MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 235229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014623	GCC	2	6	228913	228918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817454
5002	NC_014623	GCG	2	6	229037	229042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817454
5003	NC_014623	CG	3	6	229101	229106	0 %	0 %	50 %	50 %	310817454
5004	NC_014623	ACC	2	6	229112	229117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817454
5005	NC_014623	GC	3	6	229134	229139	0 %	0 %	50 %	50 %	310817454
5006	NC_014623	GCC	2	6	229159	229164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817454
5007	NC_014623	GCC	2	6	229270	229275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817454
5008	NC_014623	GCT	2	6	229423	229428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817455
5009	NC_014623	CGA	2	6	229429	229434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817455
5010	NC_014623	CCA	2	6	229440	229445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817455
5011	NC_014623	CGA	2	6	229450	229455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817455
5012	NC_014623	TGA	2	6	229464	229469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817455
5013	NC_014623	GAA	2	6	229483	229488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817455
5014	NC_014623	CCG	2	6	229491	229496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817455
5015	NC_014623	CAG	2	6	229529	229534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817455
5016	NC_014623	CGT	2	6	229642	229647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817455
5017	NC_014623	CTGG	2	8	229651	229658	0 %	25 %	50 %	25 %	310817455
5018	NC_014623	CTG	2	6	229667	229672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817455
5019	NC_014623	TGG	2	6	229674	229679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817455
5020	NC_014623	CAC	2	6	229757	229762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817455
5021	NC_014623	TCG	2	6	229803	229808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817455
5022	NC_014623	CGG	2	6	229860	229865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817455
5023	NC_014623	ATC	2	6	229868	229873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817455
5024	NC_014623	CGT	2	6	229888	229893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817455
5025	NC_014623	TGC	2	6	229926	229931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817455
5026	NC_014623	TGA	2	6	229947	229952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817455
5027	NC_014623	TGG	2	6	229971	229976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817455
5028	NC_014623	CGA	2	6	229993	229998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817455
5029	NC_014623	GC	3	6	230042	230047	0 %	0 %	50 %	50 %	310817455
5030	NC_014623	CG	3	6	230052	230057	0 %	0 %	50 %	50 %	310817455
5031	NC_014623	GGC	2	6	230144	230149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817455
5032	NC_014623	CACG	2	8	230155	230162	25 %	0 %	25 %	50 %	310817455
5033	NC_014623	GC	3	6	230203	230208	0 %	0 %	50 %	50 %	310817455
5034	NC_014623	TGC	2	6	230235	230240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817455
5035	NC_014623	CGC	2	6	230250	230255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817455
5036	NC_014623	GGCG	2	8	230284	230291	0 %	0 %	75 %	25 %	310817455
5037	NC_014623	GTG	2	6	230306	230311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817455
5038	NC_014623	TGC	2	6	230328	230333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817455
5039	NC_014623	CGA	2	6	230483	230488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817456
5040	NC_014623	GCC	2	6	230501	230506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817456
5041	NC_014623	GCG	2	6	230547	230552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817456
5042	NC_014623	TCT	2	6	230553	230558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817456
5043	NC_014623	GCA	2	6	230593	230598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817456
5044	NC_014623	CCT	2	6	230601	230606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817456
5045	NC_014623	CGC	2	6	230625	230630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817456
5046	NC_014623	CGC	2	6	230710	230715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817456
5047	NC_014623	GAG	2	6	230783	230788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817456
5048	NC_014623	CCG	2	6	230808	230813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817456
5049	NC_014623	CGG	2	6	230906	230911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817456
5050	NC_014623	TGC	2	6	230913	230918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817456
5051	NC_014623	C	8	8	230937	230944	0 %	0 %	0 %	100 %	310817456
5052	NC_014623	CCGG	2	8	231085	231092	0 %	0 %	50 %	50 %	310817456
5053	NC_014623	GCTC	2	8	231096	231103	0 %	25 %	25 %	50 %	310817456
