MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 36584

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014251	AGCA	2	8	224033	224040	50 %	0 %	25 %	25 %	298501735
4002	NC_014251	CTC	2	6	224130	224135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501736
4003	NC_014251	CTT	2	6	224222	224227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501736
4004	NC_014251	AAC	2	6	224235	224240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501736
4005	NC_014251	C	6	6	224266	224271	0 %	0 %	0 %	100 %	298501736
4006	NC_014251	CAT	2	6	224324	224329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501736
4007	NC_014251	TGG	2	6	224368	224373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501736
4008	NC_014251	T	6	6	224376	224381	0 %	100 %	0 %	0 %	298501736
4009	NC_014251	TCA	2	6	224390	224395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501736
4010	NC_014251	TCA	2	6	224539	224544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501736
4011	NC_014251	TCT	2	6	224587	224592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501736
4012	NC_014251	TTC	2	6	224643	224648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501736
4013	NC_014251	TG	3	6	224820	224825	0 %	50 %	50 %	0 %	298501736
4014	NC_014251	GCT	2	6	224881	224886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501736
4015	NC_014251	CTT	2	6	224903	224908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501736
4016	NC_014251	AAT	2	6	224974	224979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501737
4017	NC_014251	T	7	7	225014	225020	0 %	100 %	0 %	0 %	298501737
4018	NC_014251	GA	3	6	225070	225075	50 %	0 %	50 %	0 %	298501737
4019	NC_014251	ACT	2	6	225089	225094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501737
4020	NC_014251	T	6	6	225113	225118	0 %	100 %	0 %	0 %	298501737
4021	NC_014251	CTT	2	6	225148	225153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501737
4022	NC_014251	TCATA	2	10	225181	225190	40 %	40 %	0 %	20 %	298501737
4023	NC_014251	ACA	2	6	225294	225299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501737
4024	NC_014251	CT	4	8	225347	225354	0 %	50 %	0 %	50 %	298501737
4025	NC_014251	CTT	2	6	225388	225393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501737
4026	NC_014251	CT	3	6	225397	225402	0 %	50 %	0 %	50 %	298501737
4027	NC_014251	CCAAA	2	10	225436	225445	60 %	0 %	0 %	40 %	298501737
4028	NC_014251	CAT	2	6	225451	225456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501737
4029	NC_014251	CAA	2	6	225472	225477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501737
4030	NC_014251	ATTG	2	8	225478	225485	25 %	50 %	25 %	0 %	298501737
4031	NC_014251	GAC	2	6	225514	225519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501737
4032	NC_014251	TC	3	6	225568	225573	0 %	50 %	0 %	50 %	298501737
4033	NC_014251	CGT	2	6	225611	225616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501737
4034	NC_014251	GTA	2	6	225695	225700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501737
4035	NC_014251	T	6	6	225732	225737	0 %	100 %	0 %	0 %	298501737
4036	NC_014251	ATT	2	6	225744	225749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501737
4037	NC_014251	ATTTC	2	10	225751	225760	20 %	60 %	0 %	20 %	298501737
4038	NC_014251	AAT	2	6	225886	225891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501738
4039	NC_014251	TGC	3	9	225931	225939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501738
4040	NC_014251	CCA	2	6	225950	225955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501738
4041	NC_014251	CAA	2	6	226014	226019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501738
4042	NC_014251	TCAA	2	8	226043	226050	50 %	25 %	0 %	25 %	298501738
4043	NC_014251	ATA	2	6	226181	226186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501738
4044	NC_014251	CT	3	6	226202	226207	0 %	50 %	0 %	50 %	298501738
4045	NC_014251	T	6	6	226291	226296	0 %	100 %	0 %	0 %	298501738
4046	NC_014251	ACA	2	6	226407	226412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501739
4047	NC_014251	TCT	2	6	226465	226470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501739
4048	NC_014251	AGA	2	6	226634	226639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501739
4049	NC_014251	ACT	3	9	226640	226648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501739
4050	NC_014251	GAG	2	6	226650	226655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298501739
4051	NC_014251	TTG	2	6	226678	226683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501739
4052	NC_014251	CTC	2	6	226715	226720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501739
4053	NC_014251	ATA	2	6	226748	226753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501739
4054	NC_014251	ATAAA	3	15	226788	226802	80 %	20 %	0 %	0 %	298501739
4055	NC_014251	ATG	2	6	226810	226815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501739
