MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta thermophila DSM 6192 chromosome

Total Repeats: 60616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014484	TCC	2	6	187633	187638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717868
5002	NC_014484	CCCG	2	8	187680	187687	0 %	0 %	25 %	75 %	307717868
5003	NC_014484	CAC	2	6	187764	187769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307717868
5004	NC_014484	GGA	2	6	187889	187894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717868
5005	NC_014484	GCCG	2	8	187907	187914	0 %	0 %	50 %	50 %	307717868
5006	NC_014484	GTG	2	6	187960	187965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717868
5007	NC_014484	AGG	2	6	187966	187971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717868
5008	NC_014484	GAG	2	6	187974	187979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717868
5009	NC_014484	C	6	6	188020	188025	0 %	0 %	0 %	100 %	307717868
5010	NC_014484	GAG	2	6	188040	188045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717868
5011	NC_014484	CG	3	6	188102	188107	0 %	0 %	50 %	50 %	307717868
5012	NC_014484	AG	3	6	188109	188114	50 %	0 %	50 %	0 %	307717868
5013	NC_014484	GT	3	6	188115	188120	0 %	50 %	50 %	0 %	307717868
5014	NC_014484	CT	3	6	188128	188133	0 %	50 %	0 %	50 %	307717868
5015	NC_014484	GAGG	2	8	188175	188182	25 %	0 %	75 %	0 %	307717868
5016	NC_014484	T	7	7	188213	188219	0 %	100 %	0 %	0 %	307717868
5017	NC_014484	GGT	2	6	188685	188690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717869
5018	NC_014484	GCG	2	6	188720	188725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307717869
5019	NC_014484	GAA	3	9	188784	188792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307717869
5020	NC_014484	TG	3	6	188817	188822	0 %	50 %	50 %	0 %	307717869
5021	NC_014484	CAG	2	6	188830	188835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717869
5022	NC_014484	CTA	2	6	188850	188855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717869
5023	NC_014484	GTA	2	6	188857	188862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717869
5024	NC_014484	CGA	2	6	188874	188879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717869
5025	NC_014484	TCC	2	6	188939	188944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717869
5026	NC_014484	GGC	2	6	188964	188969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307717869
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5028	NC_014484	TG	3	6	189057	189062	0 %	50 %	50 %	0 %	307717869
5029	NC_014484	GAG	2	6	189063	189068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717869
5030	NC_014484	TC	3	6	189116	189121	0 %	50 %	0 %	50 %	307717869
5031	NC_014484	CAG	2	6	189178	189183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717869
5032	NC_014484	TTC	2	6	189238	189243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307717869
5033	NC_014484	TGC	2	6	189347	189352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717869
5034	NC_014484	TCAG	2	8	189441	189448	25 %	25 %	25 %	25 %	307717869
5035	NC_014484	AGA	2	6	189468	189473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307717869
5036	NC_014484	TGA	2	6	189474	189479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717869
5037	NC_014484	TCAC	2	8	189496	189503	25 %	25 %	0 %	50 %	307717869
5038	NC_014484	GGT	2	6	189703	189708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717869
5039	NC_014484	TC	3	6	189710	189715	0 %	50 %	0 %	50 %	307717869
5040	NC_014484	CAGC	2	8	189759	189766	25 %	0 %	25 %	50 %	307717869
5041	NC_014484	TAC	2	6	189826	189831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717869
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5043	NC_014484	CAC	2	6	190032	190037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307717869
5044	NC_014484	GTG	2	6	190054	190059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717869
5045	NC_014484	ACC	2	6	190063	190068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307717869
5046	NC_014484	CCT	2	6	190069	190074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717869
5047	NC_014484	CAC	2	6	190086	190091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307717869
5048	NC_014484	TGCC	2	8	190115	190122	0 %	25 %	25 %	50 %	307717869
5049	NC_014484	GGT	2	6	190131	190136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717869
5050	NC_014484	CTA	3	9	190182	190190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717869
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5052	NC_014484	TCC	2	6	190269	190274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717869
5053	NC_014484	ACA	2	6	190295	190300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307717869
5054	NC_014484	GAC	3	9	190513	190521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717869
5055	NC_014484	A	6	6	190617	190622	100 %	0 %	0 %	0 %	307717869
5056	NC_014484	CGA	2	6	190692	190697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717869
5057	NC_014484	ACC	2	6	190771	190776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307717869
5058	NC_014484	GTG	2	6	190783	190788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717869
5059	NC_014484	TTG	2	6	190832	190837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307717869
5060	NC_014484	ACT	2	6	190934	190939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717869
5061	NC_014484	TGG	2	6	191018	191023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717869
