MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae 670-6B chromosome

Total Repeats: 825

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014498	GAAATG	2	12	338	349	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307126152
2	NC_014498	TAAATC	2	12	3568	3579	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	307126155
3	NC_014498	AAATAC	2	12	5585	5596	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	307126157
4	NC_014498	CTCTGC	2	12	13543	13554	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	307126173
5	NC_014498	CAAAGC	2	12	17791	17802	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	307126177
6	NC_014498	ATTGGA	2	12	20531	20542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126179
7	NC_014498	TTGCAA	2	12	20820	20831	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307126180
8	NC_014498	TGCTTA	2	12	23467	23478	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	307126180
9	NC_014498	GCTAAC	2	12	23708	23719	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	307126180
10	NC_014498	TTGATT	2	12	24642	24653	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	307126182
11	NC_014498	AGTTGA	2	12	37072	37083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126193
12	NC_014498	TTCTTG	2	12	40481	40492	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	307126196
13	NC_014498	ACTTTT	2	12	40550	40561	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	307126196
14	NC_014498	CCTGAT	2	12	44677	44688	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	307126204
15	NC_014498	ATAAGA	2	12	45056	45067	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307126204
16	NC_014498	ATAAGA	2	12	45083	45094	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307126204
17	NC_014498	ACCTTT	2	12	47005	47016	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	307126208
18	NC_014498	ATTGAG	2	12	49130	49141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126213
19	NC_014498	AAAAAG	2	12	53207	53218	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	307126224
20	NC_014498	GGATAT	2	12	58925	58936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126229
21	NC_014498	GCATCA	2	12	62050	62061	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	307126237
22	NC_014498	GATTGA	2	12	66188	66199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126241
23	NC_014498	ATTTGG	2	12	68741	68752	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	307126242
24	NC_014498	TTTGGA	2	12	70407	70418	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	307126242
25	NC_014498	CATTTA	2	12	71166	71177	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	307126242
26	NC_014498	AGGTTG	2	12	72870	72881	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	307126242
27	NC_014498	CGGTAG	2	12	74212	74223	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	307126242
28	NC_014498	ACTGGT	2	12	76630	76641	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307126248
29	NC_014498	AGGTTG	2	12	79662	79673	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	307126253
30	NC_014498	TTGTTT	2	12	81887	81898	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	307126255
31	NC_014498	AAAATT	2	12	81918	81929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307126255
32	NC_014498	CGATTG	2	12	85907	85918	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307126259
33	NC_014498	TTCCTT	2	12	89187	89198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126262
34	NC_014498	AGGATA	2	12	94728	94739	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307126271
35	NC_014498	TCAATC	2	12	96057	96068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126271
36	NC_014498	TTACTG	2	12	106440	106451	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	307126278
37	NC_014498	GTTTCT	2	12	116741	116752	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	307126286
38	NC_014498	TTCCTT	2	12	117822	117833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126287
39	NC_014498	TTGCAG	2	12	121974	121985	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307126291
40	NC_014498	TCTTGC	2	12	123550	123561	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	307126293
41	NC_014498	GACTTG	2	12	123954	123965	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307126293
42	NC_014498	ACATCA	2	12	133600	133611	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	307126307
43	NC_014498	GCTTGC	2	12	134792	134803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307126307
44	NC_014498	TACAGG	2	12	137017	137028	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307126310
45	NC_014498	AAAAAC	2	12	137118	137129	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	307126310
46	NC_014498	TGGTTG	2	12	140726	140737	0 %	50 %	50 %	0 %	307126314
47	NC_014498	TTTTGA	2	12	144419	144430	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	307126317
48	NC_014498	AAGCAG	2	12	144947	144958	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	307126317
49	NC_014498	AAGGAA	2	12	149809	149820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126323
50	NC_014498	ACAATA	2	12	150473	150484	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	307126323
51	NC_014498	CATCTC	2	12	162143	162154	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	307126336
52	NC_014498	AGTTGA	2	12	162262	162273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126336
53	NC_014498	TTATCT	2	12	170186	170197	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	307126344
54	NC_014498	TTTTAT	2	12	171455	171466	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307126347
55	NC_014498	TAACAA	2	12	171950	171961	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	307126347
56	NC_014498	CTCCAG	2	12	176117	176128	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	307126351
57	NC_014498	TCAGGG	2	12	185492	185503	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	307126361
58	NC_014498	ATAAAT	2	12	188836	188847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307126365
59	NC_014498	GAAGCA	2	12	195098	195109	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	307126371
60	NC_014498	GTTTTA	2	12	197567	197578	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	307126374
61	NC_014498	TCAGGT	2	12	208178	208189	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307126386
62	NC_014498	ATTTTT	2	12	215271	215282	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307126394
63	NC_014498	ATTGAG	2	12	220989	221000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126400
64	NC_014498	TTCGGA	2	12	221119	221130	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307126400
65	NC_014498	ATTGAA	2	12	221520	221531	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	307126400
66	NC_014498	AACAAG	2	12	224742	224753	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	307126402
67	NC_014498	TGCACT	2	12	230254	230265	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	307126409
68	NC_014498	CAATAT	2	12	231734	231745	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	307126410
69	NC_014498	TGTTCG	2	12	232525	232536	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	307126411
