MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae AP200 chromosome

Total Repeats: 37149

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_014494	ATT	2	6	228957	228962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066880
4003	NC_014494	GA	3	6	229106	229111	50 %	0 %	50 %	0 %	307066880
4004	NC_014494	CAAG	2	8	229196	229203	50 %	0 %	25 %	25 %	307066880
4005	NC_014494	AGAA	2	8	229299	229306	75 %	0 %	25 %	0 %	307066880
4006	NC_014494	GC	3	6	229341	229346	0 %	0 %	50 %	50 %	307066881
4007	NC_014494	AAGA	2	8	229393	229400	75 %	0 %	25 %	0 %	307066881
4008	NC_014494	GCTT	2	8	229403	229410	0 %	50 %	25 %	25 %	307066881
4009	NC_014494	ACAAGA	2	12	229433	229444	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	307066881
4010	NC_014494	A	6	6	229444	229449	100 %	0 %	0 %	0 %	307066881
4011	NC_014494	ATG	2	6	229544	229549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066882
4012	NC_014494	ACG	2	6	229578	229583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066882
4013	NC_014494	CAGGAA	2	12	229637	229648	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	307066882
4014	NC_014494	AGA	2	6	229765	229770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066882
4015	NC_014494	AAT	2	6	229901	229906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307066882
4016	NC_014494	AGCAG	2	10	229913	229922	40 %	0 %	40 %	20 %	307066882
4017	NC_014494	TGG	2	6	229936	229941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307066882
4018	NC_014494	GAAT	2	8	229993	230000	50 %	25 %	25 %	0 %	307066882
4019	NC_014494	TTG	2	6	230074	230079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066883
4020	NC_014494	GCGT	2	8	230089	230096	0 %	25 %	50 %	25 %	307066883
4021	NC_014494	CT	4	8	230099	230106	0 %	50 %	0 %	50 %	307066883
4022	NC_014494	CAG	2	6	230185	230190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066883
4023	NC_014494	AGA	2	6	230195	230200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066883
4024	NC_014494	GGGAG	2	10	230252	230261	20 %	0 %	80 %	0 %	307066883
4025	NC_014494	GAA	2	6	230358	230363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066883
4026	NC_014494	ATG	2	6	230364	230369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066883
4027	NC_014494	ATTG	2	8	230402	230409	25 %	50 %	25 %	0 %	307066883
4028	NC_014494	ACGAT	2	10	230426	230435	40 %	20 %	20 %	20 %	307066883
4029	NC_014494	CCAA	2	8	230476	230483	50 %	0 %	0 %	50 %	307066883
4030	NC_014494	AGT	2	6	230522	230527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066883
4031	NC_014494	AAAG	2	8	230553	230560	75 %	0 %	25 %	0 %	307066883
4032	NC_014494	AG	3	6	230575	230580	50 %	0 %	50 %	0 %	307066883
4033	NC_014494	GAA	2	6	230584	230589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066883
4034	NC_014494	A	6	6	230588	230593	100 %	0 %	0 %	0 %	307066884
4035	NC_014494	TAG	2	6	230598	230603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066884
4036	NC_014494	CTA	2	6	230715	230720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066884
4037	NC_014494	GTA	2	6	230771	230776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066884
4038	NC_014494	AG	3	6	230844	230849	50 %	0 %	50 %	0 %	307066884
4039	NC_014494	CCTTG	2	10	230854	230863	0 %	40 %	20 %	40 %	307066884
4040	NC_014494	GAA	2	6	230891	230896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066884
4041	NC_014494	A	6	6	230988	230993	100 %	0 %	0 %	0 %	307066884
4042	NC_014494	GAG	2	6	231014	231019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307066884
4043	NC_014494	CAAA	2	8	231470	231477	75 %	0 %	0 %	25 %	307066885
4044	NC_014494	A	7	7	231475	231481	100 %	0 %	0 %	0 %	307066885
4045	NC_014494	AC	3	6	231670	231675	50 %	0 %	0 %	50 %	307066885
4046	NC_014494	A	6	6	231707	231712	100 %	0 %	0 %	0 %	307066885
4047	NC_014494	TGA	2	6	231725	231730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066885
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4049	NC_014494	A	6	6	232012	232017	100 %	0 %	0 %	0 %	307066886
4050	NC_014494	GTT	2	6	232090	232095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066886
4051	NC_014494	CAA	2	6	232173	232178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307066886
4052	NC_014494	GTT	2	6	232303	232308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066886
4053	NC_014494	TAAAGG	2	12	232326	232337	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307066886
4054	NC_014494	ACC	2	6	232400	232405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307066886
4055	NC_014494	GTC	2	6	232406	232411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066886
4056	NC_014494	GTT	2	6	232519	232524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066886
4057	NC_014494	CAG	2	6	232595	232600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066886
4058	NC_014494	ATA	2	6	232614	232619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307066886
4059	NC_014494	ATT	2	6	232656	232661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066887
4060	NC_014494	AAG	2	6	232676	232681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066887
4061	NC_014494	GTT	2	6	232690	232695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066887
4062	NC_014494	ATC	2	6	232750	232755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066887
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4064	NC_014494	GGT	2	6	232816	232821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307066887
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4071	NC_014494	CTT	2	6	233215	233220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066887
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4079	NC_014494	CAAG	2	8	233378	233385	50 %	0 %	25 %	25 %	307066888
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4101	NC_014494	ATA	2	6	234409	234414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307066889
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4103	NC_014494	TCG	2	6	234544	234549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066890
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4105	NC_014494	A	6	6	234564	234569	100 %	0 %	0 %	0 %	307066890
