MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae AP200 chromosome

Total Repeats: 37149

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_014494	CAA	2	6	56700	56705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307066696
1003	NC_014494	AGG	2	6	56805	56810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307066696
1004	NC_014494	AAG	2	6	56842	56847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066697
1005	NC_014494	GCG	2	6	56936	56941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307066697
1006	NC_014494	TGA	2	6	57021	57026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066697
1007	NC_014494	TTG	2	6	57047	57052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066697
1008	NC_014494	ATCT	2	8	57086	57093	25 %	50 %	0 %	25 %	307066697
1009	NC_014494	TC	3	6	57119	57124	0 %	50 %	0 %	50 %	307066697
1010	NC_014494	GAT	3	9	57206	57214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066697
1011	NC_014494	A	6	6	57218	57223	100 %	0 %	0 %	0 %	307066697
1012	NC_014494	CAA	2	6	57239	57244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307066698
1013	NC_014494	GGT	2	6	57298	57303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307066698
1014	NC_014494	A	6	6	57332	57337	100 %	0 %	0 %	0 %	307066698
1015	NC_014494	TTG	2	6	57360	57365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066698
1016	NC_014494	GCT	2	6	57407	57412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066698
1017	NC_014494	GCTGA	2	10	57467	57476	20 %	20 %	40 %	20 %	307066698
1018	NC_014494	ATA	2	6	57483	57488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307066698
1019	NC_014494	TGAC	2	8	57495	57502	25 %	25 %	25 %	25 %	307066698
1020	NC_014494	CAG	2	6	57528	57533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066698
1021	NC_014494	ATGA	2	8	57542	57549	50 %	25 %	25 %	0 %	307066698
1022	NC_014494	CTCA	2	8	57645	57652	25 %	25 %	0 %	50 %	307066699
1023	NC_014494	TGT	2	6	57733	57738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066699
1024	NC_014494	AAC	2	6	57773	57778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307066699
1025	NC_014494	AGA	2	6	57856	57861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066699
1026	NC_014494	GAC	2	6	57944	57949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066699
1027	NC_014494	AACC	2	8	57986	57993	50 %	0 %	0 %	50 %	307066699
1028	NC_014494	AAC	2	6	57995	58000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307066699
1029	NC_014494	GTAC	2	8	58129	58136	25 %	25 %	25 %	25 %	307066699
1030	NC_014494	TAT	2	6	58190	58195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066699
1031	NC_014494	GAA	2	6	58231	58236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066699
1032	NC_014494	CA	3	6	58238	58243	50 %	0 %	0 %	50 %	307066699
1033	NC_014494	ACTGGT	2	12	58251	58262	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307066699
1034	NC_014494	GAA	2	6	58294	58299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066699
1035	NC_014494	TAC	2	6	58376	58381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066699
1036	NC_014494	AAG	2	6	58392	58397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066699
1037	NC_014494	CAG	2	6	58428	58433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066699
1038	NC_014494	TAC	2	6	58448	58453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066699
1039	NC_014494	AAAT	2	8	58523	58530	75 %	25 %	0 %	0 %	307066699
1040	NC_014494	CTG	2	6	58704	58709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066700
1041	NC_014494	AGT	2	6	58762	58767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066700
1042	NC_014494	TC	3	6	58838	58843	0 %	50 %	0 %	50 %	307066700
1043	NC_014494	TTTTG	2	10	59022	59031	0 %	80 %	20 %	0 %	307066701
1044	NC_014494	TCT	2	6	59123	59128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066701
1045	NC_014494	TCA	2	6	59139	59144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066701
1046	NC_014494	TAT	2	6	59419	59424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066702
1047	NC_014494	GAA	2	6	59431	59436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066702
1048	NC_014494	AAG	2	6	59438	59443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066702
1049	NC_014494	GAGG	2	8	59451	59458	25 %	0 %	75 %	0 %	307066702
1050	NC_014494	GA	3	6	59463	59468	50 %	0 %	50 %	0 %	307066702
1051	NC_014494	TG	3	6	59509	59514	0 %	50 %	50 %	0 %	307066702
1052	NC_014494	AGCG	2	8	59570	59577	25 %	0 %	50 %	25 %	307066702
1053	NC_014494	ATGC	2	8	59581	59588	25 %	25 %	25 %	25 %	307066702
1054	NC_014494	TGAG	2	8	59618	59625	25 %	25 %	50 %	0 %	307066702
1055	NC_014494	GCT	2	6	59752	59757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066702
1056	NC_014494	ATC	2	6	59795	59800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066702
1057	NC_014494	T	7	7	59856	59862	0 %	100 %	0 %	0 %	307066702
1058	NC_014494	A	6	6	59875	59880	100 %	0 %	0 %	0 %	307066702
1059	NC_014494	GTT	2	6	60180	60185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066703
