MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 1287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014251	AGCCA	2	10	2391	2400	40 %	0 %	20 %	40 %	298501508
2	NC_014251	ATGGT	2	10	2948	2957	20 %	40 %	40 %	0 %	298501508
3	NC_014251	TAGCG	2	10	6482	6491	20 %	20 %	40 %	20 %	298501511
4	NC_014251	CTTGG	2	10	9220	9229	0 %	40 %	40 %	20 %	298501514
5	NC_014251	ATGGG	2	10	10080	10089	20 %	20 %	60 %	0 %	298501515
6	NC_014251	GCCTT	2	10	10795	10804	0 %	40 %	20 %	40 %	298501515
7	NC_014251	AAAGG	2	10	13359	13368	60 %	0 %	40 %	0 %	298501518
8	NC_014251	CATGG	2	10	18270	18279	20 %	20 %	40 %	20 %	298501522
9	NC_014251	ATTGA	2	10	18326	18335	40 %	40 %	20 %	0 %	298501522
10	NC_014251	ATCTT	2	10	20611	20620	20 %	60 %	0 %	20 %	298501525
11	NC_014251	CTTGA	2	10	22282	22291	20 %	40 %	20 %	20 %	298501527
12	NC_014251	CTTCA	2	10	22631	22640	20 %	40 %	0 %	40 %	298501527
13	NC_014251	AGCCA	2	10	23938	23947	40 %	0 %	20 %	40 %	298501528
14	NC_014251	AGGAT	2	10	24875	24884	40 %	20 %	40 %	0 %	298501529
15	NC_014251	TTTGT	2	10	25245	25254	0 %	80 %	20 %	0 %	298501529
16	NC_014251	AGGAG	2	10	25455	25464	40 %	0 %	60 %	0 %	298501529
17	NC_014251	ATCTT	2	10	25787	25796	20 %	60 %	0 %	20 %	298501529
18	NC_014251	AATCC	2	10	28795	28804	40 %	20 %	0 %	40 %	298501534
19	NC_014251	CCATT	2	10	29590	29599	20 %	40 %	0 %	40 %	298501535
20	NC_014251	AAAGG	2	10	29901	29910	60 %	0 %	40 %	0 %	298501536
21	NC_014251	AACCA	2	10	30918	30927	60 %	0 %	0 %	40 %	298501536
22	NC_014251	TCTTA	2	10	31841	31850	20 %	60 %	0 %	20 %	298501537
23	NC_014251	CTTTT	2	10	32943	32952	0 %	80 %	0 %	20 %	298501539
24	NC_014251	AACCA	2	10	34370	34379	60 %	0 %	0 %	40 %	298501542
25	NC_014251	TCCCA	2	10	36065	36074	20 %	20 %	0 %	60 %	298501543
26	NC_014251	AGCAA	2	10	36138	36147	60 %	0 %	20 %	20 %	298501543
27	NC_014251	AAATC	2	10	36624	36633	60 %	20 %	0 %	20 %	298501544
28	NC_014251	CTTCT	2	10	37236	37245	0 %	60 %	0 %	40 %	298501545
29	NC_014251	CAAGG	2	10	38631	38640	40 %	0 %	40 %	20 %	298501548
30	NC_014251	TTCCT	2	10	41026	41035	0 %	60 %	0 %	40 %	298501552
31	NC_014251	TTTCT	2	10	48294	48303	0 %	80 %	0 %	20 %	298501558
32	NC_014251	GTTCT	2	10	49298	49307	0 %	60 %	20 %	20 %	298501560
33	NC_014251	ACTGC	2	10	50579	50588	20 %	20 %	20 %	40 %	298501562
34	NC_014251	TTGTT	2	10	50994	51003	0 %	80 %	20 %	0 %	298501562
35	NC_014251	TTCTT	2	10	51123	51132	0 %	80 %	0 %	20 %	298501562
36	NC_014251	GCAAT	2	10	53166	53175	40 %	20 %	20 %	20 %	298501564
37	NC_014251	TGATT	2	10	55736	55745	20 %	60 %	20 %	0 %	298501566
38	NC_014251	AAATA	2	10	55855	55864	80 %	20 %	0 %	0 %	298501566
39	NC_014251	TTATA	2	10	62641	62650	40 %	60 %	0 %	0 %	298501568
40	NC_014251	TATCA	2	10	66838	66847	40 %	40 %	0 %	20 %	298501572
41	NC_014251	CTGGA	2	10	69085	69094	20 %	20 %	40 %	20 %	298501574
42	NC_014251	AAGGT	2	10	70745	70754	40 %	20 %	40 %	0 %	298501575
43	NC_014251	TAGGA	2	10	71426	71435	40 %	20 %	40 %	0 %	298501576
44	NC_014251	TCTGC	2	10	73603	73612	0 %	40 %	20 %	40 %	298501576
45	NC_014251	TGGTT	2	10	75594	75603	0 %	60 %	40 %	0 %	298501578
46	NC_014251	AAGGG	2	10	77172	77181	40 %	0 %	60 %	0 %	298501580
47	NC_014251	TCTTG	2	10	77427	77436	0 %	60 %	20 %	20 %	298501580
48	NC_014251	TGCCA	2	10	82221	82230	20 %	20 %	20 %	40 %	298501585