5054	NC_014623	AGG	2	6	231105	231110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817456
5055	NC_014623	G	6	6	231120	231125	0 %	0 %	100 %	0 %	310817456
5056	NC_014623	ACT	2	6	231141	231146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817456
5057	NC_014623	GC	3	6	231194	231199	0 %	0 %	50 %	50 %	310817456
5058	NC_014623	TGA	2	6	231204	231209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817456
5059	NC_014623	CCG	2	6	231226	231231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817456
5060	NC_014623	CG	3	6	231299	231304	0 %	0 %	50 %	50 %	310817456
5061	NC_014623	AGC	2	6	231414	231419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817456
5062	NC_014623	GCCAC	2	10	231495	231504	20 %	0 %	20 %	60 %	310817456
5063	NC_014623	CAT	2	6	231613	231618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817456
5064	NC_014623	CCT	2	6	231643	231648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817456
5065	NC_014623	CGC	2	6	231715	231720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817456
5066	NC_014623	ACT	2	6	231729	231734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817456
5067	NC_014623	GCT	2	6	231739	231744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817456
5068	NC_014623	GAG	2	6	231767	231772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817456
5069	NC_014623	TCG	2	6	231783	231788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817456
5070	NC_014623	CACC	2	8	231811	231818	25 %	0 %	0 %	75 %	310817456
5071	NC_014623	CGGA	2	8	231854	231861	25 %	0 %	50 %	25 %	310817456
5072	NC_014623	TGGG	2	8	231886	231893	0 %	25 %	75 %	0 %	310817457
5073	NC_014623	CTC	2	6	231941	231946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817457
5074	NC_014623	GAG	2	6	231951	231956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817457
5075	NC_014623	CCGC	2	8	231969	231976	0 %	0 %	25 %	75 %	310817457
5076	NC_014623	TCT	2	6	232001	232006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817457
5077	NC_014623	GC	3	6	232023	232028	0 %	0 %	50 %	50 %	310817457
5078	NC_014623	CAA	2	6	232037	232042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817457
5079	NC_014623	CCG	2	6	232072	232077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817457
5080	NC_014623	GCG	2	6	232086	232091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817457
5081	NC_014623	GGA	2	6	232103	232108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817457
5082	NC_014623	GCG	2	6	232171	232176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817457
5083	NC_014623	ACA	2	6	232186	232191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817457
5084	NC_014623	TGCC	2	8	232210	232217	0 %	25 %	25 %	50 %	310817457
5085	NC_014623	CGAT	2	8	232282	232289	25 %	25 %	25 %	25 %	310817457
5086	NC_014623	CAC	2	6	232292	232297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817457
5087	NC_014623	GCC	2	6	232345	232350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817457
5088	NC_014623	TGG	2	6	232351	232356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817457
5089	NC_014623	AGG	2	6	232378	232383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817457
5090	NC_014623	GA	3	6	232415	232420	50 %	0 %	50 %	0 %	310817457
5091	NC_014623	CGG	2	6	232426	232431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817457
5092	NC_014623	TTC	2	6	232446	232451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817457
5093	NC_014623	AGC	2	6	232479	232484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817457
5094	NC_014623	GCC	2	6	232512	232517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817457
5095	NC_014623	GTCCT	2	10	232527	232536	0 %	40 %	20 %	40 %	310817457
5096	NC_014623	CCG	2	6	232537	232542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817457
5097	NC_014623	TCT	3	9	232549	232557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817457
5098	NC_014623	CAA	2	6	232582	232587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817458
5099	NC_014623	GCG	2	6	232634	232639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817458
5100	NC_014623	AGC	2	6	232707	232712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817458
5101	NC_014623	G	6	6	232714	232719	0 %	0 %	100 %	0 %	310817458
5102	NC_014623	CCG	2	6	232723	232728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817458
5103	NC_014623	GTG	2	6	232763	232768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817458
5104	NC_014623	G	8	8	232777	232784	0 %	0 %	100 %	0 %	310817458
5105	NC_014623	ATC	2	6	232790	232795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817458
5106	NC_014623	CTG	2	6	232802	232807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817458
5107	NC_014623	GC	3	6	232813	232818	0 %	0 %	50 %	50 %	310817458
5108	NC_014623	CG	3	6	232898	232903	0 %	0 %	50 %	50 %	310817458
5109	NC_014623	TGG	2	6	232995	233000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817458
5110	NC_014623	CCA	2	6	233001	233006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817458
