MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae 670-6B chromosome

Total Repeats: 38487

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014498	CTGA	2	8	240731	240738	25 %	25 %	25 %	25 %	307126418
4002	NC_014498	TCT	2	6	240827	240832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126418
4003	NC_014498	GAA	2	6	240857	240862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126418
4004	NC_014498	TC	3	6	240899	240904	0 %	50 %	0 %	50 %	307126418
4005	NC_014498	CTG	2	6	240932	240937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307126418
4006	NC_014498	TCA	2	6	241037	241042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126419
4007	NC_014498	TAG	2	6	241097	241102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126419
4008	NC_014498	CAG	3	9	241144	241152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307126419
4009	NC_014498	CAA	2	6	241168	241173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307126419
4010	NC_014498	AGG	2	6	241206	241211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307126419
4011	NC_014498	AACC	2	8	241240	241247	50 %	0 %	0 %	50 %	307126419
4012	NC_014498	ACCG	2	8	241257	241264	25 %	0 %	25 %	50 %	307126419
4013	NC_014498	ATT	2	6	241411	241416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307126419
4014	NC_014498	GAT	2	6	241420	241425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126419
4015	NC_014498	TCG	2	6	241457	241462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307126419
4016	NC_014498	GAT	2	6	241465	241470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126419
4017	NC_014498	TCTT	2	8	241746	241753	0 %	75 %	0 %	25 %	307126420
4018	NC_014498	ATC	2	6	241808	241813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126420
4019	NC_014498	GTT	2	6	241867	241872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126420
4020	NC_014498	A	6	6	241937	241942	100 %	0 %	0 %	0 %	307126420
4021	NC_014498	GAA	2	6	241957	241962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126420
4022	NC_014498	AAG	2	6	241983	241988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126420
4023	NC_014498	CTA	2	6	242000	242005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126420
4024	NC_014498	AAAG	2	8	242018	242025	75 %	0 %	25 %	0 %	307126420
4025	NC_014498	TCA	2	6	242046	242051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126420
4026	NC_014498	T	6	6	242108	242113	0 %	100 %	0 %	0 %	307126420
4027	NC_014498	AGA	2	6	242146	242151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126420
4028	NC_014498	ATTT	2	8	242170	242177	25 %	75 %	0 %	0 %	307126420
4029	NC_014498	AGA	2	6	242197	242202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126420
4030	NC_014498	ATG	2	6	242277	242282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126420
4031	NC_014498	TAA	2	6	242392	242397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307126420
4032	NC_014498	ATTG	2	8	242416	242423	25 %	50 %	25 %	0 %	307126420
4033	NC_014498	TGG	2	6	242446	242451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307126420
4034	NC_014498	GA	3	6	242486	242491	50 %	0 %	50 %	0 %	307126420
4035	NC_014498	GAG	2	6	242583	242588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307126420
4036	NC_014498	A	6	6	242699	242704	100 %	0 %	0 %	0 %	307126420
4037	NC_014498	AATC	2	8	242719	242726	50 %	25 %	0 %	25 %	307126420
4038	NC_014498	AAG	2	6	242852	242857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126420
4039	NC_014498	TTCA	2	8	242858	242865	25 %	50 %	0 %	25 %	307126420
4040	NC_014498	GAG	2	6	242877	242882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307126420
4041	NC_014498	CTT	2	6	242894	242899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126420
4042	NC_014498	CTG	2	6	242901	242906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307126420
4043	NC_014498	GGT	2	6	242977	242982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307126420
4044	NC_014498	CAAT	2	8	242988	242995	50 %	25 %	0 %	25 %	307126420
4045	NC_014498	AT	3	6	243087	243092	50 %	50 %	0 %	0 %	307126420
4046	NC_014498	CTAA	2	8	243271	243278	50 %	25 %	0 %	25 %	307126421
4047	NC_014498	GAA	2	6	243280	243285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126421
4048	NC_014498	ATGAT	2	10	243290	243299	40 %	40 %	20 %	0 %	307126421
4049	NC_014498	A	6	6	243361	243366	100 %	0 %	0 %	0 %	307126421