4056	NC_014251	T	7	7	226816	226822	0 %	100 %	0 %	0 %	298501739
4057	NC_014251	CTT	2	6	226823	226828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501739
4058	NC_014251	TCA	2	6	226866	226871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501739
4059	NC_014251	T	6	6	226958	226963	0 %	100 %	0 %	0 %	298501739
4060	NC_014251	AAGA	2	8	226965	226972	75 %	0 %	25 %	0 %	298501739
4061	NC_014251	TGAT	2	8	227082	227089	25 %	50 %	25 %	0 %	298501739
4062	NC_014251	T	8	8	227119	227126	0 %	100 %	0 %	0 %	298501739
4063	NC_014251	TAC	2	6	227171	227176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501740
4064	NC_014251	CAT	2	6	227208	227213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501740
4065	NC_014251	ATG	2	6	227221	227226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501740
4066	NC_014251	CAT	2	6	227307	227312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501740
4067	NC_014251	AG	3	6	227333	227338	50 %	0 %	50 %	0 %	298501740
4068	NC_014251	TC	3	6	227367	227372	0 %	50 %	0 %	50 %	298501740
4069	NC_014251	ATA	2	6	227378	227383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501740
4070	NC_014251	TGA	2	6	227444	227449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501740
4071	NC_014251	CCAA	2	8	227581	227588	50 %	0 %	0 %	50 %	298501740
4072	NC_014251	CAT	2	6	227590	227595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501740
4073	NC_014251	AAT	2	6	227603	227608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501740
4074	NC_014251	TAA	2	6	227611	227616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501740
4075	NC_014251	ATG	2	6	227620	227625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501740
4076	NC_014251	AAC	2	6	227735	227740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501740
4077	NC_014251	TTAG	2	8	227885	227892	25 %	50 %	25 %	0 %	298501740
4078	NC_014251	CTC	2	6	227911	227916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501740
4079	NC_014251	ATC	2	6	227995	228000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501740
4080	NC_014251	AAT	2	6	228025	228030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501740
4081	NC_014251	TCA	2	6	228083	228088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501740
4082	NC_014251	A	6	6	228107	228112	100 %	0 %	0 %	0 %	298501740
4083	NC_014251	A	6	6	228126	228131	100 %	0 %	0 %	0 %	298501740
4084	NC_014251	GTTT	2	8	228136	228143	0 %	75 %	25 %	0 %	298501740
4085	NC_014251	TCT	2	6	228212	228217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501740
4086	NC_014251	CT	3	6	228216	228221	0 %	50 %	0 %	50 %	298501740
4087	NC_014251	AAT	2	6	228224	228229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501740
4088	NC_014251	TCC	2	6	228253	228258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501740
4089	NC_014251	CTTTT	2	10	228406	228415	0 %	80 %	0 %	20 %	298501740
4090	NC_014251	TTC	2	6	228433	228438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501740
4091	NC_014251	AAC	2	6	228442	228447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501740
4092	NC_014251	TTCC	2	8	228461	228468	0 %	50 %	0 %	50 %	298501741
4093	NC_014251	ATT	2	6	228495	228500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501741
4094	NC_014251	CTG	2	6	228563	228568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501741
4095	NC_014251	TCAA	2	8	228604	228611	50 %	25 %	0 %	25 %	298501741
4096	NC_014251	GATT	2	8	228616	228623	25 %	50 %	25 %	0 %	298501741
4097	NC_014251	AAC	2	6	228637	228642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501741
4098	NC_014251	T	7	7	228696	228702	0 %	100 %	0 %	0 %	298501741
4099	NC_014251	ATT	2	6	228717	228722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501741
4100	NC_014251	CAT	2	6	228723	228728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501741
4101	NC_014251	TAAA	2	8	228788	228795	75 %	25 %	0 %	0 %	298501741
4102	NC_014251	CCA	2	6	228871	228876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501741
4103	NC_014251	CATT	2	8	228884	228891	25 %	50 %	0 %	25 %	298501741
4104	NC_014251	TCA	2	6	228913	228918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501741
4105	NC_014251	TCA	2	6	229219	229224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501741
4106	NC_014251	A	6	6	229227	229232	100 %	0 %	0 %	0 %	298501741
4107	NC_014251	ATC	2	6	229269	229274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501741
4108	NC_014251	GCT	2	6	229282	229287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501741
4109	NC_014251	T	6	6	229305	229310	0 %	100 %	0 %	0 %	298501741
4110	NC_014251	ACT	2	6	229348	229353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501741
4111	NC_014251	A	6	6	229361	229366	100 %	0 %	0 %	0 %	298501741
4112	NC_014251	TCA	2	6	229426	229431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501741
4113	NC_014251	CTC	2	6	229525	229530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501741