4106	NC_014494	ACG	2	6	234586	234591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066890
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4108	NC_014494	TTA	2	6	234604	234609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066890
4109	NC_014494	CGT	2	6	234621	234626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066890
4110	NC_014494	GACG	2	8	234672	234679	25 %	0 %	50 %	25 %	307066890
4111	NC_014494	AAG	2	6	234703	234708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066890
4112	NC_014494	GAC	2	6	234771	234776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066890
4113	NC_014494	GCAATC	2	12	234914	234925	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	307066891
4114	NC_014494	CAAA	2	8	234939	234946	75 %	0 %	0 %	25 %	307066891
4115	NC_014494	GCT	2	6	234947	234952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066891
4116	NC_014494	ATC	2	6	234956	234961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066891
4117	NC_014494	TTTGG	2	10	235004	235013	0 %	60 %	40 %	0 %	307066891
4118	NC_014494	GTA	2	6	235028	235033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066891
4119	NC_014494	CAA	2	6	235108	235113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307066891
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4121	NC_014494	CAT	2	6	235204	235209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066893
4122	NC_014494	GCA	2	6	235310	235315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066893
4123	NC_014494	TTCAC	2	10	235360	235369	20 %	40 %	0 %	40 %	307066893
4124	NC_014494	GGT	2	6	235400	235405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307066893
4125	NC_014494	ACATCA	2	12	235461	235472	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	307066893
4126	NC_014494	AAC	2	6	235482	235487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307066893
4127	NC_014494	CGT	2	6	235553	235558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066893
4128	NC_014494	CA	3	6	235688	235693	50 %	0 %	0 %	50 %	307066893
4129	NC_014494	GAA	2	6	235721	235726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066893
4130	NC_014494	TAC	2	6	235732	235737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066893
4131	NC_014494	GTG	2	6	235773	235778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307066893
4132	NC_014494	TTC	2	6	235782	235787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066893
4133	NC_014494	AGG	2	6	235807	235812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307066893
4134	NC_014494	CGT	2	6	235850	235855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066894
4135	NC_014494	AAG	2	6	235896	235901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066894
4136	NC_014494	GCT	2	6	235967	235972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066894
4137	NC_014494	GTG	2	6	236001	236006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307066894
4138	NC_014494	CA	3	6	236031	236036	50 %	0 %	0 %	50 %	307066894
4139	NC_014494	AAG	2	6	236298	236303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066895
4140	NC_014494	A	6	6	236330	236335	100 %	0 %	0 %	0 %	307066895
4141	NC_014494	GCT	2	6	236360	236365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066895
4142	NC_014494	AACA	2	8	236379	236386	75 %	0 %	0 %	25 %	307066895
4143	NC_014494	A	6	6	236405	236410	100 %	0 %	0 %	0 %	307066895
4144	NC_014494	ATA	2	6	236449	236454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307066895
4145	NC_014494	AAT	2	6	236486	236491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307066896
4146	NC_014494	TTG	2	6	236502	236507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066896
4147	NC_014494	GACAA	2	10	236531	236540	60 %	0 %	20 %	20 %	307066896
4148	NC_014494	ACC	2	6	236568	236573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307066896
4149	NC_014494	ACT	2	6	236595	236600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066896
4150	NC_014494	A	6	6	236603	236608	100 %	0 %	0 %	0 %	307066896
4151	NC_014494	ATG	2	6	236619	236624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066896
4152	NC_014494	AAG	2	6	236640	236645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066896
4153	NC_014494	CGTA	2	8	236653	236660	25 %	25 %	25 %	25 %	307066896
4154	NC_014494	GTT	2	6	236711	236716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066896
4155	NC_014494	GAA	2	6	236717	236722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066896
4156	NC_014494	TCA	2	6	236727	236732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066896
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4158	NC_014494	TGG	2	6	236837	236842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307066897
4159	NC_014494	TGG	2	6	236906	236911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307066897
4160	NC_014494	A	6	6	236919	236924	100 %	0 %	0 %	0 %	307066897
4161	NC_014494	GTT	2	6	236931	236936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066897
4162	NC_014494	TCGT	2	8	236947	236954	0 %	50 %	25 %	25 %	307066897
4163	NC_014494	TCG	2	6	236969	236974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066897
4164	NC_014494	GCA	2	6	237009	237014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066897
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4167	NC_014494	A	7	7	237217	237223	100 %	0 %	0 %	0 %	307066898
4168	NC_014494	TGT	2	6	237271	237276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066898
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4173	NC_014494	ACA	2	6	237483	237488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307066898
4174	NC_014494	A	6	6	237488	237493	100 %	0 %	0 %	0 %	307066898
4175	NC_014494	AGT	2	6	237573	237578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066899
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4183	NC_014494	AAC	2	6	238011	238016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307066899
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4187	NC_014494	A	6	6	238138	238143	100 %	0 %	0 %	0 %	307066900