4050	NC_014498	GT	3	6	243452	243457	0 %	50 %	50 %	0 %	307126422
4051	NC_014498	GTAGA	2	10	243461	243470	40 %	20 %	40 %	0 %	307126422
4052	NC_014498	CAT	2	6	243526	243531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126422
4053	NC_014498	GTC	2	6	243542	243547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307126422
4054	NC_014498	AAG	2	6	243635	243640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126422
4055	NC_014498	TCA	2	6	243669	243674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126422
4056	NC_014498	TAT	2	6	243697	243702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307126422
4057	NC_014498	TAT	2	6	243721	243726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307126422
4058	NC_014498	AGG	2	6	243792	243797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307126422
4059	NC_014498	T	6	6	243866	243871	0 %	100 %	0 %	0 %	307126422
4060	NC_014498	TGG	2	6	243897	243902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307126422
4061	NC_014498	TTTAG	2	10	243946	243955	20 %	60 %	20 %	0 %	307126422
4062	NC_014498	ATC	2	6	244044	244049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126422
4063	NC_014498	TTG	2	6	244081	244086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126422
4064	NC_014498	CTA	2	6	244179	244184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126422
4065	NC_014498	TGC	2	6	244188	244193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307126422
4066	NC_014498	T	7	7	244285	244291	0 %	100 %	0 %	0 %	307126422
4067	NC_014498	TTG	2	6	244297	244302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126422
4068	NC_014498	CTTTT	2	10	244420	244429	0 %	80 %	0 %	20 %	307126422
4069	NC_014498	CTT	2	6	244448	244453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126422
4070	NC_014498	GTC	2	6	244462	244467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307126422
4071	NC_014498	AGA	2	6	244531	244536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126422
4072	NC_014498	TTC	2	6	244573	244578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126422
4073	NC_014498	T	6	6	244632	244637	0 %	100 %	0 %	0 %	307126422
4074	NC_014498	CTAT	2	8	244724	244731	25 %	50 %	0 %	25 %	307126422
4075	NC_014498	GAT	2	6	244738	244743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126422
4076	NC_014498	TAA	2	6	244830	244835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307126422
4077	NC_014498	GAAA	2	8	244851	244858	75 %	0 %	25 %	0 %	307126422
4078	NC_014498	AAC	2	6	244859	244864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307126422
4079	NC_014498	GGT	2	6	244890	244895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307126422
4080	NC_014498	GTCTG	2	10	244897	244906	0 %	40 %	40 %	20 %	307126422
4081	NC_014498	CAA	2	6	244936	244941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307126422
4082	NC_014498	AGA	2	6	245117	245122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126423
4083	NC_014498	A	6	6	245122	245127	100 %	0 %	0 %	0 %	307126423
4084	NC_014498	CT	3	6	245143	245148	0 %	50 %	0 %	50 %	307126423
4085	NC_014498	TCG	2	6	245149	245154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307126423
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4087	NC_014498	CTGA	2	8	245271	245278	25 %	25 %	25 %	25 %	307126423
4088	NC_014498	ATT	2	6	245283	245288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307126423
4089	NC_014498	GCTG	2	8	245381	245388	0 %	25 %	50 %	25 %	307126423
4090	NC_014498	CAA	2	6	245471	245476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307126423
4091	NC_014498	TAA	2	6	245504	245509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307126423
4092	NC_014498	CAG	2	6	245545	245550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307126423
4093	NC_014498	TTG	2	6	245554	245559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126423
4094	NC_014498	AATC	2	8	245563	245570	50 %	25 %	0 %	25 %	307126423
4095	NC_014498	CCA	2	6	245606	245611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307126423
4096	NC_014498	TGT	2	6	245670	245675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126423
4097	NC_014498	TTGA	2	8	245676	245683	25 %	50 %	25 %	0 %	307126423
4098	NC_014498	AG	3	6	245732	245737	50 %	0 %	50 %	0 %	307126423
4099	NC_014498	AGA	2	6	245857	245862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126423
4100	NC_014498	AGA	2	6	245888	245893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126423