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1061	NC_014494	TTC	2	6	60266	60271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066703
1062	NC_014494	AAG	2	6	60282	60287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066703
1063	NC_014494	TTAA	2	8	60297	60304	50 %	50 %	0 %	0 %	307066703
1064	NC_014494	ATT	2	6	60328	60333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066703
1065	NC_014494	GAA	2	6	60374	60379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066703
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1068	NC_014494	TGG	2	6	60485	60490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307066703
1069	NC_014494	TA	3	6	60574	60579	50 %	50 %	0 %	0 %	307066704
1070	NC_014494	GCA	2	6	60621	60626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066704
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1072	NC_014494	TCT	2	6	60679	60684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066704
1073	NC_014494	TTA	2	6	60757	60762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066704
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1076	NC_014494	GTT	2	6	60940	60945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066704
1077	NC_014494	GATT	2	8	60987	60994	25 %	50 %	25 %	0 %	307066704
1078	NC_014494	AGGTTG	2	12	61149	61160	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	307066705
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1081	NC_014494	CAA	2	6	61358	61363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307066705
1082	NC_014494	GAG	2	6	61412	61417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307066705
1083	NC_014494	CAG	2	6	61424	61429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066705
1084	NC_014494	CCAG	2	8	61528	61535	25 %	0 %	25 %	50 %	307066705
1085	NC_014494	TTA	2	6	61542	61547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066705
1086	NC_014494	TCCA	2	8	61553	61560	25 %	25 %	0 %	50 %	307066705
1087	NC_014494	CAT	2	6	61564	61569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066705
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1089	NC_014494	TGG	2	6	61728	61733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307066705
1090	NC_014494	CAC	2	6	61763	61768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307066705
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1092	NC_014494	AGA	2	6	61885	61890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066705
1093	NC_014494	TCC	2	6	61913	61918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307066705
1094	NC_014494	TAC	2	6	62005	62010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066705
1095	NC_014494	CTG	2	6	62106	62111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066705
1096	NC_014494	GTG	2	6	62112	62117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307066705
1097	NC_014494	GA	3	6	62232	62237	50 %	0 %	50 %	0 %	307066705
1098	NC_014494	GCT	2	6	62276	62281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066705
1099	NC_014494	AGG	2	6	62466	62471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307066706
1100	NC_014494	GGT	2	6	62657	62662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307066706
1101	NC_014494	TTCG	2	8	62682	62689	0 %	50 %	25 %	25 %	307066706
1102	NC_014494	CAA	2	6	62705	62710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307066706
1103	NC_014494	AG	3	6	62720	62725	50 %	0 %	50 %	0 %	307066706
1104	NC_014494	CTT	2	6	62830	62835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066706
1105	NC_014494	AGA	2	6	62851	62856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066706
1106	NC_014494	GAA	2	6	63001	63006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066707
1107	NC_014494	TATTT	2	10	63013	63022	20 %	80 %	0 %	0 %	307066707
1108	NC_014494	TTTTA	2	10	63025	63034	20 %	80 %	0 %	0 %	307066707
1109	NC_014494	CTA	2	6	63067	63072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066707
1110	NC_014494	ACGG	2	8	63074	63081	25 %	0 %	50 %	25 %	307066707
1111	NC_014494	CT	3	6	63132	63137	0 %	50 %	0 %	50 %	307066707
1112	NC_014494	AAG	2	6	63196	63201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066707
1113	NC_014494	GGGA	2	8	63222	63229	25 %	0 %	75 %	0 %	307066708
1114	NC_014494	AGA	2	6	63351	63356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066708
1115	NC_014494	ATT	2	6	63366	63371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066708
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1117	NC_014494	ATC	2	6	63538	63543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066708
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1120	NC_014494	CT	3	6	63752	63757	0 %	50 %	0 %	50 %	307066708
1121	NC_014494	TTG	2	6	63782	63787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066708
1122	NC_014494	TGA	2	6	63803	63808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066708
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1124	NC_014494	GA	3	6	64076	64081	50 %	0 %	50 %	0 %	307066709
1125	NC_014494	GAA	2	6	64096	64101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066709
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