4188	NC_014494	TTG	2	6	238144	238149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066900
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4193	NC_014494	A	6	6	238790	238795	100 %	0 %	0 %	0 %	307066901
4194	NC_014494	ACAA	2	8	238816	238823	75 %	0 %	0 %	25 %	307066901
4195	NC_014494	A	6	6	238917	238922	100 %	0 %	0 %	0 %	307066901
4196	NC_014494	AAG	2	6	238999	239004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066901
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4200	NC_014494	ACT	2	6	239441	239446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066902
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4204	NC_014494	GGTT	2	8	239515	239522	0 %	50 %	50 %	0 %	307066902
4205	NC_014494	CAA	3	9	239625	239633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307066902
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4210	NC_014494	TAAAGG	2	12	239713	239724	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307066902
4211	NC_014494	TTCG	2	8	239744	239751	0 %	50 %	25 %	25 %	307066902
4212	NC_014494	AAG	2	6	239757	239762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066902
4213	NC_014494	AAT	2	6	239775	239780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307066902
4214	NC_014494	AAAC	2	8	239883	239890	75 %	0 %	0 %	25 %	307066903
4215	NC_014494	CT	3	6	239926	239931	0 %	50 %	0 %	50 %	307066903
4216	NC_014494	CTG	2	6	239936	239941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066903
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4223	NC_014494	TTG	4	12	240340	240351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066904
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4228	NC_014494	CTG	2	6	240526	240531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066904
4229	NC_014494	TGG	2	6	240554	240559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307066904
4230	NC_014494	GAA	2	6	240684	240689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066904
4231	NC_014494	TGC	2	6	240692	240697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066904
4232	NC_014494	AAATTA	2	12	240752	240763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307066905
4233	NC_014494	TGT	2	6	240810	240815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066905
4234	NC_014494	ACTTGG	2	12	240819	240830	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307066905
4235	NC_014494	TTA	2	6	240848	240853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066905
4236	NC_014494	AAG	2	6	240854	240859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066905
4237	NC_014494	GCT	2	6	240865	240870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066905
4238	NC_014494	CAG	2	6	240887	240892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066905
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4240	NC_014494	TCA	2	6	241141	241146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066906
4241	NC_014494	CGT	2	6	241246	241251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066906
4242	NC_014494	GTT	2	6	241351	241356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066906
4243	NC_014494	AGC	2	6	241443	241448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066906
4244	NC_014494	GAA	2	6	241468	241473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066906
4245	NC_014494	GGT	2	6	241489	241494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307066906
4246	NC_014494	AG	3	6	241512	241517	50 %	0 %	50 %	0 %	307066906
4247	NC_014494	T	6	6	241528	241533	0 %	100 %	0 %	0 %	307066907
4248	NC_014494	ATT	2	6	241536	241541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066907
4249	NC_014494	TTTA	2	8	241581	241588	25 %	75 %	0 %	0 %	307066907
4250	NC_014494	CTT	2	6	241680	241685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066907
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4252	NC_014494	TTG	2	6	241772	241777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066907
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4257	NC_014494	GAT	2	6	242109	242114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066907
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4264	NC_014494	CTG	2	6	242324	242329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066907
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4274	NC_014494	CTT	2	6	242620	242625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066907
4275	NC_014494	CGT	2	6	242626	242631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066907
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4348	NC_014494	GAT	2	6	246653	246658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066915
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4353	NC_014494	A	6	6	246937	246942	100 %	0 %	0 %	0 %	307066916
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4355	NC_014494	TAG	2	6	246964	246969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066916
4356	NC_014494	TGA	2	6	246977	246982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066916
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4359	NC_014494	GAGAT	2	10	247174	247183	40 %	20 %	40 %	0 %	307066916
4360	NC_014494	TCA	2	6	247186	247191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066916
4361	NC_014494	ATTCC	2	10	247192	247201	20 %	40 %	0 %	40 %	307066916
4362	NC_014494	GTCA	2	8	247235	247242	25 %	25 %	25 %	25 %	307066916
4363	NC_014494	GTTG	2	8	247343	247350	0 %	50 %	50 %	0 %	307066916
4364	NC_014494	ATC	2	6	247422	247427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066916
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4367	NC_014494	GA	3	6	247572	247577	50 %	0 %	50 %	0 %	307066916
4368	NC_014494	ACG	2	6	247692	247697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066916
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4372	NC_014494	TCTGT	2	10	247867	247876	0 %	60 %	20 %	20 %	307066916
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4484	NC_014494	GCAA	2	8	254631	254638	50 %	0 %	25 %	25 %	307066924
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