MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 235229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014623	GCG	2	6	204857	204862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817435
4502	NC_014623	GCT	3	9	204876	204884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817435
4503	NC_014623	GGC	2	6	204913	204918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817435
4504	NC_014623	CCT	2	6	204978	204983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817435
4505	NC_014623	GC	3	6	205010	205015	0 %	0 %	50 %	50 %	310817435
4506	NC_014623	CGGC	2	8	205034	205041	0 %	0 %	50 %	50 %	310817435
4507	NC_014623	TCC	2	6	205130	205135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817435
4508	NC_014623	CCCGG	2	10	205165	205174	0 %	0 %	40 %	60 %	310817435
4509	NC_014623	CCA	2	6	205194	205199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817435
4510	NC_014623	CGCGCA	2	12	205212	205223	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	310817435
4511	NC_014623	AGG	2	6	205233	205238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817435
4512	NC_014623	GGC	2	6	205246	205251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817435
4513	NC_014623	CCA	2	6	205287	205292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817435
4514	NC_014623	GGC	3	9	205303	205311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817435
4515	NC_014623	TCG	3	9	205328	205336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817435
4516	NC_014623	GGC	2	6	205393	205398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817435
4517	NC_014623	CGG	2	6	205403	205408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817435
4518	NC_014623	GGC	2	6	205411	205416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817435
4519	NC_014623	GC	3	6	205454	205459	0 %	0 %	50 %	50 %	310817435
4520	NC_014623	GGC	2	6	205525	205530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817435
4521	NC_014623	CAG	2	6	205531	205536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817435
4522	NC_014623	GGC	2	6	205600	205605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817435
4523	NC_014623	CGG	2	6	205679	205684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817435
4524	NC_014623	GC	3	6	205743	205748	0 %	0 %	50 %	50 %	310817435
4525	NC_014623	GCA	2	6	205764	205769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817435
4526	NC_014623	CCA	2	6	205818	205823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817435
4527	NC_014623	CG	3	6	205864	205869	0 %	0 %	50 %	50 %	310817435
4528	NC_014623	CAG	2	6	205870	205875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817435
4529	NC_014623	G	6	6	205890	205895	0 %	0 %	100 %	0 %	310817435
4530	NC_014623	TGC	2	6	205932	205937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817435
4531	NC_014623	GCG	2	6	205970	205975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817435
4532	NC_014623	ACGG	2	8	205982	205989	25 %	0 %	50 %	25 %	310817435
4533	NC_014623	GAG	2	6	206036	206041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817435
4534	NC_014623	GCG	2	6	206051	206056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817435
4535	NC_014623	GCC	2	6	206058	206063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817435
4536	NC_014623	CGG	2	6	206070	206075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817435
4537	NC_014623	GCGCG	2	10	206103	206112	0 %	0 %	60 %	40 %	310817435
4538	NC_014623	G	6	6	206124	206129	0 %	0 %	100 %	0 %	310817435
4539	NC_014623	CTC	2	6	206131	206136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817435
4540	NC_014623	GCG	2	6	206159	206164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817435
4541	NC_014623	ACGG	2	8	206167	206174	25 %	0 %	50 %	25 %	310817435
4542	NC_014623	GTC	2	6	206182	206187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817435
4543	NC_014623	GGGC	2	8	206210	206217	0 %	0 %	75 %	25 %	310817435
4544	NC_014623	GGC	2	6	206248	206253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817435
4545	NC_014623	GC	4	8	206256	206263	0 %	0 %	50 %	50 %	310817435
4546	NC_014623	CCG	2	6	206265	206270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817435
4547	NC_014623	GAG	2	6	206282	206287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817435
4548	NC_014623	CTC	2	6	206320	206325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817435
4549	NC_014623	GCG	2	6	206330	206335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817435
4550	NC_014623	CGG	2	6	206346	206351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817435
4551	NC_014623	CGG	2	6	206357	206362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817435
4552	NC_014623	AGCCG	2	10	206412	206421	20 %	0 %	40 %	40 %	310817435
4553	NC_014623	CCG	2	6	206480	206485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817435