4101	NC_014498	GAA	2	6	245930	245935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126423
4102	NC_014498	TC	3	6	245967	245972	0 %	50 %	0 %	50 %	307126423
4103	NC_014498	CT	3	6	245989	245994	0 %	50 %	0 %	50 %	307126423
4104	NC_014498	AGGA	2	8	246172	246179	50 %	0 %	50 %	0 %	307126423
4105	NC_014498	GTCTT	2	10	246243	246252	0 %	60 %	20 %	20 %	307126423
4106	NC_014498	TTG	2	6	246262	246267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126423
4107	NC_014498	GAAT	2	8	246451	246458	50 %	25 %	25 %	0 %	307126423
4108	NC_014498	AGA	2	6	246464	246469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126423
4109	NC_014498	AGA	2	6	246566	246571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126423
4110	NC_014498	TCG	2	6	246596	246601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307126423
4111	NC_014498	CAT	2	6	246704	246709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126423
4112	NC_014498	AGA	2	6	246731	246736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126423
4113	NC_014498	TCTA	2	8	246765	246772	25 %	50 %	0 %	25 %	307126423
4114	NC_014498	TAC	2	6	246861	246866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126423
4115	NC_014498	GGT	2	6	246957	246962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307126423
4116	NC_014498	ATT	2	6	246970	246975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307126423
4117	NC_014498	GA	3	6	247119	247124	50 %	0 %	50 %	0 %	307126423
4118	NC_014498	GTT	2	6	247173	247178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126423
4119	NC_014498	AGAA	2	8	247312	247319	75 %	0 %	25 %	0 %	307126423
4120	NC_014498	GC	3	6	247354	247359	0 %	0 %	50 %	50 %	307126424
4121	NC_014498	AAGA	2	8	247406	247413	75 %	0 %	25 %	0 %	307126424
4122	NC_014498	GCTT	2	8	247416	247423	0 %	50 %	25 %	25 %	307126424
4123	NC_014498	ACAAGA	2	12	247446	247457	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	307126424
4124	NC_014498	A	6	6	247457	247462	100 %	0 %	0 %	0 %	307126424
4125	NC_014498	ATG	2	6	247557	247562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126425
4126	NC_014498	ATG	2	6	247591	247596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126425
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4133	NC_014498	CT	4	8	248112	248119	0 %	50 %	0 %	50 %	307126426
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4142	NC_014498	AG	3	6	248588	248593	50 %	0 %	50 %	0 %	307126426
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4149	NC_014498	CCTTG	2	10	248867	248876	0 %	40 %	20 %	40 %	307126427
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4156	NC_014498	A	7	7	249488	249494	100 %	0 %	0 %	0 %	307126428
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4158	NC_014498	A	6	6	249720	249725	100 %	0 %	0 %	0 %	307126428
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4239	NC_014498	CA	3	6	253700	253705	50 %	0 %	0 %	50 %	307126435
4240	NC_014498	GAA	2	6	253733	253738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126435
4241	NC_014498	TAC	2	6	253744	253749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126435
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4243	NC_014498	TTC	2	6	253794	253799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126435
4244	NC_014498	AGG	2	6	253819	253824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307126435
4245	NC_014498	CGT	2	6	253862	253867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307126436
4246	NC_014498	AAG	2	6	253908	253913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126436
4247	NC_014498	GCT	2	6	253979	253984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307126436
4248	NC_014498	GTG	2	6	254013	254018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307126436
4249	NC_014498	CA	3	6	254043	254048	50 %	0 %	0 %	50 %	307126436
4250	NC_014498	AAG	2	6	254310	254315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126437
4251	NC_014498	A	6	6	254342	254347	100 %	0 %	0 %	0 %	307126437
4252	NC_014498	GCT	2	6	254372	254377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307126437
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4254	NC_014498	A	6	6	254417	254422	100 %	0 %	0 %	0 %	307126437
4255	NC_014498	ATA	2	6	254461	254466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307126437
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4258	NC_014498	GACAA	2	10	254543	254552	60 %	0 %	20 %	20 %	307126438