49	NC_014251	CCTTT	2	10	83672	83681	0 %	60 %	0 %	40 %	298501587
50	NC_014251	GAAAT	2	10	86901	86910	60 %	20 %	20 %	0 %	298501591
51	NC_014251	AATAA	3	15	87108	87122	80 %	20 %	0 %	0 %	298501591
52	NC_014251	GCCAG	2	10	88020	88029	20 %	0 %	40 %	40 %	298501593
53	NC_014251	AATCA	2	10	88037	88046	60 %	20 %	0 %	20 %	298501593
54	NC_014251	TTCAT	2	10	88344	88353	20 %	60 %	0 %	20 %	298501593
55	NC_014251	TTTTC	2	10	90229	90238	0 %	80 %	0 %	20 %	298501595
56	NC_014251	ACTGA	2	10	91157	91166	40 %	20 %	20 %	20 %	298501596
57	NC_014251	CACTA	2	10	91792	91801	40 %	20 %	0 %	40 %	298501597
58	NC_014251	AAAGC	2	10	91808	91817	60 %	0 %	20 %	20 %	298501597
59	NC_014251	CAATC	2	10	92016	92025	40 %	20 %	0 %	40 %	298501597
60	NC_014251	CCGTC	2	10	93621	93630	0 %	20 %	20 %	60 %	298501597
61	NC_014251	TAAAT	2	10	93784	93793	60 %	40 %	0 %	0 %	298501597
62	NC_014251	CAGCC	2	10	96540	96549	20 %	0 %	20 %	60 %	298501599
63	NC_014251	ATTTC	2	10	96826	96835	20 %	60 %	0 %	20 %	298501599
64	NC_014251	ATTCT	2	10	98254	98263	20 %	60 %	0 %	20 %	298501601
65	NC_014251	TCGAT	2	10	99349	99358	20 %	40 %	20 %	20 %	298501603
66	NC_014251	AAAGT	2	10	102251	102260	60 %	20 %	20 %	0 %	298501606
67	NC_014251	TCAAG	2	10	102838	102847	40 %	20 %	20 %	20 %	298501607
68	NC_014251	GAAGA	2	10	104260	104269	60 %	0 %	40 %	0 %	298501607
69	NC_014251	GTTCT	2	10	106796	106805	0 %	60 %	20 %	20 %	298501609
70	NC_014251	AAACC	2	10	111404	111413	60 %	0 %	0 %	40 %	298501614
71	NC_014251	CAAGC	2	10	112157	112166	40 %	0 %	20 %	40 %	298501615
72	NC_014251	AGACC	2	10	114057	114066	40 %	0 %	20 %	40 %	298501618
73	NC_014251	AACCA	2	10	114386	114395	60 %	0 %	0 %	40 %	298501618
74	NC_014251	TAGAG	2	10	114503	114512	40 %	20 %	40 %	0 %	298501618
75	NC_014251	AACCA	2	10	116819	116828	60 %	0 %	0 %	40 %	298501624
76	NC_014251	ATAGT	2	10	119467	119476	40 %	40 %	20 %	0 %	298501626
77	NC_014251	TTTCT	2	10	119824	119833	0 %	80 %	0 %	20 %	298501626
78	NC_014251	TGTCA	2	10	121902	121911	20 %	40 %	20 %	20 %	298501630
79	NC_014251	ATTTC	2	10	123692	123701	20 %	60 %	0 %	20 %	298501632
80	NC_014251	TCCCT	2	10	126372	126381	0 %	40 %	0 %	60 %	298501635
81	NC_014251	TTATC	2	10	126443	126452	20 %	60 %	0 %	20 %	298501635
82	NC_014251	GAAGT	2	10	130027	130036	40 %	20 %	40 %	0 %	298501639
83	NC_014251	AAAAC	2	10	131612	131621	80 %	0 %	0 %	20 %	298501640
84	NC_014251	CCAAA	2	10	134614	134623	60 %	0 %	0 %	40 %	298501645
85	NC_014251	AAATT	2	10	137223	137232	60 %	40 %	0 %	0 %	298501647
86	NC_014251	TAGCA	2	10	138110	138119	40 %	20 %	20 %	20 %	298501647
87	NC_014251	TTGTC	2	10	138257	138266	0 %	60 %	20 %	20 %	298501647
88	NC_014251	CCTCT	2	10	144688	144697	0 %	40 %	0 %	60 %	298501650
89	NC_014251	TCCTC	2	10	144914	144923	0 %	40 %	0 %	60 %	298501650
90	NC_014251	TATGG	2	10	150003	150012	20 %	40 %	40 %	0 %	298501655
91	NC_014251	GGATC	2	10	151713	151722	20 %	20 %	40 %	20 %	298501656
92	NC_014251	CACTT	2	10	156625	156634	20 %	40 %	0 %	40 %	298501663
93	NC_014251	AAATC	2	10	157770	157779	60 %	20 %	0 %	20 %	298501663
94	NC_014251	CACTC	2	10	158865	158874	20 %	20 %	0 %	60 %	298501664
95	NC_014251	CCATT	2	10	159308	159317	20 %	40 %	0 %	40 %	298501664
96	NC_014251	AAAGA	2	10	161997	162006	80 %	0 %	20 %	0 %	298501665