70	NC_014498	ACTTGG	2	12	233322	233333	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307126411
71	NC_014498	ACCACG	2	12	239113	239124	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	307126417
72	NC_014498	GCAGAC	2	12	239972	239983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307126418
73	NC_014498	ACAAGA	2	12	247446	247457	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	307126424
74	NC_014498	TAAAGG	2	12	250338	250349	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307126429
75	NC_014498	GCAATC	2	12	252926	252937	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	307126434
76	NC_014498	ACATCA	2	12	253473	253484	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	307126435
77	NC_014498	TAAAGG	2	12	257724	257735	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307126444
78	NC_014498	AAATTA	2	12	258763	258774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307126447
79	NC_014498	ACTTGG	2	12	258830	258841	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307126447
80	NC_014498	TTGAAG	2	12	261771	261782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126451
81	NC_014498	GTAAAG	2	12	262454	262465	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307126452
82	NC_014498	AAACTC	2	12	263829	263840	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	307126454
83	NC_014498	AGATAA	2	12	267931	267942	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307126459
84	NC_014498	CATAAT	2	12	269999	270010	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	307126461
85	NC_014498	TATCTG	2	12	275272	275283	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	307126468
86	NC_014498	CCAATT	2	12	282372	282383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126472
87	NC_014498	TGAAAT	2	12	283403	283414	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	307126472
88	NC_014498	TGTCAA	2	12	293009	293020	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307126481
89	NC_014498	TGCCTT	2	12	295421	295432	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	307126483
90	NC_014498	GTTGCT	2	12	300013	300024	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	307126486
91	NC_014498	GCAAGA	2	12	303904	303915	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	307126489
92	NC_014498	ATTCGA	2	12	305302	305313	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307126489
93	NC_014498	GTCAGT	2	12	308707	308718	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307126490
94	NC_014498	CGATAC	2	12	318999	319010	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	307126501
95	NC_014498	TCTTTT	2	12	322914	322925	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	307126506
96	NC_014498	TTTTGG	2	12	323439	323450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126507
97	NC_014498	TCTTGT	2	12	328753	328764	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	307126514
98	NC_014498	GAATTA	2	12	329260	329271	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	307126515
99	NC_014498	AAAAGG	2	12	331387	331398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126518
100	NC_014498	TATTCC	2	12	331570	331581	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	307126518
101	NC_014498	AAAGCT	2	12	337692	337703	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	307126524
102	NC_014498	GATAAA	2	12	341697	341708	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307126526
103	NC_014498	GTTTGG	2	12	344408	344419	0 %	50 %	50 %	0 %	307126528
104	NC_014498	AAAATG	2	12	347165	347176	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307126531
105	NC_014498	AGAGGA	2	12	349739	349750	50 %	0 %	50 %	0 %	307126534
106	NC_014498	ATGGAG	2	12	350172	350183	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	307126535
107	NC_014498	GGACAA	2	12	351039	351050	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	307126536
108	NC_014498	CCATAG	2	12	354502	354513	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	307126540
109	NC_014498	TTGATT	2	12	354945	354956	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	307126540
110	NC_014498	AGGAGT	2	12	356691	356702	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	307126542
111	NC_014498	CGAGCT	2	12	357763	357774	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	307126546
112	NC_014498	GACCAG	2	12	358145	358156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307126547
113	NC_014498	AGCGTG	2	12	358326	358337	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	307126547
114	NC_014498	ACACAA	2	12	360634	360645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307126549
115	NC_014498	CAACCT	2	12	367350	367361	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	307126554
116	NC_014498	ATGGAG	2	12	367777	367788	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	307126555
117	NC_014498	TCTTTA	2	12	370149	370160	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	307126557
118	NC_014498	TTTTTA	2	12	371663	371674	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307126559
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227	NC_014498	CTGTAA	2	12	647615	647626	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307126832
228	NC_014498	TAAAGA	2	12	653055	653066	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307126839
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231	NC_014498	AAATTA	2	12	657269	657280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307126839
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333	NC_014498	GATAGT	2	12	911081	911092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307127120
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335	NC_014498	CCTTTT	2	12	914187	914198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307127123
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339	NC_014498	ATTGGC	2	12	929815	929826	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307127137
340	NC_014498	GAATTT	2	12	935954	935965	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307127143
341	NC_014498	GCGCAA	2	12	939053	939064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307127147
342	NC_014498	CACCAG	2	12	945848	945859	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	307127158
343	NC_014498	CATGAT	2	12	950309	950320	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307127161
344	NC_014498	TTGGAC	2	12	955979	955990	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307127165
345	NC_014498	CATCTC	2	12	958928	958939	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	307127169
346	NC_014498	AGTTGA	2	12	959047	959058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307127169
347	NC_014498	ATTTCA	2	12	963217	963228	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	307127172
348	NC_014498	TTGGAG	2	12	967696	967707	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	307127174
349	NC_014498	TGTCAT	2	12	969913	969924	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	307127178
350	NC_014498	AATCGT	2	12	970572	970583	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307127179
351	NC_014498	TGGAAA	2	12	970695	970706	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307127179
352	NC_014498	TTGGTA	2	12	971827	971838	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	307127181