4259	NC_014498	ACC	2	6	254580	254585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307126438
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4262	NC_014498	ATG	2	6	254631	254636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126438
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4264	NC_014498	CGTA	2	8	254665	254672	25 %	25 %	25 %	25 %	307126438
4265	NC_014498	GTT	2	6	254723	254728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126438
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4274	NC_014498	TCG	2	6	254981	254986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307126439
4275	NC_014498	GCA	2	6	255021	255026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307126439
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4279	NC_014498	TGT	2	6	255283	255288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126440
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4284	NC_014498	ACA	2	6	255495	255500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307126440
4285	NC_014498	A	6	6	255500	255505	100 %	0 %	0 %	0 %	307126440
4286	NC_014498	AGT	2	6	255585	255590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126441
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4304	NC_014498	A	6	6	256801	256806	100 %	0 %	0 %	0 %	307126443
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4322	NC_014498	TAAAGG	2	12	257724	257735	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307126444
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4325	NC_014498	AAT	2	6	257786	257791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307126444
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4347	NC_014498	TTA	2	6	258859	258864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307126447
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4349	NC_014498	GCT	2	6	258876	258881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307126447
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4358	NC_014498	AG	3	6	259523	259528	50 %	0 %	50 %	0 %	307126448
4359	NC_014498	T	6	6	259539	259544	0 %	100 %	0 %	0 %	307126449
4360	NC_014498	ATT	2	6	259547	259552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307126449
4361	NC_014498	TTTA	2	8	259592	259599	25 %	75 %	0 %	0 %	307126449
4362	NC_014498	CTT	2	6	259691	259696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126449
4363	NC_014498	A	6	6	259730	259735	100 %	0 %	0 %	0 %	307126449
4364	NC_014498	TTG	2	6	259783	259788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126449
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4366	NC_014498	ATC	2	6	260001	260006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126449
4367	NC_014498	GTA	2	6	260017	260022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126449
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4369	NC_014498	GAT	2	6	260120	260125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126449
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4472	NC_014498	GAGAT	2	10	265185	265194	40 %	20 %	40 %	0 %	307126457
4473	NC_014498	TCA	2	6	265197	265202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126457
4474	NC_014498	ATTCC	2	10	265203	265212	20 %	40 %	0 %	40 %	307126457
4475	NC_014498	GTCA	2	8	265246	265253	25 %	25 %	25 %	25 %	307126457
4476	NC_014498	GTTG	2	8	265354	265361	0 %	50 %	50 %	0 %	307126457
4477	NC_014498	ATC	2	6	265433	265438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126457
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4479	NC_014498	TTGG	2	8	265562	265569	0 %	50 %	50 %	0 %	307126457
4480	NC_014498	GA	3	6	265583	265588	50 %	0 %	50 %	0 %	307126457
4481	NC_014498	ACG	2	6	265703	265708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307126457
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4483	NC_014498	TGC	2	6	265822	265827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307126457
4484	NC_014498	CT	3	6	265840	265845	0 %	50 %	0 %	50 %	307126457
4485	NC_014498	TCTGT	2	10	265878	265887	0 %	60 %	20 %	20 %	307126457
4486	NC_014498	TGGAT	2	10	265888	265897	20 %	40 %	40 %	0 %	307126457
4487	NC_014498	AGA	2	6	265912	265917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126457
4488	NC_014498	CTG	2	6	265923	265928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307126457
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