	20 %	20 %	310817471
5523	NC_014623	CAT	2	6	252811	252816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817472
5524	NC_014623	ATG	2	6	252830	252835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817472
5525	NC_014623	GAC	2	6	252862	252867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817472
5526	NC_014623	GTG	2	6	252883	252888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817472
5527	NC_014623	CCT	2	6	252947	252952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817472
5528	NC_014623	G	6	6	253141	253146	0 %	0 %	100 %	0 %	310817472
5529	NC_014623	C	6	6	253176	253181	0 %	0 %	0 %	100 %	310817472
5530	NC_014623	AAGGG	2	10	253217	253226	40 %	0 %	60 %	0 %	310817472
5531	NC_014623	GGC	2	6	253243	253248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817472
5532	NC_014623	CCG	2	6	253281	253286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817472
5533	NC_014623	CTG	2	6	253374	253379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817472
5534	NC_014623	CT	3	6	253382	253387	0 %	50 %	0 %	50 %	310817472
5535	NC_014623	GAT	2	6	253465	253470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817472
5536	NC_014623	GGT	2	6	253510	253515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817472
5537	NC_014623	GGT	2	6	253626	253631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817472
5538	NC_014623	CGC	2	6	253666	253671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817472
5539	NC_014623	GGAT	2	8	253685	253692	25 %	25 %	50 %	0 %	310817472
5540	NC_014623	AC	3	6	253704	253709	50 %	0 %	0 %	50 %	310817472
5541	NC_014623	CTG	2	6	253721	253726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817472
5542	NC_014623	CCA	2	6	253812	253817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817472
5543	NC_014623	CCG	2	6	253899	253904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817472
5544	NC_014623	CG	4	8	253911	253918	0 %	0 %	50 %	50 %	310817472
5545	NC_014623	GCA	2	6	253929	253934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817472
5546	NC_014623	ATC	2	6	253989	253994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817472
5547	NC_014623	CGG	2	6	254013	254018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817472
5548	NC_014623	CGC	2	6	254158	254163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817472
5549	NC_014623	CTC	2	6	254176	254181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817472
5550	NC_014623	GCC	2	6	254242	254247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817472
5551	NC_014623	GCT	2	6	254281	254286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817472
5552	NC_014623	CGG	2	6	254364	254369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817472
5553	NC_014623	CT	3	6	254414	254419	0 %	50 %	0 %	50 %	310817472
5554	NC_014623	TGC	2	6	254433	254438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817472
5555	NC_014623	GGA	3	9	254452	254460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817472
5556	NC_014623	GAG	2	6	254483	254488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817472
5557	NC_014623	TAC	2	6	254501	254506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817472
5558	NC_014623	GGT	2	6	254509	254514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817472
5559	NC_014623	CGG	2	6	254520	254525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817472
5560	NC_014623	CAG	2	6	254591	254596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817472
5561	NC_014623	GGT	2	6	254653	254658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817472
5562	NC_014623	CGG	2	6	254661	254666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817472
5563	NC_014623	ACGG	2	8	254749	254756	25 %	0 %	50 %	25 %	310817472
5564	NC_014623	CAA	2	6	254840	254845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817472
5565	NC_014623	CGG	2	6	254886	254891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817472
5566	NC_014623	G	6	6	254902	254907	0 %	0 %	100 %	0 %	310817472
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5569	NC_014623	G	6	6	254981	254986	0 %	0 %	100 %	0 %	310817472
5570	NC_014623	CAAGT	2	10	254987	254996	40 %	20 %	20 %	20 %	310817472
5571	NC_014623	TCG	2	6	255053	255058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817473
5572	NC_014623	GC	3	6	255060	255065	0 %	0 %	50 %	50 %	310817473
5573	NC_014623	CAG	2	6	255150	255155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817473
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5578	NC_014623	A	7	7	255385	255391	100 %	0 %	0 %	0 %	310817473
5579	NC_014623	TCA	2	6	255451	255456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817473
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5586	NC_014623	ATG	2	6	255734	255739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817474
