MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae 670-6B chromosome

Total Repeats: 38487

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014498	AAC	2	6	179995	180000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307126355
3002	NC_014498	GAT	2	6	180231	180236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126355
3003	NC_014498	TCA	2	6	180276	180281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126355
3004	NC_014498	TGCG	2	8	180284	180291	0 %	25 %	50 %	25 %	307126355
3005	NC_014498	CTG	2	6	180326	180331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307126355
3006	NC_014498	GAA	2	6	180358	180363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126355
3007	NC_014498	GCT	2	6	180364	180369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307126355
3008	NC_014498	CGA	2	6	180468	180473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307126355
3009	NC_014498	TTC	2	6	180539	180544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126355
3010	NC_014498	GAT	2	6	180601	180606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126355
3011	NC_014498	GAG	2	6	180712	180717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307126355
3012	NC_014498	TGG	2	6	180794	180799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307126355
3013	NC_014498	AGA	2	6	180819	180824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126355
3014	NC_014498	ATTG	2	8	180846	180853	25 %	50 %	25 %	0 %	307126355
3015	NC_014498	GAA	2	6	180922	180927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126355
3016	NC_014498	AGCC	2	8	181026	181033	25 %	0 %	25 %	50 %	307126355
3017	NC_014498	CAG	2	6	181052	181057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307126355
3018	NC_014498	GTA	2	6	181097	181102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126355
3019	NC_014498	TTC	2	6	181329	181334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126356
3020	NC_014498	ATC	2	6	181348	181353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126356
3021	NC_014498	GAT	3	9	181356	181364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126356
3022	NC_014498	CT	3	6	181515	181520	0 %	50 %	0 %	50 %	307126356
3023	NC_014498	CAGA	2	8	181556	181563	50 %	0 %	25 %	25 %	307126356
3024	NC_014498	ATC	2	6	181564	181569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126356
3025	NC_014498	AGAT	2	8	181617	181624	50 %	25 %	25 %	0 %	307126356
3026	NC_014498	CGA	2	6	181627	181632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307126356
3027	NC_014498	CAG	2	6	181724	181729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307126356
3028	NC_014498	ACC	2	6	181893	181898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307126356
3029	NC_014498	ATG	2	6	181960	181965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126356
3030	NC_014498	TTG	2	6	181975	181980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126356
3031	NC_014498	TAG	2	6	181985	181990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126356
3032	NC_014498	AGA	2	6	182010	182015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126356
3033	NC_014498	GA	3	6	182075	182080	50 %	0 %	50 %	0 %	307126356
3034	NC_014498	CAG	2	6	182267	182272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307126356
3035	NC_014498	CTG	2	6	182283	182288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307126356
3036	NC_014498	GAT	2	6	182322	182327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126356
3037	NC_014498	CTT	2	6	182441	182446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126356
3038	NC_014498	GAG	2	6	182537	182542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307126356
3039	NC_014498	ATGA	2	8	182544	182551	50 %	25 %	25 %	0 %	307126356
3040	NC_014498	AAAG	2	8	182589	182596	75 %	0 %	25 %	0 %	307126356
3041	NC_014498	TTC	2	6	182673	182678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126356
3042	NC_014498	TGCT	2	8	182733	182740	0 %	50 %	25 %	25 %	307126356
3043	NC_014498	CCA	2	6	182758	182763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307126356
3044	NC_014498	GT	3	6	182781	182786	0 %	50 %	50 %	0 %	307126356
3045	NC_014498	AGT	2	6	182831	182836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126356
3046	NC_014498	CAAG	2	8	182858	182865	50 %	0 %	25 %	25 %	307126356
3047	NC_014498	TCT	2	6	182869	182874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126356
3048	NC_014498	CGA	2	6	182894	182899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307126356
3049	NC_014498	ACC	2	6	182955	182960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307126356
3050	NC_014498	CTT	2	6	182978	182983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126356
3051	NC_014498	AT	3	6	183077	183082	50 %	50 %	0 %	0 %	307126357
3052	NC_014498	TTC	2	6	183106	183111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126357
3053	NC_014498	GC	3	6	183174	183179	0 %	0 %	50 %	50 %	307126357
3054	NC_014498	GTT	2	6	183182	183187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126357
3055	NC_014498	A	6	6	183222	183227	100 %	0 %	0 %	0 %	307126357
3056	NC_014498	ATAA	2	8	184113	184120	75 %	25 %	0 %	0 %	307126358
3057	NC_014498	TTA	2	6	184170	184175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307126358
3058	NC_014498	GTT	2	6	184190	184195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126358
3059	NC_014498	TCA	2	6	184204	184209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126358
3060	NC_014498	TCC	2	6	184218	184223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307126359
3061	NC_014498	A	6	6	184225	184230	100 %	0 %	0 %	0 %	307126359
3062	NC_014498	ATTG	2	8	184367	184374	25 %	50 %	25 %	0 %	307126359
3063	NC_014498	GAC	2	6	184653	184658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307126360
3064	NC_014498	TGCC	2	8	184694	184701	0 %	25 %	25 %	50 %	307126360