4114	NC_014251	TGTT	2	8	229643	229650	0 %	75 %	25 %	0 %	298501741
4115	NC_014251	T	6	6	229657	229662	0 %	100 %	0 %	0 %	298501741
4116	NC_014251	ATT	2	6	229873	229878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501742
4117	NC_014251	GAA	2	6	229880	229885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501742
4118	NC_014251	TTA	2	6	229887	229892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501742
4119	NC_014251	ACT	2	6	229903	229908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501742
4120	NC_014251	GGA	2	6	229934	229939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298501742
4121	NC_014251	TC	3	6	229954	229959	0 %	50 %	0 %	50 %	298501742
4122	NC_014251	AG	3	6	229990	229995	50 %	0 %	50 %	0 %	298501742
4123	NC_014251	TCG	2	6	229996	230001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501742
4124	NC_014251	A	7	7	230005	230011	100 %	0 %	0 %	0 %	298501742
4125	NC_014251	TTG	2	6	230060	230065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501742
4126	NC_014251	GAA	2	6	230081	230086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501742
4127	NC_014251	A	6	6	230162	230167	100 %	0 %	0 %	0 %	298501742
4128	NC_014251	TCA	2	6	230186	230191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501742
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4132	NC_014251	AAAC	2	8	230339	230346	75 %	0 %	0 %	25 %	298501743
4133	NC_014251	CTAT	2	8	230357	230364	25 %	50 %	0 %	25 %	298501743
4134	NC_014251	T	6	6	230364	230369	0 %	100 %	0 %	0 %	298501743
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4137	NC_014251	TGA	2	6	230421	230426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501743
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4140	NC_014251	TGT	2	6	230568	230573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501743
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4150	NC_014251	TA	3	6	231031	231036	50 %	50 %	0 %	0 %	298501743
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4155	NC_014251	TCAA	2	8	231216	231223	50 %	25 %	0 %	25 %	298501743
4156	NC_014251	CAA	3	9	231239	231247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501743
4157	NC_014251	ACA	2	6	231330	231335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501743
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4162	NC_014251	CAC	2	6	231503	231508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501744
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4199	NC_014251	GCT	2	6	233621	233626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501745
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4228	NC_014251	TTG	2	6	235044	235049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501746
4229	NC_014251	AGGC	2	8	235079	235086	25 %	0 %	50 %	25 %	298501746
4230	NC_014251	AGA	2	6	235123	235128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501746
4231	NC_014251	ATA	2	6	235248	235253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501746
4232	NC_014251	GAT	2	6	235274	235279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501746
4233	NC_014251	TACC	2	8	235394	235401	25 %	25 %	0 %	50 %	298501746
4234	NC_014251	AGG	2	6	235426	235431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298501746
4235	NC_014251	AGA	3	9	235471	235479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501746
4236	NC_014251	TGA	2	6	235627	235632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501746
4237	NC_014251	CAA	2	6	235635	235640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501746
4238	NC_014251	ACTTGG	2	12	235644	235655	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	298501746
4239	NC_014251	ATCT	2	8	235657	235664	25 %	50 %	0 %	25 %	298501746
4240	NC_014251	ATG	2	6	235674	235679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501746
4241	NC_014251	AATC	2	8	235698	235705	50 %	25 %	0 %	25 %	298501746
4242	NC_014251	GCCA	2	8	235712	235719	25 %	0 %	25 %	50 %	298501746
4243	NC_014251	TAAA	2	8	235862	235869	75 %	25 %	0 %	0 %	298501746
4244	NC_014251	TATC	2	8	236001	236008	25 %	50 %	0 %	25 %	298501747
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4246	NC_014251	TCA	2	6	236060	236065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501747
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4495	NC_014251	A	6	6	248673	248678	100 %	0 %	0 %	0 %	298501759
4496	NC_014251	AAAAT	2	10	248754	248763	80 %	20 %	0 %	0 %	298501759
4497	NC_014251	TGT	2	6	248780	248785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501759
4498	NC_014251	ATG	2	6	248787	248792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501759
4499	NC_014251	ATT	2	6	248826	248831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501759
4500	NC_014251	AATC	2	8	249286	249293	50 %	25 %	0 %	25 %	298501760

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