97	NC_014251	GAAGA	2	10	162620	162629	60 %	0 %	40 %	0 %	298501665
98	NC_014251	AAGGA	2	10	171075	171084	60 %	0 %	40 %	0 %	298501675
99	NC_014251	ATTTT	2	10	171397	171406	20 %	80 %	0 %	0 %	298501675
100	NC_014251	TTTTG	2	10	171544	171553	0 %	80 %	20 %	0 %	298501675
101	NC_014251	TCCTT	2	10	174097	174106	0 %	60 %	0 %	40 %	298501678
102	NC_014251	TCATT	2	10	174902	174911	20 %	60 %	0 %	20 %	298501679
103	NC_014251	TCAAC	2	10	175617	175626	40 %	20 %	0 %	40 %	298501680
104	NC_014251	AGGTA	2	10	176608	176617	40 %	20 %	40 %	0 %	298501681
105	NC_014251	AGCTC	2	10	183752	183761	20 %	20 %	20 %	40 %	298501690
106	NC_014251	CAAAG	2	10	184458	184467	60 %	0 %	20 %	20 %	298501692
107	NC_014251	AACCA	2	10	184606	184615	60 %	0 %	0 %	40 %	298501692
108	NC_014251	ATGGA	2	10	187664	187673	40 %	20 %	40 %	0 %	298501694
109	NC_014251	GATTT	2	10	188135	188144	20 %	60 %	20 %	0 %	298501694
110	NC_014251	CAACC	2	10	188221	188230	40 %	0 %	0 %	60 %	298501694
111	NC_014251	GAAAG	2	10	189885	189894	60 %	0 %	40 %	0 %	298501695
112	NC_014251	AGCAT	2	10	189973	189982	40 %	20 %	20 %	20 %	298501696
113	NC_014251	AGCTT	2	10	193619	193628	20 %	40 %	20 %	20 %	298501699
114	NC_014251	TTGGT	2	10	193686	193695	0 %	60 %	40 %	0 %	298501699
115	NC_014251	TGATT	2	10	194213	194222	20 %	60 %	20 %	0 %	298501699
116	NC_014251	GTTTA	2	10	195939	195948	20 %	60 %	20 %	0 %	298501703
117	NC_014251	CGACT	2	10	197243	197252	20 %	20 %	20 %	40 %	298501703
118	NC_014251	AATGG	2	10	200205	200214	40 %	20 %	40 %	0 %	298501707
119	NC_014251	TCATC	2	10	204014	204023	20 %	40 %	0 %	40 %	298501712
120	NC_014251	GATTA	2	10	204354	204363	40 %	40 %	20 %	0 %	298501712
121	NC_014251	ATTTG	2	10	207058	207067	20 %	60 %	20 %	0 %	298501716
122	NC_014251	AGCAA	2	10	211492	211501	60 %	0 %	20 %	20 %	298501720
123	NC_014251	TGCCA	2	10	215176	215185	20 %	20 %	20 %	40 %	298501725
124	NC_014251	ACATC	2	10	219969	219978	40 %	20 %	0 %	40 %	408767009
125	NC_014251	AACAA	2	10	222254	222263	80 %	0 %	0 %	20 %	298501733
126	NC_014251	TCCAC	2	10	223554	223563	20 %	20 %	0 %	60 %	298501735
127	NC_014251	GAAAA	2	10	223746	223755	80 %	0 %	20 %	0 %	298501735
128	NC_014251	TCATA	2	10	225181	225190	40 %	40 %	0 %	20 %	298501737
129	NC_014251	CCAAA	2	10	225436	225445	60 %	0 %	0 %	40 %	298501737
130	NC_014251	ATTTC	2	10	225751	225760	20 %	60 %	0 %	20 %	298501737
131	NC_014251	ATAAA	3	15	226788	226802	80 %	20 %	0 %	0 %	298501739
132	NC_014251	CTTTT	2	10	228406	228415	0 %	80 %	0 %	20 %	298501740
133	NC_014251	TTCGA	2	10	230616	230625	20 %	40 %	20 %	20 %	298501743
134	NC_014251	ATCCA	2	10	233809	233818	40 %	20 %	0 %	40 %	298501745
135	NC_014251	ATTTT	2	10	236835	236844	20 %	80 %	0 %	0 %	298501747
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149	NC_014251	AAAAT	2	10	248754	248763	80 %	20 %	0 %	0 %	298501759
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254	NC_014251	TTGAG	2	10	427474	427483	20 %	40 %	40 %	0 %	298501972
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260	NC_014251	TTAAG	2	10	434439	434448	40 %	40 %	20 %	0 %	298501980
261	NC_014251	TCAGG	2	10	435354	435363	20 %	20 %	40 %	20 %	298501981
262	NC_014251	GCCTT	2	10	436968	436977	0 %	40 %	20 %	40 %	298501983
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