MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta thermophila DSM 6192 chromosome

Total Repeats: 60616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014484	GGA	2	6	169736	169741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717852
4502	NC_014484	GCCGGA	2	12	169778	169789	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	307717852
4503	NC_014484	GGT	2	6	170029	170034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717853
4504	NC_014484	GAACTC	2	12	170116	170127	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	307717853
4505	NC_014484	CACC	2	8	170182	170189	25 %	0 %	0 %	75 %	307717853
4506	NC_014484	AGG	2	6	170210	170215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717853
4507	NC_014484	G	6	6	170232	170237	0 %	0 %	100 %	0 %	307717853
4508	NC_014484	CTT	2	6	170262	170267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307717853
4509	NC_014484	TCCCT	2	10	170280	170289	0 %	40 %	0 %	60 %	307717853
4510	NC_014484	GTC	2	6	170299	170304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717853
4511	NC_014484	AGG	2	6	170313	170318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717853
4512	NC_014484	GAG	2	6	170354	170359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717853
4513	NC_014484	TCC	2	6	170381	170386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717853
4514	NC_014484	GCG	2	6	170432	170437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307717853
4515	NC_014484	CCG	2	6	170465	170470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307717853
4516	NC_014484	TCG	2	6	170489	170494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717853
4517	NC_014484	AG	3	6	170529	170534	50 %	0 %	50 %	0 %	307717853
4518	NC_014484	GAG	2	6	170554	170559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717853
4519	NC_014484	GGA	2	6	170566	170571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717853
4520	NC_014484	GGA	2	6	170595	170600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717853
4521	NC_014484	GA	4	8	170619	170626	50 %	0 %	50 %	0 %	307717853
4522	NC_014484	GAG	2	6	170647	170652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717853
4523	NC_014484	GAG	2	6	170782	170787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717853
4524	NC_014484	GTC	2	6	170788	170793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717853
4525	NC_014484	GAA	2	6	170803	170808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307717853
4526	NC_014484	GA	3	6	170849	170854	50 %	0 %	50 %	0 %	307717853
4527	NC_014484	CCTC	2	8	170877	170884	0 %	25 %	0 %	75 %	307717853
4528	NC_014484	CCA	2	6	170901	170906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307717853
4529	NC_014484	GCA	2	6	170939	170944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717853
4530	NC_014484	GAG	2	6	171010	171015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717853
4531	NC_014484	CTG	2	6	171052	171057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717853
4532	NC_014484	TCCC	2	8	171129	171136	0 %	25 %	0 %	75 %	307717853
4533	NC_014484	GC	3	6	171141	171146	0 %	0 %	50 %	50 %	307717853
4534	NC_014484	CGTTC	2	10	171157	171166	0 %	40 %	20 %	40 %	307717853
4535	NC_014484	GAG	2	6	171205	171210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717853
4536	NC_014484	GTA	2	6	171238	171243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717853
4537	NC_014484	GTC	2	6	171247	171252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717853
4538	NC_014484	CCGA	2	8	171383	171390	25 %	0 %	25 %	50 %	307717853
4539	NC_014484	GATCCG	2	12	171397	171408	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	307717853
4540	NC_014484	TCG	2	6	171437	171442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717853
4541	NC_014484	CCG	2	6	171482	171487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307717853
4542	NC_014484	GTG	2	6	171507	171512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717853
4543	NC_014484	GA	3	6	171533	171538	50 %	0 %	50 %	0 %	307717853
4544	NC_014484	CCT	2	6	171558	171563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717853
4545	NC_014484	AGG	3	9	171624	171632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717853
4546	NC_014484	AGGAG	2	10	171654	171663	40 %	0 %	60 %	0 %	307717853
4547	NC_014484	GAC	2	6	171664	171669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717853
4548	NC_014484	AGG	2	6	171677	171682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717853
4549	NC_014484	GAG	3	9	171700	171708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717853
4550	NC_014484	ATC	2	6	171734	171739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717853
4551	NC_014484	GCG	2	6	171883	171888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307717854
4552	NC_014484	TGA	2	6	171899	171904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717854
4553	NC_014484	GAC	2	6	171921	171926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717854
4554	NC_014484	TGC	2	6	171944	171949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717854
4555	NC_014484	GAG	3	9	171952	171960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717854
4556	NC_014484	GAG	2	6	172027	172032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717854
4557	NC_014484	GGA	2	6	172050	172055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717854
4558	NC_014484	CTC	2	6	172069	172074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717854
4559	NC_014484	CCT	3	9	172083	172091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717854
4560	NC_014484	GAG	2	6	172141	172146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717854
4561	NC_014484	CTC	2	6	172183	172188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717854
4562	NC_014484	TCCTGG	2	12	172238	172249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717854
4563	NC_014484	CAC	2	6	172255	172260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307717854
4564	NC_014484	TC	3	6	172293	172298	0 %	50 %	0 %	50 %	307717854
4565	NC_014484	GAA	2	6	172299	172304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307717854
4566	NC_014484	CAC	2	6	172332	172337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307717854