4554	NC_014623	G	6	6	206530	206535	0 %	0 %	100 %	0 %	310817435
4555	NC_014623	TGC	2	6	206562	206567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817435
4556	NC_014623	GCG	2	6	206590	206595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817435
4557	NC_014623	TCG	2	6	206597	206602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817435
4558	NC_014623	CGG	2	6	206634	206639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817435
4559	NC_014623	CCT	2	6	206658	206663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817435
4560	NC_014623	ACCGG	2	10	206708	206717	20 %	0 %	40 %	40 %	310817435
4561	NC_014623	CG	3	6	206739	206744	0 %	0 %	50 %	50 %	310817435
4562	NC_014623	GATGCG	2	12	206776	206787	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	310817435
4563	NC_014623	GC	3	6	206840	206845	0 %	0 %	50 %	50 %	310817435
4564	NC_014623	GAC	2	6	206905	206910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817435
4565	NC_014623	GTT	2	6	206941	206946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310817435
4566	NC_014623	AGCGAC	2	12	206950	206961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817435
4567	NC_014623	CCAT	2	8	207038	207045	25 %	25 %	0 %	50 %	310817435
4568	NC_014623	GCC	2	6	207097	207102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817435
4569	NC_014623	CGG	2	6	207219	207224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817435
4570	NC_014623	TTG	2	6	207251	207256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310817435
4571	NC_014623	GCG	2	6	207257	207262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817435
4572	NC_014623	CTG	2	6	207281	207286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817435
4573	NC_014623	CG	3	6	207299	207304	0 %	0 %	50 %	50 %	310817435
4574	NC_014623	CCG	2	6	207305	207310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817435
4575	NC_014623	GAG	2	6	207313	207318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817435
4576	NC_014623	CTC	2	6	207666	207671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817436
4577	NC_014623	GTCCT	2	10	207675	207684	0 %	40 %	20 %	40 %	310817436
4578	NC_014623	CGCC	2	8	207697	207704	0 %	0 %	25 %	75 %	310817436
4579	NC_014623	CCA	2	6	207815	207820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817436
4580	NC_014623	GCCGG	2	10	207896	207905	0 %	0 %	60 %	40 %	310817436
4581	NC_014623	ACT	2	6	207913	207918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817436
4582	NC_014623	AAC	2	6	208002	208007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817436
4583	NC_014623	CAT	2	6	208034	208039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817436
4584	NC_014623	CGG	3	9	208085	208093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817436
4585	NC_014623	CCG	2	6	208121	208126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817436
4586	NC_014623	GC	3	6	208142	208147	0 %	0 %	50 %	50 %	310817436
4587	NC_014623	GGC	2	6	208214	208219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817436
4588	NC_014623	AAC	2	6	208350	208355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817436
4589	NC_014623	CAC	2	6	208448	208453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817436
4590	NC_014623	G	6	6	208454	208459	0 %	0 %	100 %	0 %	310817436
4591	NC_014623	CAA	2	6	208514	208519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817436
4592	NC_014623	CCA	3	9	208562	208570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817436
4593	NC_014623	CGCGGC	2	12	208625	208636	0 %	0 %	50 %	50 %	310817436
4594	NC_014623	CCCCG	2	10	208697	208706	0 %	0 %	20 %	80 %	310817436
4595	NC_014623	CCA	2	6	208759	208764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817436
4596	NC_014623	GTG	3	9	208767	208775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817436
4597	NC_014623	CCA	2	6	208795	208800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817436
4598	NC_014623	CG	3	6	208858	208863	0 %	0 %	50 %	50 %	310817436
4599	NC_014623	CCT	2	6	208891	208896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817436
4600	NC_014623	CCG	2	6	208900	208905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817436
4601	NC_014623	GCG	2	6	208998	209003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817437
4602	NC_014623	GGC	2	6	209011	209016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817437
4603	NC_014623	GCC	2	6	209078	209083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817437
4604	NC_014623	GCC	2	6	209114	209119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817437
4605	NC_014623	TGG	2	6	209157	209162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817437
4606	NC_014623	GCC	2	6	209176	209181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817437
4607	NC_014623	AGGACG	2	12	209201	209212	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	310817437
