MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta thermophila DSM 6192 chromosome

Total Repeats: 60616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014484	AG	3	6	20684	20689	50 %	0 %	50 %	0 %	307717737
502	NC_014484	GAG	2	6	20723	20728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717737
503	NC_014484	CTC	2	6	20766	20771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717737
504	NC_014484	GGAG	2	8	20833	20840	25 %	0 %	75 %	0 %	307717737
505	NC_014484	TCG	2	6	20844	20849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717737
506	NC_014484	TCT	2	6	20856	20861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307717737
507	NC_014484	AG	3	6	20874	20879	50 %	0 %	50 %	0 %	307717737
508	NC_014484	GAGG	2	8	20880	20887	25 %	0 %	75 %	0 %	307717737
509	NC_014484	ACA	2	6	20904	20909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307717737
510	NC_014484	AGG	2	6	20943	20948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717737
511	NC_014484	G	6	6	20947	20952	0 %	0 %	100 %	0 %	307717737
512	NC_014484	CCT	2	6	20960	20965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717737
513	NC_014484	G	6	6	20972	20977	0 %	0 %	100 %	0 %	307717737
514	NC_014484	GTG	2	6	21035	21040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717737
515	NC_014484	GA	4	8	21041	21048	50 %	0 %	50 %	0 %	307717737
516	NC_014484	GGT	2	6	21082	21087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717737
517	NC_014484	GA	3	6	21165	21170	50 %	0 %	50 %	0 %	307717738
518	NC_014484	GTC	2	6	21192	21197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717738
519	NC_014484	GAG	2	6	21223	21228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717738
520	NC_014484	GAT	2	6	21265	21270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717738
521	NC_014484	TCT	2	6	21272	21277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307717738
522	NC_014484	GGA	2	6	21291	21296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717738
523	NC_014484	G	7	7	21331	21337	0 %	0 %	100 %	0 %	307717738
524	NC_014484	CGG	2	6	21372	21377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307717738
525	NC_014484	TCC	2	6	21419	21424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717738
526	NC_014484	GGT	2	6	21544	21549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717738
527	NC_014484	TTG	2	6	21569	21574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307717738
528	NC_014484	GAG	2	6	21764	21769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717738
529	NC_014484	CCT	2	6	21936	21941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717738
530	NC_014484	G	6	6	21969	21974	0 %	0 %	100 %	0 %	307717738
531	NC_014484	CTC	2	6	22009	22014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717738
532	NC_014484	TCCC	2	8	22042	22049	0 %	25 %	0 %	75 %	307717738
533	NC_014484	GGTC	2	8	22050	22057	0 %	25 %	50 %	25 %	307717738
534	NC_014484	CCA	2	6	22098	22103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307717738
535	NC_014484	AGG	2	6	22166	22171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717738
536	NC_014484	GTA	2	6	22183	22188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717738
537	NC_014484	GAT	2	6	22210	22215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717738
538	NC_014484	GAG	2	6	22231	22236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717738
539	NC_014484	GCC	3	9	22320	22328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307717738
540	NC_014484	TCG	2	6	22379	22384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717738
541	NC_014484	GAG	2	6	22402	22407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717738
542	NC_014484	AGG	2	6	22424	22429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717738
543	NC_014484	GATG	2	8	22440	22447	25 %	25 %	50 %	0 %	307717738
544	NC_014484	TGT	2	6	22458	22463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307717738
545	NC_014484	GCG	2	6	22478	22483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307717738
546	NC_014484	CAC	3	9	22507	22515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307717738
547	NC_014484	G	6	6	22526	22531	0 %	0 %	100 %	0 %	307717738
548	NC_014484	AGG	2	6	22578	22583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717738
549	NC_014484	GAG	2	6	22591	22596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717738
550	NC_014484	G	6	6	22603	22608	0 %	0 %	100 %	0 %	307717738
551	NC_014484	TCT	2	6	22686	22691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307717738
552	NC_014484	CGAGG	2	10	22877	22886	20 %	0 %	60 %	20 %	307717739
553	NC_014484	GA	3	6	22893	22898	50 %	0 %	50 %	0 %	307717739
554	NC_014484	GA	3	6	22927	22932	50 %	0 %	50 %	0 %	307717739
555	NC_014484	CGA	2	6	22937	22942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717739
556	NC_014484	TCG	2	6	22977	22982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717739
557	NC_014484	CTC	3	9	22989	22997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717739