4567	NC_014484	TGG	2	6	172364	172369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717854
4568	NC_014484	GGC	2	6	172419	172424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307717854
4569	NC_014484	AGG	2	6	172448	172453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717854
4570	NC_014484	ACT	2	6	172574	172579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717854
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4572	NC_014484	GGA	2	6	172629	172634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717854
4573	NC_014484	TC	3	6	172635	172640	0 %	50 %	0 %	50 %	307717854
4574	NC_014484	CG	3	6	172642	172647	0 %	0 %	50 %	50 %	307717854
4575	NC_014484	TCC	2	6	172649	172654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717854
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4577	NC_014484	ATG	2	6	172714	172719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717854
4578	NC_014484	AGG	2	6	172721	172726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717854
4579	NC_014484	ACT	2	6	172766	172771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717854
4580	NC_014484	TCC	2	6	172883	172888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717854
4581	NC_014484	GAC	2	6	172918	172923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717854
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4583	NC_014484	GGA	2	6	172949	172954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717854
4584	NC_014484	CTA	2	6	172980	172985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717854
4585	NC_014484	TAC	2	6	172999	173004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717854
4586	NC_014484	CTT	2	6	173082	173087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307717854
4587	NC_014484	AGG	2	6	173108	173113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717854
4588	NC_014484	CTCC	2	8	173163	173170	0 %	25 %	0 %	75 %	307717854
4589	NC_014484	CGT	2	6	173192	173197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717854
4590	NC_014484	ATG	2	6	173293	173298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717855
4591	NC_014484	GGT	2	6	173357	173362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717855
4592	NC_014484	GAGT	2	8	173381	173388	25 %	25 %	50 %	0 %	307717855
4593	NC_014484	GACGA	2	10	173445	173454	40 %	0 %	40 %	20 %	307717855
4594	NC_014484	GTG	3	9	173466	173474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717855
4595	NC_014484	ACC	2	6	173536	173541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307717855
4596	NC_014484	C	8	8	173653	173660	0 %	0 %	0 %	100 %	307717855
4597	NC_014484	TC	3	6	173774	173779	0 %	50 %	0 %	50 %	307717855
4598	NC_014484	TCC	2	6	173864	173869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717855
4599	NC_014484	G	6	6	173870	173875	0 %	0 %	100 %	0 %	307717855
4600	NC_014484	TTCGTG	2	12	173877	173888	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	307717855
4601	NC_014484	GAG	2	6	173900	173905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717855
4602	NC_014484	TCC	2	6	173935	173940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717855
4603	NC_014484	GAG	2	6	174005	174010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717855
4604	NC_014484	GGC	2	6	174019	174024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307717855
4605	NC_014484	TGG	2	6	174037	174042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717855
4606	NC_014484	GAG	2	6	174073	174078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717855
4607	NC_014484	TGGG	2	8	174091	174098	0 %	25 %	75 %	0 %	307717855
4608	NC_014484	TGA	2	6	174136	174141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717855
4609	NC_014484	GGT	2	6	174158	174163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717855
4610	NC_014484	ACG	2	6	174191	174196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717856
4611	NC_014484	TGG	2	6	174240	174245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717856
4612	NC_014484	GGA	2	6	174274	174279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717856
4613	NC_014484	GTG	2	6	174287	174292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717856
4614	NC_014484	GGA	2	6	174298	174303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717856
4615	NC_014484	GT	4	8	174317	174324	0 %	50 %	50 %	0 %	307717856
4616	NC_014484	GATC	2	8	174328	174335	25 %	25 %	25 %	25 %	307717856
4617	NC_014484	AGG	2	6	174360	174365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717856
4618	NC_014484	GGGAG	2	10	174402	174411	20 %	0 %	80 %	0 %	307717856
4619	NC_014484	TCCTC	2	10	174438	174447	0 %	40 %	0 %	60 %	307717856
4620	NC_014484	GGA	2	6	174456	174461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717856
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4622	NC_014484	GAG	2	6	174521	174526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717856
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4868	NC_014484	CCA	2	6	182469	182474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307717862
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4989	NC_014484	CG	3	6	187213	187218	0 %	0 %	50 %	50 %	307717867
4990	NC_014484	C	7	7	187246	187252	0 %	0 %	0 %	100 %	307717867
4991	NC_014484	GCC	2	6	187306	187311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307717867
4992	NC_014484	GTC	2	6	187333	187338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717867
4993	NC_014484	CTC	2	6	187366	187371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717867
4994	NC_014484	TCG	2	6	187457	187462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717867
4995	NC_014484	CTT	2	6	187468	187473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307717867
4996	NC_014484	CCT	2	6	187479	187484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717867
4997	NC_014484	CGCC	2	8	187562	187569	0 %	0 %	25 %	75 %	307717867
4998	NC_014484	AGG	2	6	187573	187578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717867
4999	NC_014484	GC	3	6	187600	187605	0 %	0 %	50 %	50 %	307717867
5000	NC_014484	GCAC	2	8	187615	187622	25 %	0 %	25 %	50 %	307717867

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