MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae AP200 chromosome

Total Repeats: 37149

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_014494	TCA	2	6	30484	30489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066667
503	NC_014494	CTTAT	2	10	30576	30585	20 %	60 %	0 %	20 %	307066668
504	NC_014494	AAC	2	6	30599	30604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307066668
505	NC_014494	AAG	2	6	30605	30610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066668
506	NC_014494	TG	3	6	30677	30682	0 %	50 %	50 %	0 %	307066668
507	NC_014494	GAA	2	6	30700	30705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066668
508	NC_014494	TGAA	2	8	30719	30726	50 %	25 %	25 %	0 %	307066668
509	NC_014494	GA	3	6	30749	30754	50 %	0 %	50 %	0 %	307066668
510	NC_014494	TC	3	6	30776	30781	0 %	50 %	0 %	50 %	307066668
511	NC_014494	ATG	2	6	30785	30790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066668
512	NC_014494	AAG	2	6	30839	30844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066668
513	NC_014494	AGCT	2	8	30851	30858	25 %	25 %	25 %	25 %	307066668
514	NC_014494	AAC	2	6	30901	30906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307066668
515	NC_014494	TTA	2	6	31001	31006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066668
516	NC_014494	TGA	2	6	31022	31027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066668
517	NC_014494	GAT	2	6	31099	31104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066668
518	NC_014494	A	6	6	31211	31216	100 %	0 %	0 %	0 %	307066668
519	NC_014494	ACAA	2	8	31291	31298	75 %	0 %	0 %	25 %	307066668
520	NC_014494	AG	3	6	31356	31361	50 %	0 %	50 %	0 %	307066669
521	NC_014494	GAG	2	6	31422	31427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307066669
522	NC_014494	GGC	2	6	31454	31459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307066669
523	NC_014494	GAT	2	6	31592	31597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066670
524	NC_014494	ATC	2	6	31617	31622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066670
525	NC_014494	GAC	2	6	31678	31683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066670
526	NC_014494	AGG	2	6	31732	31737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307066670
527	NC_014494	A	7	7	31740	31746	100 %	0 %	0 %	0 %	307066670
528	NC_014494	TTA	2	6	31756	31761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066671
529	NC_014494	GCA	2	6	31818	31823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066671
530	NC_014494	GAT	2	6	31839	31844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066671
531	NC_014494	AGA	2	6	31933	31938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066672
532	NC_014494	GAAGA	2	10	31995	32004	60 %	0 %	40 %	0 %	307066672
533	NC_014494	GAA	2	6	32072	32077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066672
534	NC_014494	GGA	2	6	32105	32110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307066672
535	NC_014494	GAT	2	6	32118	32123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066672
536	NC_014494	A	6	6	32137	32142	100 %	0 %	0 %	0 %	307066672
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538	NC_014494	AGA	2	6	32250	32255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066673
539	NC_014494	TGA	2	6	32295	32300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066673
540	NC_014494	CTA	2	6	32327	32332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066673
541	NC_014494	TGA	2	6	32361	32366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066673
542	NC_014494	GGA	2	6	32425	32430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307066673
543	NC_014494	AAG	2	6	32459	32464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066674
544	NC_014494	TGT	2	6	32482	32487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066674
545	NC_014494	AAC	2	6	32538	32543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307066674
546	NC_014494	ATT	2	6	32629	32634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066674
547	NC_014494	ACGA	2	8	32648	32655	50 %	0 %	25 %	25 %	307066674
548	NC_014494	AAGA	2	8	32679	32686	75 %	0 %	25 %	0 %	307066674
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552	NC_014494	TAAA	2	8	32940	32947	75 %	25 %	0 %	0 %	307066674
553	NC_014494	A	6	6	32968	32973	100 %	0 %	0 %	0 %	307066674
554	NC_014494	AGCA	2	8	32977	32984	50 %	0 %	25 %	25 %	307066674
555	NC_014494	AAAG	2	8	33019	33026	75 %	0 %	25 %	0 %	307066674
556	NC_014494	TTG	2	6	33069	33074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066674
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558	NC_014494	GAAA	2	8	33430	33437	75 %	0 %	25 %	0 %	307066675
559	NC_014494	ATG	2	6	33522	33527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066675
560	NC_014494	TTG	2	6	33543	33548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066675
561	NC_014494	GAT	2	6	33557	33562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066675
562	NC_014494	ATG	2	6	33566	33571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066675
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564	NC_014494	ATT	2	6	33633	33638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066675
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571	NC_014494	TGA	2	6	33996	34001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066676
572	NC_014494	A	7	7	34003	34009	100 %	0 %	0 %	0 %	307066676
573	NC_014494	AC	3	6	34032	34037	50 %	0 %	0 %	50 %	307066676
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577	NC_014494	CTAT	2	8	34332	34339	25 %	50 %	0 %	25 %	307066677
578	NC_014494	GAAT	2	8	34509	34516	50 %	25 %	25 %	0 %	307066677
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582	NC_014494	ATT	2	6	34728	34733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066677
583	NC_014494	CAG	2	6	34748	34753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066677
584	NC_014494	AT	3	6	35036	35041	50 %	50 %	0 %	0 %	307066678
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589	NC_014494	TGA	2	6	35427	35432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066679
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592	NC_014494	ATTT	2	8	35558	35565	25 %	75 %	0 %	0 %	307066679
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596	NC_014494	A	6	6	35922	35927	100 %	0 %	0 %	0 %	307066680
597	NC_014494	CAATGA	2	12	35938	35949	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	307066680
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599	NC_014494	ATGGA	2	10	36072	36081	40 %	20 %	40 %	0 %	307066680
600	NC_014494	TGAGA	2	10	36188	36197	40 %	20 %	40 %	0 %	307066680
601	NC_014494	AG	3	6	36278	36283	50 %	0 %	50 %	0 %	307066681
602	NC_014494	AAG	3	9	36310	36318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066681
603	NC_014494	GCA	2	6	36352	36357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066681
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606	NC_014494	GAA	2	6	36492	36497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066681
607	NC_014494	TCAT	2	8	36505	36512	25 %	50 %	0 %	25 %	307066681
608	NC_014494	TAT	2	6	36521	36526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066681
609	NC_014494	AAC	2	6	36548	36553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307066681
610	NC_014494	ATT	2	6	36585	36590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066681
611	NC_014494	CGAA	2	8	36679	36686	50 %	0 %	25 %	25 %	307066681
612	NC_014494	TAC	2	6	36721	36726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066681
613	NC_014494	TCAA	2	8	36774	36781	50 %	25 %	0 %	25 %	307066681
614	NC_014494	TGA	2	6	36833	36838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066681
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616	NC_014494	TCA	2	6	36862	36867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066681
617	NC_014494	ATG	2	6	36877	36882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066681
618	NC_014494	A	6	6	36899	36904	100 %	0 %	0 %	0 %	307066681
619	NC_014494	CCA	2	6	36925	36930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307066681
620	NC_014494	ACA	2	6	36967	36972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307066681
621	NC_014494	TGA	2	6	36989	36994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066681
622	NC_014494	GAT	2	6	37038	37043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066681
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625	NC_014494	GGTT	2	8	37239	37246	0 %	50 %	50 %	0 %	307066681
626	NC_014494	GTTT	2	8	37264	37271	0 %	75 %	25 %	0 %	307066681
627	NC_014494	GAG	2	6	37281	37286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307066681
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