353	NC_014498	TTTATC	2	12	976226	976237	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	307127186
354	NC_014498	AAAACC	2	12	977871	977882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307127187
355	NC_014498	CATCCA	2	12	980495	980506	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	307127191
356	NC_014498	GATTTG	2	12	991105	991116	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	307127201
357	NC_014498	CAACTG	2	12	991480	991491	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	307127201
358	NC_014498	GAAGTA	2	12	999368	999379	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307127210
359	NC_014498	TCAAGT	2	12	999407	999418	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307127210
360	NC_014498	AGAAAA	2	12	1001424	1001435	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	307127215
361	NC_014498	TTTATG	2	12	1006568	1006579	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	307127221
362	NC_014498	GATTGG	2	12	1008615	1008626	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	307127222
363	NC_014498	ATCAAA	2	12	1009834	1009845	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	307127224
364	NC_014498	ATTGGT	2	12	1011025	1011036	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	307127225
365	NC_014498	CATATC	2	12	1011848	1011859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307127226
366	NC_014498	CTTGAA	2	12	1012585	1012596	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307127226
367	NC_014498	TGCAGA	2	12	1014602	1014613	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307127228
368	NC_014498	GTTGCA	2	12	1014710	1014721	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307127229
369	NC_014498	GTGATT	2	12	1015142	1015153	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	307127229
370	NC_014498	TATCTC	2	12	1015759	1015770	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	307127229
371	NC_014498	CATTAC	2	12	1017289	1017300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307127231
372	NC_014498	GCAGAA	2	12	1019038	1019049	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	307127231
373	NC_014498	CATTAC	2	12	1019900	1019911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307127232
374	NC_014498	TCGACC	2	12	1022856	1022867	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	307127234
375	NC_014498	GCTGGT	2	12	1027617	1027628	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	307127239
376	NC_014498	GGCTAT	2	12	1027922	1027933	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307127239
377	NC_014498	AAACAA	2	12	1029541	1029552	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	307127241
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379	NC_014498	CTTGAT	2	12	1037689	1037700	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	307127246
380	NC_014498	ATATGC	2	12	1040017	1040028	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307127249
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382	NC_014498	TAATCC	2	12	1045502	1045513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307127254
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386	NC_014498	CAAGTT	2	12	1059797	1059808	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307127270
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389	NC_014498	TATTTC	2	12	1068848	1068859	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	307127281
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410	NC_014498	TGAAAA	2	12	1113824	1113835	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307127322
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418	NC_014498	TCTGTT	2	12	1127197	1127208	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	307127335
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432	NC_014498	CCAAGA	2	12	1156778	1156789	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	307127355
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437	NC_014498	TCATGG	2	12	1171519	1171530	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307127375
438	NC_014498	CATTTT	2	12	1180675	1180686	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	307127385
439	NC_014498	CTGTAT	2	12	1189996	1190007	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	307127397
440	NC_014498	TGCGCT	2	12	1196908	1196919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307127401
441	NC_014498	AAGACA	2	12	1198205	1198216	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	307127402
442	NC_014498	ATCTGG	2	12	1201974	1201985	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307127407
443	NC_014498	AAGGCT	2	12	1202050	1202061	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307127407
444	NC_014498	TTCGAA	2	12	1203323	1203334	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307127408
445	NC_014498	ATCTAA	2	12	1209497	1209508	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	307127415
446	NC_014498	GGGCTA	2	12	1211632	1211643	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	307127418
447	NC_014498	TATATT	2	12	1212026	1212037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307127418
448	NC_014498	ATTAAC	2	12	1213407	1213418	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	307127420
449	NC_014498	AAATGG	2	12	1219337	1219348	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307127425
450	NC_014498	ATTGAA	2	12	1220179	1220190	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	307127426
451	NC_014498	ACCTTG	2	12	1222306	1222317	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	307127428
452	NC_014498	ATTGAG	2	12	1223018	1223029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307127429
453	NC_014498	CTGTCG	2	12	1224466	1224477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307127431
454	NC_014498	AACTCC	2	12	1228268	1228279	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	307127435
455	NC_014498	TCATCT	2	12	1228921	1228932	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	307127436
456	NC_014498	TCACTC	2	12	1232371	1232382	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	307127440
457	NC_014498	TTTTTC	2	12	1237400	1237411	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	307127447
458	NC_014498	TAGTGA	2	12	1239309	1239320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307127447
459	NC_014498	TTATGA	2	12	1242173	1242184	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307127448
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484	NC_014498	GGAATT	2	12	1303528	1303539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307127517
485	NC_014498	TTTCAT	2	12	1303578	1303589	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	307127517
486	NC_014498	TGGCAA	2	12	1306367	1306378	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307127520
487	NC_014498	GATACC	2	12	1309267	1309278	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	307127524
488	NC_014498	TGGATC	2	12	1312010	1312021	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307127527
489	NC_014498	TGTAGA	2	12	1312165	1312176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307127527
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