558	NC_014484	GT	3	6	23031	23036	0 %	50 %	50 %	0 %	307717739
559	NC_014484	GAG	2	6	23088	23093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717739
560	NC_014484	TCC	2	6	23125	23130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717739
561	NC_014484	GCG	2	6	23139	23144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307717739
562	NC_014484	TTC	2	6	23198	23203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307717739
563	NC_014484	CTC	2	6	23217	23222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717739
564	NC_014484	TTTC	2	8	23232	23239	0 %	75 %	0 %	25 %	307717739
565	NC_014484	TCG	2	6	23314	23319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717739
566	NC_014484	ACG	2	6	23375	23380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717739
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569	NC_014484	CGG	2	6	23449	23454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307717740
570	NC_014484	CGA	2	6	23479	23484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717740
571	NC_014484	TCGT	2	8	23504	23511	0 %	50 %	25 %	25 %	307717740
572	NC_014484	TGG	3	9	23520	23528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717740
573	NC_014484	TCC	2	6	23544	23549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717740
574	NC_014484	ATC	2	6	23573	23578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717740
575	NC_014484	GA	3	6	23613	23618	50 %	0 %	50 %	0 %	307717740
576	NC_014484	GT	3	6	23642	23647	0 %	50 %	50 %	0 %	307717740
577	NC_014484	CCT	2	6	23677	23682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717740
578	NC_014484	TCC	2	6	23694	23699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717740
579	NC_014484	GAA	2	6	23726	23731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307717740
580	NC_014484	CTT	2	6	23791	23796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307717740
581	NC_014484	TC	3	6	23806	23811	0 %	50 %	0 %	50 %	307717740
582	NC_014484	TCC	2	6	23826	23831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717740
583	NC_014484	GTG	2	6	23834	23839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717740
584	NC_014484	TGG	2	6	23841	23846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717740
585	NC_014484	CAT	2	6	23863	23868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717740
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588	NC_014484	CCTTC	2	10	23962	23971	0 %	40 %	0 %	60 %	307717740
589	NC_014484	TCG	2	6	23976	23981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717740
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593	NC_014484	G	6	6	24068	24073	0 %	0 %	100 %	0 %	307717740
594	NC_014484	TCGTGC	2	12	24084	24095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717740
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597	NC_014484	ACC	2	6	24144	24149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307717740
598	NC_014484	TCA	2	6	24207	24212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717740
599	NC_014484	G	6	6	24230	24235	0 %	0 %	100 %	0 %	307717740
600	NC_014484	CTC	2	6	24329	24334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717740
601	NC_014484	CTC	2	6	24395	24400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717740
602	NC_014484	TCC	2	6	24402	24407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717740
603	NC_014484	TGG	2	6	24441	24446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717740
604	NC_014484	TCCTC	2	10	24517	24526	0 %	40 %	0 %	60 %	307717740
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609	NC_014484	GAG	2	6	24743	24748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717741
610	NC_014484	AGG	2	6	24785	24790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717741
611	NC_014484	GTA	3	9	24802	24810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717741
612	NC_014484	GCC	2	6	24877	24882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307717741
613	NC_014484	GA	3	6	24896	24901	50 %	0 %	50 %	0 %	307717741
614	NC_014484	TC	3	6	24902	24907	0 %	50 %	0 %	50 %	307717741
615	NC_014484	GAG	2	6	24955	24960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717741
616	NC_014484	CGG	2	6	24984	24989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307717741
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619	NC_014484	G	7	7	25109	25115	0 %	0 %	100 %	0 %	307717741
620	NC_014484	CGT	2	6	25119	25124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717741
621	NC_014484	GAG	2	6	25184	25189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717741
622	NC_014484	C	7	7	25194	25200	0 %	0 %	0 %	100 %	307717741
623	NC_014484	ACG	2	6	25214	25219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717741
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629	NC_014484	GAG	2	6	25550	25555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717742
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