4608	NC_014623	GCG	2	6	209245	209250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817437
4609	NC_014623	CCA	2	6	209355	209360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817437
4610	NC_014623	CCG	2	6	209542	209547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817437
4611	NC_014623	GACA	2	8	209585	209592	50 %	0 %	25 %	25 %	310817437
4612	NC_014623	CCCGT	2	10	209640	209649	0 %	20 %	20 %	60 %	310817437
4613	NC_014623	GCC	2	6	209651	209656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817437
4614	NC_014623	GAC	2	6	209686	209691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817437
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4616	NC_014623	CG	3	6	209814	209819	0 %	0 %	50 %	50 %	310817437
4617	NC_014623	AGC	2	6	209888	209893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817437
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4619	NC_014623	CGG	2	6	210280	210285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817438
4620	NC_014623	CG	3	6	210286	210291	0 %	0 %	50 %	50 %	310817438
4621	NC_014623	CGC	2	6	210335	210340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817438
4622	NC_014623	GCA	2	6	210373	210378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817438
4623	NC_014623	GC	3	6	210392	210397	0 %	0 %	50 %	50 %	310817438
4624	NC_014623	CGC	3	9	210395	210403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817438
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4633	NC_014623	GCG	3	9	210522	210530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817438
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4730	NC_014623	C	6	6	214833	214838	0 %	0 %	0 %	100 %	310817442
4731	NC_014623	TGG	2	6	214849	214854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817442
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4733	NC_014623	CA	4	8	214936	214943	50 %	0 %	0 %	50 %	310817442
4734	NC_014623	GCA	2	6	214978	214983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817442
4735	NC_014623	GCA	2	6	214990	214995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817442
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4737	NC_014623	GAG	2	6	215089	215094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817443
4738	NC_014623	GCG	4	12	215147	215158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817443
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4741	NC_014623	GCAC	2	8	215408	215415	25 %	0 %	25 %	50 %	310817443
4742	NC_014623	CGA	2	6	215448	215453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817443
4743	NC_014623	CTC	2	6	215476	215481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817443
4744	NC_014623	GGC	2	6	215510	215515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817443
4745	NC_014623	ACC	2	6	215543	215548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817443
4746	NC_014623	CG	3	6	215624	215629	0 %	0 %	50 %	50 %	310817443
4747	NC_014623	GGT	2	6	215631	215636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817443
4748	NC_014623	CGA	2	6	215637	215642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817443
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4757	NC_014623	GTC	2	6	215965	215970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817443
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4764	NC_014623	G	6	6	216286	216291	0 %	0 %	100 %	0 %	310817443
4765	NC_014623	TCG	2	6	216338	216343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817443
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4771	NC_014623	CAC	2	6	216634	216639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817443
4772	NC_014623	CGG	2	6	216693	216698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817443
4773	NC_014623	GGT	2	6	216763	216768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817443
4774	NC_014623	CG	3	6	216776	216781	0 %	0 %	50 %	50 %	310817443
4775	NC_014623	GCG	3	9	216800	216808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817443
4776	NC_014623	CCGGGC	2	12	216817	216828	0 %	0 %	50 %	50 %	310817443
4777	NC_014623	GC	3	6	216842	216847	0 %	0 %	50 %	50 %	310817443
4778	NC_014623	TCG	2	6	216870	216875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817443
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4855	NC_014623	GCA	2	6	221215	221220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817446
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4859	NC_014623	GCT	2	6	221326	221331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817446
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4861	NC_014623	CTG	2	6	221372	221377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817446
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4863	NC_014623	CAG	2	6	221390	221395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817446