3065	NC_014498	T	6	6	184707	184712	0 %	100 %	0 %	0 %	307126360
3066	NC_014498	TTGGA	2	10	184723	184732	20 %	40 %	40 %	0 %	307126360
3067	NC_014498	GTTG	2	8	184842	184849	0 %	50 %	50 %	0 %	307126360
3068	NC_014498	CAA	2	6	184882	184887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307126360
3069	NC_014498	GTTT	2	8	184892	184899	0 %	75 %	25 %	0 %	307126360
3070	NC_014498	GATG	2	8	184908	184915	25 %	25 %	50 %	0 %	307126360
3071	NC_014498	AAT	2	6	184924	184929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307126360
3072	NC_014498	TTG	2	6	185054	185059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126360
3073	NC_014498	CAA	2	6	185277	185282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307126361
3074	NC_014498	AGTC	2	8	185333	185340	25 %	25 %	25 %	25 %	307126361
3075	NC_014498	ATG	2	6	185404	185409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126361
3076	NC_014498	TCAGGG	2	12	185492	185503	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	307126361
3077	NC_014498	GACA	2	8	185534	185541	50 %	0 %	25 %	25 %	307126361
3078	NC_014498	AAGA	2	8	185595	185602	75 %	0 %	25 %	0 %	307126361
3079	NC_014498	CTA	2	6	185633	185638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126361
3080	NC_014498	AG	3	6	185671	185676	50 %	0 %	50 %	0 %	307126361
3081	NC_014498	GATA	2	8	185689	185696	50 %	25 %	25 %	0 %	307126361
3082	NC_014498	TGA	2	6	185721	185726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126362
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3084	NC_014498	TGG	2	6	185808	185813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307126362
3085	NC_014498	GTC	2	6	185834	185839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307126362
3086	NC_014498	GAG	2	6	185869	185874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307126362
3087	NC_014498	TTG	2	6	186076	186081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126362
3088	NC_014498	CA	3	6	186103	186108	50 %	0 %	0 %	50 %	307126362
3089	NC_014498	TTG	2	6	186146	186151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126362
3090	NC_014498	TCA	2	6	186249	186254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126362
3091	NC_014498	TCA	2	6	186348	186353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126362
3092	NC_014498	AGA	2	6	186387	186392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126362
3093	NC_014498	TG	3	6	186395	186400	0 %	50 %	50 %	0 %	307126362
3094	NC_014498	CTTC	2	8	186401	186408	0 %	50 %	0 %	50 %	307126362
3095	NC_014498	AGC	2	6	186411	186416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307126362
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3097	NC_014498	GGA	2	6	186456	186461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307126362
3098	NC_014498	GGT	2	6	186490	186495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307126362
3099	NC_014498	AGC	2	6	186528	186533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307126362
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3101	NC_014498	C	6	6	186561	186566	0 %	0 %	0 %	100 %	307126362
3102	NC_014498	CT	3	6	186761	186766	0 %	50 %	0 %	50 %	307126363
3103	NC_014498	T	6	6	186766	186771	0 %	100 %	0 %	0 %	307126363
3104	NC_014498	TCA	2	6	186783	186788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126363
3105	NC_014498	T	6	6	186796	186801	0 %	100 %	0 %	0 %	307126363
3106	NC_014498	ATT	2	6	186856	186861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307126363
3107	NC_014498	A	6	6	186929	186934	100 %	0 %	0 %	0 %	307126363
3108	NC_014498	TCAA	2	8	186983	186990	50 %	25 %	0 %	25 %	307126363
3109	NC_014498	TTC	2	6	187010	187015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126363
3110	NC_014498	GTA	2	6	187051	187056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126363
3111	NC_014498	AGC	2	6	187082	187087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307126363
3112	NC_014498	GTA	2	6	187173	187178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126364
3113	NC_014498	GCT	2	6	187373	187378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307126364
3114	NC_014498	ATA	2	6	187389	187394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307126364
3115	NC_014498	TGA	2	6	187415	187420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126364
3116	NC_014498	CT	4	8	187440	187447	0 %	50 %	0 %	50 %	307126364
3117	NC_014498	GGAT	2	8	187505	187512	25 %	25 %	50 %	0 %	307126364
3118	NC_014498	AGG	2	6	187696	187701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307126364
3119	NC_014498	T	6	6	187712	187717	0 %	100 %	0 %	0 %	307126364
3120	NC_014498	ACC	2	6	187774	187779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307126364
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3122	NC_014498	ATC	2	6	187888	187893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126364
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3492	NC_014498	A	6	6	207916	207921	100 %	0 %	0 %	0 %	307126386
3493	NC_014498	CAG	2	6	207943	207948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307126386
3494	NC_014498	CTG	2	6	208024	208029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307126386
3495	NC_014498	ATA	2	6	208048	208053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307126386
3496	NC_014498	TCAGGT	2	12	208178	208189	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307126386
3497	NC_014498	TGG	2	6	208330	208335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307126386
3498	NC_014498	TCCA	2	8	208338	208345	25 %	25 %	0 %	50 %	307126386
3499	NC_014498	AAG	2	6	208363	208368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126386
3500	NC_014498	GAC	2	6	208421	208426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307126386

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