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5589	NC_014623	TTCG	2	8	256006	256013	0 %	50 %	25 %	25 %	310817474
5590	NC_014623	TGG	2	6	256090	256095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817474
5591	NC_014623	CTTG	2	8	256201	256208	0 %	50 %	25 %	25 %	310817474
5592	NC_014623	CCT	2	6	256229	256234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817474
5593	NC_014623	GCC	2	6	256290	256295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817474
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5600	NC_014623	GGA	2	6	256528	256533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817474
5601	NC_014623	CT	3	6	256560	256565	0 %	50 %	0 %	50 %	310817474
5602	NC_014623	GTG	2	6	256667	256672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817474
5603	NC_014623	CGATG	2	10	256711	256720	20 %	20 %	40 %	20 %	310817474
5604	NC_014623	TCG	2	6	256794	256799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817474
5605	NC_014623	GC	3	6	256816	256821	0 %	0 %	50 %	50 %	310817474
5606	NC_014623	AGC	2	6	256902	256907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817474
5607	NC_014623	CCGG	2	8	257004	257011	0 %	0 %	50 %	50 %	310817474
5608	NC_014623	GCC	2	6	257026	257031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817474
5609	NC_014623	CT	3	6	257078	257083	0 %	50 %	0 %	50 %	310817474
5610	NC_014623	GAA	2	6	257117	257122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817474
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5612	NC_014623	GAG	2	6	257147	257152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817474
5613	NC_014623	TAC	2	6	257165	257170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817474
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5620	NC_014623	ACGG	2	8	257413	257420	25 %	0 %	50 %	25 %	310817474
5621	NC_014623	GC	3	6	257499	257504	0 %	0 %	50 %	50 %	310817474
5622	NC_014623	GCT	2	6	257510	257515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817474
5623	NC_014623	CGG	2	6	257550	257555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817474
5624	NC_014623	G	6	6	257566	257571	0 %	0 %	100 %	0 %	310817474
5625	NC_014623	TGG	2	6	257583	257588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817474
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5627	NC_014623	T	6	6	257744	257749	0 %	100 %	0 %	0 %	310817475
5628	NC_014623	GCGG	2	8	257752	257759	0 %	0 %	75 %	25 %	310817475
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5635	NC_014623	CT	3	6	258236	258241	0 %	50 %	0 %	50 %	310817475
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5639	NC_014623	TTC	2	6	258367	258372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817476
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5642	NC_014623	GGA	2	6	258468	258473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817476
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5644	NC_014623	G	6	6	258522	258527	0 %	0 %	100 %	0 %	310817476
5645	NC_014623	GC	3	6	258560	258565	0 %	0 %	50 %	50 %	310817476
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5648	NC_014623	G	6	6	258693	258698	0 %	0 %	100 %	0 %	310817476
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5664	NC_014623	ATCAC	2	10	259370	259379	40 %	20 %	0 %	40 %	310817477
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5736	NC_014623	CG	3	6	263998	264003	0 %	0 %	50 %	50 %	310817482
5737	NC_014623	GCAT	2	8	264017	264024	25 %	25 %	25 %	25 %	310817482
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5988	NC_014623	GCG	2	6	275083	275088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817495
5989	NC_014623	CG	3	6	275098	275103	0 %	0 %	50 %	50 %	310817495
5990	NC_014623	GCT	2	6	275132	275137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817495
5991	NC_014623	CGG	2	6	275221	275226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817495
5992	NC_014623	CGG	2	6	275251	275256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817495
5993	NC_014623	CGA	2	6	275302	275307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817495
5994	NC_014623	TGG	2	6	275326	275331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817495
5995	NC_014623	CGG	2	6	275359	275364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817495
5996	NC_014623	TGGCGC	3	18	275377	275394	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	310817495
5997	NC_014623	CGG	2	6	275406	275411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817495
5998	NC_014623	G	6	6	275449	275454	0 %	0 %	100 %	0 %	310817495
5999	NC_014623	TGC	2	6	275479	275484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817495
6000	NC_014623	TGC	2	6	275530	275535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817495

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