5062	NC_014484	AGG	2	6	191096	191101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717869
5063	NC_014484	GATCCT	2	12	191206	191217	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	307717869
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5065	NC_014484	CGGGT	2	10	191238	191247	0 %	20 %	60 %	20 %	307717869
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5067	NC_014484	CGATAT	2	12	191298	191309	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307717869
5068	NC_014484	CTCC	2	8	191378	191385	0 %	25 %	0 %	75 %	307717869
5069	NC_014484	CTC	2	6	191399	191404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717869
5070	NC_014484	CTC	2	6	191476	191481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717869
5071	NC_014484	GGT	2	6	191524	191529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717869
5072	NC_014484	TCC	2	6	191530	191535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717869
5073	NC_014484	CT	3	6	191576	191581	0 %	50 %	0 %	50 %	307717869
5074	NC_014484	GAG	2	6	191628	191633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717869
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5076	NC_014484	CGCCT	2	10	191727	191736	0 %	20 %	20 %	60 %	307717869
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5079	NC_014484	CCGG	2	8	191857	191864	0 %	0 %	50 %	50 %	307717869
5080	NC_014484	TG	3	6	191877	191882	0 %	50 %	50 %	0 %	307717869
5081	NC_014484	CAG	2	6	192013	192018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717869
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5084	NC_014484	CGA	2	6	192090	192095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717869
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5088	NC_014484	GCCT	2	8	192330	192337	0 %	25 %	25 %	50 %	307717869
5089	NC_014484	CCA	2	6	192431	192436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307717869
5090	NC_014484	GATC	2	8	192528	192535	25 %	25 %	25 %	25 %	307717869
5091	NC_014484	TG	3	6	192567	192572	0 %	50 %	50 %	0 %	307717869
5092	NC_014484	GAG	2	6	192622	192627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717869
5093	NC_014484	GATC	2	8	192645	192652	25 %	25 %	25 %	25 %	307717869
5094	NC_014484	CAA	2	6	192693	192698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307717869
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5096	NC_014484	CGA	3	9	192741	192749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717869
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5099	NC_014484	TCC	3	9	192888	192896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717869
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5101	NC_014484	TC	3	6	193131	193136	0 %	50 %	0 %	50 %	307717869
5102	NC_014484	GGT	2	6	193197	193202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717869
5103	NC_014484	ACC	2	6	193204	193209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307717869
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5105	NC_014484	TGG	2	6	193403	193408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717869
5106	NC_014484	CAC	2	6	193440	193445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307717869
5107	NC_014484	ACA	2	6	193472	193477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307717869
5108	NC_014484	CGTT	2	8	193490	193497	0 %	50 %	25 %	25 %	307717869
5109	NC_014484	ACA	2	6	193625	193630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307717869
5110	NC_014484	CAC	2	6	193638	193643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307717869
5111	NC_014484	GTG	2	6	193667	193672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717869
5112	NC_014484	AGCTT	2	10	193697	193706	20 %	40 %	20 %	20 %	307717869
5113	NC_014484	ACC	2	6	193738	193743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307717869
5114	NC_014484	ACG	2	6	193760	193765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717869
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5117	NC_014484	TGC	2	6	193899	193904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717869
5118	NC_014484	CCG	2	6	193907	193912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307717869
5119	NC_014484	TAC	2	6	193915	193920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717869
5120	NC_014484	G	7	7	194026	194032	0 %	0 %	100 %	0 %	307717869
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5122	NC_014484	ACGA	2	8	194134	194141	50 %	0 %	25 %	25 %	307717869
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5243	NC_014484	GCTC	2	8	199262	199269	0 %	25 %	25 %	50 %	307717871
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5482	NC_014484	GGT	3	9	209661	209669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717879
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5484	NC_014484	TCTCC	2	10	209706	209715	0 %	40 %	0 %	60 %	307717879
5485	NC_014484	CGACCT	2	12	209727	209738	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	307717879
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5487	NC_014484	CCCCCT	2	12	209772	209783	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	307717879
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5489	NC_014484	C	6	6	209801	209806	0 %	0 %	0 %	100 %	307717879
5490	NC_014484	C	6	6	209825	209830	0 %	0 %	0 %	100 %	307717879
5491	NC_014484	TCC	2	6	209834	209839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717879
5492	NC_014484	C	7	7	209850	209856	0 %	0 %	0 %	100 %	307717879
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