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4865	NC_014623	AGC	2	6	221512	221517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817446
4866	NC_014623	CG	3	6	221519	221524	0 %	0 %	50 %	50 %	310817446
4867	NC_014623	GCT	3	9	221545	221553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817446
4868	NC_014623	GCC	2	6	221657	221662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817446
4869	NC_014623	GCGA	2	8	221708	221715	25 %	0 %	50 %	25 %	310817446
4870	NC_014623	GTC	2	6	221761	221766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817446
4871	NC_014623	CACCC	2	10	221801	221810	20 %	0 %	0 %	80 %	310817446
4872	NC_014623	CCAC	2	8	221894	221901	25 %	0 %	0 %	75 %	310817446
4873	NC_014623	C	6	6	221908	221913	0 %	0 %	0 %	100 %	310817446
4874	NC_014623	GCGGA	2	10	222079	222088	20 %	0 %	60 %	20 %	310817446
4875	NC_014623	CCT	3	9	222091	222099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817446
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4877	NC_014623	TGG	2	6	222124	222129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817446
4878	NC_014623	T	6	6	222293	222298	0 %	100 %	0 %	0 %	310817447
4879	NC_014623	GCC	2	6	222368	222373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817447
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4882	NC_014623	CA	3	6	222450	222455	50 %	0 %	0 %	50 %	310817447
4883	NC_014623	GGT	2	6	222574	222579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817447
4884	NC_014623	GCT	2	6	222631	222636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817447
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4888	NC_014623	TGA	3	9	223152	223160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817448
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4895	NC_014623	TG	3	6	223294	223299	0 %	50 %	50 %	0 %	310817448
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4898	NC_014623	TGC	2	6	223342	223347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817448
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4940	NC_014623	TGG	2	6	225744	225749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817451
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4944	NC_014623	TGG	2	6	225820	225825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817451
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4957	NC_014623	CAGCCA	2	12	226755	226766	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	310817452
4958	NC_014623	TGCA	2	8	226804	226811	25 %	25 %	25 %	25 %	310817452
4959	NC_014623	ACC	2	6	226989	226994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817453
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4962	NC_014623	TG	3	6	227161	227166	0 %	50 %	50 %	0 %	310817453
4963	NC_014623	CCT	2	6	227170	227175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817453
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4969	NC_014623	CG	3	6	227761	227766	0 %	0 %	50 %	50 %	310817454
4970	NC_014623	CGGG	2	8	227768	227775	0 %	0 %	75 %	25 %	310817454
4971	NC_014623	GAA	2	6	227784	227789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817454
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4975	NC_014623	AGG	2	6	227954	227959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817454
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4982	NC_014623	ATC	2	6	228241	228246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817454
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4984	NC_014623	GCC	2	6	228373	228378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817454
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4987	NC_014623	CCG	2	6	228479	228484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817454
4988	NC_014623	CG	3	6	228503	228508	0 %	0 %	50 %	50 %	310817454
4989	NC_014623	TCGC	2	8	228680	228687	0 %	25 %	25 %	50 %	310817454
4990	NC_014623	CG	3	6	228711	228716	0 %	0 %	50 %	50 %	310817454
4991	NC_014623	CTCC	2	8	228717	228724	0 %	25 %	0 %	75 %	310817454
4992	NC_014623	CGC	2	6	228729	228734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817454
4993	NC_014623	CCG	2	6	228740	228745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817454
4994	NC_014623	GCTCG	2	10	228759	228768	0 %	20 %	40 %	40 %	310817454
4995	NC_014623	TAC	2	6	228772	228777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817454
4996	NC_014623	TGG	2	6	228809	228814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817454
4997	NC_014623	GCCC	2	8	228849	228856	0 %	0 %	25 %	75 %	310817454
4998	NC_014623	GTG	2	6	228862	228867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817454
4999	NC_014623	TGG	2	6	228869	228874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817454
5000	NC_014623	GGA	2	6	228894	228899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817454

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