5111	NC_014623	GT	3	6	233092	233097	0 %	50 %	50 %	0 %	310817458
5112	NC_014623	TTCCCA	2	12	233121	233132	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	310817458
5113	NC_014623	CGA	2	6	233173	233178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817458
5114	NC_014623	ACCC	2	8	233213	233220	25 %	0 %	0 %	75 %	310817458
5115	NC_014623	CG	3	6	233274	233279	0 %	0 %	50 %	50 %	310817458
5116	NC_014623	CGG	2	6	233297	233302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817458
5117	NC_014623	GGTC	2	8	233325	233332	0 %	25 %	50 %	25 %	310817458
5118	NC_014623	CGC	2	6	233353	233358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817458
5119	NC_014623	AGC	2	6	233379	233384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817458
5120	NC_014623	TGC	2	6	233439	233444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817458
5121	NC_014623	CGCGG	2	10	233500	233509	0 %	0 %	60 %	40 %	310817458
5122	NC_014623	GGC	2	6	233557	233562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817458
5123	NC_014623	CTG	2	6	233573	233578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817458
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5144	NC_014623	CG	3	6	234582	234587	0 %	0 %	50 %	50 %	310817459
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5240	NC_014623	AGC	2	6	238422	238427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817462
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5242	NC_014623	TGG	2	6	238470	238475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817462
5243	NC_014623	GC	3	6	238535	238540	0 %	0 %	50 %	50 %	310817462
5244	NC_014623	GC	3	6	238619	238624	0 %	0 %	50 %	50 %	310817462
5245	NC_014623	GACA	2	8	238635	238642	50 %	0 %	25 %	25 %	310817462
5246	NC_014623	CAG	2	6	238649	238654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817462
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5248	NC_014623	CGG	2	6	238837	238842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817462
5249	NC_014623	CGG	2	6	238867	238872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817462
5250	NC_014623	CGG	2	6	238902	238907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817462
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5252	NC_014623	CGAG	2	8	238927	238934	25 %	0 %	50 %	25 %	310817462
5253	NC_014623	GCCAG	2	10	238975	238984	20 %	0 %	40 %	40 %	310817462
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5320	NC_014623	TGC	2	6	242259	242264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817464
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5354	NC_014623	GT	3	6	243484	243489	0 %	50 %	50 %	0 %	310817465
5355	NC_014623	CGG	2	6	243499	243504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817465
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5359	NC_014623	TCTCC	2	10	243637	243646	0 %	40 %	0 %	60 %	310817466
5360	NC_014623	GC	3	6	243651	243656	0 %	0 %	50 %	50 %	310817466
5361	NC_014623	CGC	2	6	243700	243705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817466
5362	NC_014623	CACG	2	8	243706	243713	25 %	0 %	25 %	50 %	310817466
5363	NC_014623	GTG	2	6	243733	243738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817466
5364	NC_014623	CCAA	2	8	243741	243748	50 %	0 %	0 %	50 %	310817466
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5367	NC_014623	CTG	2	6	243842	243847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817466
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5370	NC_014623	CG	3	6	243974	243979	0 %	0 %	50 %	50 %	310817466
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5395	NC_014623	CCG	2	6	245184	245189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817467
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5488	NC_014623	GGC	3	9	250971	250979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817471
5489	NC_014623	TGGC	2	8	251137	251144	0 %	25 %	50 %	25 %	310817471
5490	NC_014623	GCC	2	6	251163	251168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817471
5491	NC_014623	GGA	2	6	251250	251255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817471
5492	NC_014623	GGC	2	6	251271	251276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817471
5493	NC_014623	GCT	2	6	251322	251327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817471
5494	NC_014623	GGA	2	6	251341	251346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817471
5495	NC_014623	GGTG	2	8	251387	251394	0 %	25 %	75 %	0 %	310817471
5496	NC_014623	TCCA	2	8	251536	251543	25 %	25 %	0 %	50 %	310817471
5497	NC_014623	GCA	2	6	251564	251569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817471
5498	NC_014623	CCCGG	2	10	251592	251601	0 %	0 %	40 %	60 %	310817471
5499	NC_014623	TGT	2	6	251606	251611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310817471
5500	NC_014623	TCG	2	6	251729	251734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817471

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